MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 94970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_011831	CCG	2	6	1422021	1422026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848067
29003	NC_011831	AAG	2	6	1422027	1422032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219848067
29004	NC_011831	CGC	2	6	1422073	1422078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848067
29005	NC_011831	TGG	2	6	1422120	1422125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219848067
29006	NC_011831	CGC	2	6	1422178	1422183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848067
29007	NC_011831	CCG	2	6	1422277	1422282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848067
29008	NC_011831	TGCC	2	8	1422339	1422346	0 %	25 %	25 %	50 %	219848067
29009	NC_011831	AAC	2	6	1422382	1422387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219848067
29010	NC_011831	GAC	2	6	1422417	1422422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848067
29011	NC_011831	AAC	2	6	1422444	1422449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219848067
29012	NC_011831	ACG	2	6	1422455	1422460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848067
29013	NC_011831	ACT	2	6	1422479	1422484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219848067
29014	NC_011831	TGA	2	6	1422516	1422521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219848067
29015	NC_011831	CCG	2	6	1422537	1422542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848067
29016	NC_011831	AGC	2	6	1422560	1422565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848067
29017	NC_011831	GCC	2	6	1422632	1422637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848067
29018	NC_011831	TAC	2	6	1422664	1422669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219848067
29019	NC_011831	GCG	2	6	1422734	1422739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219848067
29020	NC_011831	CGG	2	6	1422822	1422827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219848067
29021	NC_011831	GGCC	2	8	1422871	1422878	0 %	0 %	50 %	50 %	219848067
29022	NC_011831	CAA	2	6	1422901	1422906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219848067
29023	NC_011831	GCG	2	6	1422910	1422915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219848067
29024	NC_011831	CAA	2	6	1423064	1423069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29025	NC_011831	CAC	2	6	1423285	1423290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29026	NC_011831	ACA	2	6	1423300	1423305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29027	NC_011831	GGA	2	6	1423365	1423370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29028	NC_011831	CATCCC	2	12	1423372	1423383	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29029	NC_011831	TCC	2	6	1423407	1423412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29030	NC_011831	TCC	2	6	1423499	1423504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29031	NC_011831	TCC	2	6	1423523	1423528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29032	NC_011831	TCC	2	6	1423570	1423575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29033	NC_011831	CGC	2	6	1423594	1423599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29034	NC_011831	GA	3	6	1423625	1423630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29035	NC_011831	AAC	2	6	1423651	1423656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29036	NC_011831	CG	3	6	1423760	1423765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29037	NC_011831	CTG	2	6	1423783	1423788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29038	NC_011831	C	6	6	1423943	1423948	0 %	0 %	0 %	100 %	219848068
29039	NC_011831	GC	3	6	1423950	1423955	0 %	0 %	50 %	50 %	219848068
29040	NC_011831	ACCGA	2	10	1423984	1423993	40 %	0 %	20 %	40 %	219848068
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29051	NC_011831	GCTCC	2	10	1424455	1424464	0 %	20 %	20 %	60 %	219848068
29052	NC_011831	CAG	2	6	1424500	1424505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848068
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29054	NC_011831	GAT	2	6	1424580	1424585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219848068
29055	NC_011831	TCA	2	6	1424708	1424713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219848068
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29067	NC_011831	CGCC	2	8	1425128	1425135	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29068	NC_011831	TTAA	2	8	1425183	1425190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29069	NC_011831	AGTT	2	8	1425196	1425203	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29070	NC_011831	GC	3	6	1425237	1425242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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29089	NC_011831	CCGTA	2	10	1426347	1426356	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29090	NC_011831	TGC	2	6	1426365	1426370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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29094	NC_011831	TGCCG	2	10	1426587	1426596	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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29098	NC_011831	TGCCG	2	10	1426809	1426818	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29099	NC_011831	CATGC	2	10	1426913	1426922	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29100	NC_011831	C	6	6	1426980	1426985	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29101	NC_011831	CAA	2	6	1426992	1426997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29102	NC_011831	GTG	2	6	1427081	1427086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29103	NC_011831	TG	3	6	1427085	1427090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29104	NC_011831	AG	3	6	1427154	1427159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29105	NC_011831	ATAC	2	8	1427208	1427215	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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29107	NC_011831	TG	3	6	1427235	1427240	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29108	NC_011831	CTG	2	6	1427390	1427395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219848070
