MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 94970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_011831	G	6	6	1246110	1246115	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25502	NC_011831	GC	3	6	1246146	1246151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25503	NC_011831	T	6	6	1246195	1246200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25504	NC_011831	CG	3	6	1246276	1246281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25505	NC_011831	CGA	2	6	1246325	1246330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25506	NC_011831	T	6	6	1246333	1246338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25507	NC_011831	GAG	3	9	1246393	1246401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25508	NC_011831	GC	3	6	1246438	1246443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25509	NC_011831	GGC	2	6	1246476	1246481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25510	NC_011831	TGG	2	6	1246499	1246504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25511	NC_011831	GCC	2	6	1246605	1246610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25512	NC_011831	CTC	2	6	1246693	1246698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25513	NC_011831	ATG	2	6	1246805	1246810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25514	NC_011831	GATG	2	8	1246925	1246932	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25515	NC_011831	TGA	2	6	1246939	1246944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25516	NC_011831	ATT	2	6	1247060	1247065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847927
25517	NC_011831	GCT	2	6	1247104	1247109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847927
25518	NC_011831	AGC	2	6	1247139	1247144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847927
25519	NC_011831	CTC	2	6	1247153	1247158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847927
25520	NC_011831	TCAAAC	2	12	1247196	1247207	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	219847927
25521	NC_011831	GCC	2	6	1247312	1247317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847927
25522	NC_011831	CAA	2	6	1247425	1247430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847927
25523	NC_011831	GATC	2	8	1247431	1247438	25 %	25 %	25 %	25 %	219847927
25524	NC_011831	CTG	2	6	1247496	1247501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847927
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25526	NC_011831	GCCAGC	2	12	1247589	1247600	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	219847927
25527	NC_011831	AGGT	2	8	1247796	1247803	25 %	25 %	50 %	0 %	219847927
25528	NC_011831	CCGG	2	8	1247873	1247880	0 %	0 %	50 %	50 %	219847927
25529	NC_011831	ACG	2	6	1247994	1247999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847927
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25533	NC_011831	CG	3	6	1248348	1248353	0 %	0 %	50 %	50 %	219847927
25534	NC_011831	TGC	2	6	1248354	1248359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847927
25535	NC_011831	CGCA	2	8	1248419	1248426	25 %	0 %	25 %	50 %	219847927
25536	NC_011831	CTCG	2	8	1248436	1248443	0 %	25 %	25 %	50 %	219847927
25537	NC_011831	ATC	2	6	1248447	1248452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847927
25538	NC_011831	CGG	2	6	1248700	1248705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847927
25539	NC_011831	AAG	2	6	1248752	1248757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847927
25540	NC_011831	AAG	2	6	1248792	1248797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847927
25541	NC_011831	GTA	2	6	1248872	1248877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847928
25542	NC_011831	GCT	2	6	1248894	1248899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847928
25543	NC_011831	TCC	2	6	1248908	1248913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847928
25544	NC_011831	GTG	2	6	1248931	1248936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847928
25545	NC_011831	AAT	2	6	1249015	1249020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847928
25546	NC_011831	GAT	2	6	1249137	1249142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847928
25547	NC_011831	CTG	3	9	1249153	1249161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847928
25548	NC_011831	TAC	2	6	1249162	1249167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847928
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25552	NC_011831	GC	3	6	1249339	1249344	0 %	0 %	50 %	50 %	219847928
25553	NC_011831	TGA	3	9	1249356	1249364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847928
25554	NC_011831	CG	3	6	1249436	1249441	0 %	0 %	50 %	50 %	219847928
25555	NC_011831	GGT	2	6	1249462	1249467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847928
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25611	NC_011831	AGGG	2	8	1252733	1252740	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25612	NC_011831	CGGGC	2	10	1252886	1252895	0 %	0 %	60 %	40 %	219847932
