MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 94970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_011831	CAG	2	6	1223739	1223744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847912
25002	NC_011831	GAT	2	6	1223919	1223924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847912
25003	NC_011831	CTT	2	6	1223961	1223966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847912
25004	NC_011831	CTT	2	6	1224084	1224089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847912
25005	NC_011831	CGG	2	6	1224128	1224133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847912
25006	NC_011831	GCCGG	2	10	1224145	1224154	0 %	0 %	60 %	40 %	219847912
25007	NC_011831	TCTT	2	8	1224190	1224197	0 %	75 %	0 %	25 %	219847912
25008	NC_011831	AACC	2	8	1224218	1224225	50 %	0 %	0 %	50 %	219847912
25009	NC_011831	CAG	2	6	1224252	1224257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847912
25010	NC_011831	GTT	2	6	1224274	1224279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847912
25011	NC_011831	CAA	2	6	1224434	1224439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847912
25012	NC_011831	GCA	2	6	1224502	1224507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847912
25013	NC_011831	GAT	2	6	1224576	1224581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847912
25014	NC_011831	CCT	2	6	1224615	1224620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25015	NC_011831	GCC	2	6	1224667	1224672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25016	NC_011831	ACGA	2	8	1224679	1224686	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25017	NC_011831	T	7	7	1224691	1224697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25018	NC_011831	AAC	2	6	1224744	1224749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25019	NC_011831	GCC	2	6	1224786	1224791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25020	NC_011831	GCG	3	9	1224827	1224835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25021	NC_011831	GTC	2	6	1224839	1224844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25022	NC_011831	GAGGTA	2	12	1224887	1224898	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
25023	NC_011831	GAG	2	6	1224901	1224906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25024	NC_011831	ACG	2	6	1224977	1224982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847913
25025	NC_011831	CACCG	2	10	1225035	1225044	20 %	0 %	20 %	60 %	219847913
25026	NC_011831	AAG	2	6	1225087	1225092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847913
25027	NC_011831	GGCG	2	8	1225175	1225182	0 %	0 %	75 %	25 %	219847913
25028	NC_011831	ACC	2	6	1225225	1225230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847913
25029	NC_011831	ATC	2	6	1225270	1225275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847913
25030	NC_011831	CGGT	2	8	1225282	1225289	0 %	25 %	50 %	25 %	219847913
25031	NC_011831	ATA	2	6	1225294	1225299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847913
25032	NC_011831	ATA	2	6	1225333	1225338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847913
25033	NC_011831	ACG	2	6	1225446	1225451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847913
25034	NC_011831	CTG	2	6	1225457	1225462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847913
25035	NC_011831	AGC	2	6	1225473	1225478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847913
25036	NC_011831	CTCG	2	8	1225505	1225512	0 %	25 %	25 %	50 %	219847913
25037	NC_011831	CGG	2	6	1225541	1225546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847913
25038	NC_011831	CGG	2	6	1225565	1225570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847913
25039	NC_011831	GC	3	6	1225602	1225607	0 %	0 %	50 %	50 %	219847913
25040	NC_011831	GGT	2	6	1225666	1225671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847913
25041	NC_011831	GCTC	2	8	1225736	1225743	0 %	25 %	25 %	50 %	219847913
25042	NC_011831	GGT	2	6	1225768	1225773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847913
25043	NC_011831	TGG	2	6	1225783	1225788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847913
25044	NC_011831	GCA	2	6	1225813	1225818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847913
25045	NC_011831	CAC	2	6	1225841	1225846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847913
25046	NC_011831	CGG	2	6	1225865	1225870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847913
25047	NC_011831	GGCACG	2	12	1225875	1225886	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219847913
25048	NC_011831	TCG	2	6	1225978	1225983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847913
25049	NC_011831	GGT	2	6	1226011	1226016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847913
25050	NC_011831	AG	3	6	1226033	1226038	50 %	0 %	50 %	0 %	219847913
25051	NC_011831	GCCA	2	8	1226076	1226083	25 %	0 %	25 %	50 %	219847913
25052	NC_011831	TC	3	6	1226153	1226158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25053	NC_011831	TAC	2	6	1226191	1226196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25054	NC_011831	AGT	2	6	1226232	1226237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25055	NC_011831	CA	3	6	1226248	1226253	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25056	NC_011831	GAG	2	6	1226315	1226320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847914
