MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 94970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_011831	AG	3	6	471524	471529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9502	NC_011831	ATT	2	6	471596	471601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9503	NC_011831	CATT	2	8	471606	471613	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9504	NC_011831	T	7	7	471612	471618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9505	NC_011831	AAT	2	6	471631	471636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9506	NC_011831	ACTT	2	8	471665	471672	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9507	NC_011831	TTG	2	6	471676	471681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9508	NC_011831	TAC	2	6	471837	471842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9509	NC_011831	TGC	2	6	471902	471907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9510	NC_011831	GAA	2	6	471973	471978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847328
9511	NC_011831	GC	3	6	472008	472013	0 %	0 %	50 %	50 %	219847328
9512	NC_011831	GGT	2	6	472024	472029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847328
9513	NC_011831	CAG	2	6	472045	472050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847328
9514	NC_011831	CACG	2	8	472051	472058	25 %	0 %	25 %	50 %	219847328
9515	NC_011831	AGC	2	6	472157	472162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847328
9516	NC_011831	GGA	2	6	472249	472254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847328
9517	NC_011831	CGG	2	6	472262	472267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847328
9518	NC_011831	CAA	2	6	472275	472280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847328
9519	NC_011831	ATC	2	6	472324	472329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847328
9520	NC_011831	AAG	2	6	472361	472366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847328
9521	NC_011831	CGC	2	6	472380	472385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847328
9522	NC_011831	CGG	2	6	472464	472469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847328
9523	NC_011831	GCG	2	6	472600	472605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847328
9524	NC_011831	GAT	2	6	472648	472653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847328
9525	NC_011831	TTAC	2	8	472689	472696	25 %	50 %	0 %	25 %	219847328
9526	NC_011831	ACA	2	6	472703	472708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847328
9527	NC_011831	CCG	2	6	472717	472722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847328
9528	NC_011831	CCGA	2	8	472745	472752	25 %	0 %	25 %	50 %	219847328
9529	NC_011831	GACG	2	8	472782	472789	25 %	0 %	50 %	25 %	219847328
9530	NC_011831	GATC	2	8	472818	472825	25 %	25 %	25 %	25 %	219847328
9531	NC_011831	GTC	2	6	472921	472926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847328
9532	NC_011831	AC	3	6	473039	473044	50 %	0 %	0 %	50 %	219847328
9533	NC_011831	CGG	2	6	473076	473081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847328
9534	NC_011831	ATT	2	6	473104	473109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847328
9535	NC_011831	AAC	2	6	473195	473200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847328
9536	NC_011831	CGA	2	6	473283	473288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847328
9537	NC_011831	GC	3	6	473292	473297	0 %	0 %	50 %	50 %	219847328
9538	NC_011831	TGC	2	6	473298	473303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847328
9539	NC_011831	CCG	2	6	473343	473348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847328
9540	NC_011831	T	6	6	473353	473358	0 %	100 %	0 %	0 %	219847328
9541	NC_011831	TGA	2	6	473391	473396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847328
9542	NC_011831	GCA	2	6	473463	473468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847328
9543	NC_011831	CCA	2	6	473473	473478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847328
9544	NC_011831	CGT	2	6	473498	473503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847328
9545	NC_011831	GAG	2	6	473514	473519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9546	NC_011831	CCA	2	6	473646	473651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847329
9547	NC_011831	TGA	2	6	473713	473718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847329
9548	NC_011831	CGC	2	6	473765	473770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847329
9549	NC_011831	GAT	2	6	473877	473882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847329
9550	NC_011831	CGT	2	6	473891	473896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847330
9551	NC_011831	CTGAG	2	10	473940	473949	20 %	20 %	40 %	20 %	219847330
9552	NC_011831	TCAAC	2	10	473968	473977	40 %	20 %	0 %	40 %	219847330
9553	NC_011831	CAC	2	6	474030	474035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847330
9554	NC_011831	ACCCGT	2	12	474058	474069	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219847330
9555	NC_011831	TGC	2	6	474070	474075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847330
9556	NC_011831	ACC	2	6	474083	474088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847330
9557	NC_011831	CAC	2	6	474090	474095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847330
9558	NC_011831	CGCC	2	8	474117	474124	0 %	0 %	25 %	75 %	219847330
9559	NC_011831	ATC	2	6	474215	474220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847330
