MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 97323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
72501	NC_011884	TACT	2	8	4007467	4007474	25 %	50 %	0 %	25 %	220909340
72502	NC_011884	CAAAGG	2	12	4007483	4007494	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	220909340
72503	NC_011884	ACC	2	6	4007515	4007520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220909340
72504	NC_011884	AGA	2	6	4007564	4007569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220909340
72505	NC_011884	CAG	2	6	4007638	4007643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220909340
72506	NC_011884	AGT	2	6	4007711	4007716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220909340
72507	NC_011884	ACC	2	6	4007830	4007835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72508	NC_011884	ACA	2	6	4007857	4007862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72509	NC_011884	ATG	2	6	4007895	4007900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72510	NC_011884	TG	3	6	4007938	4007943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72511	NC_011884	TAC	2	6	4007981	4007986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72512	NC_011884	GTC	2	6	4007990	4007995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72513	NC_011884	CTTAA	2	10	4008018	4008027	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72514	NC_011884	GGT	2	6	4008031	4008036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72515	NC_011884	TTTC	2	8	4008050	4008057	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72516	NC_011884	CAA	2	6	4008064	4008069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72517	NC_011884	TTC	2	6	4008118	4008123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220909341
72518	NC_011884	GAA	2	6	4008226	4008231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220909341
72519	NC_011884	ATG	2	6	4008322	4008327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220909341
72520	NC_011884	TCAA	2	8	4008408	4008415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72521	NC_011884	CAAC	2	8	4008423	4008430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72522	NC_011884	TTC	2	6	4008478	4008483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220909342
72523	NC_011884	ACA	4	12	4008527	4008538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220909342
72524	NC_011884	GAA	2	6	4008586	4008591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220909342
72525	NC_011884	GGT	2	6	4008676	4008681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220909342
72526	NC_011884	GAT	2	6	4008780	4008785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72527	NC_011884	TCA	2	6	4008866	4008871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72528	NC_011884	AACATC	2	12	4008923	4008934	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	220909343
72529	NC_011884	TTC	2	6	4008941	4008946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220909343
72530	NC_011884	AAC	2	6	4008992	4008997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220909343
72531	NC_011884	TTA	2	6	4009036	4009041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220909343
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72533	NC_011884	AGA	2	6	4009227	4009232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72534	NC_011884	AT	3	6	4009265	4009270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72535	NC_011884	CATT	2	8	4009334	4009341	25 %	50 %	0 %	25 %	220909344
72536	NC_011884	GCG	2	6	4009436	4009441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220909344
72537	NC_011884	GATTG	2	10	4009470	4009479	20 %	40 %	40 %	0 %	220909344
72538	NC_011884	GAT	2	6	4009481	4009486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220909344
72539	NC_011884	CT	3	6	4009514	4009519	0 %	50 %	0 %	50 %	220909344
72540	NC_011884	ATT	2	6	4009577	4009582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220909344
72541	NC_011884	CCAA	2	8	4009590	4009597	50 %	0 %	0 %	50 %	220909344
72542	NC_011884	CTG	2	6	4009629	4009634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220909344
72543	NC_011884	TGC	2	6	4009675	4009680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220909344
72544	NC_011884	CCAGC	2	10	4009710	4009719	20 %	0 %	20 %	60 %	220909344
72545	NC_011884	TAAT	2	8	4009809	4009816	50 %	50 %	0 %	0 %	220909344
72546	NC_011884	ACTT	2	8	4009872	4009879	25 %	50 %	0 %	25 %	220909344
72547	NC_011884	T	7	7	4009882	4009888	0 %	100 %	0 %	0 %	220909344
72548	NC_011884	TCAA	2	8	4009897	4009904	50 %	25 %	0 %	25 %	220909344
72549	NC_011884	TTA	2	6	4009924	4009929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220909344
72550	NC_011884	AGA	2	6	4010062	4010067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220909344
72551	NC_011884	CAT	2	6	4010094	4010099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220909344
72552	NC_011884	CAG	2	6	4010154	4010159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220909344
72553	NC_011884	CT	3	6	4010188	4010193	0 %	50 %	0 %	50 %	220909344
72554	NC_011884	TCC	2	6	4010240	4010245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220909344
72555	NC_011884	T	6	6	4010294	4010299	0 %	100 %	0 %	0 %	220909344
72556	NC_011884	GGTTG	2	10	4010378	4010387	0 %	40 %	60 %	0 %	220909344
72557	NC_011884	TG	3	6	4010462	4010467	0 %	50 %	50 %	0 %	220909344
72558	NC_011884	TGAT	2	8	4010535	4010542	25 %	50 %	25 %	0 %	220909344
