MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 97323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
75001	NC_011884	CT	3	6	4145425	4145430	0 %	50 %	0 %	50 %	220909471
75002	NC_011884	AAC	2	6	4145451	4145456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220909471
75003	NC_011884	TTCA	2	8	4145465	4145472	25 %	50 %	0 %	25 %	220909471
75004	NC_011884	CA	3	6	4145471	4145476	50 %	0 %	0 %	50 %	220909471
75005	NC_011884	GAT	2	6	4145506	4145511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220909471
75006	NC_011884	CTC	2	6	4145531	4145536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220909471
75007	NC_011884	TTG	2	6	4145645	4145650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220909471
75008	NC_011884	CCTC	2	8	4145795	4145802	0 %	25 %	0 %	75 %	220909471
75009	NC_011884	AGA	2	6	4145809	4145814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220909471
75010	NC_011884	TCC	2	6	4145874	4145879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220909471
75011	NC_011884	AAT	2	6	4145923	4145928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220909471
75012	NC_011884	GC	3	6	4145941	4145946	0 %	0 %	50 %	50 %	220909471
75013	NC_011884	CAA	2	6	4146011	4146016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220909471
75014	NC_011884	GCC	2	6	4146138	4146143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75015	NC_011884	TAC	2	6	4146146	4146151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75016	NC_011884	ATC	2	6	4146234	4146239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220909472
75017	NC_011884	TCA	2	6	4146247	4146252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220909472
75018	NC_011884	GCA	2	6	4146278	4146283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220909472
75019	NC_011884	GCT	2	6	4146304	4146309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220909472
75020	NC_011884	ATCT	2	8	4146314	4146321	25 %	50 %	0 %	25 %	220909472
75021	NC_011884	CAG	2	6	4146377	4146382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220909472
75022	NC_011884	TCAG	2	8	4146424	4146431	25 %	25 %	25 %	25 %	220909472
75023	NC_011884	C	6	6	4146480	4146485	0 %	0 %	0 %	100 %	220909472
75024	NC_011884	TTGGT	2	10	4146527	4146536	0 %	60 %	40 %	0 %	220909472
75025	NC_011884	ATC	2	6	4146550	4146555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220909472
75026	NC_011884	AAT	2	6	4146594	4146599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220909472
75027	NC_011884	AG	3	6	4146622	4146627	50 %	0 %	50 %	0 %	220909472
75028	NC_011884	GTA	2	6	4146651	4146656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220909472
75029	NC_011884	TCC	2	6	4146700	4146705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220909472
75030	NC_011884	TCA	2	6	4146841	4146846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220909472
75031	NC_011884	CAA	2	6	4146875	4146880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220909472
75032	NC_011884	GAC	2	6	4146960	4146965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220909472
75033	NC_011884	CAC	2	6	4147019	4147024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220909472
75034	NC_011884	TAG	2	6	4147067	4147072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220909472
75035	NC_011884	GAC	2	6	4147102	4147107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220909472
75036	NC_011884	TTC	2	6	4147132	4147137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220909472
75037	NC_011884	TCA	2	6	4147198	4147203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220909472
75038	NC_011884	TAC	2	6	4147259	4147264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220909472
75039	NC_011884	GAG	2	6	4147270	4147275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220909472
75040	NC_011884	T	7	7	4147385	4147391	0 %	100 %	0 %	0 %	220909472
75041	NC_011884	ACT	2	6	4147410	4147415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220909472
75042	NC_011884	GTT	2	6	4147420	4147425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75043	NC_011884	GTATA	2	10	4147434	4147443	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75044	NC_011884	CTT	2	6	4147506	4147511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75045	NC_011884	AGCCA	2	10	4147522	4147531	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
75046	NC_011884	AAG	2	6	4147544	4147549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75047	NC_011884	ATTA	2	8	4147550	4147557	50 %	50 %	0 %	0 %	220909473
75048	NC_011884	CGC	3	9	4147564	4147572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220909473
75049	NC_011884	ACC	2	6	4147682	4147687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220909473
75050	NC_011884	CGAG	2	8	4147692	4147699	25 %	0 %	50 %	25 %	220909473
75051	NC_011884	CGT	2	6	4147706	4147711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220909473
75052	NC_011884	GAA	2	6	4147718	4147723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220909473
75053	NC_011884	AGA	3	9	4147736	4147744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220909473
75054	NC_011884	AAAT	2	8	4147761	4147768	75 %	25 %	0 %	0 %	220909473
75055	NC_011884	TGAC	2	8	4147822	4147829	25 %	25 %	25 %	25 %	220909473
75056	NC_011884	TAC	3	9	4147850	4147858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220909473
75057	NC_011884	TGT	2	6	4147883	4147888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220909473
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75059	NC_011884	GCG	2	6	4147974	4147979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220909473
75060	NC_011884	TA	3	6	4147983	4147988	50 %	50 %	0 %	0 %	220909473
75061	NC_011884	GGGA	2	8	4148021	4148028	25 %	0 %	75 %	0 %	220909473
75062	NC_011884	GCG	2	6	4148051	4148056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220909473
75063	NC_011884	ACA	2	6	4148083	4148088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220909473
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75067	NC_011884	GAA	2	6	4148301	4148306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75068	NC_011884	G	6	6	4148309	4148314	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75069	NC_011884	GCCT	2	8	4148320	4148327	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75070	NC_011884	TCG	2	6	4148434	4148439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75071	NC_011884	TGC	2	6	4148449	4148454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75072	NC_011884	A	7	7	4148463	4148469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75073	NC_011884	CCT	2	6	4148525	4148530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75074	NC_011884	GGGT	2	8	4148541	4148548	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
75075	NC_011884	GCA	2	6	4148598	4148603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75076	NC_011884	CT	3	6	4148708	4148713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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75078	NC_011884	CGATC	2	10	4148826	4148835	20 %	20 %	20 %	40 %	220909474
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75084	NC_011884	CAA	2	6	4149041	4149046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220909475
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75086	NC_011884	TTGCCG	2	12	4149084	4149095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220909475
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75090	NC_011884	GGCAG	2	10	4149298	4149307	20 %	0 %	60 %	20 %	220909475
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75108	NC_011884	G	6	6	4150323	4150328	0 %	0 %	100 %	0 %	220909475
75109	NC_011884	GCTG	2	8	4150332	4150339	0 %	25 %	50 %	25 %	220909475
75110	NC_011884	CGC	2	6	4150353	4150358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220909475
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75116	NC_011884	GCC	2	6	4150538	4150543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220909475
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75157	NC_011884	CCTTT	2	10	4152789	4152798	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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75350	NC_011884	TA	3	6	4162728	4162733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75351	NC_011884	GCCT	2	8	4162797	4162804	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75352	NC_011884	GCT	2	6	4162810	4162815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75353	NC_011884	TAT	2	6	4162817	4162822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75354	NC_011884	CTGA	2	8	4162829	4162836	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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