MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 94970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011831	AAT	2	6	77869	77874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847012
1502	NC_011831	GTG	2	6	77912	77917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847012
1503	NC_011831	CTT	2	6	78015	78020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847012
1504	NC_011831	GAATCA	2	12	78033	78044	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	219847012
1505	NC_011831	GCCC	2	8	78080	78087	0 %	0 %	25 %	75 %	219847012
1506	NC_011831	AAT	2	6	78115	78120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847012
1507	NC_011831	ATA	2	6	78182	78187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847012
1508	NC_011831	CCGA	2	8	78244	78251	25 %	0 %	25 %	50 %	219847012
1509	NC_011831	GTG	2	6	78299	78304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847012
1510	NC_011831	GTG	2	6	78308	78313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847012
1511	NC_011831	ACCGGT	2	12	78352	78363	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219847012
1512	NC_011831	ACA	3	9	78488	78496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847012
1513	NC_011831	TGC	2	6	78531	78536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847012
1514	NC_011831	TGC	2	6	78591	78596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847012
1515	NC_011831	GTT	2	6	78618	78623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847012
1516	NC_011831	ACC	2	6	78720	78725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847012
1517	NC_011831	GCC	2	6	78726	78731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847012
1518	NC_011831	CGT	2	6	78805	78810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847012
1519	NC_011831	AATG	2	8	78849	78856	50 %	25 %	25 %	0 %	219847012
1520	NC_011831	GCC	2	6	78912	78917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847012
1521	NC_011831	CGC	2	6	78923	78928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847012
1522	NC_011831	GCG	2	6	78978	78983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847012
1523	NC_011831	CTGGT	2	10	79084	79093	0 %	40 %	40 %	20 %	219847012
1524	NC_011831	GTG	2	6	79205	79210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847012
1525	NC_011831	TTG	2	6	79249	79254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847012
1526	NC_011831	ACC	2	6	79270	79275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847012
1527	NC_011831	CGG	2	6	79303	79308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847012
1528	NC_011831	CTT	2	6	79344	79349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847012
1529	NC_011831	TGG	2	6	79374	79379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847012
1530	NC_011831	AGT	2	6	79381	79386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847012
1531	NC_011831	GGT	2	6	79468	79473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847012
1532	NC_011831	GGAT	2	8	79484	79491	25 %	25 %	50 %	0 %	219847012
1533	NC_011831	TCG	2	6	79576	79581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847012
1534	NC_011831	CAT	2	6	79686	79691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847012
1535	NC_011831	CAAT	2	8	79697	79704	50 %	25 %	0 %	25 %	219847012
1536	NC_011831	GC	3	6	79752	79757	0 %	0 %	50 %	50 %	219847012
1537	NC_011831	GGTG	2	8	79785	79792	0 %	25 %	75 %	0 %	219847012
1538	NC_011831	GGTGA	2	10	79813	79822	20 %	20 %	60 %	0 %	219847012
1539	NC_011831	GGTAC	2	10	79887	79896	20 %	20 %	40 %	20 %	219847012
1540	NC_011831	GAG	2	6	79903	79908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847012
1541	NC_011831	TCT	2	6	79943	79948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847012
1542	NC_011831	CCAC	2	8	79953	79960	25 %	0 %	0 %	75 %	219847012
1543	NC_011831	TGG	3	9	80030	80038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847012
1544	NC_011831	TG	3	6	80115	80120	0 %	50 %	50 %	0 %	219847012
1545	NC_011831	TTC	3	9	80215	80223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_011831	TCG	2	6	80224	80229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_011831	ATGC	2	8	80288	80295	25 %	25 %	25 %	25 %	219847013
1548	NC_011831	CTC	2	6	80310	80315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847013
1549	NC_011831	GGC	2	6	80429	80434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847013
1550	NC_011831	AAT	2	6	80508	80513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847013
1551	NC_011831	CATTGC	2	12	80533	80544	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219847013
1552	NC_011831	TCA	2	6	80590	80595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847013
1553	NC_011831	GTG	2	6	80596	80601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847013
1554	NC_011831	ATAG	2	8	80610	80617	50 %	25 %	25 %	0 %	219847013
1555	NC_011831	GTG	2	6	80656	80661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847013
1556	NC_011831	ATG	2	6	80722	80727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847013
1557	NC_011831	CGGT	2	8	80789	80796	0 %	25 %	50 %	25 %	219847013
1558	NC_011831	CGG	2	6	80861	80866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847013
1559	NC_011831	GGC	2	6	81108	81113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847013
1560	NC_011831	TCT	2	6	81163	81168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847013
1561	NC_011831	GATT	2	8	81359	81366	25 %	50 %	25 %	0 %	219847013
1562	NC_011831	CGG	2	6	81390	81395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847013
1563	NC_011831	CGA	2	6	81409	81414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847013
1564	NC_011831	ACCA	2	8	81432	81439	50 %	0 %	0 %	50 %	219847013
1565	NC_011831	TGC	2	6	81443	81448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847013
