MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 94970

< Previous12...3233343536373839404142...189190Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_011831	CCGG	2	8	887232	887239	0 %	0 %	50 %	50 %	219847642
18002	NC_011831	AATT	2	8	887249	887256	50 %	50 %	0 %	0 %	219847642
18003	NC_011831	CAC	2	6	887262	887267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847642
18004	NC_011831	CCGG	2	8	887305	887312	0 %	0 %	50 %	50 %	219847642
18005	NC_011831	AGAT	2	8	887360	887367	50 %	25 %	25 %	0 %	219847642
18006	NC_011831	CGG	2	6	887374	887379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847642
18007	NC_011831	CGG	2	6	887391	887396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847642
18008	NC_011831	GCGTG	2	10	887409	887418	0 %	20 %	60 %	20 %	219847642
18009	NC_011831	TCA	2	6	887429	887434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847642
18010	NC_011831	ACC	2	6	887443	887448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847642
18011	NC_011831	GAT	2	6	887532	887537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847642
18012	NC_011831	AAT	2	6	887561	887566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847642
18013	NC_011831	CGC	2	6	887634	887639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847643
18014	NC_011831	T	7	7	887746	887752	0 %	100 %	0 %	0 %	219847643
18015	NC_011831	GAA	2	6	887786	887791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847643
18016	NC_011831	GC	3	6	887797	887802	0 %	0 %	50 %	50 %	219847643
18017	NC_011831	CGA	2	6	887834	887839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847643
18018	NC_011831	GGA	2	6	887929	887934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847643
18019	NC_011831	TGA	2	6	887955	887960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847643
18020	NC_011831	GCA	2	6	888037	888042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847643
18021	NC_011831	CCCG	2	8	888047	888054	0 %	0 %	25 %	75 %	219847643
18022	NC_011831	GGC	2	6	888105	888110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847643
18023	NC_011831	CCA	2	6	888181	888186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847643
18024	NC_011831	ACT	2	6	888198	888203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847644
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18026	NC_011831	CCAA	2	8	888276	888283	50 %	0 %	0 %	50 %	219847644
18027	NC_011831	TGC	2	6	888354	888359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847644
18028	NC_011831	GCA	2	6	888376	888381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847644
18029	NC_011831	TCG	2	6	888383	888388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847644
18030	NC_011831	GCATC	2	10	888429	888438	20 %	20 %	20 %	40 %	219847644
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18032	NC_011831	CT	3	6	888482	888487	0 %	50 %	0 %	50 %	219847644
18033	NC_011831	CCGT	2	8	888532	888539	0 %	25 %	25 %	50 %	219847644
18034	NC_011831	CCG	2	6	888551	888556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847644
18035	NC_011831	CGAC	2	8	888560	888567	25 %	0 %	25 %	50 %	219847644
18036	NC_011831	CGT	2	6	888630	888635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847644
18037	NC_011831	GAAC	2	8	888675	888682	50 %	0 %	25 %	25 %	219847644
18038	NC_011831	GGC	2	6	888701	888706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847644
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18040	NC_011831	CCA	2	6	888782	888787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847644
18041	NC_011831	GGC	2	6	888796	888801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847644
18042	NC_011831	TGCG	2	8	888827	888834	0 %	25 %	50 %	25 %	219847644
18043	NC_011831	TGC	2	6	888837	888842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847644
18044	NC_011831	TGG	2	6	888846	888851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847644
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18046	NC_011831	TGC	3	9	888924	888932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847644
18047	NC_011831	GTGC	2	8	888940	888947	0 %	25 %	50 %	25 %	219847644
18048	NC_011831	GTGGG	2	10	888991	889000	0 %	20 %	80 %	0 %	219847644
18049	NC_011831	CGG	2	6	889092	889097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847644
18050	NC_011831	TCT	2	6	889109	889114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847644
18051	NC_011831	AC	3	6	889229	889234	50 %	0 %	0 %	50 %	219847644
18052	NC_011831	CCAC	2	8	889255	889262	25 %	0 %	0 %	75 %	219847644
18053	NC_011831	TAC	2	6	889263	889268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847644
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18055	NC_011831	ATGA	2	8	889390	889397	50 %	25 %	25 %	0 %	219847644
18056	NC_011831	CGA	2	6	889437	889442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847644
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18059	NC_011831	GAT	2	6	889684	889689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847644
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18062	NC_011831	GTTG	2	8	889902	889909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18063	NC_011831	CG	3	6	889984	889989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18064	NC_011831	TG	3	6	889996	890001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18065	NC_011831	GGT	2	6	890016	890021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18066	NC_011831	GAA	3	9	890134	890142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847645
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18077	NC_011831	GAT	2	6	890683	890688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847645
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18088	NC_011831	CCGGCG	2	12	891002	891013	0 %	0 %	50 %	50 %	219847645
18089	NC_011831	TACC	2	8	891140	891147	25 %	25 %	0 %	50 %	219847645
18090	NC_011831	TTC	2	6	891214	891219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847645
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18093	NC_011831	TAC	2	6	891334	891339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847645
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18103	NC_011831	AGACC	2	10	891795	891804	40 %	0 %	20 %	40 %	219847645
18104	NC_011831	AAG	2	6	891947	891952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847645
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18110	NC_011831	TCG	2	6	892265	892270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847645
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18352	NC_011831	CTC	2	6	902712	902717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18353	NC_011831	CGA	2	6	902761	902766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18354	NC_011831	CAG	2	6	902775	902780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18355	NC_011831	CAG	2	6	902816	902821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18356	NC_011831	ATG	2	6	902822	902827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18357	NC_011831	AGG	2	6	902862	902867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18358	NC_011831	CCG	2	6	902915	902920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847651
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18471	NC_011831	TA	3	6	908853	908858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18472	NC_011831	GTT	2	6	908859	908864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18482	NC_011831	GCG	2	6	909460	909465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847658
18483	NC_011831	GCG	2	6	909475	909480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847658
18484	NC_011831	TTGA	2	8	909542	909549	25 %	50 %	25 %	0 %	219847658
18485	NC_011831	TCG	2	6	909568	909573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847658
18486	NC_011831	AAC	2	6	909582	909587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847658
18487	NC_011831	TC	4	8	909598	909605	0 %	50 %	0 %	50 %	219847658
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18492	NC_011831	GCTG	2	8	909833	909840	0 %	25 %	50 %	25 %	219847659
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