MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880201

Total Repeats: 1615

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013160	TA	3	6	9	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013160	GAA	2	6	96	101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818683
3	NC_013160	GAA	2	6	159	164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818683
4	NC_013160	CGT	2	6	212	217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818683
5	NC_013160	TAT	2	6	245	250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818683
6	NC_013160	AAAG	2	8	273	280	75 %	0 %	25 %	0 %	256818683
7	NC_013160	A	6	6	282	287	100 %	0 %	0 %	0 %	256818683
8	NC_013160	TAT	2	6	288	293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818683
9	NC_013160	TTG	2	6	401	406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818684
10	NC_013160	A	6	6	418	423	100 %	0 %	0 %	0 %	256818684
11	NC_013160	TGA	2	6	494	499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818684
12	NC_013160	TAAA	2	8	533	540	75 %	25 %	0 %	0 %	256818684
13	NC_013160	ATT	2	6	596	601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013160	A	7	7	622	628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013160	TAAAAA	2	12	652	663	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013160	TAG	2	6	753	758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013160	ATT	2	6	808	813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013160	AGA	2	6	834	839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013160	ACTCAA	2	12	956	967	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	256818685
20	NC_013160	ACC	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818685
21	NC_013160	AG	3	6	1067	1072	50 %	0 %	50 %	0 %	256818685
22	NC_013160	TTTTCA	2	12	1124	1135	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	256818685
23	NC_013160	CCA	2	6	1164	1169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818685
24	NC_013160	TCG	2	6	1192	1197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818685
25	NC_013160	TG	3	6	1204	1209	0 %	50 %	50 %	0 %	256818685
26	NC_013160	ATA	2	6	1308	1313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818685
27	NC_013160	ATT	2	6	1380	1385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013160	A	6	6	1438	1443	100 %	0 %	0 %	0 %	256818686
29	NC_013160	TAC	2	6	1484	1489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818686
30	NC_013160	GTT	2	6	1503	1508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818686
31	NC_013160	GCA	2	6	1702	1707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818686
32	NC_013160	ACA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818686
33	NC_013160	CAT	2	6	1914	1919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818686
34	NC_013160	TCG	2	6	1968	1973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818686
35	NC_013160	TGC	2	6	1985	1990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818686
36	NC_013160	ACT	2	6	2067	2072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818687
37	NC_013160	AAC	2	6	2073	2078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818687
38	NC_013160	TAA	2	6	2115	2120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818687
39	NC_013160	GAC	2	6	2211	2216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818687
40	NC_013160	GGT	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256818687
41	NC_013160	TCA	2	6	2391	2396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818687
42	NC_013160	CTGAT	2	10	2471	2480	20 %	40 %	20 %	20 %	256818687
43	NC_013160	AAAT	2	8	2512	2519	75 %	25 %	0 %	0 %	256818687
44	NC_013160	TGCTT	2	10	2521	2530	0 %	60 %	20 %	20 %	256818687
45	NC_013160	AGC	2	6	2629	2634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818687
46	NC_013160	TTAT	2	8	2715	2722	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013160	ACT	2	6	2934	2939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013160	C	6	6	3008	3013	0 %	0 %	0 %	100 %	256818688
49	NC_013160	TGG	2	6	3059	3064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256818688
50	NC_013160	AAAC	2	8	3164	3171	75 %	0 %	0 %	25 %	256818688
51	NC_013160	CCA	2	6	3193	3198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818688
52	NC_013160	GGAG	2	8	3264	3271	25 %	0 %	75 %	0 %	256818688
53	NC_013160	GTT	2	6	3322	3327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818688
54	NC_013160	CCCA	2	8	3340	3347	25 %	0 %	0 %	75 %	256818688
55	NC_013160	TCAG	2	8	3391	3398	25 %	25 %	25 %	25 %	256818688
56	NC_013160	GAC	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818688
57	NC_013160	TGAA	2	8	3593	3600	50 %	25 %	25 %	0 %	256818688
58	NC_013160	AAT	2	6	3739	3744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818688
59	NC_013160	GGAGC	2	10	3939	3948	20 %	0 %	60 %	20 %	256818688
60	NC_013160	TCA	2	6	3985	3990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818688
61	NC_013160	GACAG	2	10	4017	4026	40 %	0 %	40 %	20 %	256818688
62	NC_013160	ATT	2	6	4043	4048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818688
63	NC_013160	GTC	2	6	4108	4113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818688
64	NC_013160	CTT	2	6	4122	4127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818688
65	NC_013160	GATT	2	8	4152	4159	25 %	50 %	25 %	0 %	256818688
66	NC_013160	CTG	2	6	4302	4307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818689
67	NC_013160	TTGT	2	8	4308	4315	0 %	75 %	25 %	0 %	256818689
68	NC_013160	TGT	2	6	4322	4327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818689
69	NC_013160	AAT	2	6	4437	4442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818689
70	NC_013160	AGC	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818689
71	NC_013160	CAA	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818689
72	NC_013160	CAGA	2	8	4499	4506	50 %	0 %	25 %	25 %	256818689
73	NC_013160	CAAG	2	8	4595	4602	50 %	0 %	25 %	25 %	256818689
74	NC_013160	AAC	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818689
75	NC_013160	GA	3	6	4651	4656	50 %	0 %	50 %	0 %	256818689
76	NC_013160	GCG	2	6	4658	4663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256818689
77	NC_013160	GCT	2	6	4677	4682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818689
78	NC_013160	CTT	2	6	4744	4749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818689
79	NC_013160	CGAGAT	2	12	4773	4784	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	256818689
80	NC_013160	CTGC	2	8	4797	4804	0 %	25 %	25 %	50 %	256818689
81	NC_013160	CTGT	2	8	4864	4871	0 %	50 %	25 %	25 %	256818689
