MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 94970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23502	NC_011831	CGG	2	6	1148700	1148705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847842
23503	NC_011831	CTC	2	6	1148752	1148757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847842
23504	NC_011831	ACC	2	6	1148775	1148780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847842
23505	NC_011831	ACG	2	6	1148814	1148819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847842
23506	NC_011831	CGG	2	6	1148823	1148828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847842
23507	NC_011831	GC	3	6	1148830	1148835	0 %	0 %	50 %	50 %	219847842
23508	NC_011831	GTT	2	6	1148841	1148846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847842
23509	NC_011831	CAA	2	6	1148854	1148859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847842
23510	NC_011831	CGC	2	6	1148950	1148955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847842
23511	NC_011831	CGCT	2	8	1149134	1149141	0 %	25 %	25 %	50 %	219847842
23512	NC_011831	GCC	2	6	1149152	1149157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847842
23513	NC_011831	GGC	2	6	1149174	1149179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847842
23514	NC_011831	CCGTC	2	10	1149225	1149234	0 %	20 %	20 %	60 %	219847842
23515	NC_011831	TGGC	2	8	1149305	1149312	0 %	25 %	50 %	25 %	219847842
23516	NC_011831	CTC	2	6	1149328	1149333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847842
23517	NC_011831	GGAT	2	8	1149343	1149350	25 %	25 %	50 %	0 %	219847842
23518	NC_011831	TG	3	6	1149359	1149364	0 %	50 %	50 %	0 %	219847842
23519	NC_011831	CCG	2	6	1149379	1149384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847842
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23521	NC_011831	GCG	2	6	1149444	1149449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847842
23522	NC_011831	CAT	4	12	1149507	1149518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23523	NC_011831	ACC	2	6	1149568	1149573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23524	NC_011831	CGGA	2	8	1149578	1149585	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23525	NC_011831	CGT	4	12	1149619	1149630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23526	NC_011831	ATG	2	6	1149645	1149650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23527	NC_011831	CGT	2	6	1149651	1149656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23528	NC_011831	CGC	2	6	1149673	1149678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23529	NC_011831	CAT	3	9	1149689	1149697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23530	NC_011831	ACC	2	6	1149747	1149752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23531	NC_011831	CGGA	2	8	1149757	1149764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23532	NC_011831	CGT	4	12	1149798	1149809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23533	NC_011831	ATG	2	6	1149824	1149829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23534	NC_011831	CGT	2	6	1149830	1149835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23535	NC_011831	CGC	2	6	1149852	1149857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23536	NC_011831	CAT	3	9	1149868	1149876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847843
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23539	NC_011831	CGT	4	12	1149977	1149988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847843
23540	NC_011831	ACC	2	6	1150040	1150045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847843
23541	NC_011831	CGGA	2	8	1150050	1150057	25 %	0 %	50 %	25 %	219847843
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23544	NC_011831	CGT	2	6	1150123	1150128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847843
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23549	NC_011831	CGT	3	9	1150270	1150278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847844
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23551	NC_011831	CGT	2	6	1150299	1150304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847844
23552	NC_011831	CGC	2	6	1150321	1150326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847844
23553	NC_011831	CAT	3	9	1150337	1150345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847844
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23555	NC_011831	CGGA	2	8	1150405	1150412	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23556	NC_011831	CGT	2	6	1150435	1150440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23557	NC_011831	CGT	3	9	1150446	1150454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23558	NC_011831	CAT	2	6	1150455	1150460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23559	NC_011831	ACC	2	6	1150509	1150514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23560	NC_011831	CGGA	2	8	1150519	1150526	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23561	NC_011831	TTG	2	6	1150558	1150563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23564	NC_011831	TTA	2	6	1150667	1150672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23574	NC_011831	CGAT	2	8	1151211	1151218	25 %	25 %	25 %	25 %	219847845
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23585	NC_011831	CAA	2	6	1151938	1151943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847845
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23588	NC_011831	GC	3	6	1152057	1152062	0 %	0 %	50 %	50 %	219847845
23589	NC_011831	CCG	2	6	1152076	1152081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847845
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23591	NC_011831	CCT	2	6	1152120	1152125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847845
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23593	NC_011831	CCT	2	6	1152280	1152285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847845
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23599	NC_011831	ACGGT	2	10	1152537	1152546	20 %	20 %	40 %	20 %	219847845
23600	NC_011831	GAC	2	6	1152547	1152552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847845
23601	NC_011831	CG	3	6	1152830	1152835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23602	NC_011831	C	7	7	1152888	1152894	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23603	NC_011831	ATG	2	6	1152976	1152981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847846
23604	NC_011831	TCA	3	9	1152983	1152991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847846
23605	NC_011831	TGC	2	6	1153007	1153012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847846
23606	NC_011831	CCGTA	2	10	1153194	1153203	20 %	20 %	20 %	40 %	219847846
23607	NC_011831	TTA	2	6	1153267	1153272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847846
23608	NC_011831	GTT	2	6	1153337	1153342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847846
23609	NC_011831	GCCT	2	8	1153440	1153447	0 %	25 %	25 %	50 %	219847846
23610	NC_011831	AAC	2	6	1153469	1153474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847846
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23612	NC_011831	CGCC	2	8	1153527	1153534	0 %	0 %	25 %	75 %	219847846
23613	NC_011831	CGT	2	6	1153713	1153718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847846
23614	NC_011831	CGT	2	6	1153759	1153764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847846
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23616	NC_011831	ACT	2	6	1153829	1153834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847846
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23747	NC_011831	CGC	2	6	1160372	1160377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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23972	NC_011831	TCCG	2	8	1172123	1172130	0 %	25 %	25 %	50 %	219847864
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23974	NC_011831	TGT	2	6	1172202	1172207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23975	NC_011831	CAC	2	6	1172232	1172237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23976	NC_011831	T	6	6	1172263	1172268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23977	NC_011831	AGG	2	6	1172308	1172313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23978	NC_011831	TGA	2	6	1172408	1172413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847865
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23986	NC_011831	CAAC	2	8	1172975	1172982	50 %	0 %	0 %	50 %	219847865
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23991	NC_011831	TCT	2	6	1173089	1173094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847865
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23997	NC_011831	GC	3	6	1173640	1173645	0 %	0 %	50 %	50 %	219847865
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23999	NC_011831	TCG	2	6	1173692	1173697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847865
24000	NC_011831	GGT	2	6	1173814	1173819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847865

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