MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 94970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_011831	GGC	2	6	1124655	1124660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847817
23003	NC_011831	CG	3	6	1124741	1124746	0 %	0 %	50 %	50 %	219847817
23004	NC_011831	GCT	2	6	1124749	1124754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847817
23005	NC_011831	CGC	2	6	1124764	1124769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847817
23006	NC_011831	CTGAT	2	10	1125004	1125013	20 %	40 %	20 %	20 %	219847817
23007	NC_011831	CAA	2	6	1125036	1125041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847817
23008	NC_011831	GTT	2	6	1125118	1125123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23009	NC_011831	ACT	2	6	1125133	1125138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23010	NC_011831	GTT	2	6	1125187	1125192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23011	NC_011831	CAC	2	6	1125193	1125198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23012	NC_011831	CAAA	2	8	1125202	1125209	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23013	NC_011831	GAA	2	6	1125228	1125233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23014	NC_011831	CGA	2	6	1125276	1125281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23015	NC_011831	GGA	2	6	1125282	1125287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23016	NC_011831	CG	3	6	1125315	1125320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23017	NC_011831	CAA	2	6	1125321	1125326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23018	NC_011831	CAC	2	6	1125347	1125352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847818
23019	NC_011831	ATCGA	2	10	1125361	1125370	40 %	20 %	20 %	20 %	219847818
23020	NC_011831	CCA	2	6	1125373	1125378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847818
23021	NC_011831	GAC	2	6	1125405	1125410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847818
23022	NC_011831	CGG	2	6	1125428	1125433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847818
23023	NC_011831	CCG	2	6	1125490	1125495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847818
23024	NC_011831	CCATA	2	10	1125551	1125560	40 %	20 %	0 %	40 %	219847818
23025	NC_011831	TGC	2	6	1125573	1125578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847818
23026	NC_011831	GT	3	6	1125596	1125601	0 %	50 %	50 %	0 %	219847818
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23029	NC_011831	CGATC	2	10	1125644	1125653	20 %	20 %	20 %	40 %	219847818
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23032	NC_011831	CG	3	6	1125747	1125752	0 %	0 %	50 %	50 %	219847818
23033	NC_011831	CGT	2	6	1125762	1125767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847818
23034	NC_011831	CAC	2	6	1125773	1125778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847818
23035	NC_011831	ACC	2	6	1125796	1125801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847818
23036	NC_011831	CGG	2	6	1125812	1125817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847818
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23039	NC_011831	CCG	2	6	1125881	1125886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847818
23040	NC_011831	CAA	2	6	1125914	1125919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847818
23041	NC_011831	CGG	2	6	1125935	1125940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847818
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23043	NC_011831	CGA	2	6	1126022	1126027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847818
23044	NC_011831	CCT	2	6	1126088	1126093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23045	NC_011831	TGG	2	6	1126187	1126192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23046	NC_011831	GTG	2	6	1126258	1126263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23047	NC_011831	CGG	2	6	1126501	1126506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847819
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23050	NC_011831	GCC	2	6	1126568	1126573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847819
23051	NC_011831	TGGG	2	8	1126583	1126590	0 %	25 %	75 %	0 %	219847819
23052	NC_011831	ACGAG	2	10	1126629	1126638	40 %	0 %	40 %	20 %	219847819
23053	NC_011831	AGCG	2	8	1126668	1126675	25 %	0 %	50 %	25 %	219847819
23054	NC_011831	CTG	2	6	1126678	1126683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847819
23055	NC_011831	TGT	2	6	1126718	1126723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847819
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23071	NC_011831	GCTT	2	8	1127213	1127220	0 %	50 %	25 %	25 %	219847820
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23083	NC_011831	TAT	2	6	1127859	1127864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23084	NC_011831	TTC	2	6	1127931	1127936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23085	NC_011831	ACAT	2	8	1127993	1128000	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23086	NC_011831	GTTAT	2	10	1128005	1128014	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23087	NC_011831	TTG	2	6	1128057	1128062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23089	NC_011831	AGGA	2	8	1128132	1128139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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23100	NC_011831	CGG	2	6	1128473	1128478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847821
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23103	NC_011831	CTCG	2	8	1128504	1128511	0 %	25 %	25 %	50 %	219847821
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23105	NC_011831	CGT	2	6	1128544	1128549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847821
23106	NC_011831	GCT	2	6	1128622	1128627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847821
23107	NC_011831	TAT	2	6	1128657	1128662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847821
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23115	NC_011831	CGG	2	6	1128998	1129003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847821
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23117	NC_011831	TGG	2	6	1129095	1129100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847821
23118	NC_011831	GCC	3	9	1129105	1129113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847821
23119	NC_011831	GGCAT	2	10	1129260	1129269	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23120	NC_011831	CGT	2	6	1129284	1129289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23121	NC_011831	GCT	2	6	1129349	1129354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23122	NC_011831	ATC	2	6	1129382	1129387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23123	NC_011831	A	6	6	1129408	1129413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23124	NC_011831	TA	3	6	1129438	1129443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23125	NC_011831	TAA	2	6	1129459	1129464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23126	NC_011831	ATA	2	6	1129495	1129500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23127	NC_011831	CAA	2	6	1129506	1129511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23128	NC_011831	AC	4	8	1129738	1129745	50 %	0 %	0 %	50 %	219847822
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23138	NC_011831	CA	3	6	1130294	1130299	50 %	0 %	0 %	50 %	219847822
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23152	NC_011831	C	6	6	1131114	1131119	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23153	NC_011831	GCA	2	6	1131134	1131139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23224	NC_011831	CCA	2	6	1134575	1134580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23225	NC_011831	CCG	2	6	1134582	1134587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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23236	NC_011831	AAC	2	6	1135137	1135142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847827
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23341	NC_011831	TGA	2	6	1140640	1140645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23345	NC_011831	CAAC	2	8	1140809	1140816	50 %	0 %	0 %	50 %	219847833
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23349	NC_011831	GCG	2	6	1140860	1140865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847833
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23468	NC_011831	ATCGAA	2	12	1146835	1146846	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	219847840
23469	NC_011831	CAA	2	6	1146991	1146996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23470	NC_011831	TACA	2	8	1147077	1147084	50 %	25 %	0 %	25 %	219847841
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23491	NC_011831	CTTGC	2	10	1148203	1148212	0 %	40 %	20 %	40 %	219847842
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23493	NC_011831	ACT	2	6	1148308	1148313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847842
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23495	NC_011831	CGAA	2	8	1148400	1148407	50 %	0 %	25 %	25 %	219847842
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23497	NC_011831	GCT	2	6	1148442	1148447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847842
23498	NC_011831	TCTT	2	8	1148543	1148550	0 %	75 %	0 %	25 %	219847842
23499	NC_011831	CTT	2	6	1148568	1148573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847842
23500	NC_011831	AAT	2	6	1148644	1148649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847842

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