25057	NC_011831	GCA	2	6	1226331	1226336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847914
25058	NC_011831	GGT	2	6	1226404	1226409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847914
25059	NC_011831	GAG	2	6	1226417	1226422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847914
25060	NC_011831	GTG	2	6	1226446	1226451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847914
25061	NC_011831	GAT	2	6	1226495	1226500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847914
25062	NC_011831	CG	3	6	1226503	1226508	0 %	0 %	50 %	50 %	219847914
25063	NC_011831	GTAG	2	8	1226567	1226574	25 %	25 %	50 %	0 %	219847914
25064	NC_011831	AGT	2	6	1226577	1226582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847914
25065	NC_011831	T	7	7	1226702	1226708	0 %	100 %	0 %	0 %	219847914
25066	NC_011831	A	6	6	1226717	1226722	100 %	0 %	0 %	0 %	219847914
25067	NC_011831	GCA	3	9	1226796	1226804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847914
25068	NC_011831	ACC	2	6	1226816	1226821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847914
25069	NC_011831	ACC	2	6	1226826	1226831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847914
25070	NC_011831	ATC	2	6	1226853	1226858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847914
25071	NC_011831	GCG	2	6	1226949	1226954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847914
25072	NC_011831	ATT	2	6	1226978	1226983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847914
25073	NC_011831	CGG	2	6	1227013	1227018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847914
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25077	NC_011831	CGAG	2	8	1227222	1227229	25 %	0 %	50 %	25 %	219847914
25078	NC_011831	TGA	2	6	1227232	1227237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847914
25079	NC_011831	TCGAG	2	10	1227339	1227348	20 %	20 %	40 %	20 %	219847914
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25081	NC_011831	TAT	2	6	1227431	1227436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847914
25082	NC_011831	CAG	2	6	1227446	1227451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847914
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25085	NC_011831	GTAC	2	8	1227600	1227607	25 %	25 %	25 %	25 %	219847915
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25089	NC_011831	GAG	2	6	1227783	1227788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847915
25090	NC_011831	ATC	2	6	1227789	1227794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847915
25091	NC_011831	CCG	2	6	1227837	1227842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847915
25092	NC_011831	ATC	2	6	1227936	1227941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847915
25093	NC_011831	GCT	3	9	1227986	1227994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847915
25094	NC_011831	CCGG	2	8	1228019	1228026	0 %	0 %	50 %	50 %	219847915
25095	NC_011831	GCTC	2	8	1228039	1228046	0 %	25 %	25 %	50 %	219847915
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25097	NC_011831	GCGG	2	8	1228198	1228205	0 %	0 %	75 %	25 %	219847915
25098	NC_011831	GC	3	6	1228303	1228308	0 %	0 %	50 %	50 %	219847915
25099	NC_011831	TTC	2	6	1228344	1228349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847915
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25101	NC_011831	AGG	2	6	1228543	1228548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847915
25102	NC_011831	GAT	2	6	1228571	1228576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847915
25103	NC_011831	AAC	2	6	1228616	1228621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25104	NC_011831	TAC	2	6	1228656	1228661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25105	NC_011831	TTG	2	6	1228692	1228697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25106	NC_011831	TAC	2	6	1228721	1228726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25107	NC_011831	GTAA	2	8	1228728	1228735	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25108	NC_011831	AATCG	2	10	1228805	1228814	40 %	20 %	20 %	20 %	219847916
25109	NC_011831	ACGA	2	8	1228884	1228891	50 %	0 %	25 %	25 %	219847916
25110	NC_011831	CCAC	2	8	1228946	1228953	25 %	0 %	0 %	75 %	219847916
25111	NC_011831	TAG	2	6	1229010	1229015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847916
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25113	NC_011831	GCCA	2	8	1229062	1229069	25 %	0 %	25 %	50 %	219847916
25114	NC_011831	ACG	2	6	1229084	1229089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847916
25115	NC_011831	TGA	2	6	1229095	1229100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847916
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25117	NC_011831	GAAC	2	8	1229233	1229240	50 %	0 %	25 %	25 %	219847916
25118	NC_011831	GTC	2	6	1229289	1229294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847916
25119	NC_011831	TCA	2	6	1229350	1229355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847916
