MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 97323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
76001	NC_011884	GATG	2	8	4199650	4199657	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76002	NC_011884	T	6	6	4199660	4199665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76003	NC_011884	CTTG	2	8	4199700	4199707	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76004	NC_011884	GAT	2	6	4199734	4199739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76005	NC_011884	T	6	6	4199856	4199861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76006	NC_011884	CTT	2	6	4199888	4199893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76007	NC_011884	AATCC	2	10	4199899	4199908	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
76008	NC_011884	GGA	2	6	4199935	4199940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220909506
76009	NC_011884	TAATTG	2	12	4200011	4200022	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	220909506
76010	NC_011884	GCTT	2	8	4200064	4200071	0 %	50 %	25 %	25 %	220909506
76011	NC_011884	TGTT	2	8	4200108	4200115	0 %	75 %	25 %	0 %	220909506
76012	NC_011884	AGG	2	6	4200227	4200232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220909506
76013	NC_011884	TTG	2	6	4200262	4200267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220909506
76014	NC_011884	TTA	2	6	4200295	4200300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220909506
76015	NC_011884	TGA	2	6	4200530	4200535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220909506
76016	NC_011884	GAA	2	6	4200538	4200543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220909506
76017	NC_011884	ATG	2	6	4200601	4200606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220909506
76018	NC_011884	GAG	2	6	4200665	4200670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220909506
76019	NC_011884	AT	3	6	4200679	4200684	50 %	50 %	0 %	0 %	220909506
76020	NC_011884	ATCC	3	12	4200704	4200715	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76021	NC_011884	CGG	2	6	4200743	4200748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76022	NC_011884	CTG	2	6	4200824	4200829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76023	NC_011884	AG	5	10	4200890	4200899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76024	NC_011884	TGG	2	6	4200912	4200917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76025	NC_011884	TAGC	2	8	4200932	4200939	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76026	NC_011884	A	7	7	4200942	4200948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76027	NC_011884	GGC	2	6	4200971	4200976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76028	NC_011884	TAG	2	6	4200979	4200984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76029	NC_011884	CTT	2	6	4201172	4201177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220909507
76030	NC_011884	ACTCT	2	10	4201224	4201233	20 %	40 %	0 %	40 %	220909507
76031	NC_011884	CTC	2	6	4201242	4201247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220909507
76032	NC_011884	TC	3	6	4201270	4201275	0 %	50 %	0 %	50 %	220909507
76033	NC_011884	ATT	2	6	4201285	4201290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220909507
76034	NC_011884	ATT	2	6	4201292	4201297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220909507
76035	NC_011884	GGGA	2	8	4201372	4201379	25 %	0 %	75 %	0 %	220909507
76036	NC_011884	ACC	2	6	4201403	4201408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220909507
76037	NC_011884	GA	3	6	4201459	4201464	50 %	0 %	50 %	0 %	220909507
76038	NC_011884	ACAA	2	8	4201522	4201529	75 %	0 %	0 %	25 %	220909507
76039	NC_011884	TAA	2	6	4201537	4201542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220909507
76040	NC_011884	T	8	8	4201575	4201582	0 %	100 %	0 %	0 %	220909507
76041	NC_011884	ACA	2	6	4201660	4201665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76042	NC_011884	AGCC	2	8	4201690	4201697	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76043	NC_011884	CAT	2	6	4201707	4201712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76044	NC_011884	AAT	2	6	4201907	4201912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76045	NC_011884	AT	3	6	4201930	4201935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76046	NC_011884	AG	3	6	4202053	4202058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76047	NC_011884	TC	3	6	4202097	4202102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76048	NC_011884	CCT	2	6	4202145	4202150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76049	NC_011884	TA	3	6	4202224	4202229	50 %	50 %	0 %	0 %	220909508
76050	NC_011884	ATG	2	6	4202233	4202238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220909508
76051	NC_011884	ATT	2	6	4202352	4202357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220909508
76052	NC_011884	TCG	2	6	4202387	4202392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220909508
76053	NC_011884	AAG	2	6	4202452	4202457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220909508
76054	NC_011884	TGGGC	2	10	4202510	4202519	0 %	20 %	60 %	20 %	220909508
76055	NC_011884	CTGC	2	8	4202609	4202616	0 %	25 %	25 %	50 %	220909508
76056	NC_011884	GAA	2	6	4202706	4202711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220909508
76057	NC_011884	A	6	6	4202888	4202893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76058	NC_011884	TA	3	6	4202911	4202916	50 %	50 %	0 %	0 %	220909509
76059	NC_011884	TGA	2	6	4202918	4202923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220909509
76060	NC_011884	TC	3	6	4202953	4202958	0 %	50 %	0 %	50 %	220909509
76061	NC_011884	ACA	3	9	4202962	4202970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220909509
76062	NC_011884	GGA	2	6	4203038	4203043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220909509
76063	NC_011884	GCA	2	6	4203051	4203056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220909509
76064	NC_011884	AGA	2	6	4203115	4203120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220909509
76065	NC_011884	TCAA	2	8	4203166	4203173	50 %	25 %	0 %	25 %	220909509
76066	NC_011884	ACT	2	6	4203176	4203181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220909509
76067	NC_011884	ACT	2	6	4203280	4203285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220909509
76068	NC_011884	ATTG	2	8	4203330	4203337	25 %	50 %	25 %	0 %	220909509
76069	NC_011884	AG	3	6	4203389	4203394	50 %	0 %	50 %	0 %	220909509
