MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Catenulispora acidiphila DSM 44928 chromosome

Total Repeats: 291454

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_013131	GCC	2	6	250245	250250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389456
7002	NC_013131	ATC	2	6	250339	250344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256389456
7003	NC_013131	CGC	2	6	250346	250351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389456
7004	NC_013131	ATC	2	6	250425	250430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256389456
7005	NC_013131	TCG	2	6	250459	250464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389456
7006	NC_013131	GGC	2	6	250465	250470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389456
7007	NC_013131	CG	3	6	250494	250499	0 %	0 %	50 %	50 %	256389456
7008	NC_013131	CGG	2	6	250508	250513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389456
7009	NC_013131	GAT	2	6	250525	250530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256389456
7010	NC_013131	CTG	2	6	250540	250545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_013131	CCG	2	6	250562	250567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7012	NC_013131	GAG	2	6	250576	250581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_013131	GCC	2	6	250582	250587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7014	NC_013131	CGA	2	6	250590	250595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_013131	CGG	2	6	250611	250616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_013131	GCTG	2	8	250635	250642	0 %	25 %	50 %	25 %	256389457
7017	NC_013131	TTC	2	6	250726	250731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256389457
7018	NC_013131	CGGC	2	8	250811	250818	0 %	0 %	50 %	50 %	256389457
7019	NC_013131	GGC	2	6	250911	250916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389457
7020	NC_013131	GCC	2	6	250924	250929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389457
7021	NC_013131	ACG	3	9	250931	250939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389457
7022	NC_013131	GGT	2	6	250943	250948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256389457
7023	NC_013131	GC	3	6	250975	250980	0 %	0 %	50 %	50 %	256389457
7024	NC_013131	CCG	2	6	250990	250995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389457
7025	NC_013131	CGG	2	6	251002	251007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389457
7026	NC_013131	GCC	2	6	251059	251064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389457
7027	NC_013131	GGCCT	2	10	251081	251090	0 %	20 %	40 %	40 %	256389457
7028	NC_013131	AC	3	6	251095	251100	50 %	0 %	0 %	50 %	256389457
7029	NC_013131	TG	3	6	251111	251116	0 %	50 %	50 %	0 %	256389457
7030	NC_013131	GC	3	6	251188	251193	0 %	0 %	50 %	50 %	256389457
7031	NC_013131	TCG	2	6	251206	251211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389457
7032	NC_013131	GCG	2	6	251272	251277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389457
7033	NC_013131	TGC	2	6	251280	251285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389457
7034	NC_013131	GC	3	6	251293	251298	0 %	0 %	50 %	50 %	256389457
7035	NC_013131	CTGGC	2	10	251315	251324	0 %	20 %	40 %	40 %	256389457
7036	NC_013131	GC	3	6	251328	251333	0 %	0 %	50 %	50 %	256389457
7037	NC_013131	CGA	2	6	251352	251357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389457
7038	NC_013131	GCT	2	6	251379	251384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389457
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7041	NC_013131	CGC	2	6	251493	251498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389457
7042	NC_013131	GTCG	2	8	251502	251509	0 %	25 %	50 %	25 %	256389457
7043	NC_013131	GAG	2	6	251578	251583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389457
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7045	NC_013131	GC	4	8	251648	251655	0 %	0 %	50 %	50 %	256389457
7046	NC_013131	GC	3	6	251701	251706	0 %	0 %	50 %	50 %	256389457
7047	NC_013131	TGG	2	6	251723	251728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256389457
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7050	NC_013131	GAC	2	6	251833	251838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389457
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7054	NC_013131	CTG	2	6	252064	252069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389457
7055	NC_013131	GGCA	2	8	252071	252078	25 %	0 %	50 %	25 %	256389457
7056	NC_013131	CAG	2	6	252139	252144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389457
7057	NC_013131	GGTG	2	8	252213	252220	0 %	25 %	75 %	0 %	256389457
7058	NC_013131	GGC	2	6	252231	252236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389457
7059	NC_013131	CGC	2	6	252344	252349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389457
7060	NC_013131	CGGC	2	8	252431	252438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7061	NC_013131	TGG	2	6	252490	252495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_013131	GC	3	6	252511	252516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7063	NC_013131	CGA	2	6	252577	252582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7064	NC_013131	CCG	2	6	252589	252594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7065	NC_013131	GT	3	6	252618	252623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_013131	GCA	2	6	252640	252645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7067	NC_013131	GGA	2	6	252689	252694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_013131	CATA	2	8	252708	252715	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7069	NC_013131	CGG	2	6	252757	252762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7070	NC_013131	GCC	2	6	252768	252773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7071	NC_013131	GCG	2	6	252807	252812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7072	NC_013131	GTG	2	6	252827	252832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_013131	CCA	2	6	252846	252851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7074	NC_013131	AG	3	6	252876	252881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_013131	G	6	6	252881	252886	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_013131	GCG	2	6	252957	252962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389458