25120	NC_011831	CGG	2	6	1229375	1229380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847916
25121	NC_011831	TGG	2	6	1229469	1229474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847916
25122	NC_011831	TGC	2	6	1229548	1229553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847916
25123	NC_011831	CAA	2	6	1229664	1229669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847917
25124	NC_011831	TCT	3	9	1229749	1229757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847917
25125	NC_011831	ACA	2	6	1229867	1229872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847917
25126	NC_011831	CAC	2	6	1229873	1229878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847917
25127	NC_011831	CTTT	2	8	1230049	1230056	0 %	75 %	0 %	25 %	219847917
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25130	NC_011831	TGG	2	6	1230177	1230182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847917
25131	NC_011831	GTG	2	6	1230208	1230213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847917
25132	NC_011831	CGG	2	6	1230228	1230233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847917
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25141	NC_011831	TTCATC	2	12	1230915	1230926	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	219847918
25142	NC_011831	TGA	2	6	1231058	1231063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847918
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25145	NC_011831	TCATCG	2	12	1231137	1231148	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219847918
25146	NC_011831	GC	4	8	1231242	1231249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25147	NC_011831	ACG	2	6	1231278	1231283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847919
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25152	NC_011831	CCA	2	6	1231415	1231420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847919
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25154	NC_011831	GAG	2	6	1231465	1231470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847919
25155	NC_011831	GC	3	6	1231519	1231524	0 %	0 %	50 %	50 %	219847919
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25157	NC_011831	CGGA	2	8	1231692	1231699	25 %	0 %	50 %	25 %	219847920
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25172	NC_011831	TCG	2	6	1232380	1232385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847920
25173	NC_011831	AAT	2	6	1232388	1232393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847920
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25188	NC_011831	TCC	2	6	1233252	1233257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25189	NC_011831	GCG	2	6	1233304	1233309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25190	NC_011831	GTGG	2	8	1233319	1233326	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25191	NC_011831	TGGT	2	8	1233484	1233491	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25192	NC_011831	GGT	2	6	1233552	1233557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25193	NC_011831	CCG	2	6	1233569	1233574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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25195	NC_011831	GCG	2	6	1233654	1233659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25196	NC_011831	CCCA	2	8	1233681	1233688	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
25197	NC_011831	GCG	3	9	1233705	1233713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25198	NC_011831	GTT	2	6	1233743	1233748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25201	NC_011831	GCTG	2	8	1233964	1233971	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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25204	NC_011831	CGG	3	9	1234005	1234013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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25207	NC_011831	GC	3	6	1234076	1234081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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25212	NC_011831	GC	3	6	1234266	1234271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25213	NC_011831	CAC	2	6	1234291	1234296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25214	NC_011831	GCG	2	6	1234323	1234328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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25217	NC_011831	C	7	7	1234457	1234463	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25218	NC_011831	GCACCG	2	12	1234468	1234479	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25219	NC_011831	CTGG	2	8	1234529	1234536	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25220	NC_011831	GCC	2	6	1234538	1234543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25221	NC_011831	TGG	2	6	1234546	1234551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25222	NC_011831	GCTGG	2	10	1234578	1234587	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
