MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742503

Total Repeats: 620

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011882	CAA	2	6	158	163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883410
2	NC_011882	GAT	2	6	185	190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883410
3	NC_011882	CGA	2	6	271	276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883410
4	NC_011882	AG	3	6	292	297	50 %	0 %	50 %	0 %	219883410
5	NC_011882	TTC	2	6	360	365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883410
6	NC_011882	ACA	2	6	430	435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883410
7	NC_011882	T	6	6	582	587	0 %	100 %	0 %	0 %	219883411
8	NC_011882	CGA	2	6	604	609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883411
9	NC_011882	ATT	2	6	790	795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883411
10	NC_011882	CTAG	2	8	934	941	25 %	25 %	25 %	25 %	219883411
11	NC_011882	ACGA	2	8	944	951	50 %	0 %	25 %	25 %	219883411
12	NC_011882	CAG	2	6	967	972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883411
13	NC_011882	ACTG	2	8	1065	1072	25 %	25 %	25 %	25 %	219883411
14	NC_011882	GTA	2	6	1082	1087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883411
15	NC_011882	AGA	2	6	1095	1100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883411
16	NC_011882	GGA	2	6	1126	1131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883411
17	NC_011882	GTT	2	6	1156	1161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883411
18	NC_011882	TCT	2	6	1165	1170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883411
19	NC_011882	GGA	2	6	1341	1346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883411
20	NC_011882	TAGCTC	2	12	1364	1375	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219883411
21	NC_011882	TCG	2	6	1428	1433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883411
22	NC_011882	AGA	2	6	1488	1493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883411
23	NC_011882	GTT	2	6	1507	1512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883411
24	NC_011882	GGCA	2	8	1538	1545	25 %	0 %	50 %	25 %	219883411
25	NC_011882	AG	3	6	1561	1566	50 %	0 %	50 %	0 %	219883411
26	NC_011882	GAG	2	6	1572	1577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883411
27	NC_011882	CCT	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883411
28	NC_011882	CGC	2	6	1708	1713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883411
29	NC_011882	GAA	2	6	1759	1764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883411
30	NC_011882	CTAGTT	2	12	1921	1932	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	219883411
31	NC_011882	ACT	2	6	1960	1965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883411
32	NC_011882	CTTA	2	8	1979	1986	25 %	50 %	0 %	25 %	219883411
33	NC_011882	TA	3	6	2033	2038	50 %	50 %	0 %	0 %	219883411
34	NC_011882	AAAT	2	8	2050	2057	75 %	25 %	0 %	0 %	219883411
35	NC_011882	CAAG	2	8	2100	2107	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011882	TCA	2	6	2141	2146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011882	TA	3	6	2160	2165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011882	TAT	2	6	2199	2204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883412
39	NC_011882	ATT	2	6	2226	2231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883412
40	NC_011882	TAA	2	6	2297	2302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883412
41	NC_011882	GATT	2	8	2358	2365	25 %	50 %	25 %	0 %	219883412
42	NC_011882	TGCG	2	8	2371	2378	0 %	25 %	50 %	25 %	219883412
43	NC_011882	CA	3	6	2388	2393	50 %	0 %	0 %	50 %	219883412
44	NC_011882	AGG	2	6	2651	2656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011882	TCAT	2	8	2665	2672	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011882	ACCGC	2	10	2711	2720	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
47	NC_011882	TC	3	6	2875	2880	0 %	50 %	0 %	50 %	219883413
48	NC_011882	TAA	2	6	2983	2988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883413
49	NC_011882	AAT	2	6	3039	3044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883413
50	NC_011882	GCT	3	9	3080	3088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883413
51	NC_011882	AAGAT	2	10	3101	3110	60 %	20 %	20 %	0 %	219883413
52	NC_011882	CTT	2	6	3126	3131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883413
53	NC_011882	GTTG	2	8	3164	3171	0 %	50 %	50 %	0 %	219883413
54	NC_011882	GAA	2	6	3189	3194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883413
55	NC_011882	ATA	2	6	3214	3219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883413
56	NC_011882	GGTC	2	8	3248	3255	0 %	25 %	50 %	25 %	219883413
57	NC_011882	ATT	2	6	3304	3309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883413
58	NC_011882	T	6	6	3318	3323	0 %	100 %	0 %	0 %	219883413
59	NC_011882	T	7	7	3395	3401	0 %	100 %	0 %	0 %	219883413
60	NC_011882	TG	3	6	3485	3490	0 %	50 %	50 %	0 %	219883413
61	NC_011882	GCT	3	9	3522	3530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883413
62	NC_011882	CTA	2	6	3552	3557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883413
63	NC_011882	CTT	2	6	3563	3568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883413
64	NC_011882	ATGT	2	8	3583	3590	25 %	50 %	25 %	0 %	219883413
65	NC_011882	ATT	2	6	3754	3759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883413
66	NC_011882	GCT	2	6	3765	3770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883413
67	NC_011882	TAG	2	6	3804	3809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883413
