MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 97323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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65002	NC_011884	ACCC	2	8	3598506	3598513	25 %	0 %	0 %	75 %	220908995
65003	NC_011884	AGC	2	6	3598549	3598554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220908995
65004	NC_011884	GCC	2	6	3598562	3598567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220908995
65005	NC_011884	TGC	2	6	3598585	3598590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220908995
65006	NC_011884	TGAAGT	2	12	3598679	3598690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220908995
65007	NC_011884	GCG	2	6	3598717	3598722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220908995
65008	NC_011884	CTG	2	6	3598738	3598743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220908995
65009	NC_011884	GGGC	2	8	3598788	3598795	0 %	0 %	75 %	25 %	220908995
65010	NC_011884	GGATTG	2	12	3598811	3598822	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	220908995
65011	NC_011884	ACT	3	9	3598834	3598842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220908995
65012	NC_011884	GTCA	2	8	3598982	3598989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65013	NC_011884	CCT	2	6	3599149	3599154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65014	NC_011884	GCT	2	6	3599251	3599256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220908996
65015	NC_011884	TGGCA	2	10	3599268	3599277	20 %	20 %	40 %	20 %	220908996
65016	NC_011884	GCA	2	6	3599308	3599313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220908996
65017	NC_011884	GTT	2	6	3599317	3599322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220908996
65018	NC_011884	TCC	2	6	3599410	3599415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220908996
65019	NC_011884	TAACCC	2	12	3599460	3599471	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	220908996
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65021	NC_011884	GCC	2	6	3599614	3599619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220908996
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65024	NC_011884	CAA	2	6	3599782	3599787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220908996
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65027	NC_011884	GGC	2	6	3599931	3599936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220908996
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65031	NC_011884	CGGG	2	8	3600106	3600113	0 %	0 %	75 %	25 %	220908996
65032	NC_011884	CTC	2	6	3600129	3600134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220908996
65033	NC_011884	CAG	3	9	3600148	3600156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220908996
65034	NC_011884	ATT	2	6	3600188	3600193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220908996
65035	NC_011884	CAG	2	6	3600202	3600207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220908996
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65037	NC_011884	CAG	2	6	3600346	3600351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220908996
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65049	NC_011884	CTG	3	9	3601097	3601105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220908997
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65054	NC_011884	AGATC	2	10	3601432	3601441	40 %	20 %	20 %	20 %	220908997
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65115	NC_011884	C	7	7	3604216	3604222	0 %	0 %	0 %	100 %	220908999
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65118	NC_011884	G	6	6	3604395	3604400	0 %	0 %	100 %	0 %	220908999
65119	NC_011884	TGG	2	6	3604418	3604423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220908999
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65232	NC_011884	ATC	2	6	3610619	3610624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220909005
65233	NC_011884	GCA	2	6	3610629	3610634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220909005
65234	NC_011884	GTC	2	6	3610649	3610654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220909005
65235	NC_011884	TTA	2	6	3610669	3610674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220909005
65236	NC_011884	AGC	2	6	3610731	3610736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65237	NC_011884	T	6	6	3610800	3610805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65238	NC_011884	AGTT	2	8	3611029	3611036	25 %	50 %	25 %	0 %	220909006
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65242	NC_011884	T	6	6	3611138	3611143	0 %	100 %	0 %	0 %	220909006
65243	NC_011884	GTA	2	6	3611179	3611184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220909006
65244	NC_011884	A	6	6	3611261	3611266	100 %	0 %	0 %	0 %	220909006
65245	NC_011884	AGG	2	6	3611300	3611305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220909006
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65247	NC_011884	TGA	2	6	3611347	3611352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220909006
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65251	NC_011884	ACTGG	2	10	3611848	3611857	20 %	20 %	40 %	20 %	220909007
65252	NC_011884	GCA	2	6	3611970	3611975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220909007
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65260	NC_011884	TCGA	2	8	3612356	3612363	25 %	25 %	25 %	25 %	220909008
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65262	NC_011884	ATT	2	6	3612432	3612437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220909008
65263	NC_011884	A	6	6	3612460	3612465	100 %	0 %	0 %	0 %	220909008
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65274	NC_011884	TTGTCA	2	12	3613146	3613157	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	220909008
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65299	NC_011884	GAC	2	6	3614778	3614783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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65301	NC_011884	TTGG	2	8	3614849	3614856	0 %	50 %	50 %	0 %	220909011
65302	NC_011884	T	6	6	3614857	3614862	0 %	100 %	0 %	0 %	220909011
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65332	NC_011884	CTG	2	6	3616206	3616211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220909012
65333	NC_011884	CAA	2	6	3616341	3616346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220909012
65334	NC_011884	TGG	2	6	3616370	3616375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220909012
65335	NC_011884	GCA	2	6	3616384	3616389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220909012
65336	NC_011884	GCAG	2	8	3616502	3616509	25 %	0 %	50 %	25 %	220909012
65337	NC_011884	A	6	6	3616518	3616523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65338	NC_011884	TAC	2	6	3616549	3616554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65339	NC_011884	ATT	2	6	3616561	3616566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220909013
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65341	NC_011884	TTC	2	6	3616607	3616612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220909013
65342	NC_011884	ACCC	2	8	3616766	3616773	25 %	0 %	0 %	75 %	220909013
65343	NC_011884	ATC	2	6	3616827	3616832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220909013
65344	NC_011884	GTT	2	6	3616900	3616905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220909013
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65346	NC_011884	T	6	6	3616918	3616923	0 %	100 %	0 %	0 %	220909013
65347	NC_011884	TTCCG	2	10	3616941	3616950	0 %	40 %	20 %	40 %	220909013
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