MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 94970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_011831	GGC	2	6	521882	521887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847369
10502	NC_011831	CCG	2	6	521899	521904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847369
10503	NC_011831	AGCA	2	8	521959	521966	50 %	0 %	25 %	25 %	219847369
10504	NC_011831	GAT	2	6	522083	522088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847369
10505	NC_011831	GTG	2	6	522106	522111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847369
10506	NC_011831	CTT	2	6	522170	522175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847369
10507	NC_011831	CGA	2	6	522197	522202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847369
10508	NC_011831	AGC	2	6	522204	522209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847369
10509	NC_011831	ACG	2	6	522210	522215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847369
10510	NC_011831	ACT	2	6	522303	522308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_011831	CACGCG	2	12	522496	522507	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	219847370
10512	NC_011831	GCG	2	6	522557	522562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847370
10513	NC_011831	GCA	2	6	522579	522584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847370
10514	NC_011831	GCA	2	6	522591	522596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847370
10515	NC_011831	CAGG	2	8	522615	522622	25 %	0 %	50 %	25 %	219847370
10516	NC_011831	CGG	2	6	522664	522669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847370
10517	NC_011831	CAA	2	6	522779	522784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847370
10518	NC_011831	CA	4	8	522785	522792	50 %	0 %	0 %	50 %	219847370
10519	NC_011831	TTC	2	6	522879	522884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847370
10520	NC_011831	TGA	2	6	522909	522914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847370
10521	NC_011831	GAT	2	6	523021	523026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847370
10522	NC_011831	CGG	2	6	523027	523032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847370
10523	NC_011831	GATC	2	8	523057	523064	25 %	25 %	25 %	25 %	219847370
10524	NC_011831	TTGC	2	8	523117	523124	0 %	50 %	25 %	25 %	219847370
10525	NC_011831	GAC	2	6	523141	523146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847370
10526	NC_011831	TG	4	8	523150	523157	0 %	50 %	50 %	0 %	219847370
10527	NC_011831	A	8	8	523236	523243	100 %	0 %	0 %	0 %	219847370
10528	NC_011831	GCT	2	6	523284	523289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847370
10529	NC_011831	ACA	2	6	523407	523412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847370
10530	NC_011831	CTC	2	6	523523	523528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847370
10531	NC_011831	CGG	2	6	523600	523605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847370
10532	NC_011831	GCA	3	9	523615	523623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847370
10533	NC_011831	CTC	2	6	523653	523658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10534	NC_011831	CTTG	2	8	523679	523686	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10535	NC_011831	GAA	2	6	523768	523773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_011831	CTT	2	6	523794	523799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847371
10537	NC_011831	CCGC	2	8	523812	523819	0 %	0 %	25 %	75 %	219847371
10538	NC_011831	CGT	2	6	523837	523842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847371
10539	NC_011831	CAA	2	6	523890	523895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847371
10540	NC_011831	CAA	2	6	523968	523973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847371
10541	NC_011831	TCA	2	6	524054	524059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847371
10542	NC_011831	TGA	2	6	524080	524085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847371
10543	NC_011831	CAC	2	6	524091	524096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847371
10544	NC_011831	GCA	2	6	524186	524191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847371
10545	NC_011831	GGC	2	6	524298	524303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847371
10546	NC_011831	AGC	2	6	524308	524313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847371
10547	NC_011831	TCGG	2	8	524477	524484	0 %	25 %	50 %	25 %	219847371
10548	NC_011831	CCA	2	6	524550	524555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847371
10549	NC_011831	GCA	2	6	524636	524641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847371
10550	NC_011831	TCA	2	6	524672	524677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847371
10551	NC_011831	A	6	6	524697	524702	100 %	0 %	0 %	0 %	219847371
10552	NC_011831	TAA	2	6	524777	524782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847371
10553	NC_011831	GCA	2	6	524816	524821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847371
10554	NC_011831	GCGG	2	8	524873	524880	0 %	0 %	75 %	25 %	219847371
10555	NC_011831	CTC	2	6	524944	524949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847371
10556	NC_011831	TCG	2	6	524972	524977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847371
10557	NC_011831	CCG	2	6	525116	525121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847371
10558	NC_011831	GGC	2	6	525150	525155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847371
10559	NC_011831	ATC	2	6	525251	525256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847371
10560	NC_011831	CGC	2	6	525268	525273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847371
10561	NC_011831	TCG	2	6	525362	525367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847371
10562	NC_011831	GCA	2	6	525416	525421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847371
10563	NC_011831	CGT	2	6	525424	525429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847371
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10565	NC_011831	TAT	2	6	525492	525497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_011831	AAT	2	6	525593	525598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10567	NC_011831	ATC	2	6	525809	525814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847372
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10569	NC_011831	GCT	2	6	526028	526033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847372
10570	NC_011831	GTC	2	6	526076	526081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847372
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10572	NC_011831	CCAT	2	8	526200	526207	25 %	25 %	0 %	50 %	219847372
10573	NC_011831	GATCA	2	10	526229	526238	40 %	20 %	20 %	20 %	219847372
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10579	NC_011831	TAT	2	6	526432	526437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847372
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10587	NC_011831	TGA	2	6	526585	526590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847372
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10591	NC_011831	TGC	2	6	526735	526740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847372
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10603	NC_011831	CG	3	6	527326	527331	0 %	0 %	50 %	50 %	219847373
10604	NC_011831	CGG	2	6	527341	527346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847373
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10606	NC_011831	GGT	2	6	527393	527398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847373
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