MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 94970

< Previous12...3839404142434445464748...189190Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_011831	TTG	2	6	1030036	1030041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847754
21003	NC_011831	TCG	2	6	1030084	1030089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847754
21004	NC_011831	CGG	2	6	1030132	1030137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847754
21005	NC_011831	CAC	2	6	1030144	1030149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847754
21006	NC_011831	CGGT	2	8	1030288	1030295	0 %	25 %	50 %	25 %	219847754
21007	NC_011831	GCT	2	6	1030309	1030314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847754
21008	NC_011831	CCA	2	6	1030327	1030332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847754
21009	NC_011831	G	6	6	1030353	1030358	0 %	0 %	100 %	0 %	219847754
21010	NC_011831	TTA	2	6	1030401	1030406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847754
21011	NC_011831	TTA	2	6	1030430	1030435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847754
21012	NC_011831	GC	3	6	1030490	1030495	0 %	0 %	50 %	50 %	219847754
21013	NC_011831	CGG	2	6	1030527	1030532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847754
21014	NC_011831	CAGC	2	8	1030553	1030560	25 %	0 %	25 %	50 %	219847754
21015	NC_011831	ACC	2	6	1030567	1030572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847754
21016	NC_011831	CCA	2	6	1030619	1030624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847754
21017	NC_011831	CAG	2	6	1030665	1030670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847754
21018	NC_011831	CAA	2	6	1030722	1030727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847754
21019	NC_011831	ACCG	2	8	1030770	1030777	25 %	0 %	25 %	50 %	219847754
21020	NC_011831	A	6	6	1030904	1030909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21021	NC_011831	G	8	8	1030910	1030917	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21022	NC_011831	CAT	2	6	1030928	1030933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847755
21023	NC_011831	GT	3	6	1030996	1031001	0 %	50 %	50 %	0 %	219847755
21024	NC_011831	GAGC	2	8	1031004	1031011	25 %	0 %	50 %	25 %	219847755
21025	NC_011831	TGG	2	6	1031021	1031026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847755
21026	NC_011831	CGG	2	6	1031057	1031062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847755
21027	NC_011831	CTA	2	6	1031078	1031083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847755
21028	NC_011831	AGC	2	6	1031097	1031102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847755
21029	NC_011831	CCA	2	6	1031235	1031240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847755
21030	NC_011831	GCC	2	6	1031287	1031292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847755
21031	NC_011831	GC	3	6	1031393	1031398	0 %	0 %	50 %	50 %	219847755
21032	NC_011831	GCG	2	6	1031547	1031552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847755
21033	NC_011831	CGG	2	6	1031564	1031569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847755
21034	NC_011831	TTG	2	6	1031608	1031613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847755
21035	NC_011831	GTTG	2	8	1031630	1031637	0 %	50 %	50 %	0 %	219847755
21036	NC_011831	ACA	2	6	1031658	1031663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847755
21037	NC_011831	CGT	2	6	1031666	1031671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847755
21038	NC_011831	CGT	2	6	1031697	1031702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847755
21039	NC_011831	GCT	2	6	1031715	1031720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847755
21040	NC_011831	GCC	2	6	1031721	1031726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847755
21041	NC_011831	TG	3	6	1031772	1031777	0 %	50 %	50 %	0 %	219847755
21042	NC_011831	CTG	2	6	1031778	1031783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847755
21043	NC_011831	CGT	2	6	1031793	1031798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847755
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21047	NC_011831	CGA	2	6	1031957	1031962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847755
21048	NC_011831	CAAC	2	8	1032085	1032092	50 %	0 %	0 %	50 %	219847755
21049	NC_011831	ACC	2	6	1032098	1032103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847755
21050	NC_011831	ACTA	2	8	1032104	1032111	50 %	25 %	0 %	25 %	219847755
21051	NC_011831	AGC	2	6	1032203	1032208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847755
21052	NC_011831	TCA	2	6	1032216	1032221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847755
21053	NC_011831	CGGAT	2	10	1032317	1032326	20 %	20 %	40 %	20 %	219847756
21054	NC_011831	CTT	2	6	1032436	1032441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847756
21055	NC_011831	GCT	2	6	1032475	1032480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847756
21056	NC_011831	ATG	2	6	1032485	1032490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847756
21057	NC_011831	TGT	2	6	1032546	1032551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847756
21058	NC_011831	CAA	2	6	1032572	1032577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847756
21059	NC_011831	CTT	2	6	1032625	1032630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847756
21060	NC_011831	GC	3	6	1032650	1032655	0 %	0 %	50 %	50 %	219847756
21061	NC_011831	GGTT	2	8	1032656	1032663	0 %	50 %	50 %	0 %	219847756
21062	NC_011831	CTC	2	6	1032665	1032670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847756
