MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 94970

< Previous12...2627282930313233343536...189190Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_011831	TCGG	2	8	750774	750781	0 %	25 %	50 %	25 %	219847547
15002	NC_011831	CA	3	6	750805	750810	50 %	0 %	0 %	50 %	219847547
15003	NC_011831	CGCT	2	8	750837	750844	0 %	25 %	25 %	50 %	219847547
15004	NC_011831	ATCGG	2	10	750852	750861	20 %	20 %	40 %	20 %	219847547
15005	NC_011831	GGCA	2	8	750913	750920	25 %	0 %	50 %	25 %	219847547
15006	NC_011831	CCT	2	6	751029	751034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15007	NC_011831	ACA	2	6	751055	751060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15008	NC_011831	GCG	2	6	751065	751070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15009	NC_011831	CGC	2	6	751086	751091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15010	NC_011831	AAG	2	6	751106	751111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847548
15011	NC_011831	CG	3	6	751122	751127	0 %	0 %	50 %	50 %	219847548
15012	NC_011831	CAT	2	6	751138	751143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847548
15013	NC_011831	GATT	2	8	751173	751180	25 %	50 %	25 %	0 %	219847548
15014	NC_011831	CTTC	2	8	751206	751213	0 %	50 %	0 %	50 %	219847548
15015	NC_011831	TGT	2	6	751238	751243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847548
15016	NC_011831	TTC	2	6	751382	751387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847548
15017	NC_011831	AGCGC	2	10	751388	751397	20 %	0 %	40 %	40 %	219847548
15018	NC_011831	ACT	2	6	751523	751528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847549
15019	NC_011831	GCT	2	6	751541	751546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847549
15020	NC_011831	TCG	2	6	751555	751560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847549
15021	NC_011831	CGG	2	6	751598	751603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847549
15022	NC_011831	CGC	2	6	751619	751624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847549
15023	NC_011831	ATT	2	6	751683	751688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847549
15024	NC_011831	CTA	2	6	751692	751697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847549
15025	NC_011831	TCG	2	6	751747	751752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847549
15026	NC_011831	CAA	2	6	751778	751783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847549
15027	NC_011831	CGG	2	6	751793	751798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847549
15028	NC_011831	GCC	2	6	751812	751817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847549
15029	NC_011831	CTC	2	6	751827	751832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847549
15030	NC_011831	AC	3	6	751897	751902	50 %	0 %	0 %	50 %	219847549
15031	NC_011831	CGC	2	6	751910	751915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847549
15032	NC_011831	CCG	2	6	752036	752041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847549
15033	NC_011831	TTGAC	2	10	752053	752062	20 %	40 %	20 %	20 %	219847549
15034	NC_011831	ACA	2	6	752179	752184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847549
15035	NC_011831	CAC	3	9	752243	752251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847549
15036	NC_011831	TGT	2	6	752276	752281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847549
15037	NC_011831	TCG	2	6	752372	752377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847549
15038	NC_011831	ACA	2	6	752548	752553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847549
15039	NC_011831	CTT	2	6	752570	752575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847549
15040	NC_011831	CGCT	2	8	752589	752596	0 %	25 %	25 %	50 %	219847549
15041	NC_011831	GTC	2	6	752610	752615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847549
15042	NC_011831	TGG	2	6	752678	752683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847549
15043	NC_011831	CTTAC	2	10	752771	752780	20 %	40 %	0 %	40 %	219847549
15044	NC_011831	CAC	2	6	752861	752866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847549
15045	NC_011831	CTC	2	6	752889	752894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847549
15046	NC_011831	CGG	2	6	752900	752905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847549
15047	NC_011831	GCT	2	6	752957	752962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847549
15048	NC_011831	ATT	2	6	753108	753113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847549
15049	NC_011831	CTC	2	6	753126	753131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847549
15050	NC_011831	AAC	2	6	753183	753188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15051	NC_011831	AACC	2	8	753246	753253	50 %	0 %	0 %	50 %	219847550
15052	NC_011831	GAC	2	6	753302	753307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847550
15053	NC_011831	CTG	2	6	753537	753542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847550
15054	NC_011831	TGT	2	6	753653	753658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847550
15055	NC_011831	CTCG	2	8	753689	753696	0 %	25 %	25 %	50 %	219847550
15056	NC_011831	CGA	2	6	753728	753733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847550
15057	NC_011831	TGA	2	6	753734	753739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847550
15058	NC_011831	GTC	2	6	753747	753752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847550
15059	NC_011831	CTG	2	6	753756	753761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847550
15060	NC_011831	CAA	2	6	753797	753802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847550
15061	NC_011831	GAT	2	6	753822	753827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847550
15062	NC_011831	CA	3	6	753871	753876	50 %	0 %	0 %	50 %	219847550
15063	NC_011831	GC	3	6	753944	753949	0 %	0 %	50 %	50 %	219847550
15064	NC_011831	GCTG	2	8	753964	753971	0 %	25 %	50 %	25 %	219847550
15065	NC_011831	GTG	2	6	753982	753987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847550
15066	NC_011831	GAA	2	6	754005	754010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847550
15067	NC_011831	CCGT	2	8	754043	754050	0 %	25 %	25 %	50 %	219847550
15068	NC_011831	TGGC	2	8	754122	754129	0 %	25 %	50 %	25 %	219847550
15069	NC_011831	GCT	2	6	754170	754175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847550
15070	NC_011831	TGG	3	9	754197	754205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847550
15071	NC_011831	GCA	2	6	754206	754211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847550
15072	NC_011831	CGA	2	6	754214	754219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847550
15073	NC_011831	AGC	2	6	754244	754249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847550
15074	NC_011831	TGCT	2	8	754353	754360	0 %	50 %	25 %	25 %	219847550
15075	NC_011831	CCG	2	6	754441	754446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847550
15076	NC_011831	GTG	2	6	754469	754474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15077	NC_011831	GAC	2	6	754488	754493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15078	NC_011831	GAAGG	2	10	754511	754520	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15079	NC_011831	GAT	2	6	754586	754591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847551
15080	NC_011831	CGA	2	6	754649	754654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847551
15081	NC_011831	TCC	2	6	754726	754731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847551