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7081	NC_013131	TCG	2	6	253247	253252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389458
7082	NC_013131	GC	3	6	253295	253300	0 %	0 %	50 %	50 %	256389458
7083	NC_013131	GC	3	6	253337	253342	0 %	0 %	50 %	50 %	256389458
7084	NC_013131	GCCG	2	8	253351	253358	0 %	0 %	50 %	50 %	256389458
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7092	NC_013131	GCT	3	9	253536	253544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389458
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7096	NC_013131	TCG	2	6	253757	253762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389458
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7098	NC_013131	CGG	2	6	253799	253804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389458
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7119	NC_013131	ATC	2	6	254929	254934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256389458
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7122	NC_013131	CGG	3	9	255119	255127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389458
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7244	NC_013131	TCA	2	6	260299	260304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256389461
7245	NC_013131	GC	3	6	260386	260391	0 %	0 %	50 %	50 %	256389461
7246	NC_013131	TCGGC	2	10	260407	260416	0 %	20 %	40 %	40 %	256389461
7247	NC_013131	GCCTG	2	10	260476	260485	0 %	20 %	40 %	40 %	256389461
7248	NC_013131	GAC	2	6	260549	260554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389461
7249	NC_013131	TGC	2	6	260569	260574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389461
7250	NC_013131	ACC	3	9	260589	260597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256389461
7251	NC_013131	CGA	2	6	260600	260605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389461
7252	NC_013131	TCCT	2	8	260607	260614	0 %	50 %	0 %	50 %	256389461
7253	NC_013131	CGA	3	9	260678	260686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389461
7254	NC_013131	CTA	2	6	260768	260773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256389461
7255	NC_013131	CTC	2	6	260814	260819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256389461
7256	NC_013131	GC	3	6	260831	260836	0 %	0 %	50 %	50 %	256389461
7257	NC_013131	CG	3	6	260933	260938	0 %	0 %	50 %	50 %	256389461
7258	NC_013131	TTC	2	6	260939	260944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256389461
7259	NC_013131	CGT	2	6	260954	260959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389461
7260	NC_013131	TGA	2	6	260976	260981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256389461
7261	NC_013131	GTC	2	6	261002	261007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389462
7262	NC_013131	TCG	2	6	261035	261040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389462
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7264	NC_013131	GCG	2	6	261273	261278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389462
7265	NC_013131	CGGC	2	8	261337	261344	0 %	0 %	50 %	50 %	256389462
7266	NC_013131	TCG	2	6	261345	261350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389462
7267	NC_013131	CGG	2	6	261354	261359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389462
7268	NC_013131	CTG	2	6	261365	261370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389462
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7270	NC_013131	GTC	2	6	261523	261528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389462
7271	NC_013131	CGT	2	6	261573	261578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389462
7272	NC_013131	GT	3	6	261618	261623	0 %	50 %	50 %	0 %	256389462
7273	NC_013131	AGG	2	6	261744	261749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389462
7274	NC_013131	CG	3	6	261754	261759	0 %	0 %	50 %	50 %	256389462
7275	NC_013131	GGA	2	6	261770	261775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389462
7276	NC_013131	ACG	2	6	261860	261865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389462
7277	NC_013131	CGT	2	6	261873	261878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389462
7278	NC_013131	CCG	2	6	261892	261897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7279	NC_013131	GCGCGT	2	12	261901	261912	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7280	NC_013131	GT	3	6	261911	261916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7281	NC_013131	GCA	2	6	261930	261935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7282	NC_013131	TCCGT	2	10	261948	261957	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7283	NC_013131	TGCT	2	8	261971	261978	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7284	NC_013131	CTG	2	6	261994	261999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7285	NC_013131	CCGG	2	8	262020	262027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7286	NC_013131	C	6	6	262204	262209	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7287	NC_013131	CGC	2	6	262217	262222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7288	NC_013131	TCG	2	6	262241	262246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7289	NC_013131	CG	3	6	262285	262290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7290	NC_013131	CGG	2	6	262303	262308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7291	NC_013131	GTG	2	6	262323	262328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7292	NC_013131	GCG	2	6	262336	262341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7293	NC_013131	CGC	2	6	262359	262364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7294	NC_013131	AGG	2	6	262379	262384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7295	NC_013131	GAT	2	6	262413	262418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7296	NC_013131	GCG	2	6	262471	262476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7297	NC_013131	GTC	2	6	262485	262490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7298	NC_013131	GATG	2	8	262522	262529	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7299	NC_013131	TTTC	2	8	262603	262610	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7300	NC_013131	TGA	2	6	262632	262637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7302	NC_013131	CAG	2	6	262693	262698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7303	NC_013131	AAG	2	6	262764	262769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7304	NC_013131	CGG	2	6	262861	262866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7305	NC_013131	TGA	2	6	262907	262912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256389463
