MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ

Total Repeats: 8415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012654	CAC	2	6	7	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_012654	CTTT	2	8	33	40	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_012654	AGTT	2	8	49	56	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012654	TTTGT	2	10	60	69	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012654	A	6	6	83	88	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012654	TCT	2	6	119	124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587272
7	NC_012654	AT	3	6	127	132	50 %	50 %	0 %	0 %	229587272
8	NC_012654	TAA	2	6	134	139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587272
9	NC_012654	TTC	2	6	141	146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587272
10	NC_012654	TCTTT	2	10	182	191	0 %	80 %	0 %	20 %	229587272
11	NC_012654	TCTT	2	8	214	221	0 %	75 %	0 %	25 %	229587272
12	NC_012654	TGT	2	6	228	233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587272
13	NC_012654	AAT	2	6	253	258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587272
14	NC_012654	TTA	2	6	281	286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587272
15	NC_012654	T	7	7	290	296	0 %	100 %	0 %	0 %	229587272
16	NC_012654	TAAA	2	8	299	306	75 %	25 %	0 %	0 %	229587272
17	NC_012654	AAT	2	6	324	329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587272
18	NC_012654	TAA	2	6	380	385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587272
19	NC_012654	TA	3	6	397	402	50 %	50 %	0 %	0 %	229587272
20	NC_012654	ATA	2	6	429	434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012654	TAAT	2	8	495	502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012654	AT	3	6	525	530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012654	TAA	3	9	552	560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012654	AT	3	6	593	598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012654	ATCT	2	8	626	633	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012654	AT	3	6	634	639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012654	ATT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012654	A	6	6	658	663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012654	A	6	6	670	675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012654	A	7	7	679	685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012654	ATA	2	6	704	709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012654	ATA	2	6	720	725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012654	AT	3	6	727	732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012654	T	7	7	817	823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012654	T	6	6	891	896	0 %	100 %	0 %	0 %	229587273
36	NC_012654	TTG	2	6	966	971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587273
37	NC_012654	ATA	2	6	986	991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587273
38	NC_012654	ATTT	2	8	1014	1021	25 %	75 %	0 %	0 %	229587273
39	NC_012654	TCT	2	6	1123	1128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587273
40	NC_012654	TA	3	6	1142	1147	50 %	50 %	0 %	0 %	229587273
41	NC_012654	TAG	2	6	1178	1183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587273
42	NC_012654	TA	3	6	1262	1267	50 %	50 %	0 %	0 %	229587273
43	NC_012654	T	7	7	1275	1281	0 %	100 %	0 %	0 %	229587273
44	NC_012654	ATT	2	6	1290	1295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587273
45	NC_012654	T	6	6	1294	1299	0 %	100 %	0 %	0 %	229587273
46	NC_012654	ATT	2	6	1308	1313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587273
47	NC_012654	ATT	2	6	1323	1328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587273
48	NC_012654	TAT	2	6	1329	1334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587273
49	NC_012654	TAG	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587273
50	NC_012654	TTA	2	6	1412	1417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587273
51	NC_012654	ATA	2	6	1420	1425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587273
52	NC_012654	T	6	6	1434	1439	0 %	100 %	0 %	0 %	229587273
53	NC_012654	TAA	2	6	1479	1484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012654	AT	3	6	1504	1509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012654	GTT	2	6	1545	1550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012654	TTTAA	2	10	1598	1607	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012654	AT	3	6	1639	1644	50 %	50 %	0 %	0 %	229587274
58	NC_012654	AT	3	6	1716	1721	50 %	50 %	0 %	0 %	229587274
59	NC_012654	TA	3	6	1724	1729	50 %	50 %	0 %	0 %	229587274
60	NC_012654	ATC	2	6	1736	1741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587274
61	NC_012654	AAT	2	6	1742	1747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587274
62	NC_012654	CTTT	2	8	1820	1827	0 %	75 %	0 %	25 %	229587274
63	NC_012654	ATC	2	6	1838	1843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587274
64	NC_012654	ATT	2	6	1851	1856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587274
65	NC_012654	TTTA	2	8	1883	1890	25 %	75 %	0 %	0 %	229587274
66	NC_012654	AAT	2	6	1910	1915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587274
67	NC_012654	ATC	2	6	1920	1925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587274
