MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 94970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28004	NC_011831	CGTT	2	8	1374621	1374628	0 %	50 %	25 %	25 %	219848029
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28006	NC_011831	CGGC	2	8	1374647	1374654	0 %	0 %	50 %	50 %	219848029
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28009	NC_011831	ATC	2	6	1374675	1374680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219848029
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28022	NC_011831	CGT	2	6	1375361	1375366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219848030
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28056	NC_011831	GC	3	6	1376845	1376850	0 %	0 %	50 %	50 %	219848032
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28118	NC_011831	AGA	2	6	1379328	1379333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219848032
28119	NC_011831	ACG	2	6	1379373	1379378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848032
28120	NC_011831	GAG	3	9	1379447	1379455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219848032
28121	NC_011831	CCGG	2	8	1379463	1379470	0 %	0 %	50 %	50 %	219848032
28122	NC_011831	GAG	2	6	1379477	1379482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219848032
28123	NC_011831	CCG	2	6	1379505	1379510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848032
28124	NC_011831	CG	3	6	1379518	1379523	0 %	0 %	50 %	50 %	219848032
28125	NC_011831	TGC	2	6	1379595	1379600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219848032
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28129	NC_011831	AGG	2	6	1379751	1379756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219848032
28130	NC_011831	CGC	2	6	1379880	1379885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848033
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28144	NC_011831	GAT	2	6	1380288	1380293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219848033
28145	NC_011831	CCA	2	6	1380303	1380308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219848033
28146	NC_011831	TGA	2	6	1380342	1380347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219848033
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28160	NC_011831	GAA	2	6	1381224	1381229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219848033
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28171	NC_011831	TCT	2	6	1381535	1381540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219848033
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28173	NC_011831	GAC	2	6	1381635	1381640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848033
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28178	NC_011831	AAG	3	9	1382071	1382079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219848033
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28180	NC_011831	CGG	2	6	1382144	1382149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219848033
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28182	NC_011831	AAG	2	6	1382239	1382244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219848033
28183	NC_011831	CGA	2	6	1382276	1382281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848033
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28188	NC_011831	GCT	2	6	1382514	1382519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219848033
28189	NC_011831	AGC	2	6	1382532	1382537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848033
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28191	NC_011831	ACAAA	2	10	1382558	1382567	80 %	0 %	0 %	20 %	219848033
28192	NC_011831	CCTT	2	8	1382570	1382577	0 %	50 %	0 %	50 %	219848033
28193	NC_011831	GAG	2	6	1382635	1382640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219848033
28194	NC_011831	TGAA	2	8	1382702	1382709	50 %	25 %	25 %	0 %	219848033
28195	NC_011831	CCT	2	6	1382723	1382728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219848033
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28197	NC_011831	ACC	2	6	1382762	1382767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219848033
28198	NC_011831	CCGG	2	8	1382822	1382829	0 %	0 %	50 %	50 %	219848033
28199	NC_011831	ACG	2	6	1382939	1382944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848033
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28201	NC_011831	CCGA	2	8	1383129	1383136	25 %	0 %	25 %	50 %	219848033
28202	NC_011831	GAT	2	6	1383144	1383149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219848033
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28204	NC_011831	CGC	2	6	1383186	1383191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848033
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28209	NC_011831	GAG	2	6	1383288	1383293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219848033
28210	NC_011831	CCTT	2	8	1383305	1383312	0 %	50 %	0 %	50 %	219848033
28211	NC_011831	AAAC	2	8	1383316	1383323	75 %	0 %	0 %	25 %	219848033
28212	NC_011831	CGA	2	6	1383330	1383335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848033
28213	NC_011831	CT	3	6	1383373	1383378	0 %	50 %	0 %	50 %	219848033