21063	NC_011831	TGA	2	6	1032693	1032698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847756
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21065	NC_011831	GTTT	2	8	1032724	1032731	0 %	75 %	25 %	0 %	219847756
21066	NC_011831	GAG	2	6	1032788	1032793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847756
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21087	NC_011831	GGGA	2	8	1033756	1033763	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21088	NC_011831	CA	4	8	1033774	1033781	50 %	0 %	0 %	50 %	219847757
21089	NC_011831	AGC	2	6	1033787	1033792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847757
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21091	NC_011831	CGA	2	6	1033990	1033995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847757
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21093	NC_011831	ATC	2	6	1034160	1034165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847757
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21096	NC_011831	AC	3	6	1034283	1034288	50 %	0 %	0 %	50 %	219847757
21097	NC_011831	GAT	2	6	1034411	1034416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847757
21098	NC_011831	TCG	2	6	1034491	1034496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847757
21099	NC_011831	GACCT	2	10	1034514	1034523	20 %	20 %	20 %	40 %	219847757
21100	NC_011831	CGC	2	6	1034616	1034621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847757
21101	NC_011831	GAACC	2	10	1034671	1034680	40 %	0 %	20 %	40 %	219847757
21102	NC_011831	ATC	2	6	1034820	1034825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21103	NC_011831	TTC	2	6	1035023	1035028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847758
21104	NC_011831	ACC	2	6	1035031	1035036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847758
21105	NC_011831	GTA	2	6	1035060	1035065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847758
21106	NC_011831	ACC	2	6	1035078	1035083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847758
21107	NC_011831	ACCG	2	8	1035122	1035129	25 %	0 %	25 %	50 %	219847758
21108	NC_011831	CGC	2	6	1035201	1035206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847758
21109	NC_011831	CAT	2	6	1035335	1035340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847758
21110	NC_011831	ACCC	2	8	1035458	1035465	25 %	0 %	0 %	75 %	219847758
21111	NC_011831	CGCAA	2	10	1035485	1035494	40 %	0 %	20 %	40 %	219847758
21112	NC_011831	GAT	2	6	1035527	1035532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847758
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21114	NC_011831	GTC	2	6	1035617	1035622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847758
21115	NC_011831	GGT	2	6	1035630	1035635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847758
21116	NC_011831	TCA	2	6	1035640	1035645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847758
21117	NC_011831	ATC	2	6	1035654	1035659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847758
21118	NC_011831	TCG	2	6	1035679	1035684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847758
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21143	NC_011831	GC	3	6	1037425	1037430	0 %	0 %	50 %	50 %	219847760
21144	NC_011831	TGC	2	6	1037449	1037454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847760
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21208	NC_011831	TCGC	2	8	1041064	1041071	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21209	NC_011831	CGA	2	6	1041192	1041197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21216	NC_011831	GGTA	2	8	1041547	1041554	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21217	NC_011831	ATC	2	6	1041582	1041587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21218	NC_011831	TGT	2	6	1041594	1041599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21220	NC_011831	ACA	2	6	1041666	1041671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21221	NC_011831	CGA	2	6	1041718	1041723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847763
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21224	NC_011831	GCG	2	6	1041824	1041829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847763
21225	NC_011831	CGT	2	6	1041860	1041865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847763
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21227	NC_011831	GGT	2	6	1042015	1042020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847763
21228	NC_011831	CCTA	2	8	1042045	1042052	25 %	25 %	0 %	50 %	219847763
21229	NC_011831	GCA	2	6	1042092	1042097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847763
21230	NC_011831	ATT	2	6	1042133	1042138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847763
21231	NC_011831	GAATCA	2	12	1042172	1042183	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	219847763
21232	NC_011831	TCA	2	6	1042214	1042219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847763
21233	NC_011831	TCT	2	6	1042263	1042268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847763
21234	NC_011831	ACGA	2	8	1042295	1042302	50 %	0 %	25 %	25 %	219847763
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21466	NC_011831	GTCG	2	8	1052478	1052485	0 %	25 %	50 %	25 %	219847769
21467	NC_011831	G	6	6	1052509	1052514	0 %	0 %	100 %	0 %	219847769
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21477	NC_011831	CTC	2	6	1053136	1053141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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