MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis B/Jali20/OT chromosome

Total Repeats: 23073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012686	TTTA	2	8	203844	203851	25 %	75 %	0 %	0 %	237802604
4502	NC_012686	CAT	2	6	203921	203926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802604
4503	NC_012686	CTT	3	9	203951	203959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802604
4504	NC_012686	TTTC	2	8	203990	203997	0 %	75 %	0 %	25 %	237802604
4505	NC_012686	ACA	2	6	204073	204078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802604
4506	NC_012686	TCC	2	6	204090	204095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802604
4507	NC_012686	TTC	3	9	204165	204173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802604
4508	NC_012686	GTT	2	6	204178	204183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802604
4509	NC_012686	T	6	6	204223	204228	0 %	100 %	0 %	0 %	237802604
4510	NC_012686	TGC	2	6	204262	204267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802604
4511	NC_012686	CTG	2	6	204285	204290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802604
4512	NC_012686	AG	3	6	204330	204335	50 %	0 %	50 %	0 %	237802604
4513	NC_012686	AAT	2	6	204355	204360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802604
4514	NC_012686	AGCT	2	8	204416	204423	25 %	25 %	25 %	25 %	237802604
4515	NC_012686	AAT	2	6	204458	204463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802604
4516	NC_012686	ACGA	2	8	204494	204501	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4517	NC_012686	CTAAG	2	10	204660	204669	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4518	NC_012686	T	6	6	204768	204773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_012686	GAAA	2	8	204780	204787	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_012686	A	7	7	204785	204791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_012686	T	7	7	204822	204828	0 %	100 %	0 %	0 %	237802605
4522	NC_012686	TGAA	2	8	204860	204867	50 %	25 %	25 %	0 %	237802605
4523	NC_012686	TCG	2	6	204974	204979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802605
4524	NC_012686	CTT	2	6	205080	205085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802605
4525	NC_012686	TG	3	6	205280	205285	0 %	50 %	50 %	0 %	237802605
4526	NC_012686	CAAGA	2	10	205301	205310	60 %	0 %	20 %	20 %	237802605
4527	NC_012686	AG	3	6	205357	205362	50 %	0 %	50 %	0 %	237802605
4528	NC_012686	TCC	2	6	205395	205400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802605
4529	NC_012686	CTT	2	6	205419	205424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802605
4530	NC_012686	ATTA	2	8	205453	205460	50 %	50 %	0 %	0 %	237802605
4531	NC_012686	AAAG	2	8	205475	205482	75 %	0 %	25 %	0 %	237802605
4532	NC_012686	ATA	2	6	205502	205507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802605
4533	NC_012686	T	6	6	205558	205563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_012686	CAT	2	6	205587	205592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_012686	CT	3	6	205633	205638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4536	NC_012686	AAT	2	6	205680	205685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_012686	TAG	2	6	205716	205721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_012686	AAT	2	6	205729	205734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_012686	AAG	2	6	205827	205832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_012686	CTT	2	6	205838	205843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_012686	A	6	6	205892	205897	100 %	0 %	0 %	0 %	237802606
4542	NC_012686	GTT	2	6	206024	206029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802606
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4544	NC_012686	G	6	6	206075	206080	0 %	0 %	100 %	0 %	237802606
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4546	NC_012686	TTG	2	6	206166	206171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802606
4547	NC_012686	CTG	2	6	206247	206252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802606
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4549	NC_012686	GT	3	6	206320	206325	0 %	50 %	50 %	0 %	237802606
4550	NC_012686	CTTTA	2	10	206348	206357	20 %	60 %	0 %	20 %	237802606
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4552	NC_012686	TCTA	2	8	206525	206532	25 %	50 %	0 %	25 %	237802606
4553	NC_012686	TATT	2	8	206603	206610	25 %	75 %	0 %	0 %	237802606
4554	NC_012686	TCT	2	6	206650	206655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802607
4555	NC_012686	CT	3	6	206679	206684	0 %	50 %	0 %	50 %	237802607
4556	NC_012686	CTA	2	6	206692	206697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802607
4557	NC_012686	GA	3	6	206698	206703	50 %	0 %	50 %	0 %	237802607
4558	NC_012686	CGA	2	6	206799	206804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802607
4559	NC_012686	ATC	2	6	206837	206842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802607
4560	NC_012686	TCT	2	6	206848	206853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802607
4561	NC_012686	ATT	2	6	206977	206982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802607
4562	NC_012686	AAACC	2	10	207173	207182	60 %	0 %	0 %	40 %	237802607
4563	NC_012686	GCA	2	6	207209	207214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802607
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4566	NC_012686	TTG	2	6	207500	207505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802607
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4572	NC_012686	CAG	2	6	207701	207706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802607
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4575	NC_012686	GTC	2	6	207847	207852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802607
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4580	NC_012686	TTG	2	6	208079	208084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802607
4581	NC_012686	GATG	2	8	208100	208107	25 %	25 %	50 %	0 %	237802607
4582	NC_012686	ATTC	2	8	208173	208180	25 %	50 %	0 %	25 %	237802607
4583	NC_012686	GCT	2	6	208183	208188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802607
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4591	NC_012686	T	7	7	208722	208728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_012686	CT	4	8	208740	208747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4593	NC_012686	A	6	6	208749	208754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_012686	GAA	2	6	208783	208788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802609
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4596	NC_012686	AGGA	2	8	208904	208911	50 %	0 %	50 %	0 %	237802609
4597	NC_012686	TTTG	2	8	208927	208934	0 %	75 %	25 %	0 %	237802609
4598	NC_012686	GAA	2	6	208978	208983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802609
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4604	NC_012686	ACC	2	6	209178	209183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	237802609
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4608	NC_012686	TGA	2	6	209343	209348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802609
4609	NC_012686	ATT	2	6	209372	209377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802609
4610	NC_012686	CT	3	6	209426	209431	0 %	50 %	0 %	50 %	237802609
4611	NC_012686	TTC	2	6	209515	209520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802609
4612	NC_012686	GCT	2	6	209568	209573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802609
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4615	NC_012686	A	7	7	209622	209628	100 %	0 %	0 %	0 %	237802609
4616	NC_012686	A	6	6	209630	209635	100 %	0 %	0 %	0 %	237802609
4617	NC_012686	TTC	2	6	209654	209659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802609
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4622	NC_012686	TTAC	2	8	209829	209836	25 %	50 %	0 %	25 %	237802609
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4624	NC_012686	A	6	6	209887	209892	100 %	0 %	0 %	0 %	237802609
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4872	NC_012686	GTC	2	6	221583	221588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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