76070	NC_011884	CTT	2	6	4203405	4203410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220909509
76071	NC_011884	AGT	2	6	4203431	4203436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220909509
76072	NC_011884	AAG	3	9	4203664	4203672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220909510
76073	NC_011884	CAT	3	9	4203813	4203821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220909510
76074	NC_011884	CAC	2	6	4203849	4203854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220909510
76075	NC_011884	AAT	2	6	4203886	4203891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220909510
76076	NC_011884	GAA	2	6	4203954	4203959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220909510
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76078	NC_011884	T	7	7	4204138	4204144	0 %	100 %	0 %	0 %	220909511
76079	NC_011884	GGT	2	6	4204159	4204164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220909511
76080	NC_011884	TCC	2	6	4204269	4204274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220909511
76081	NC_011884	CCG	2	6	4204283	4204288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220909511
76082	NC_011884	GGC	2	6	4204388	4204393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220909511
76083	NC_011884	ACAT	2	8	4204404	4204411	50 %	25 %	0 %	25 %	220909511
76084	NC_011884	TGA	2	6	4204416	4204421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220909511
76085	NC_011884	CGT	2	6	4204466	4204471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220909511
76086	NC_011884	TTC	2	6	4204499	4204504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220909511
76087	NC_011884	AG	3	6	4204626	4204631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76088	NC_011884	ACTT	2	8	4204646	4204653	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76089	NC_011884	CCCA	2	8	4204720	4204727	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
76090	NC_011884	GAT	2	6	4204745	4204750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76091	NC_011884	GAA	2	6	4204764	4204769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76092	NC_011884	TCC	3	9	4204920	4204928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76093	NC_011884	CGATT	2	10	4205004	4205013	20 %	40 %	20 %	20 %	220909512
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76095	NC_011884	CTT	2	6	4205238	4205243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220909512
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76100	NC_011884	TGA	2	6	4205508	4205513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220909513
76101	NC_011884	CT	3	6	4205525	4205530	0 %	50 %	0 %	50 %	220909513
76102	NC_011884	TCT	2	6	4205535	4205540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220909513
76103	NC_011884	CTGT	2	8	4205598	4205605	0 %	50 %	25 %	25 %	220909513
76104	NC_011884	GGT	2	6	4205641	4205646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220909513
76105	NC_011884	AGTG	2	8	4205652	4205659	25 %	25 %	50 %	0 %	220909513
76106	NC_011884	CAGG	2	8	4205665	4205672	25 %	0 %	50 %	25 %	220909513
76107	NC_011884	AGGCA	2	10	4205704	4205713	40 %	0 %	40 %	20 %	220909513
76108	NC_011884	AGCTTG	2	12	4205731	4205742	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220909513
76109	NC_011884	ACC	2	6	4205801	4205806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220909513
76110	NC_011884	ACC	2	6	4205822	4205827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220909513
76111	NC_011884	GAT	2	6	4205926	4205931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220909513
76112	NC_011884	GTT	2	6	4205947	4205952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220909513
76113	NC_011884	TGG	2	6	4205984	4205989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220909513
76114	NC_011884	TTGGTC	2	12	4206087	4206098	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	220909513
76115	NC_011884	AAAT	2	8	4206130	4206137	75 %	25 %	0 %	0 %	220909513
76116	NC_011884	TC	3	6	4206201	4206206	0 %	50 %	0 %	50 %	220909513
76117	NC_011884	GCA	2	6	4206282	4206287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220909513
76118	NC_011884	GTC	2	6	4206376	4206381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220909513
76119	NC_011884	AC	3	6	4206407	4206412	50 %	0 %	0 %	50 %	220909513
76120	NC_011884	CATT	2	8	4206491	4206498	25 %	50 %	0 %	25 %	220909513
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76124	NC_011884	GCTT	2	8	4206791	4206798	0 %	50 %	25 %	25 %	220909513
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76477	NC_011884	CTC	2	6	4225862	4225867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76478	NC_011884	CCTA	2	8	4225965	4225972	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76479	NC_011884	TCT	2	6	4226014	4226019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220909535
76480	NC_011884	CT	3	6	4226038	4226043	0 %	50 %	0 %	50 %	220909535
76481	NC_011884	TCGT	2	8	4226076	4226083	0 %	50 %	25 %	25 %	220909535
76482	NC_011884	ACC	2	6	4226111	4226116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220909535
76483	NC_011884	ATTCA	2	10	4226153	4226162	40 %	40 %	0 %	20 %	220909535
76484	NC_011884	CTA	2	6	4226170	4226175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220909535
76485	NC_011884	ATG	2	6	4226377	4226382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76486	NC_011884	GAT	2	6	4226394	4226399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76487	NC_011884	GAA	2	6	4226400	4226405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76488	NC_011884	GAA	2	6	4226420	4226425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76489	NC_011884	GA	3	6	4226427	4226432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76490	NC_011884	ATG	2	6	4226528	4226533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220909536
76491	NC_011884	GTG	2	6	4226537	4226542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220909536
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76496	NC_011884	T	6	6	4226979	4226984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76497	NC_011884	GTCA	2	8	4227024	4227031	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76498	NC_011884	T	6	6	4227039	4227044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76499	NC_011884	CAT	2	6	4227052	4227057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76500	NC_011884	GGC	2	6	4227079	4227084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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