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7309	NC_013131	CGG	2	6	263111	263116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7310	NC_013131	GCG	2	6	263118	263123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7311	NC_013131	CGG	2	6	263125	263130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7312	NC_013131	GT	3	6	263245	263250	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7313	NC_013131	CGA	2	6	263313	263318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7314	NC_013131	ACGTA	2	10	263355	263364	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7315	NC_013131	CTG	2	6	263382	263387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7317	NC_013131	TCC	2	6	263471	263476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7319	NC_013131	TC	3	6	263510	263515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7320	NC_013131	GTG	2	6	263534	263539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7321	NC_013131	GCGG	2	8	263592	263599	0 %	0 %	75 %	25 %	256389464
7322	NC_013131	GGC	3	9	263606	263614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389464
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7324	NC_013131	GGC	3	9	263621	263629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389464
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7341	NC_013131	CG	3	6	264278	264283	0 %	0 %	50 %	50 %	256389465
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7346	NC_013131	ACAGC	2	10	264460	264469	40 %	0 %	20 %	40 %	256389465
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7348	NC_013131	CGG	3	9	264480	264488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389465
7349	NC_013131	GAGC	2	8	264499	264506	25 %	0 %	50 %	25 %	256389465
7350	NC_013131	ATC	2	6	264512	264517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256389465
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7352	NC_013131	GTGCG	2	10	264584	264593	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7353	NC_013131	GCG	2	6	264613	264618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7354	NC_013131	CA	3	6	264625	264630	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7355	NC_013131	CCGGG	2	10	264649	264658	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7356	NC_013131	GAG	2	6	264669	264674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7357	NC_013131	GGC	2	6	264697	264702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389466
7358	NC_013131	CGA	2	6	264778	264783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389466
7359	NC_013131	GCC	2	6	264791	264796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389466
7360	NC_013131	CCT	2	6	264808	264813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256389466
7361	NC_013131	ATC	2	6	264816	264821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256389466
7362	NC_013131	CGT	2	6	264832	264837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389466
7363	NC_013131	CGC	2	6	264877	264882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389466
7364	NC_013131	TCGT	2	8	264990	264997	0 %	50 %	25 %	25 %	256389466
7365	NC_013131	CTG	2	6	265016	265021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389466
7366	NC_013131	CTG	3	9	265028	265036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389466
7367	NC_013131	CGG	3	9	265037	265045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389466
7368	NC_013131	CTG	2	6	265058	265063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389466
7369	NC_013131	CGG	3	9	265064	265072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389466
7370	NC_013131	CTG	2	6	265076	265081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389466
7371	NC_013131	GCT	2	6	265102	265107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389466
7372	NC_013131	CGG	2	6	265139	265144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7373	NC_013131	ACG	2	6	265158	265163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7375	NC_013131	GCT	2	6	265204	265209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7376	NC_013131	TTG	2	6	265293	265298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7402	NC_013131	CGT	2	6	266265	266270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389467
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7490	NC_013131	GCA	3	9	268722	268730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389469
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7493	NC_013131	GC	3	6	268749	268754	0 %	0 %	50 %	50 %	256389469
7494	NC_013131	TCG	2	6	268760	268765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389469
7495	NC_013131	GTA	2	6	268792	268797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256389469
7496	NC_013131	CCG	2	6	268805	268810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389469
7497	NC_013131	CGGTGG	2	12	268857	268868	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	256389469
7498	NC_013131	GTG	2	6	268880	268885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256389469
7499	NC_013131	TCG	2	6	268908	268913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389469
7500	NC_013131	GC	3	6	268915	268920	0 %	0 %	50 %	50 %	256389469

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