15082	NC_011831	ATG	2	6	754734	754739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847551
15083	NC_011831	TG	3	6	754738	754743	0 %	50 %	50 %	0 %	219847551
15084	NC_011831	TG	3	6	754791	754796	0 %	50 %	50 %	0 %	219847551
15085	NC_011831	GCT	2	6	754828	754833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847551
15086	NC_011831	CCCG	2	8	754865	754872	0 %	0 %	25 %	75 %	219847551
15087	NC_011831	CCG	2	6	754908	754913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15088	NC_011831	TG	3	6	754915	754920	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15089	NC_011831	CAA	2	6	754933	754938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15090	NC_011831	TCGC	2	8	754941	754948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15091	NC_011831	CAG	2	6	754950	754955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15092	NC_011831	CGT	2	6	754977	754982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847552
15093	NC_011831	TCA	2	6	755015	755020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847552
15094	NC_011831	CGC	2	6	755037	755042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847552
15095	NC_011831	CGG	2	6	755125	755130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847552
15096	NC_011831	AATC	2	8	755144	755151	50 %	25 %	0 %	25 %	219847552
15097	NC_011831	CGA	2	6	755208	755213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847552
15098	NC_011831	CGG	2	6	755272	755277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847553
15099	NC_011831	ATC	2	6	755348	755353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847553
15100	NC_011831	ACC	2	6	755393	755398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847553
15101	NC_011831	CAT	2	6	755435	755440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847553
15102	NC_011831	GCA	2	6	755476	755481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847553
15103	NC_011831	TCG	2	6	755580	755585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847553
15104	NC_011831	GAG	2	6	755655	755660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847553
15105	NC_011831	CG	3	6	755668	755673	0 %	0 %	50 %	50 %	219847553
15106	NC_011831	GC	3	6	755748	755753	0 %	0 %	50 %	50 %	219847553
15107	NC_011831	ACC	2	6	755760	755765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847553
15108	NC_011831	TGT	2	6	755812	755817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847553
15109	NC_011831	ATT	2	6	755819	755824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847553
15110	NC_011831	CAA	2	6	755868	755873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847553
15111	NC_011831	GATG	2	8	755934	755941	25 %	25 %	50 %	0 %	219847553
15112	NC_011831	CGT	2	6	755957	755962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847553
15113	NC_011831	TCG	2	6	755989	755994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847553
15114	NC_011831	ACC	2	6	756056	756061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847553
15115	NC_011831	TGAT	2	8	756090	756097	25 %	50 %	25 %	0 %	219847553
15116	NC_011831	ATG	2	6	756123	756128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847553
15117	NC_011831	ACG	2	6	756150	756155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847553
15118	NC_011831	GCA	2	6	756167	756172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847553
15119	NC_011831	GCG	2	6	756239	756244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847553
15120	NC_011831	GCG	2	6	756260	756265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847553
15121	NC_011831	C	6	6	756453	756458	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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15125	NC_011831	CGT	2	6	756636	756641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15247	NC_011831	A	6	6	762051	762056	100 %	0 %	0 %	0 %	219847558
15248	NC_011831	ACA	2	6	762124	762129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847558
15249	NC_011831	A	6	6	762198	762203	100 %	0 %	0 %	0 %	219847558
15250	NC_011831	CGG	2	6	762229	762234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847558
15251	NC_011831	CAA	2	6	762279	762284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847558
15252	NC_011831	TCA	2	6	762289	762294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847558
15253	NC_011831	CG	3	6	762346	762351	0 %	0 %	50 %	50 %	219847558
15254	NC_011831	GAG	2	6	762360	762365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847558
15255	NC_011831	ATT	2	6	762447	762452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847558
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15257	NC_011831	TGC	2	6	762475	762480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847558
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15260	NC_011831	GTA	2	6	762559	762564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847558
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15269	NC_011831	CGA	2	6	763009	763014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847558
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15276	NC_011831	GCT	2	6	763394	763399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847558
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15279	NC_011831	AAC	2	6	763512	763517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847558
15280	NC_011831	AGCGC	2	10	763619	763628	20 %	0 %	40 %	40 %	219847558
15281	NC_011831	TTG	2	6	763633	763638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847558
15282	NC_011831	CCAATA	2	12	763664	763675	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	219847558
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15284	NC_011831	CATC	2	8	763806	763813	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15285	NC_011831	GAA	2	6	763927	763932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847559
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15295	NC_011831	CGAT	2	8	764389	764396	25 %	25 %	25 %	25 %	219847559
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15351	NC_011831	ATG	2	6	767112	767117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15352	NC_011831	GTA	2	6	767172	767177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15353	NC_011831	T	6	6	767180	767185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15354	NC_011831	ATC	2	6	767264	767269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847562
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15356	NC_011831	GCGA	2	8	767342	767349	25 %	0 %	50 %	25 %	219847562
15357	NC_011831	GCC	2	6	767356	767361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847562
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15361	NC_011831	ATC	2	6	767494	767499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847562
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15363	NC_011831	TTG	2	6	767581	767586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847562
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15487	NC_011831	CGAT	2	8	774091	774098	25 %	25 %	25 %	25 %	219847569
15488	NC_011831	CAC	2	6	774140	774145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847569
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15491	NC_011831	ACT	2	6	774253	774258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847569
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