1566	NC_011831	CAA	2	6	81512	81517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847013
1567	NC_011831	ATTAC	2	10	81526	81535	40 %	40 %	0 %	20 %	219847013
1568	NC_011831	CGG	2	6	81566	81571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847013
1569	NC_011831	AGA	2	6	81620	81625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847013
1570	NC_011831	TAG	2	6	81635	81640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847013
1571	NC_011831	TCG	2	6	81649	81654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847013
1572	NC_011831	GCA	4	12	81708	81719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847013
1573	NC_011831	ACC	2	6	81734	81739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847013
1574	NC_011831	CAAGT	2	10	81751	81760	40 %	20 %	20 %	20 %	219847013
1575	NC_011831	ATGT	2	8	81774	81781	25 %	50 %	25 %	0 %	219847013
1576	NC_011831	GGT	2	6	81786	81791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847013
1577	NC_011831	TGA	2	6	81794	81799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847013
1578	NC_011831	TGG	2	6	81830	81835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847013
1579	NC_011831	GAC	2	6	81854	81859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847013
1580	NC_011831	CGC	2	6	82013	82018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847013
1581	NC_011831	GA	3	6	82039	82044	50 %	0 %	50 %	0 %	219847013
1582	NC_011831	ATCCTG	2	12	82105	82116	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219847013
1583	NC_011831	TGT	2	6	82117	82122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847013
1584	NC_011831	AAC	2	6	82128	82133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847013
1585	NC_011831	CTC	2	6	82251	82256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847013
1586	NC_011831	ATT	2	6	82296	82301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847013
1587	NC_011831	AAC	2	6	82326	82331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847013
1588	NC_011831	GCG	2	6	82386	82391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847013
1589	NC_011831	GCG	3	9	82404	82412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847013
1590	NC_011831	TGG	2	6	82421	82426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847013
1591	NC_011831	CGG	2	6	82452	82457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847013
1592	NC_011831	TAA	2	6	82619	82624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847013
1593	NC_011831	CGG	2	6	82633	82638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847013
1594	NC_011831	TGG	2	6	82687	82692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847013
1595	NC_011831	GTG	2	6	82741	82746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847013
1596	NC_011831	ATT	2	6	82770	82775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847013
1597	NC_011831	GTT	2	6	82788	82793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847013
1598	NC_011831	CAC	2	6	82795	82800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847013
1599	NC_011831	ACAT	2	8	82945	82952	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1600	NC_011831	ATG	2	6	82966	82971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_011831	GCA	3	9	83111	83119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847014
1602	NC_011831	GCAGTA	2	12	83153	83164	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219847014
1603	NC_011831	CAG	2	6	83234	83239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847014
1604	NC_011831	GACC	2	8	83248	83255	25 %	0 %	25 %	50 %	219847014
1605	NC_011831	GCC	2	6	83269	83274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847014
1606	NC_011831	GTT	2	6	83299	83304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847014
1607	NC_011831	TGA	2	6	83332	83337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847014
1608	NC_011831	GCG	3	9	83342	83350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847014
1609	NC_011831	GTT	2	6	83515	83520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847014
1610	NC_011831	TCTT	2	8	83547	83554	0 %	75 %	0 %	25 %	219847014
1611	NC_011831	CTG	2	6	83864	83869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847014
1612	NC_011831	CCCG	2	8	83878	83885	0 %	0 %	25 %	75 %	219847014
1613	NC_011831	CGG	2	6	83903	83908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847014
1614	NC_011831	GGC	2	6	83970	83975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847014
1615	NC_011831	GC	3	6	83996	84001	0 %	0 %	50 %	50 %	219847014
1616	NC_011831	CGAT	2	8	84006	84013	25 %	25 %	25 %	25 %	219847014
1617	NC_011831	CGG	2	6	84021	84026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847014
1618	NC_011831	AGC	2	6	84028	84033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847014
1619	NC_011831	TGA	2	6	84043	84048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847014
1620	NC_011831	CTG	2	6	84077	84082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847014
1621	NC_011831	GGTT	2	8	84118	84125	0 %	50 %	50 %	0 %	219847014
1622	NC_011831	GCC	2	6	84260	84265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847014
1623	NC_011831	ACCG	2	8	84268	84275	25 %	0 %	25 %	50 %	219847014
1624	NC_011831	GTG	2	6	84288	84293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847014
1625	NC_011831	CGA	2	6	84305	84310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847014
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1988	NC_011831	CCTG	2	8	102942	102949	0 %	25 %	25 %	50 %	219847030
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1998	NC_011831	GCC	2	6	103253	103258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847030
1999	NC_011831	TAG	2	6	103270	103275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847030
2000	NC_011831	CAGC	2	8	103276	103283	25 %	0 %	25 %	50 %	219847030

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