MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 94970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_011831	CCAT	2	8	799590	799597	25 %	25 %	0 %	50 %	219847587
16002	NC_011831	CAT	2	6	799604	799609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847587
16003	NC_011831	GCT	2	6	799648	799653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847587
16004	NC_011831	ATT	2	6	799670	799675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847587
16005	NC_011831	TCC	2	6	799734	799739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847587
16006	NC_011831	CGC	2	6	799812	799817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847588
16007	NC_011831	GTT	2	6	799820	799825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847588
16008	NC_011831	ACTC	2	8	799841	799848	25 %	25 %	0 %	50 %	219847588
16009	NC_011831	GAC	2	6	799883	799888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847588
16010	NC_011831	ATCT	2	8	799941	799948	25 %	50 %	0 %	25 %	219847588
16011	NC_011831	ATC	2	6	799950	799955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847588
16012	NC_011831	CGC	2	6	800035	800040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847588
16013	NC_011831	CAGC	2	8	800069	800076	25 %	0 %	25 %	50 %	219847588
16014	NC_011831	CTT	2	6	800105	800110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847588
16015	NC_011831	GTC	2	6	800176	800181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847588
16016	NC_011831	GTT	2	6	800272	800277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847588
16017	NC_011831	TGA	2	6	800293	800298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847588
16018	NC_011831	ACC	2	6	800337	800342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847588
16019	NC_011831	GGT	2	6	800361	800366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847588
16020	NC_011831	ACC	2	6	800437	800442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847588
16021	NC_011831	GCTCGC	2	12	800463	800474	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219847588
16022	NC_011831	CGA	2	6	800536	800541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847588
16023	NC_011831	TCT	2	6	800584	800589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847588
16024	NC_011831	CAAC	2	8	800639	800646	50 %	0 %	0 %	50 %	219847588
16025	NC_011831	AC	3	6	800684	800689	50 %	0 %	0 %	50 %	219847588
16026	NC_011831	GTAA	2	8	800705	800712	50 %	25 %	25 %	0 %	219847588
16027	NC_011831	TCA	2	6	800795	800800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847588
16028	NC_011831	CCG	2	6	800828	800833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847588
16029	NC_011831	TCG	2	6	800882	800887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847588
16030	NC_011831	AACG	2	8	800895	800902	50 %	0 %	25 %	25 %	219847588
16031	NC_011831	ACC	2	6	800912	800917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847588
16032	NC_011831	TCA	2	6	800984	800989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847588
16033	NC_011831	CCA	2	6	801071	801076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847588
16034	NC_011831	A	6	6	801079	801084	100 %	0 %	0 %	0 %	219847588
16035	NC_011831	AC	3	6	801089	801094	50 %	0 %	0 %	50 %	219847588
16036	NC_011831	TCG	2	6	801135	801140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847588
16037	NC_011831	CGC	2	6	801159	801164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847588
16038	NC_011831	GC	3	6	801163	801168	0 %	0 %	50 %	50 %	219847588
16039	NC_011831	AGA	2	6	801215	801220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847588
16040	NC_011831	A	6	6	801233	801238	100 %	0 %	0 %	0 %	219847588
16041	NC_011831	GAT	2	6	801324	801329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847588
16042	NC_011831	ACT	2	6	801333	801338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847588
16043	NC_011831	TGG	2	6	801482	801487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847588
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16045	NC_011831	GCAC	2	8	801562	801569	25 %	0 %	25 %	50 %	219847588
16046	NC_011831	AAT	2	6	801594	801599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847588
16047	NC_011831	CAG	2	6	801606	801611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847588
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16049	NC_011831	TCA	2	6	801774	801779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16050	NC_011831	ATT	2	6	801896	801901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847589
16051	NC_011831	TTGC	2	8	801911	801918	0 %	50 %	25 %	25 %	219847589
16052	NC_011831	T	6	6	801964	801969	0 %	100 %	0 %	0 %	219847589
16053	NC_011831	GCT	2	6	801970	801975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847589
16054	NC_011831	CAT	2	6	801976	801981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847589
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16056	NC_011831	ATT	2	6	802091	802096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847589
16057	NC_011831	TGT	2	6	802159	802164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847589
16058	NC_011831	TGC	3	9	802183	802191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847589
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16060	NC_011831	CGC	2	6	802214	802219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847589
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16062	NC_011831	AGT	2	6	802465	802470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_011831	GCA	2	6	802509	802514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16064	NC_011831	CAC	2	6	802572	802577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16065	NC_011831	GGTG	2	8	802669	802676	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16066	NC_011831	CCG	2	6	802764	802769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16067	NC_011831	CA	4	8	802775	802782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16068	NC_011831	TGAA	2	8	802792	802799	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16069	NC_011831	CGT	2	6	802807	802812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16071	NC_011831	G	6	6	802951	802956	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16072	NC_011831	GCG	2	6	802991	802996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16073	NC_011831	GCC	2	6	803058	803063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16074	NC_011831	CTC	2	6	803070	803075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16075	NC_011831	GTCC	2	8	803084	803091	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16076	NC_011831	ACG	2	6	803169	803174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16077	NC_011831	CGA	2	6	803249	803254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16079	NC_011831	CGG	2	6	803447	803452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16080	NC_011831	GC	3	6	803480	803485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16082	NC_011831	GCCA	2	8	803529	803536	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16083	NC_011831	CCG	2	6	803550	803555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16084	NC_011831	CCGG	2	8	803599	803606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16085	NC_011831	TCC	2	6	803639	803644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16086	NC_011831	GTA	2	6	803675	803680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16088	NC_011831	TTCGG	2	10	803866	803875	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16089	NC_011831	CCCCT	2	10	803884	803893	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