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25630	NC_011831	GCAC	2	8	1253571	1253578	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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25852	NC_011831	GCT	2	6	1266709	1266714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847940
25853	NC_011831	CTCGA	2	10	1266738	1266747	20 %	20 %	20 %	40 %	219847940
25854	NC_011831	CGA	2	6	1266772	1266777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847940
25855	NC_011831	TCGC	2	8	1266784	1266791	0 %	25 %	25 %	50 %	219847940
25856	NC_011831	GTT	2	6	1266877	1266882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847940
25857	NC_011831	GCC	2	6	1266904	1266909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847940
25858	NC_011831	CCT	2	6	1266925	1266930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847940
25859	NC_011831	GGCA	2	8	1266975	1266982	25 %	0 %	50 %	25 %	219847940
25860	NC_011831	GCC	3	9	1267012	1267020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847940
25861	NC_011831	CCT	2	6	1267063	1267068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847940
25862	NC_011831	CAC	2	6	1267198	1267203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847940
25863	NC_011831	CG	3	6	1267220	1267225	0 %	0 %	50 %	50 %	219847940
25864	NC_011831	AGC	2	6	1267297	1267302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847940
25865	NC_011831	TGA	2	6	1267384	1267389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847940
25866	NC_011831	CTGCGG	2	12	1267472	1267483	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219847940
25867	NC_011831	ATT	2	6	1267562	1267567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847940
25868	NC_011831	CG	3	6	1267568	1267573	0 %	0 %	50 %	50 %	219847940
25869	NC_011831	TCA	2	6	1267608	1267613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847940
25870	NC_011831	ACT	2	6	1267627	1267632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847940
25871	NC_011831	ACC	2	6	1267664	1267669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847940
25872	NC_011831	TCA	2	6	1267699	1267704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847940
25873	NC_011831	CGG	2	6	1267707	1267712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847940
25874	NC_011831	CACT	2	8	1267713	1267720	25 %	25 %	0 %	50 %	219847940
25875	NC_011831	AACC	2	8	1267748	1267755	50 %	0 %	0 %	50 %	219847940
25876	NC_011831	GCA	2	6	1267766	1267771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847940
25877	NC_011831	GAC	2	6	1267774	1267779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847940
25878	NC_011831	CAT	2	6	1267783	1267788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847940
25879	NC_011831	AGCA	2	8	1267815	1267822	50 %	0 %	25 %	25 %	219847940
25880	NC_011831	AGC	2	6	1267825	1267830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847940
25881	NC_011831	GATC	2	8	1267924	1267931	25 %	25 %	25 %	25 %	219847940
25882	NC_011831	ACT	2	6	1267957	1267962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847940
25883	NC_011831	ATTG	2	8	1268032	1268039	25 %	50 %	25 %	0 %	219847940
25884	NC_011831	AGC	2	6	1268060	1268065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847940
25885	NC_011831	ACT	2	6	1268182	1268187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847940
25886	NC_011831	TAG	2	6	1268211	1268216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847940
25887	NC_011831	ACC	2	6	1268374	1268379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847940
25888	NC_011831	CGA	2	6	1268422	1268427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847940
25889	NC_011831	CTG	2	6	1268475	1268480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847940
25890	NC_011831	CTC	2	6	1268492	1268497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847940
25891	NC_011831	ACT	2	6	1268522	1268527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847940
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25894	NC_011831	GGCCC	2	10	1268657	1268666	0 %	0 %	40 %	60 %	219847940
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25898	NC_011831	GC	3	6	1268724	1268729	0 %	0 %	50 %	50 %	219847940
25899	NC_011831	CGC	2	6	1268731	1268736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847940
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25901	NC_011831	CGA	2	6	1268839	1268844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847940
25902	NC_011831	CTC	2	6	1268912	1268917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847940
25903	NC_011831	GCA	2	6	1268939	1268944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847940
25904	NC_011831	GCA	2	6	1268968	1268973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847940
25905	NC_011831	TCC	2	6	1268982	1268987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847940
25906	NC_011831	GTC	2	6	1269125	1269130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847940