9560	NC_011831	AAC	2	6	474242	474247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847330
9561	NC_011831	GC	3	6	474255	474260	0 %	0 %	50 %	50 %	219847330
9562	NC_011831	CGCT	2	8	474324	474331	0 %	25 %	25 %	50 %	219847330
9563	NC_011831	TGA	2	6	474482	474487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847331
9564	NC_011831	TGA	2	6	474571	474576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847331
9565	NC_011831	CGC	2	6	474682	474687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847331
9566	NC_011831	GCT	2	6	474752	474757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847331
9567	NC_011831	GC	3	6	474775	474780	0 %	0 %	50 %	50 %	219847331
9568	NC_011831	GCT	2	6	474797	474802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847331
9569	NC_011831	GCC	2	6	474831	474836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847331
9570	NC_011831	GCTG	2	8	474863	474870	0 %	25 %	50 %	25 %	219847331
9571	NC_011831	CGCTCG	2	12	474871	474882	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219847331
9572	NC_011831	GAA	2	6	474894	474899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847331
9573	NC_011831	ATC	2	6	474915	474920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847331
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9575	NC_011831	CGC	2	6	474995	475000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847331
9576	NC_011831	GCC	2	6	475034	475039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847331
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9578	NC_011831	GTC	2	6	475096	475101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847331
9579	NC_011831	CAC	2	6	475139	475144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847331
9580	NC_011831	CTAA	2	8	475239	475246	50 %	25 %	0 %	25 %	219847331
9581	NC_011831	CTT	2	6	475283	475288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847331
9582	NC_011831	CGA	2	6	475306	475311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847331
9583	NC_011831	GCT	2	6	475389	475394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847331
9584	NC_011831	ATC	2	6	475449	475454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847331
9585	NC_011831	GGC	2	6	475484	475489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847331
9586	NC_011831	GC	3	6	475488	475493	0 %	0 %	50 %	50 %	219847331
9587	NC_011831	GTG	2	6	475494	475499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847331
9588	NC_011831	ACG	2	6	475513	475518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847331
9589	NC_011831	CGC	2	6	475562	475567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847331
9590	NC_011831	TAGC	2	8	475576	475583	25 %	25 %	25 %	25 %	219847331
9591	NC_011831	CGG	2	6	475592	475597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847331
9592	NC_011831	GGT	2	6	475598	475603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847331
9593	NC_011831	GTTACA	2	12	475629	475640	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9594	NC_011831	AAAG	2	8	475692	475699	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9595	NC_011831	GCT	2	6	475802	475807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847332
9596	NC_011831	GC	3	6	475823	475828	0 %	0 %	50 %	50 %	219847332
9597	NC_011831	GCG	2	6	475834	475839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847332
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9601	NC_011831	AGA	2	6	475927	475932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847332
9602	NC_011831	TGA	2	6	475980	475985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847332
9603	NC_011831	AGC	2	6	476029	476034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847332
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9605	NC_011831	GC	4	8	476047	476054	0 %	0 %	50 %	50 %	219847332
9606	NC_011831	GGT	2	6	476071	476076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847332
9607	NC_011831	CAT	2	6	476098	476103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847332
9608	NC_011831	GAA	4	12	476150	476161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847332
9609	NC_011831	ATC	2	6	476167	476172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847332
9610	NC_011831	TCA	2	6	476291	476296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9611	NC_011831	AGGC	2	8	476375	476382	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9612	NC_011831	GGTT	2	8	476407	476414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9613	NC_011831	ACG	2	6	476429	476434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9614	NC_011831	ACCG	2	8	476550	476557	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9615	NC_011831	GGC	2	6	476611	476616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9616	NC_011831	TGG	2	6	476679	476684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9617	NC_011831	CAC	2	6	476688	476693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9618	NC_011831	ATGC	2	8	476713	476720	25 %	25 %	25 %	25 %	219847333
9619	NC_011831	TGC	2	6	476730	476735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847333
9620	NC_011831	GCT	2	6	476748	476753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847333
9621	NC_011831	CCG	2	6	476768	476773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847333
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