MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Hodgkinia cicadicola Dsem chromosome

Total Repeats: 3587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_012960	GCTGGC	2	12	79697	79708	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253795648
2002	NC_012960	GCT	2	6	79727	79732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795648
2003	NC_012960	TGGC	2	8	79781	79788	0 %	25 %	50 %	25 %	253795648
2004	NC_012960	TGGC	2	8	79792	79799	0 %	25 %	50 %	25 %	253795648
2005	NC_012960	GC	3	6	79817	79822	0 %	0 %	50 %	50 %	253795648
2006	NC_012960	CTG	2	6	79825	79830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795648
2007	NC_012960	GC	4	8	79849	79856	0 %	0 %	50 %	50 %	253795648
2008	NC_012960	GC	3	6	79875	79880	0 %	0 %	50 %	50 %	253795648
2009	NC_012960	CTG	2	6	79912	79917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795648
2010	NC_012960	GC	4	8	79965	79972	0 %	0 %	50 %	50 %	253795648
2011	NC_012960	GC	3	6	79975	79980	0 %	0 %	50 %	50 %	253795648
2012	NC_012960	GCG	2	6	79998	80003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795648
2013	NC_012960	TGC	2	6	80004	80009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795648
2014	NC_012960	TCTG	2	8	80054	80061	0 %	50 %	25 %	25 %	253795648
2015	NC_012960	GTG	2	6	80062	80067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795648
2016	NC_012960	CA	3	6	80192	80197	50 %	0 %	0 %	50 %	253795649
2017	NC_012960	GCC	2	6	80200	80205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795649
2018	NC_012960	CCG	2	6	80207	80212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795649
2019	NC_012960	GCC	2	6	80239	80244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795649
2020	NC_012960	CG	3	6	80251	80256	0 %	0 %	50 %	50 %	253795649
2021	NC_012960	GC	3	6	80315	80320	0 %	0 %	50 %	50 %	253795649
2022	NC_012960	TG	3	6	80352	80357	0 %	50 %	50 %	0 %	253795649
2023	NC_012960	GCC	2	6	80366	80371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795649
2024	NC_012960	C	6	6	80370	80375	0 %	0 %	0 %	100 %	253795649
2025	NC_012960	CTA	2	6	80408	80413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253795649
2026	NC_012960	TGG	2	6	80417	80422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795649
2027	NC_012960	GCC	2	6	80466	80471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795649
2028	NC_012960	CG	3	6	80501	80506	0 %	0 %	50 %	50 %	253795649
2029	NC_012960	TGT	2	6	80532	80537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795649
2030	NC_012960	GCA	2	6	80609	80614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795649
2031	NC_012960	ACC	2	6	80719	80724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253795649
2032	NC_012960	TGC	2	6	80748	80753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795649
2033	NC_012960	TAT	2	6	80796	80801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253795649
2034	NC_012960	TCG	2	6	80839	80844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795649
2035	NC_012960	TGC	2	6	80966	80971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795649
2036	NC_012960	GCTA	2	8	80979	80986	25 %	25 %	25 %	25 %	253795649
2037	NC_012960	AGCG	2	8	80991	80998	25 %	0 %	50 %	25 %	253795649
2038	NC_012960	AAC	2	6	81044	81049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2039	NC_012960	AGCTG	2	10	81050	81059	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2040	NC_012960	GC	5	10	81085	81094	0 %	0 %	50 %	50 %	253795650
2041	NC_012960	GCTG	3	12	81112	81123	0 %	25 %	50 %	25 %	253795650
2042	NC_012960	CG	3	6	81128	81133	0 %	0 %	50 %	50 %	253795650
2043	NC_012960	CG	5	10	81167	81176	0 %	0 %	50 %	50 %	253795650
2044	NC_012960	CG	3	6	81200	81205	0 %	0 %	50 %	50 %	253795650
2045	NC_012960	AGCT	2	8	81225	81232	25 %	25 %	25 %	25 %	253795650
2046	NC_012960	TTG	2	6	81243	81248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795650
2047	NC_012960	GCC	2	6	81266	81271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2048	NC_012960	ACT	2	6	81320	81325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253795651
2049	NC_012960	GCG	2	6	81346	81351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795651
2050	NC_012960	CG	3	6	81350	81355	0 %	0 %	50 %	50 %	253795651
2051	NC_012960	TGC	2	6	81370	81375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795651
2052	NC_012960	GCCG	2	8	81408	81415	0 %	0 %	50 %	50 %	253795651
2053	NC_012960	GCG	2	6	81420	81425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795651
2054	NC_012960	GCGT	2	8	81454	81461	0 %	25 %	50 %	25 %	253795651
2055	NC_012960	CG	3	6	81463	81468	0 %	0 %	50 %	50 %	253795651
2056	NC_012960	GTG	2	6	81508	81513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795651
2057	NC_012960	TGC	2	6	81537	81542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795651
2058	NC_012960	CG	3	6	81571	81576	0 %	0 %	50 %	50 %	253795651
2059	NC_012960	GCT	2	6	81601	81606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795651
2060	NC_012960	TGGC	2	8	81629	81636	0 %	25 %	50 %	25 %	253795651
2061	NC_012960	CGT	2	6	81685	81690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795651
2062	NC_012960	CG	4	8	81729	81736	0 %	0 %	50 %	50 %	253795651
2063	NC_012960	CG	3	6	81742	81747	0 %	0 %	50 %	50 %	253795651
2064	NC_012960	GC	4	8	81752	81759	0 %	0 %	50 %	50 %	253795651
2065	NC_012960	GC	3	6	81761	81766	0 %	0 %	50 %	50 %	253795651
2066	NC_012960	TGC	2	6	81779	81784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795651
2067	NC_012960	GGC	2	6	81786	81791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795651
2068	NC_012960	GC	4	8	81794	81801	0 %	0 %	50 %	50 %	253795651