25907	NC_011831	ACC	2	6	1269166	1269171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847940
25908	NC_011831	GCA	2	6	1269185	1269190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847940
25909	NC_011831	GCT	2	6	1269194	1269199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847940
25910	NC_011831	GGC	2	6	1269232	1269237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847940
25911	NC_011831	AGT	2	6	1269280	1269285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847940
25912	NC_011831	GCT	2	6	1269361	1269366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25913	NC_011831	ACG	2	6	1269422	1269427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847941
25914	NC_011831	CCA	2	6	1269452	1269457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847941
25915	NC_011831	GAA	2	6	1269554	1269559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847941
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25920	NC_011831	GAA	2	6	1269698	1269703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847941
25921	NC_011831	TCA	2	6	1269732	1269737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847941
25922	NC_011831	ACG	2	6	1269804	1269809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847941
25923	NC_011831	TGCAA	2	10	1269820	1269829	40 %	20 %	20 %	20 %	219847941
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25929	NC_011831	CTGCCG	2	12	1270421	1270432	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219847942
25930	NC_011831	CAC	2	6	1270444	1270449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847942
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25933	NC_011831	ATT	2	6	1270567	1270572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847942
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25936	NC_011831	TCG	2	6	1270729	1270734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847942
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25940	NC_011831	CAC	2	6	1270880	1270885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847942
25941	NC_011831	TGGT	2	8	1270921	1270928	0 %	50 %	50 %	0 %	219847942
25942	NC_011831	GGT	2	6	1270944	1270949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847942
25943	NC_011831	CGAG	2	8	1270951	1270958	25 %	0 %	50 %	25 %	219847942
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25946	NC_011831	ACAG	2	8	1271171	1271178	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25947	NC_011831	ACG	2	6	1271191	1271196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25948	NC_011831	CCGA	2	8	1271330	1271337	25 %	0 %	25 %	50 %	219847943
25949	NC_011831	CGT	2	6	1271393	1271398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847943
25950	NC_011831	TGA	2	6	1271441	1271446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847943
25951	NC_011831	CAC	2	6	1271465	1271470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847943
25952	NC_011831	GTC	2	6	1271497	1271502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847943
25953	NC_011831	GTA	2	6	1271579	1271584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847943
25954	NC_011831	CAACC	3	15	1271618	1271632	40 %	0 %	0 %	60 %	219847943
25955	NC_011831	GAG	2	6	1271665	1271670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847943
25956	NC_011831	CGG	2	6	1271673	1271678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847943
25957	NC_011831	CGA	2	6	1271703	1271708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847943
25958	NC_011831	AACC	2	8	1271741	1271748	50 %	0 %	0 %	50 %	219847943
25959	NC_011831	TGC	2	6	1271811	1271816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847943
25960	NC_011831	CAC	2	6	1271897	1271902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847943
25961	NC_011831	GCCGGT	2	12	1271953	1271964	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219847943
25962	NC_011831	GCT	2	6	1272055	1272060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847943
25963	NC_011831	ACC	2	6	1272174	1272179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847943
25964	NC_011831	TAC	2	6	1272217	1272222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847943
25965	NC_011831	GTGG	2	8	1272288	1272295	0 %	25 %	75 %	0 %	219847943
25966	NC_011831	CAT	2	6	1272324	1272329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847943
25967	NC_011831	ATA	2	6	1272364	1272369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25970	NC_011831	A	6	6	1272433	1272438	100 %	0 %	0 %	0 %	219847944
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25997	NC_011831	TCA	2	6	1273784	1273789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847946
25998	NC_011831	CGCA	2	8	1273803	1273810	25 %	0 %	25 %	50 %	219847946
25999	NC_011831	CGG	2	6	1273823	1273828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847946
26000	NC_011831	CAG	2	6	1273851	1273856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847946

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