82	NC_013160	AGCC	2	8	4934	4941	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_013160	GAA	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013160	AT	3	6	5119	5124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013160	A	6	6	5134	5139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013160	AAAT	2	8	5191	5198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013160	CTA	2	6	5211	5216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013160	TTC	2	6	5293	5298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013160	ACT	2	6	5306	5311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013160	TCA	2	6	5325	5330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013160	TTCT	2	8	5343	5350	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013160	ACC	2	6	5351	5356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_013160	TAA	2	6	5368	5373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013160	TGA	2	6	5416	5421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013160	CAC	2	6	5451	5456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_013160	TAA	2	6	5515	5520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013160	TTCG	2	8	5531	5538	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013160	AAT	3	9	5573	5581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013160	T	7	7	5623	5629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013160	T	6	6	5657	5662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013160	AGT	2	6	5664	5669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013160	GACT	2	8	5677	5684	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_013160	CTTTTT	2	12	5772	5783	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_013160	AAT	2	6	5795	5800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013160	TA	4	8	5866	5873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013160	GGAG	2	8	5933	5940	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013160	ATT	2	6	5951	5956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013160	TTGTC	2	10	5992	6001	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_013160	T	6	6	6068	6073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013160	ACT	2	6	6147	6152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013160	CCA	2	6	6169	6174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_013160	T	6	6	6237	6242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013160	ATTT	2	8	6292	6299	25 %	75 %	0 %	0 %	256818690
114	NC_013160	AG	3	6	6324	6329	50 %	0 %	50 %	0 %	256818690
115	NC_013160	CTT	2	6	6373	6378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818690
116	NC_013160	ACC	2	6	6381	6386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818690
117	NC_013160	TCA	2	6	6462	6467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818690
118	NC_013160	ATC	2	6	6570	6575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818690
119	NC_013160	CTT	2	6	6651	6656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818690
120	NC_013160	CTT	2	6	6685	6690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818690
121	NC_013160	CCT	2	6	6726	6731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256818691
122	NC_013160	CAT	2	6	6811	6816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818691
123	NC_013160	TTC	2	6	6940	6945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818691
124	NC_013160	T	6	6	6955	6960	0 %	100 %	0 %	0 %	256818691
125	NC_013160	GTT	2	6	6983	6988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818691
126	NC_013160	AACC	2	8	7002	7009	50 %	0 %	0 %	50 %	256818691
127	NC_013160	AAT	2	6	7037	7042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818691
128	NC_013160	CAG	2	6	7059	7064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818691
129	NC_013160	TGG	3	9	7186	7194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256818691
130	NC_013160	AGC	2	6	7300	7305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818691
131	NC_013160	TTC	2	6	7360	7365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818691
132	NC_013160	T	6	6	7401	7406	0 %	100 %	0 %	0 %	256818691
133	NC_013160	AAG	2	6	7429	7434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818691
134	NC_013160	GTCG	2	8	7436	7443	0 %	25 %	50 %	25 %	256818691
135	NC_013160	GCTT	2	8	7480	7487	0 %	50 %	25 %	25 %	256818691
136	NC_013160	GAACA	2	10	7504	7513	60 %	0 %	20 %	20 %	256818691
137	NC_013160	C	6	6	7573	7578	0 %	0 %	0 %	100 %	256818691
138	NC_013160	AGT	2	6	7684	7689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013160	GTA	2	6	7692	7697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013160	AAC	2	6	7759	7764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013160	TAG	2	6	7824	7829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013160	ACAAA	2	10	7902	7911	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_013160	TTC	2	6	7912	7917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_013160	TGA	2	6	7953	7958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013160	ACCC	2	8	7988	7995	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
146	NC_013160	GTC	2	6	8024	8029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_013160	CAC	2	6	8047	8052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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149	NC_013160	GT	3	6	8190	8195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013160	TTTG	2	8	8215	8222	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013160	AGA	2	6	8262	8267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013160	TTCAAT	2	12	8276	8287	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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156	NC_013160	TAA	2	6	8432	8437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_013160	AAG	2	6	8681	8686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_013160	TAT	3	9	9867	9875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_013160	ATA	2	6	12665	12670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_013160	TAA	2	6	12676	12681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_013160	CTT	2	6	12912	12917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818695
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285	NC_013160	TC	3	6	13029	13034	0 %	50 %	0 %	50 %	256818695
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399	NC_013160	TAA	2	6	17969	17974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
400	NC_013160	T	6	6	17976	17981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
401	NC_013160	CAG	2	6	18190	18195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
402	NC_013160	TAA	2	6	18239	18244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
403	NC_013160	TAG	3	9	18259	18267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
404	NC_013160	TTG	2	6	18295	18300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
405	NC_013160	TGATT	2	10	18335	18344	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
406	NC_013160	AACC	2	8	18379	18386	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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408	NC_013160	AGTT	2	8	18478	18485	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
409	NC_013160	TCA	2	6	18535	18540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
410	NC_013160	TGAA	2	8	18790	18797	50 %	25 %	25 %	0 %	256818698
411	NC_013160	AGT	2	6	18826	18831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818698
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