68	NC_011882	GCA	2	6	3830	3835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883413
69	NC_011882	TAG	2	6	3838	3843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883413
70	NC_011882	CCA	2	6	3847	3852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883413
71	NC_011882	TA	3	6	3873	3878	50 %	50 %	0 %	0 %	219883413
72	NC_011882	GCT	2	6	3884	3889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883413
73	NC_011882	AATTG	2	10	4033	4042	40 %	40 %	20 %	0 %	219883413
74	NC_011882	TCTG	2	8	4070	4077	0 %	50 %	25 %	25 %	219883413
75	NC_011882	TCA	2	6	4091	4096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883413
76	NC_011882	CAC	2	6	4101	4106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883413
77	NC_011882	TAC	2	6	4170	4175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883413
78	NC_011882	TTC	2	6	4217	4222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883413
79	NC_011882	TCTGC	2	10	4231	4240	0 %	40 %	20 %	40 %	219883413
80	NC_011882	AGA	2	6	4291	4296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883413
81	NC_011882	CTT	2	6	4308	4313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883413
82	NC_011882	AATC	2	8	4374	4381	50 %	25 %	0 %	25 %	219883413
83	NC_011882	ATT	2	6	4387	4392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883413
84	NC_011882	TCA	2	6	4418	4423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883413
85	NC_011882	AGTT	2	8	4461	4468	25 %	50 %	25 %	0 %	219883413
86	NC_011882	GGA	2	6	4470	4475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883413
87	NC_011882	CAG	2	6	4494	4499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883413
88	NC_011882	TCA	2	6	4511	4516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883413
89	NC_011882	GT	3	6	4548	4553	0 %	50 %	50 %	0 %	219883413
90	NC_011882	AAGGT	2	10	4560	4569	40 %	20 %	40 %	0 %	219883413
91	NC_011882	CAT	2	6	4608	4613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883413
92	NC_011882	TCT	2	6	4617	4622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883413
93	NC_011882	AGC	2	6	4648	4653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883413
94	NC_011882	AAT	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883413
95	NC_011882	CTG	2	6	4719	4724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883413
96	NC_011882	CTTC	2	8	4760	4767	0 %	50 %	0 %	50 %	219883413
97	NC_011882	AG	3	6	4868	4873	50 %	0 %	50 %	0 %	219883413
98	NC_011882	TCCA	2	8	4908	4915	25 %	25 %	0 %	50 %	219883413
99	NC_011882	TCT	2	6	4916	4921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883413
100	NC_011882	AGT	2	6	4927	4932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883413
101	NC_011882	AAG	2	6	4945	4950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883413
102	NC_011882	TCT	2	6	5033	5038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883413
103	NC_011882	TTC	2	6	5098	5103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883413
104	NC_011882	TCA	2	6	5111	5116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883413
105	NC_011882	AAGC	2	8	5122	5129	50 %	0 %	25 %	25 %	219883413
106	NC_011882	CGT	2	6	5159	5164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883413
107	NC_011882	TGC	2	6	5305	5310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883413
108	NC_011882	AGTCT	2	10	5359	5368	20 %	40 %	20 %	20 %	219883414
109	NC_011882	TAA	2	6	5378	5383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883414
110	NC_011882	CTT	2	6	5393	5398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883414
111	NC_011882	CTGT	2	8	5407	5414	0 %	50 %	25 %	25 %	219883414
112	NC_011882	AG	3	6	5548	5553	50 %	0 %	50 %	0 %	219883414
113	NC_011882	AGT	2	6	5568	5573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883414
114	NC_011882	GAT	2	6	5583	5588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883414
115	NC_011882	GTAA	2	8	5621	5628	50 %	25 %	25 %	0 %	219883414
116	NC_011882	C	6	6	5697	5702	0 %	0 %	0 %	100 %	219883414
117	NC_011882	TTG	2	6	5715	5720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883414
118	NC_011882	ATTA	2	8	5785	5792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011882	CAA	2	6	5859	5864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011882	ATT	2	6	5915	5920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011882	TTA	2	6	5927	5932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011882	A	6	6	5955	5960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011882	AAT	2	6	5997	6002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011882	CTT	2	6	6102	6107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011882	GT	3	6	6173	6178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011882	T	6	6	6185	6190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011882	ATT	2	6	6224	6229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011882	TAT	2	6	6230	6235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011882	TTC	2	6	6390	6395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883415
130	NC_011882	T	6	6	6422	6427	0 %	100 %	0 %	0 %	219883415
131	NC_011882	AGC	2	6	6453	6458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883415
132	NC_011882	A	6	6	6471	6476	100 %	0 %	0 %	0 %	219883415
133	NC_011882	GTT	2	6	6505	6510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883415
134	NC_011882	GCT	2	6	6655	6660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883416
135	NC_011882	TCCA	2	8	6749	6756	25 %	25 %	0 %	50 %	219883416
136	NC_011882	TGT	2	6	6840	6845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883416
