MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 94970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27502	NC_011831	TGA	2	6	1349632	1349637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219848006
27503	NC_011831	A	6	6	1349679	1349684	100 %	0 %	0 %	0 %	219848006
27504	NC_011831	CA	3	6	1349686	1349691	50 %	0 %	0 %	50 %	219848006
27505	NC_011831	CCA	2	6	1349740	1349745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219848006
27506	NC_011831	CGA	2	6	1349773	1349778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848006
27507	NC_011831	A	6	6	1349784	1349789	100 %	0 %	0 %	0 %	219848006
27508	NC_011831	GCC	2	6	1349802	1349807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848006
27509	NC_011831	CAA	2	6	1349834	1349839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219848006
27510	NC_011831	AGGT	2	8	1349869	1349876	25 %	25 %	50 %	0 %	219848006
27511	NC_011831	A	7	7	1349912	1349918	100 %	0 %	0 %	0 %	219848006
27512	NC_011831	AGG	2	6	1349989	1349994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219848006
27513	NC_011831	A	6	6	1349995	1350000	100 %	0 %	0 %	0 %	219848007
27514	NC_011831	ATG	2	6	1350061	1350066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219848007
27515	NC_011831	AGT	2	6	1350099	1350104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219848007
27516	NC_011831	AGT	2	6	1350116	1350121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219848007
27517	NC_011831	ATAC	2	8	1350155	1350162	50 %	25 %	0 %	25 %	219848007
27518	NC_011831	TTA	2	6	1350267	1350272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219848007
27519	NC_011831	GAA	2	6	1350315	1350320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219848007
27520	NC_011831	ATT	2	6	1350373	1350378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219848007
27521	NC_011831	GAA	2	6	1350384	1350389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219848007
27522	NC_011831	CAA	2	6	1350434	1350439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27523	NC_011831	TGC	2	6	1350463	1350468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27524	NC_011831	TC	3	6	1350652	1350657	0 %	50 %	0 %	50 %	219848008
27525	NC_011831	TTGCC	2	10	1350731	1350740	0 %	40 %	20 %	40 %	219848008
27526	NC_011831	CGG	2	6	1350826	1350831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219848008
27527	NC_011831	GTG	2	6	1350863	1350868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219848008
27528	NC_011831	TGC	2	6	1350896	1350901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27529	NC_011831	CAGG	2	8	1350954	1350961	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27530	NC_011831	CGGT	2	8	1350967	1350974	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27531	NC_011831	GCTT	2	8	1350979	1350986	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27532	NC_011831	ACT	2	6	1351025	1351030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27533	NC_011831	AGA	2	6	1351127	1351132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219848009
27534	NC_011831	GCC	2	6	1351246	1351251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848009
27535	NC_011831	GATT	2	8	1351270	1351277	25 %	50 %	25 %	0 %	219848009
27536	NC_011831	CAC	2	6	1351300	1351305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219848009
27537	NC_011831	AC	3	6	1351349	1351354	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27538	NC_011831	CGG	2	6	1351372	1351377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27539	NC_011831	TGA	2	6	1351378	1351383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27540	NC_011831	TTGA	2	8	1351409	1351416	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27541	NC_011831	ATG	2	6	1351428	1351433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27542	NC_011831	TGG	2	6	1351631	1351636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27543	NC_011831	AGC	2	6	1351669	1351674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27544	NC_011831	GTGA	2	8	1351713	1351720	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27545	NC_011831	GGCT	2	8	1351815	1351822	0 %	25 %	50 %	25 %	219848010
27546	NC_011831	GA	3	6	1351904	1351909	50 %	0 %	50 %	0 %	219848010
27547	NC_011831	TGA	2	6	1351962	1351967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219848010
27548	NC_011831	GCG	2	6	1352017	1352022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219848010
27549	NC_011831	GCA	2	6	1352038	1352043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848010
27550	NC_011831	GC	3	6	1352046	1352051	0 %	0 %	50 %	50 %	219848010
27551	NC_011831	CGC	2	6	1352067	1352072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219848010
27552	NC_011831	TCG	2	6	1352074	1352079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219848010
27553	NC_011831	TCT	2	6	1352107	1352112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219848010
27554	NC_011831	TCG	2	6	1352160	1352165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219848010
27555	NC_011831	TGG	2	6	1352200	1352205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219848010
27556	NC_011831	TGA	2	6	1352454	1352459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27557	NC_011831	C	7	7	1352526	1352532	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27558	NC_011831	GC	3	6	1352534	1352539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27559	NC_011831	GACG	2	8	1352552	1352559	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27560	NC_011831	GC	3	6	1352577	1352582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27561	NC_011831	CCA	2	6	1352610	1352615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27562	NC_011831	CG	4	8	1352627	1352634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27563	NC_011831	TCC	2	6	1352675	1352680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27564	NC_011831	CG	3	6	1352711	1352716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27565	NC_011831	CACC	2	8	1352728	1352735	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
27566	NC_011831	CGTG	2	8	1352749	1352756	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27567	NC_011831	GTC	2	6	1352763	1352768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27568	NC_011831	AAT	2	6	1352964	1352969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27569	NC_011831	CCG	2	6	1353063	1353068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27570	NC_011831	CGC	2	6	1353081	1353086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27571	NC_011831	CGC	2	6	1353130	1353135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27572	NC_011831	AACGTA	2	12	1353187	1353198	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27573	NC_011831	GA	3	6	1353199	1353204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27574	NC_011831	ATGG	2	8	1353241	1353248	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27575	NC_011831	GTT	2	6	1353260	1353265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27576	NC_011831	CGG	2	6	1353275	1353280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27577	NC_011831	GGT	2	6	1353352	1353357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27578	NC_011831	CA	3	6	1353553	1353558	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27579	NC_011831	TCA	2	6	1353586	1353591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27580	NC_011831	CAA	3	9	1353823	1353831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27581	NC_011831	CAAAG	2	10	1353853	1353862	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