72559	NC_011884	CTG	2	6	4010552	4010557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220909344
72560	NC_011884	GCT	2	6	4010650	4010655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220909344
72561	NC_011884	CAA	2	6	4010726	4010731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220909344
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72564	NC_011884	TCC	2	6	4010933	4010938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220909344
72565	NC_011884	CTC	2	6	4011092	4011097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220909344
72566	NC_011884	CTGGC	2	10	4011116	4011125	0 %	20 %	40 %	40 %	220909344
72567	NC_011884	GGC	2	6	4011145	4011150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220909344
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72569	NC_011884	ATG	2	6	4011195	4011200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220909344
72570	NC_011884	ATCA	2	8	4011391	4011398	50 %	25 %	0 %	25 %	220909344
72571	NC_011884	CGAT	2	8	4011541	4011548	25 %	25 %	25 %	25 %	220909344
72572	NC_011884	GTGGC	2	10	4011591	4011600	0 %	20 %	60 %	20 %	220909344
72573	NC_011884	CGG	2	6	4011742	4011747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220909344
72574	NC_011884	CT	3	6	4011811	4011816	0 %	50 %	0 %	50 %	220909344
72575	NC_011884	GCA	2	6	4011982	4011987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220909344
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72578	NC_011884	GCCCTG	2	12	4012076	4012087	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220909344
72579	NC_011884	TGC	2	6	4012096	4012101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220909344
72580	NC_011884	GCA	2	6	4012210	4012215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220909344
72581	NC_011884	TCAG	2	8	4012235	4012242	25 %	25 %	25 %	25 %	220909344
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72583	NC_011884	CTG	2	6	4012381	4012386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220909344
72584	NC_011884	CTG	3	9	4012409	4012417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220909344
72585	NC_011884	GCC	2	6	4012421	4012426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220909344
72586	NC_011884	GGT	2	6	4012480	4012485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220909344
72587	NC_011884	G	6	6	4012504	4012509	0 %	0 %	100 %	0 %	220909344
72588	NC_011884	ACC	2	6	4012531	4012536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220909344
72589	NC_011884	TTC	2	6	4012556	4012561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220909344
72590	NC_011884	TGT	2	6	4012629	4012634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220909344
72591	NC_011884	A	6	6	4012645	4012650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72592	NC_011884	CCTG	2	8	4012769	4012776	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72593	NC_011884	CGGA	2	8	4012781	4012788	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72594	NC_011884	CCCTC	2	10	4012813	4012822	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
72595	NC_011884	AGC	2	6	4012837	4012842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220909345
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72597	NC_011884	TGGAC	2	10	4013006	4013015	20 %	20 %	40 %	20 %	220909345
72598	NC_011884	TCT	2	6	4013044	4013049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220909345
72599	NC_011884	CTA	2	6	4013174	4013179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220909345
72600	NC_011884	ATC	2	6	4013190	4013195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220909345
72601	NC_011884	TGG	3	9	4013200	4013208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220909345
72602	NC_011884	CTG	2	6	4013247	4013252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220909345
72603	NC_011884	AAC	2	6	4013266	4013271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220909345
72604	NC_011884	CTA	2	6	4013363	4013368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220909345
72605	NC_011884	ATCT	2	8	4013376	4013383	25 %	50 %	0 %	25 %	220909345
72606	NC_011884	AGC	2	6	4013420	4013425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220909345
72607	NC_011884	CGAT	2	8	4013428	4013435	25 %	25 %	25 %	25 %	220909345
72608	NC_011884	TGGC	2	8	4013444	4013451	0 %	25 %	50 %	25 %	220909345
72609	NC_011884	TGG	2	6	4013500	4013505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220909345
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72612	NC_011884	G	6	6	4013564	4013569	0 %	0 %	100 %	0 %	220909345
72613	NC_011884	TTA	2	6	4013597	4013602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220909345
72614	NC_011884	TTTGAA	2	12	4013693	4013704	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	220909345
72615	NC_011884	TGG	2	6	4013735	4013740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72616	NC_011884	TTC	2	6	4013818	4013823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72617	NC_011884	CTG	2	6	4013919	4013924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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72619	NC_011884	GTC	2	6	4013981	4013986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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72853	NC_011884	TCTAC	2	10	4026639	4026648	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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