MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 94970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_011831	ACA	2	6	1397383	1397388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219848043
28503	NC_011831	AGCT	2	8	1397403	1397410	25 %	25 %	25 %	25 %	219848043
28504	NC_011831	GGGC	2	8	1397437	1397444	0 %	0 %	75 %	25 %	219848043
28505	NC_011831	TCG	2	6	1397462	1397467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219848043
28506	NC_011831	AGC	2	6	1397479	1397484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848043
28507	NC_011831	AGG	2	6	1397485	1397490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219848043
28508	NC_011831	CGC	2	6	1397547	1397552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848043
28509	NC_011831	CAT	2	6	1397595	1397600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219848043
28510	NC_011831	GCT	2	6	1397692	1397697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28511	NC_011831	AG	3	6	1397743	1397748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28512	NC_011831	CTG	2	6	1397789	1397794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219848044
28513	NC_011831	GCA	2	6	1397826	1397831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848044
28514	NC_011831	CGT	2	6	1397862	1397867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219848044
28515	NC_011831	ACCG	2	8	1397896	1397903	25 %	0 %	25 %	50 %	219848044
28516	NC_011831	CAACCG	2	12	1397934	1397945	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	219848044
28517	NC_011831	C	7	7	1397970	1397976	0 %	0 %	0 %	100 %	219848044
28518	NC_011831	CCCCA	2	10	1397986	1397995	20 %	0 %	0 %	80 %	219848044
28519	NC_011831	TCC	2	6	1398288	1398293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219848044
28520	NC_011831	ACG	2	6	1398384	1398389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848044
28521	NC_011831	CAA	2	6	1398571	1398576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219848045
28522	NC_011831	CAG	2	6	1398586	1398591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848045
28523	NC_011831	ACCA	2	8	1398753	1398760	50 %	0 %	0 %	50 %	219848045
28524	NC_011831	ACCC	2	8	1398798	1398805	25 %	0 %	0 %	75 %	219848045
28525	NC_011831	GCC	2	6	1398822	1398827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848045
28526	NC_011831	CGGT	2	8	1398851	1398858	0 %	25 %	50 %	25 %	219848045
28527	NC_011831	ATT	2	6	1398884	1398889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219848045
28528	NC_011831	CGG	2	6	1398905	1398910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219848045
28529	NC_011831	TG	3	6	1398911	1398916	0 %	50 %	50 %	0 %	219848045
28530	NC_011831	TGC	2	6	1398943	1398948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219848045
28531	NC_011831	ATT	2	6	1398963	1398968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219848045
28532	NC_011831	GCT	2	6	1398974	1398979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219848045
28533	NC_011831	AAC	2	6	1399051	1399056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219848045
28534	NC_011831	CGC	2	6	1399073	1399078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848045
28535	NC_011831	CGCTG	2	10	1399093	1399102	0 %	20 %	40 %	40 %	219848045
28536	NC_011831	GCT	2	6	1399140	1399145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219848045
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28539	NC_011831	CAAG	2	8	1399319	1399326	50 %	0 %	25 %	25 %	219848045
28540	NC_011831	AGA	2	6	1399340	1399345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219848045
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28542	NC_011831	CG	3	6	1399425	1399430	0 %	0 %	50 %	50 %	219848045
28543	NC_011831	TGC	2	6	1399684	1399689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219848046
28544	NC_011831	ACC	3	9	1399702	1399710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219848046
28545	NC_011831	CGC	2	6	1399711	1399716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848046
28546	NC_011831	GCA	2	6	1399835	1399840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848046
28547	NC_011831	G	6	6	1399885	1399890	0 %	0 %	100 %	0 %	219848046
28548	NC_011831	CG	3	6	1399904	1399909	0 %	0 %	50 %	50 %	219848046
28549	NC_011831	ACG	2	6	1399947	1399952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848046
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28551	NC_011831	ACG	2	6	1399990	1399995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848046
28552	NC_011831	CCG	2	6	1400003	1400008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848046
28553	NC_011831	TTG	2	6	1400009	1400014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219848046
28554	NC_011831	GGT	3	9	1400030	1400038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219848046
28555	NC_011831	CGG	2	6	1400079	1400084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219848046
28556	NC_011831	CCG	2	6	1400098	1400103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848046
28557	NC_011831	GGC	2	6	1400113	1400118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219848046
28558	NC_011831	CGA	2	6	1400125	1400130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848046
28559	NC_011831	ATC	2	6	1400138	1400143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219848046
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28564	NC_011831	GATTGC	2	12	1400482	1400493	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219848046
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28588	NC_011831	ACC	2	6	1401560	1401565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28589	NC_011831	TCAA	2	8	1401569	1401576	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28590	NC_011831	CCG	2	6	1401591	1401596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28591	NC_011831	TCGA	2	8	1401605	1401612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28592	NC_011831	TCC	2	6	1401676	1401681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219848047
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28601	NC_011831	GC	3	6	1402223	1402228	0 %	0 %	50 %	50 %	219848048
28602	NC_011831	GAC	2	6	1402260	1402265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848048
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28616	NC_011831	CG	3	6	1402975	1402980	0 %	0 %	50 %	50 %	219848048
28617	NC_011831	CGCC	2	8	1403057	1403064	0 %	0 %	25 %	75 %	219848048
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28733	NC_011831	CGA	2	6	1408428	1408433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848052
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28836	NC_011831	GCT	2	6	1413432	1413437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28837	NC_011831	TATC	2	8	1413446	1413453	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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28844	NC_011831	CT	3	6	1413991	1413996	0 %	50 %	0 %	50 %	219848057
28845	NC_011831	TAT	2	6	1414004	1414009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219848057
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28848	NC_011831	CGCCAT	2	12	1414151	1414162	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219848058
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28968	NC_011831	GAC	2	6	1420378	1420383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848066
28969	NC_011831	GGT	2	6	1420385	1420390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219848066
28970	NC_011831	AGCG	2	8	1420413	1420420	25 %	0 %	50 %	25 %	219848066
28971	NC_011831	TCT	2	6	1420423	1420428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219848066
28972	NC_011831	CTC	2	6	1420441	1420446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219848066
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28974	NC_011831	CCG	2	6	1420484	1420489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848066
28975	NC_011831	TGG	2	6	1420504	1420509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219848066
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28978	NC_011831	TCT	2	6	1420708	1420713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219848066
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28983	NC_011831	CA	3	6	1420854	1420859	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28984	NC_011831	TGG	2	6	1420878	1420883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28985	NC_011831	CTG	2	6	1420907	1420912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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28987	NC_011831	A	6	6	1421222	1421227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28988	NC_011831	AC	3	6	1421261	1421266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28989	NC_011831	GAA	2	6	1421279	1421284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28990	NC_011831	GGA	2	6	1421296	1421301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28991	NC_011831	TGC	2	6	1421442	1421447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28992	NC_011831	CCG	2	6	1421458	1421463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28993	NC_011831	TA	3	6	1421492	1421497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28996	NC_011831	AAGG	2	8	1421639	1421646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28997	NC_011831	CAACC	2	10	1421662	1421671	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
28998	NC_011831	CAC	2	6	1421725	1421730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219848067
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