25223	NC_011831	CGG	3	9	1234639	1234647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25224	NC_011831	CGG	2	6	1234658	1234663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25225	NC_011831	GCG	2	6	1234676	1234681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25226	NC_011831	GTT	2	6	1234723	1234728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25227	NC_011831	CAG	2	6	1234753	1234758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847921
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25230	NC_011831	GTT	2	6	1234892	1234897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847921
25231	NC_011831	T	6	6	1234971	1234976	0 %	100 %	0 %	0 %	219847921
25232	NC_011831	ACC	2	6	1235005	1235010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847921
25233	NC_011831	GTG	2	6	1235025	1235030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847921
25234	NC_011831	GGC	2	6	1235063	1235068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847921
25235	NC_011831	TGT	2	6	1235080	1235085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847921
25236	NC_011831	GTCT	2	8	1235115	1235122	0 %	50 %	25 %	25 %	219847921
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25355	NC_011831	CTG	2	6	1239679	1239684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847922
25356	NC_011831	AGC	2	6	1239734	1239739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847922
25357	NC_011831	CGG	2	6	1239750	1239755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847922
25358	NC_011831	CGTG	2	8	1239828	1239835	0 %	25 %	50 %	25 %	219847922
25359	NC_011831	GTGG	2	8	1239871	1239878	0 %	25 %	75 %	0 %	219847922
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25363	NC_011831	GC	3	6	1240009	1240014	0 %	0 %	50 %	50 %	219847922
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25368	NC_011831	G	6	6	1240272	1240277	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25369	NC_011831	C	6	6	1240293	1240298	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25370	NC_011831	TCG	2	6	1240302	1240307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25374	NC_011831	CT	3	6	1240727	1240732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25375	NC_011831	CCA	2	6	1240783	1240788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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25388	NC_011831	GCC	2	6	1241333	1241338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847924
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25471	NC_011831	ATAC	2	8	1244968	1244975	50 %	25 %	0 %	25 %	219847926
25472	NC_011831	GAT	2	6	1245039	1245044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847926
25473	NC_011831	ATC	2	6	1245052	1245057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847926
25474	NC_011831	TG	3	6	1245106	1245111	0 %	50 %	50 %	0 %	219847926
25475	NC_011831	GAT	2	6	1245163	1245168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25476	NC_011831	GTGCG	2	10	1245170	1245179	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
25477	NC_011831	CGA	2	6	1245203	1245208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25478	NC_011831	TGACC	2	10	1245245	1245254	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25479	NC_011831	CTA	2	6	1245257	1245262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25480	NC_011831	GCG	2	6	1245269	1245274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25481	NC_011831	GAC	3	9	1245350	1245358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25482	NC_011831	TGC	2	6	1245528	1245533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25483	NC_011831	GTT	2	6	1245544	1245549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25484	NC_011831	GCC	2	6	1245553	1245558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25485	NC_011831	CAA	2	6	1245627	1245632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25486	NC_011831	CGG	2	6	1245699	1245704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25487	NC_011831	CAG	2	6	1245720	1245725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25488	NC_011831	GC	3	6	1245743	1245748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25489	NC_011831	G	6	6	1245761	1245766	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25490	NC_011831	TCT	2	6	1245772	1245777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25491	NC_011831	TCG	2	6	1245780	1245785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25492	NC_011831	ATT	2	6	1245828	1245833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25493	NC_011831	GCA	2	6	1245849	1245854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25494	NC_011831	GTT	2	6	1245872	1245877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25495	NC_011831	CAG	2	6	1245885	1245890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25496	NC_011831	CGCTTG	2	12	1245897	1245908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25497	NC_011831	CGG	2	6	1245931	1245936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25498	NC_011831	GGTGA	2	10	1245978	1245987	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
25499	NC_011831	TGC	2	6	1246018	1246023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25500	NC_011831	CTA	2	6	1246094	1246099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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