27582	NC_011831	GCA	2	6	1353879	1353884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27583	NC_011831	CTTT	2	8	1353977	1353984	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27584	NC_011831	T	6	6	1353982	1353987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27585	NC_011831	AGGA	2	8	1353989	1353996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27586	NC_011831	CT	3	6	1354008	1354013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27587	NC_011831	ATG	2	6	1354031	1354036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27588	NC_011831	CTG	2	6	1354049	1354054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27589	NC_011831	ATG	2	6	1354082	1354087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27590	NC_011831	TC	3	6	1354242	1354247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27591	NC_011831	TCT	2	6	1354249	1354254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27592	NC_011831	AGA	2	6	1354313	1354318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27593	NC_011831	CTT	2	6	1354341	1354346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27594	NC_011831	GCTAC	2	10	1354348	1354357	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27595	NC_011831	GCT	2	6	1354482	1354487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27596	NC_011831	ACA	2	6	1354495	1354500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27597	NC_011831	GGA	2	6	1354518	1354523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27598	NC_011831	TCA	2	6	1354526	1354531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27599	NC_011831	CGA	2	6	1354551	1354556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27600	NC_011831	CTC	2	6	1354568	1354573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27601	NC_011831	CAAAC	2	10	1354577	1354586	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
27602	NC_011831	G	6	6	1354800	1354805	0 %	0 %	100 %	0 %	219848011
27603	NC_011831	ATC	2	6	1354806	1354811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219848011
27604	NC_011831	GAT	2	6	1354866	1354871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219848011
27605	NC_011831	GA	3	6	1354952	1354957	50 %	0 %	50 %	0 %	219848011
27606	NC_011831	TCA	2	6	1355071	1355076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219848011
27607	NC_011831	TCA	2	6	1355140	1355145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219848011
27608	NC_011831	GATT	2	8	1355168	1355175	25 %	50 %	25 %	0 %	219848011
27609	NC_011831	GAT	2	6	1355184	1355189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219848011
27610	NC_011831	TGA	2	6	1355200	1355205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219848011
27611	NC_011831	TCC	2	6	1355246	1355251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219848011
27612	NC_011831	CAT	2	6	1355295	1355300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219848011
27613	NC_011831	ATG	2	6	1355365	1355370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219848011
27614	NC_011831	TGAAG	2	10	1355378	1355387	40 %	20 %	40 %	0 %	219848011
27615	NC_011831	GA	3	6	1355456	1355461	50 %	0 %	50 %	0 %	219848011
27616	NC_011831	TGCC	2	8	1355500	1355507	0 %	25 %	25 %	50 %	219848011
27617	NC_011831	TCC	2	6	1355559	1355564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219848011
27618	NC_011831	TGA	2	6	1355644	1355649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27619	NC_011831	GGGA	2	8	1355654	1355661	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
27620	NC_011831	AGA	2	6	1355671	1355676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27621	NC_011831	CTT	2	6	1355690	1355695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27622	NC_011831	GTG	2	6	1355699	1355704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27623	NC_011831	ATA	2	6	1355730	1355735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27975	NC_011831	GGT	2	6	1373273	1373278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219848028
27976	NC_011831	GC	3	6	1373349	1373354	0 %	0 %	50 %	50 %	219848028
27977	NC_011831	CGGCGC	2	12	1373362	1373373	0 %	0 %	50 %	50 %	219848028
27978	NC_011831	GTT	3	9	1373380	1373388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219848028
27979	NC_011831	AGC	2	6	1373391	1373396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848028
27980	NC_011831	GGC	2	6	1373439	1373444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219848028
27981	NC_011831	GGC	2	6	1373465	1373470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219848028
27982	NC_011831	GCAACG	2	12	1373488	1373499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848028
27983	NC_011831	TAA	2	6	1373547	1373552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219848028
27984	NC_011831	GGCC	2	8	1373695	1373702	0 %	0 %	50 %	50 %	219848028
27985	NC_011831	AAC	2	6	1373703	1373708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219848028
27986	NC_011831	GC	3	6	1373726	1373731	0 %	0 %	50 %	50 %	219848028
27987	NC_011831	CATCT	2	10	1373732	1373741	20 %	40 %	0 %	40 %	219848028
27988	NC_011831	CTG	2	6	1373747	1373752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219848028
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27990	NC_011831	CGG	2	6	1373777	1373782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219848028
27991	NC_011831	ATC	2	6	1373805	1373810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219848028
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27994	NC_011831	ACG	2	6	1374000	1374005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848029
27995	NC_011831	TCG	2	6	1374047	1374052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219848029
27996	NC_011831	GGT	2	6	1374240	1374245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219848029
27997	NC_011831	CAA	2	6	1374252	1374257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219848029
27998	NC_011831	GCAT	2	8	1374358	1374365	25 %	25 %	25 %	25 %	219848029
27999	NC_011831	GCCAAA	2	12	1374447	1374458	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	219848029
28000	NC_011831	GCA	2	6	1374484	1374489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219848029

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