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29120	NC_011831	GGC	2	6	1428045	1428050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219848071
29121	NC_011831	GCC	2	6	1428123	1428128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848071
29122	NC_011831	CCA	2	6	1428136	1428141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219848071
29123	NC_011831	GCCGT	2	10	1428171	1428180	0 %	20 %	40 %	40 %	219848071
29124	NC_011831	CGC	2	6	1428194	1428199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848071
29125	NC_011831	TGT	2	6	1428289	1428294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219848071
29126	NC_011831	CA	3	6	1428301	1428306	50 %	0 %	0 %	50 %	219848071
29127	NC_011831	CTC	2	6	1428330	1428335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219848071
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29129	NC_011831	CGC	2	6	1428433	1428438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848071
29130	NC_011831	CAT	2	6	1428601	1428606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219848072
29131	NC_011831	GAC	2	6	1428647	1428652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848072
29132	NC_011831	TGCC	2	8	1428659	1428666	0 %	25 %	25 %	50 %	219848072
29133	NC_011831	CAACC	2	10	1428819	1428828	40 %	0 %	0 %	60 %	219848072
29134	NC_011831	GAG	2	6	1428858	1428863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219848072
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29140	NC_011831	GCA	2	6	1429069	1429074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848072
29141	NC_011831	CCGA	2	8	1429088	1429095	25 %	0 %	25 %	50 %	219848072
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29145	NC_011831	GCC	2	6	1429174	1429179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848072
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29147	NC_011831	CG	4	8	1429226	1429233	0 %	0 %	50 %	50 %	219848072
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29152	NC_011831	GCA	2	6	1429451	1429456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848072
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29156	NC_011831	CCA	2	6	1429551	1429556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219848072
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29166	NC_011831	AGCAA	2	10	1429897	1429906	60 %	0 %	20 %	20 %	219848072
29167	NC_011831	CGACC	2	10	1429911	1429920	20 %	0 %	20 %	60 %	219848072
29168	NC_011831	CCA	2	6	1429946	1429951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219848072
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29170	NC_011831	CAT	3	9	1430061	1430069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219848072
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29195	NC_011831	TCA	2	6	1431556	1431561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219848075
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29212	NC_011831	CGT	2	6	1432329	1432334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219848075
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29215	NC_011831	CTC	2	6	1432391	1432396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29216	NC_011831	GTC	2	6	1432400	1432405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29217	NC_011831	AAT	2	6	1432422	1432427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29218	NC_011831	ACC	2	6	1432468	1432473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29219	NC_011831	CGT	2	6	1432484	1432489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29220	NC_011831	TGCC	2	8	1432490	1432497	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29221	NC_011831	CCCA	2	8	1432518	1432525	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
29222	NC_011831	GC	3	6	1432628	1432633	0 %	0 %	50 %	50 %	219848076
29223	NC_011831	CGC	2	6	1432651	1432656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848076
29224	NC_011831	CGCTGC	2	12	1432661	1432672	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219848076
29225	NC_011831	GCATT	2	10	1432702	1432711	20 %	40 %	20 %	20 %	219848076
29226	NC_011831	ATGG	2	8	1432747	1432754	25 %	25 %	50 %	0 %	219848076
29227	NC_011831	GC	3	6	1432764	1432769	0 %	0 %	50 %	50 %	219848076
29228	NC_011831	GCG	2	6	1432820	1432825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219848076
29229	NC_011831	CG	3	6	1432840	1432845	0 %	0 %	50 %	50 %	219848076
29230	NC_011831	GCG	2	6	1432873	1432878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219848076
29231	NC_011831	CGG	2	6	1432890	1432895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219848076
29232	NC_011831	C	7	7	1432902	1432908	0 %	0 %	0 %	100 %	219848076
29233	NC_011831	CCA	2	6	1432955	1432960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219848076
29234	NC_011831	GTG	2	6	1432969	1432974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219848076
29235	NC_011831	GCG	2	6	1433027	1433032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219848076
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29355	NC_011831	GTCT	2	8	1438408	1438415	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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29479	NC_011831	CTGCA	2	10	1444095	1444104	20 %	20 %	20 %	40 %	219848082
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29482	NC_011831	CGT	2	6	1444188	1444193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219848082
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