2069	NC_012960	TCCAAA	2	12	81841	81852	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	253795651
2070	NC_012960	GT	3	6	81869	81874	0 %	50 %	50 %	0 %	253795651
2071	NC_012960	CG	3	6	81886	81891	0 %	0 %	50 %	50 %	253795651
2072	NC_012960	GC	3	6	81913	81918	0 %	0 %	50 %	50 %	253795651
2073	NC_012960	GC	3	6	81940	81945	0 %	0 %	50 %	50 %	253795651
2074	NC_012960	GCGTTG	2	12	82013	82024	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	253795651
2075	NC_012960	CG	3	6	82025	82030	0 %	0 %	50 %	50 %	253795651
2076	NC_012960	GCT	2	6	82078	82083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795651
2077	NC_012960	GC	3	6	82104	82109	0 %	0 %	50 %	50 %	253795651
2078	NC_012960	GCC	2	6	82123	82128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795651
2079	NC_012960	TTG	2	6	82151	82156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795651
2080	NC_012960	GC	3	6	82160	82165	0 %	0 %	50 %	50 %	253795651
2081	NC_012960	CGG	2	6	82173	82178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795651
2082	NC_012960	GC	3	6	82179	82184	0 %	0 %	50 %	50 %	253795651
2083	NC_012960	GCT	2	6	82210	82215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795651
2084	NC_012960	TGGGCT	2	12	82232	82243	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	253795651
2085	NC_012960	GCTG	3	12	82298	82309	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2086	NC_012960	TGGC	2	8	82339	82346	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2087	NC_012960	GC	4	8	82345	82352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2088	NC_012960	GC	3	6	82379	82384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2089	NC_012960	GC	3	6	82427	82432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2090	NC_012960	GC	5	10	82482	82491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2091	NC_012960	GC	3	6	82534	82539	0 %	0 %	50 %	50 %	253795652
2092	NC_012960	TGGCA	2	10	82545	82554	20 %	20 %	40 %	20 %	253795652
2093	NC_012960	GC	4	8	82564	82571	0 %	0 %	50 %	50 %	253795652
2094	NC_012960	AAC	2	6	82573	82578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253795652
2095	NC_012960	GC	4	8	82590	82597	0 %	0 %	50 %	50 %	253795652
2096	NC_012960	CGT	2	6	82627	82632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795652
2097	NC_012960	TCG	2	6	82736	82741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795652
2098	NC_012960	CTG	2	6	82772	82777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795652
2099	NC_012960	CTG	2	6	82795	82800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795652
2100	NC_012960	CGC	2	6	82828	82833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795652
2101	NC_012960	GCC	2	6	82836	82841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795652
2102	NC_012960	CA	3	6	82862	82867	50 %	0 %	0 %	50 %	253795652
2103	NC_012960	GACT	2	8	82898	82905	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2104	NC_012960	GC	3	6	82937	82942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2105	NC_012960	ACGA	2	8	82976	82983	50 %	0 %	25 %	25 %	253795653
2106	NC_012960	CCTT	2	8	83003	83010	0 %	50 %	0 %	50 %	253795653
2107	NC_012960	CAG	2	6	83026	83031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795653
2108	NC_012960	ATC	2	6	83048	83053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253795653
2109	NC_012960	GTC	2	6	83080	83085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795653
2110	NC_012960	GTG	2	6	83177	83182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795653
2111	NC_012960	GCT	2	6	83229	83234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795653
2112	NC_012960	CAC	2	6	83296	83301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253795653
2113	NC_012960	CAG	2	6	83380	83385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795653
2114	NC_012960	T	6	6	83472	83477	0 %	100 %	0 %	0 %	253795653
2115	NC_012960	ACTTGA	2	12	83625	83636	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	253795653
2116	NC_012960	TGC	2	6	83708	83713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795653
2117	NC_012960	GGT	2	6	83741	83746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795654
2118	NC_012960	TGGC	2	8	83749	83756	0 %	25 %	50 %	25 %	253795654
2119	NC_012960	GC	3	6	83806	83811	0 %	0 %	50 %	50 %	253795654
2120	NC_012960	CG	3	6	83819	83824	0 %	0 %	50 %	50 %	253795654
2121	NC_012960	GC	5	10	83861	83870	0 %	0 %	50 %	50 %	253795654
2122	NC_012960	GCT	2	6	83879	83884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795655
2123	NC_012960	CG	3	6	83885	83890	0 %	0 %	50 %	50 %	253795655
2124	NC_012960	T	6	6	83948	83953	0 %	100 %	0 %	0 %	253795655
2125	NC_012960	TGA	2	6	83962	83967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795655
2126	NC_012960	GCC	2	6	83988	83993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795655
2127	NC_012960	GC	3	6	84049	84054	0 %	0 %	50 %	50 %	253795655
2128	NC_012960	GCC	2	6	84056	84061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795655
2129	NC_012960	GCCT	2	8	84086	84093	0 %	25 %	25 %	50 %	253795655
2130	NC_012960	ATG	2	6	84125	84130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795655
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2258	NC_012960	AAC	2	6	89043	89048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253795660
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2382	NC_012960	CG	3	6	94152	94157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2383	NC_012960	CAAC	2	8	94365	94372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2384	NC_012960	TGC	2	6	94401	94406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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