28214	NC_011831	GAA	2	6	1383406	1383411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219848033
28215	NC_011831	GC	3	6	1383414	1383419	0 %	0 %	50 %	50 %	219848033
28216	NC_011831	GCT	2	6	1383423	1383428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219848033
28217	NC_011831	GGC	2	6	1383433	1383438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219848033
28218	NC_011831	A	6	6	1383463	1383468	100 %	0 %	0 %	0 %	219848033
28219	NC_011831	GTG	2	6	1383529	1383534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219848033
28220	NC_011831	ACC	2	6	1383557	1383562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28221	NC_011831	CG	3	6	1383594	1383599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28222	NC_011831	TGC	2	6	1383635	1383640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28223	NC_011831	GC	3	6	1383639	1383644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28224	NC_011831	GGT	2	6	1383658	1383663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28225	NC_011831	GCAC	3	12	1383701	1383712	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28226	NC_011831	AATG	2	8	1383790	1383797	50 %	25 %	25 %	0 %	219848034
28227	NC_011831	A	7	7	1383870	1383876	100 %	0 %	0 %	0 %	219848034
28228	NC_011831	GCT	2	6	1383974	1383979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219848034
28229	NC_011831	CT	3	6	1384061	1384066	0 %	50 %	0 %	50 %	219848034
28230	NC_011831	AAC	2	6	1384113	1384118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219848034
28231	NC_011831	AG	3	6	1384150	1384155	50 %	0 %	50 %	0 %	219848034
28232	NC_011831	TGC	2	6	1384324	1384329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219848034
28233	NC_011831	CGA	2	6	1384384	1384389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848034
28234	NC_011831	TAA	2	6	1384444	1384449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219848034
28235	NC_011831	ATCT	2	8	1384462	1384469	25 %	50 %	0 %	25 %	219848034
28236	NC_011831	T	7	7	1384510	1384516	0 %	100 %	0 %	0 %	219848034
28237	NC_011831	AAACA	2	10	1384517	1384526	80 %	0 %	0 %	20 %	219848034
28238	NC_011831	ATT	2	6	1384532	1384537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219848034
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28241	NC_011831	CGTG	2	8	1384595	1384602	0 %	25 %	50 %	25 %	219848034
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28243	NC_011831	ATGG	2	8	1384663	1384670	25 %	25 %	50 %	0 %	219848035
28244	NC_011831	GAG	2	6	1384729	1384734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219848035
28245	NC_011831	ACC	2	6	1384770	1384775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219848035
28246	NC_011831	GCA	2	6	1384785	1384790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848035
28247	NC_011831	CTGG	2	8	1384838	1384845	0 %	25 %	50 %	25 %	219848035
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28253	NC_011831	GCAA	2	8	1385048	1385055	50 %	0 %	25 %	25 %	219848035
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28262	NC_011831	CGA	2	6	1385464	1385469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848035
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28277	NC_011831	CG	3	6	1385935	1385940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28278	NC_011831	TGC	2	6	1385976	1385981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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28280	NC_011831	GGC	2	6	1385999	1386004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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28337	NC_011831	CT	3	6	1389065	1389070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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28339	NC_011831	CAC	2	6	1389111	1389116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219848037
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28347	NC_011831	CAC	2	6	1389385	1389390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219848037
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28350	NC_011831	CAA	2	6	1389555	1389560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219848037
28351	NC_011831	CGTT	2	8	1389564	1389571	0 %	50 %	25 %	25 %	219848037
28352	NC_011831	TCA	2	6	1389603	1389608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219848037
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28354	NC_011831	CCG	2	6	1389652	1389657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848037
28355	NC_011831	CAT	2	6	1389742	1389747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219848037
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28441	NC_011831	GA	3	6	1394073	1394078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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28447	NC_011831	GC	3	6	1394355	1394360	0 %	0 %	50 %	50 %	219848041
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28468	NC_011831	TTGG	2	8	1395599	1395606	0 %	50 %	50 %	0 %	219848041
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28495	NC_011831	ATCG	2	8	1396924	1396931	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28496	NC_011831	TCGG	2	8	1396989	1396996	0 %	25 %	50 %	25 %	219848043
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