16090	NC_011831	GGCA	2	8	803910	803917	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16091	NC_011831	CAG	2	6	803946	803951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16093	NC_011831	CTT	2	6	804046	804051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16094	NC_011831	CCG	2	6	804246	804251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16095	NC_011831	CGC	2	6	804302	804307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16096	NC_011831	CTC	2	6	804346	804351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16097	NC_011831	TGT	2	6	804373	804378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16098	NC_011831	GAT	2	6	804467	804472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16101	NC_011831	GAC	2	6	804557	804562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16102	NC_011831	GCT	2	6	804637	804642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16103	NC_011831	GCT	2	6	804678	804683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16104	NC_011831	CCT	2	6	804694	804699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16105	NC_011831	GCG	2	6	804710	804715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16106	NC_011831	CGG	2	6	804757	804762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16107	NC_011831	GTT	2	6	804768	804773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_011831	CGA	2	6	804781	804786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16109	NC_011831	CCG	2	6	804800	804805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16110	NC_011831	CG	3	6	804824	804829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16111	NC_011831	CAA	2	6	804875	804880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16112	NC_011831	CG	3	6	804895	804900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16113	NC_011831	CTCCGG	2	12	805123	805134	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16114	NC_011831	CT	3	6	805245	805250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16115	NC_011831	TTC	2	6	805360	805365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16116	NC_011831	C	6	6	805394	805399	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16117	NC_011831	GTG	2	6	805473	805478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16118	NC_011831	CCT	2	6	805490	805495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16119	NC_011831	TCC	2	6	805506	805511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16120	NC_011831	GGC	2	6	805533	805538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16121	NC_011831	TCGC	2	8	805571	805578	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16122	NC_011831	CTA	2	6	805581	805586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16123	NC_011831	TCGC	2	8	805593	805600	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16124	NC_011831	TCC	2	6	805604	805609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16125	NC_011831	CCA	2	6	805659	805664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16126	NC_011831	GTGCC	2	10	805735	805744	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16127	NC_011831	CATC	2	8	805774	805781	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16128	NC_011831	TCA	2	6	805788	805793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16129	NC_011831	CGT	2	6	805805	805810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16130	NC_011831	A	7	7	805924	805930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16131	NC_011831	GAC	2	6	805961	805966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16132	NC_011831	TTG	2	6	805974	805979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16133	NC_011831	GC	3	6	805984	805989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16134	NC_011831	TCC	2	6	806001	806006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16135	NC_011831	CCG	2	6	806014	806019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16136	NC_011831	GAG	2	6	806033	806038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16137	NC_011831	TCA	2	6	806135	806140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16139	NC_011831	TAC	2	6	806310	806315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847590
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16148	NC_011831	CGAT	2	8	806662	806669	25 %	25 %	25 %	25 %	219847590
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16157	NC_011831	GCTG	2	8	806935	806942	0 %	25 %	50 %	25 %	219847590
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16159	NC_011831	TCA	2	6	807024	807029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16160	NC_011831	TGTC	2	8	807045	807052	0 %	50 %	25 %	25 %	219847591
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16165	NC_011831	GTCGCC	2	12	807290	807301	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219847591
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16174	NC_011831	GTT	2	6	807622	807627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16175	NC_011831	GC	3	6	807673	807678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16242	NC_011831	AATT	2	8	811725	811732	50 %	50 %	0 %	0 %	219847596
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16246	NC_011831	TGGTG	2	10	811885	811894	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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16248	NC_011831	GATT	2	8	811962	811969	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16249	NC_011831	ACC	2	6	812026	812031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16490	NC_011831	AGC	2	6	823080	823085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847606
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16493	NC_011831	TGA	2	6	823228	823233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847606
16494	NC_011831	GCG	2	6	823237	823242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847606
16495	NC_011831	GTG	2	6	823247	823252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847606
16496	NC_011831	CGA	2	6	823291	823296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847606
16497	NC_011831	CGAG	2	8	823333	823340	25 %	0 %	50 %	25 %	219847606
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