68	NC_012654	ATT	2	6	1946	1951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012654	TAAT	2	8	1952	1959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012654	TAT	2	6	1960	1965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012654	ATT	2	6	1969	1974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012654	A	6	6	2088	2093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012654	ATA	2	6	2099	2104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012654	TA	3	6	2106	2111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012654	TAA	2	6	2126	2131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012654	TA	3	6	2143	2148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012654	TTC	2	6	2157	2162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012654	A	7	7	2165	2171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012654	T	7	7	2209	2215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012654	TAA	2	6	2235	2240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012654	TAG	2	6	2248	2253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012654	CTATA	2	10	2288	2297	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_012654	T	7	7	2306	2312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012654	ATC	2	6	2328	2333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012654	CTTT	2	8	2438	2445	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_012654	ATTA	2	8	2501	2508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012654	TCAT	2	8	2513	2520	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_012654	T	7	7	2588	2594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012654	CTA	2	6	2602	2607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_012654	TTC	2	6	2612	2617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_012654	ATT	2	6	2648	2653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012654	ATAA	2	8	2676	2683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012654	ATA	2	6	2729	2734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012654	ATTA	2	8	2739	2746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012654	A	6	6	2748	2753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012654	ATTT	2	8	2775	2782	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012654	A	6	6	2800	2805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012654	ATT	2	6	2828	2833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012654	AT	3	6	2855	2860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012654	T	6	6	2955	2960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012654	TAA	2	6	2968	2973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012654	TAGCA	2	10	3002	3011	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_012654	ATTA	2	8	3102	3109	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
104	NC_012654	TC	3	6	3120	3125	0 %	50 %	0 %	50 %	229587275
105	NC_012654	CATC	2	8	3126	3133	25 %	25 %	0 %	50 %	229587275
106	NC_012654	CTA	2	6	3171	3176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
107	NC_012654	TAT	2	6	3193	3198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
108	NC_012654	CTA	2	6	3211	3216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
109	NC_012654	TAT	2	6	3226	3231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
110	NC_012654	TGA	2	6	3237	3242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587275
111	NC_012654	ATT	2	6	3269	3274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
112	NC_012654	ATTT	2	8	3295	3302	25 %	75 %	0 %	0 %	229587275
113	NC_012654	T	6	6	3318	3323	0 %	100 %	0 %	0 %	229587275
114	NC_012654	TAC	3	9	3332	3340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
115	NC_012654	T	6	6	3385	3390	0 %	100 %	0 %	0 %	229587275
116	NC_012654	GCCT	2	8	3395	3402	0 %	25 %	25 %	50 %	229587275
117	NC_012654	TAG	2	6	3412	3417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587275
118	NC_012654	ACT	2	6	3441	3446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
119	NC_012654	AT	3	6	3453	3458	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
120	NC_012654	ATT	2	6	3467	3472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
121	NC_012654	T	7	7	3506	3512	0 %	100 %	0 %	0 %	229587275
122	NC_012654	ATA	2	6	3513	3518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
123	NC_012654	TAAA	2	8	3548	3555	75 %	25 %	0 %	0 %	229587275
124	NC_012654	ATT	2	6	3617	3622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
125	NC_012654	ATTT	2	8	3634	3641	25 %	75 %	0 %	0 %	229587275
126	NC_012654	AAT	2	6	3685	3690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
127	NC_012654	TGAT	2	8	3722	3729	25 %	50 %	25 %	0 %	229587275
128	NC_012654	TTA	2	6	3843	3848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
129	NC_012654	TA	3	6	3905	3910	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
130	NC_012654	TAT	2	6	3931	3936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
131	NC_012654	TA	3	6	3965	3970	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
132	NC_012654	AT	3	6	3976	3981	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
133	NC_012654	ACT	2	6	4005	4010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
134	NC_012654	ATT	2	6	4047	4052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
135	NC_012654	ATT	2	6	4085	4090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
136	NC_012654	TAT	2	6	4103	4108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
137	NC_012654	ATT	2	6	4118	4123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
138	NC_012654	CATA	2	8	4183	4190	50 %	25 %	0 %	25 %	229587275
139	NC_012654	TAT	2	6	4192	4197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
140	NC_012654	T	6	6	4209	4214	0 %	100 %	0 %	0 %	229587275
141	NC_012654	TAC	2	6	4231	4236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
142	NC_012654	ATTA	2	8	4244	4251	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
143	NC_012654	TA	3	6	4300	4305	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
144	NC_012654	ATC	3	9	4337	4345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587275
145	NC_012654	TA	3	6	4348	4353	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
146	NC_012654	AT	3	6	4389	4394	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