137	NC_011882	CGT	2	6	6882	6887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883416
138	NC_011882	TTA	2	6	6903	6908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883416
139	NC_011882	TTAA	2	8	6942	6949	50 %	50 %	0 %	0 %	219883416
140	NC_011882	AAC	2	6	6965	6970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883416
141	NC_011882	CAA	2	6	6976	6981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883416
142	NC_011882	TGA	2	6	7048	7053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883417
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145	NC_011882	A	6	6	7129	7134	100 %	0 %	0 %	0 %	219883417
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149	NC_011882	AAT	2	6	7313	7318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011882	TGT	2	6	7351	7356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883418
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167	NC_011882	CTT	2	6	8369	8374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_011882	ATTA	2	8	8789	8796	50 %	50 %	0 %	0 %	219883420
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192	NC_011882	TAT	2	6	9460	9465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_011882	TGA	2	6	9483	9488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_011882	TTCAAA	2	12	9763	9774	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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199	NC_011882	ACC	2	6	9856	9861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883423
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239	NC_011882	CGA	2	6	12482	12487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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241	NC_011882	TAA	2	6	12574	12579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
242	NC_011882	T	6	6	12634	12639	0 %	100 %	0 %	0 %	219883424
243	NC_011882	G	6	6	12745	12750	0 %	0 %	100 %	0 %	219883424
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256	NC_011882	TTC	2	6	13355	13360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883425
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258	NC_011882	TCT	2	6	13432	13437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_011882	GCT	2	6	13451	13456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_011882	GAA	2	6	13487	13492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
261	NC_011882	CGG	2	6	13541	13546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_011882	CTT	2	6	13563	13568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883426
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265	NC_011882	GCG	2	6	13733	13738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883426
266	NC_011882	GCT	2	6	13912	13917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883426
267	NC_011882	TAAT	2	8	13951	13958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_011882	TA	3	6	14007	14012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_011882	AAAT	2	8	14431	14438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_011882	GATG	2	8	22388	22395	25 %	25 %	50 %	0 %	219883431
401	NC_011882	TG	3	6	22450	22455	0 %	50 %	50 %	0 %	219883431
402	NC_011882	GTT	2	6	22520	22525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883431
403	NC_011882	ATG	2	6	22651	22656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883431
404	NC_011882	AAG	3	9	22695	22703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883431
405	NC_011882	GGC	2	6	22746	22751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883431
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408	NC_011882	CTC	2	6	22833	22838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883431
409	NC_011882	CAT	2	6	22916	22921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883431
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412	NC_011882	AAC	2	6	23151	23156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883431
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420	NC_011882	GAA	2	6	23559	23564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883432
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422	NC_011882	TTA	2	6	23661	23666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883432
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426	NC_011882	AAT	2	6	24032	24037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883432
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429	NC_011882	TGA	2	6	24082	24087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883432
430	NC_011882	TA	3	6	24098	24103	50 %	50 %	0 %	0 %	219883432
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433	NC_011882	TTG	2	6	24210	24215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883432
434	NC_011882	TAG	2	6	24277	24282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883432
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439	NC_011882	CTG	2	6	24348	24353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883432
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442	NC_011882	ATT	2	6	24443	24448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883432
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461	NC_011882	GAG	2	6	25495	25500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883433
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463	NC_011882	CG	3	6	25536	25541	0 %	0 %	50 %	50 %	219883434
464	NC_011882	GGCT	2	8	25582	25589	0 %	25 %	50 %	25 %	219883434
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