MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Clostridium kluyveri NBRC 12016 plasmid pCKL1

Total Repeats: 1427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011836	GCAA	2	8	41923	41930	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_011836	GA	3	6	41959	41964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_011836	AGG	2	6	41985	41990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011836	AAT	2	6	42114	42119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684065
1005	NC_011836	ATAA	2	8	42138	42145	75 %	25 %	0 %	0 %	219684065
1006	NC_011836	GGA	2	6	42186	42191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219684065
1007	NC_011836	TA	3	6	42213	42218	50 %	50 %	0 %	0 %	219684065
1008	NC_011836	GAT	2	6	42222	42227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684065
1009	NC_011836	AT	3	6	42226	42231	50 %	50 %	0 %	0 %	219684065
1010	NC_011836	TGA	2	6	42248	42253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684065
1011	NC_011836	AGT	2	6	42257	42262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684065
1012	NC_011836	A	6	6	42298	42303	100 %	0 %	0 %	0 %	219684065
1013	NC_011836	GCT	2	6	42326	42331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684065
1014	NC_011836	GAA	2	6	42333	42338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219684065
1015	NC_011836	AGA	2	6	42353	42358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219684065
1016	NC_011836	TA	3	6	42390	42395	50 %	50 %	0 %	0 %	219684065
1017	NC_011836	AGAA	2	8	42412	42419	75 %	0 %	25 %	0 %	219684065
1018	NC_011836	TAAA	2	8	42427	42434	75 %	25 %	0 %	0 %	219684065
1019	NC_011836	CTT	2	6	42441	42446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219684065
1020	NC_011836	A	7	7	42521	42527	100 %	0 %	0 %	0 %	219684065
1021	NC_011836	AT	3	6	42540	42545	50 %	50 %	0 %	0 %	219684065
1022	NC_011836	AAG	2	6	42560	42565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219684065
1023	NC_011836	GGT	2	6	42590	42595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219684065
1024	NC_011836	TGA	2	6	42611	42616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684066
1025	NC_011836	TAAAAT	2	12	42620	42631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684066
1026	NC_011836	GAAT	2	8	42674	42681	50 %	25 %	25 %	0 %	219684066
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1028	NC_011836	TAA	2	6	42742	42747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684066
1029	NC_011836	GGTAT	2	10	42762	42771	20 %	40 %	40 %	0 %	219684066
1030	NC_011836	ATG	2	6	42802	42807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684066
1031	NC_011836	TCAG	2	8	42810	42817	25 %	25 %	25 %	25 %	219684066
1032	NC_011836	AT	3	6	42862	42867	50 %	50 %	0 %	0 %	219684066
1033	NC_011836	A	6	6	42875	42880	100 %	0 %	0 %	0 %	219684066
1034	NC_011836	GAT	2	6	42960	42965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_011836	AG	3	6	43077	43082	50 %	0 %	50 %	0 %	219684067
1036	NC_011836	A	7	7	43119	43125	100 %	0 %	0 %	0 %	219684067
1037	NC_011836	AGA	2	6	43138	43143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219684067
1038	NC_011836	TGA	2	6	43148	43153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684067
1039	NC_011836	ATT	2	6	43170	43175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219684067
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1041	NC_011836	A	6	6	43235	43240	100 %	0 %	0 %	0 %	219684067
1042	NC_011836	TGA	2	6	43247	43252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684067
1043	NC_011836	A	6	6	43273	43278	100 %	0 %	0 %	0 %	219684067
1044	NC_011836	GAT	2	6	43293	43298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684067
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1052	NC_011836	A	6	6	43867	43872	100 %	0 %	0 %	0 %	219684068
1053	NC_011836	AT	3	6	43907	43912	50 %	50 %	0 %	0 %	219684068
1054	NC_011836	TA	3	6	43991	43996	50 %	50 %	0 %	0 %	219684068
1055	NC_011836	A	8	8	44028	44035	100 %	0 %	0 %	0 %	219684068
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1057	NC_011836	A	6	6	44061	44066	100 %	0 %	0 %	0 %	219684068
1058	NC_011836	AAAAG	2	10	44076	44085	80 %	0 %	20 %	0 %	219684068
1059	NC_011836	AAAG	2	8	44117	44124	75 %	0 %	25 %	0 %	219684068
1060	NC_011836	CAA	2	6	44183	44188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219684068
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1069	NC_011836	A	7	7	44526	44532	100 %	0 %	0 %	0 %	219684068
1070	NC_011836	A	8	8	44551	44558	100 %	0 %	0 %	0 %	219684068
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1092	NC_011836	A	7	7	45494	45500	100 %	0 %	0 %	0 %	219684068
1093	NC_011836	AGT	2	6	45525	45530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684068
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1102	NC_011836	ATA	2	6	45850	45855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684068
1103	NC_011836	TGC	2	6	45866	45871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684068
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1111	NC_011836	AAG	3	9	46197	46205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219684068
1112	NC_011836	ATA	2	6	46225	46230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_011836	TTA	2	6	46249	46254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1115	NC_011836	TTA	2	6	46272	46277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1117	NC_011836	TA	4	8	46312	46319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_011836	TAA	2	6	46322	46327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_011836	ATA	2	6	46329	46334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_011836	AT	3	6	46343	46348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_011836	TACG	2	8	46349	46356	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_011836	T	6	6	46396	46401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_011836	A	6	6	46402	46407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_011836	GTTA	3	12	46409	46420	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_011836	GTA	2	6	46454	46459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_011836	TTA	2	6	46483	46488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_011836	TTA	2	6	46495	46500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_011836	AAG	2	6	46507	46512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_011836	AAAT	2	8	46541	46548	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1390	NC_011836	AATT	2	8	57892	57899	50 %	50 %	0 %	0 %	219684081
1391	NC_011836	TAC	2	6	57905	57910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219684081
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1393	NC_011836	ATA	2	6	57962	57967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1423	NC_011836	TAT	2	6	59020	59025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1425	NC_011836	AAT	2	6	59119	59124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_011836	T	6	6	59150	59155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1427	NC_011836	AGG	2	6	59170	59175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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