147	NC_012654	ATA	2	6	4408	4413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
148	NC_012654	T	6	6	4415	4420	0 %	100 %	0 %	0 %	229587275
149	NC_012654	TAT	2	6	4468	4473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
150	NC_012654	TAT	2	6	4519	4524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
151	NC_012654	AT	4	8	4526	4533	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
152	NC_012654	TAA	2	6	4538	4543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587275
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157	NC_012654	T	6	6	4796	4801	0 %	100 %	0 %	0 %	229587275
158	NC_012654	T	6	6	4804	4809	0 %	100 %	0 %	0 %	229587275
159	NC_012654	TTA	2	6	4813	4818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587275
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161	NC_012654	TA	3	6	4859	4864	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
162	NC_012654	TA	3	6	5053	5058	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
163	NC_012654	TA	3	6	5087	5092	50 %	50 %	0 %	0 %	229587275
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172	NC_012654	T	6	6	5373	5378	0 %	100 %	0 %	0 %	229587275
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178	NC_012654	TCT	2	6	5592	5597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587275
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262	NC_012654	ATC	2	6	7773	7778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587276
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271	NC_012654	A	6	6	8188	8193	100 %	0 %	0 %	0 %	229587276
272	NC_012654	AAT	2	6	8250	8255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587276
273	NC_012654	TTAT	2	8	8290	8297	25 %	75 %	0 %	0 %	229587276
274	NC_012654	ATT	2	6	8298	8303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587276
275	NC_012654	AT	4	8	8337	8344	50 %	50 %	0 %	0 %	229587276
276	NC_012654	A	6	6	8377	8382	100 %	0 %	0 %	0 %	229587276
277	NC_012654	ATT	2	6	8391	8396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587276
278	NC_012654	TGT	3	9	8439	8447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587276
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415	NC_012654	AAAT	2	8	12714	12721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
416	NC_012654	CAAA	2	8	12727	12734	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
417	NC_012654	CAAT	2	8	12763	12770	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
418	NC_012654	ATAA	2	8	12790	12797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
419	NC_012654	TCATG	2	10	12824	12833	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
420	NC_012654	AAATAT	2	12	12862	12873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_012654	TTA	2	6	12943	12948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_012654	ATG	2	6	13065	13070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
423	NC_012654	ATA	2	6	13085	13090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_012654	GAC	2	6	13092	13097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
425	NC_012654	ATG	2	6	13126	13131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
426	NC_012654	CTAT	2	8	13136	13143	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
427	NC_012654	ATA	2	6	13148	13153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_012654	TCA	2	6	13172	13177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
429	NC_012654	TAG	3	9	13201	13209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
430	NC_012654	T	6	6	13241	13246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NC_012654	TAAA	2	8	13294	13301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_012654	CTT	2	6	13314	13319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_012654	ATA	2	6	13362	13367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_012654	AT	3	6	13406	13411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_012654	TAT	2	6	13414	13419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_012654	ACA	2	6	13485	13490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
437	NC_012654	TAAT	2	8	13492	13499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_012654	TGA	2	6	13516	13521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
439	NC_012654	GAT	2	6	13551	13556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
440	NC_012654	ATT	2	6	13659	13664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_012654	TC	3	6	13714	13719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
442	NC_012654	TAT	2	6	13752	13757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_012654	A	6	6	13823	13828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_012654	TGA	2	6	13866	13871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587279
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446	NC_012654	A	7	7	14046	14052	100 %	0 %	0 %	0 %	229587279
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449	NC_012654	A	6	6	14109	14114	100 %	0 %	0 %	0 %	229587279
450	NC_012654	TA	3	6	14141	14146	50 %	50 %	0 %	0 %	229587279
451	NC_012654	TAA	2	6	14163	14168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587279
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454	NC_012654	TTA	2	6	14230	14235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587279
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459	NC_012654	A	6	6	14332	14337	100 %	0 %	0 %	0 %	229587280
460	NC_012654	ACT	2	6	14349	14354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587280
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477	NC_012654	A	6	6	14852	14857	100 %	0 %	0 %	0 %	229587280
478	NC_012654	TA	3	6	14889	14894	50 %	50 %	0 %	0 %	229587280
479	NC_012654	A	6	6	14900	14905	100 %	0 %	0 %	0 %	229587280
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