MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 94970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011831	CCA	2	6	25596	25601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846971
502	NC_011831	CAGGG	2	10	25606	25615	20 %	0 %	60 %	20 %	219846971
503	NC_011831	GTG	2	6	25618	25623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846971
504	NC_011831	CGG	2	6	25677	25682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846971
505	NC_011831	GAT	2	6	25694	25699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846971
506	NC_011831	TGG	2	6	25740	25745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846971
507	NC_011831	CAC	2	6	25765	25770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846971
508	NC_011831	AGC	2	6	25847	25852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846971
509	NC_011831	TAG	2	6	25875	25880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846971
510	NC_011831	GAG	2	6	25925	25930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219846971
511	NC_011831	GCG	2	6	25937	25942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846971
512	NC_011831	ACA	2	6	25977	25982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219846971
513	NC_011831	GTT	2	6	26018	26023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219846971
514	NC_011831	CG	3	6	26035	26040	0 %	0 %	50 %	50 %	219846971
515	NC_011831	ACAA	2	8	26078	26085	75 %	0 %	0 %	25 %	219846971
516	NC_011831	AGC	2	6	26097	26102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846971
517	NC_011831	ACC	2	6	26138	26143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846971
518	NC_011831	CGG	2	6	26209	26214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846971
519	NC_011831	ACG	2	6	26216	26221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846971
520	NC_011831	TCA	2	6	26286	26291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846971
521	NC_011831	CAC	2	6	26300	26305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846971
522	NC_011831	ACGA	2	8	26321	26328	50 %	0 %	25 %	25 %	219846971
523	NC_011831	CGC	2	6	26337	26342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846971
524	NC_011831	CGGC	2	8	26404	26411	0 %	0 %	50 %	50 %	219846971
525	NC_011831	CTG	2	6	26435	26440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846971
526	NC_011831	A	6	6	26514	26519	100 %	0 %	0 %	0 %	219846971
527	NC_011831	GCG	2	6	26565	26570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846971
528	NC_011831	CAATCG	2	12	26581	26592	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219846971
529	NC_011831	TCA	2	6	26749	26754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846971
530	NC_011831	GATC	2	8	26782	26789	25 %	25 %	25 %	25 %	219846971
531	NC_011831	GTGC	2	8	26805	26812	0 %	25 %	50 %	25 %	219846971
532	NC_011831	TCCAT	2	10	26827	26836	20 %	40 %	0 %	40 %	219846971
533	NC_011831	TGC	2	6	26839	26844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_011831	TTC	2	6	26884	26889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_011831	TAA	2	6	26905	26910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_011831	ATC	2	6	26947	26952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_011831	TGCGA	2	10	26965	26974	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
538	NC_011831	GCT	2	6	27035	27040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_011831	AGGT	2	8	27125	27132	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_011831	GGA	2	6	27158	27163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011831	GTC	2	6	27175	27180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846972
542	NC_011831	CGA	2	6	27181	27186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846972
543	NC_011831	GCC	2	6	27249	27254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846972
544	NC_011831	GCG	2	6	27330	27335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846972
545	NC_011831	TTC	2	6	27374	27379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219846972
546	NC_011831	GGC	3	9	27386	27394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846972
547	NC_011831	CG	3	6	27453	27458	0 %	0 %	50 %	50 %	219846972
548	NC_011831	ACC	2	6	27485	27490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846972
549	NC_011831	CCA	2	6	27520	27525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846972
550	NC_011831	GC	3	6	27601	27606	0 %	0 %	50 %	50 %	219846972
551	NC_011831	GCCG	2	8	27634	27641	0 %	0 %	50 %	50 %	219846972
552	NC_011831	TTCA	2	8	27665	27672	25 %	50 %	0 %	25 %	219846972
553	NC_011831	GCC	2	6	27771	27776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846972
554	NC_011831	ATG	2	6	27882	27887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_011831	ACT	2	6	27946	27951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846973
556	NC_011831	ACG	2	6	28091	28096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846973
557	NC_011831	TGA	2	6	28125	28130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846973
558	NC_011831	CGA	2	6	28188	28193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846973
559	NC_011831	CTTA	2	8	28204	28211	25 %	50 %	0 %	25 %	219846973
560	NC_011831	GTA	2	6	28291	28296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846973
561	NC_011831	TCG	2	6	28322	28327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846973
562	NC_011831	CGG	2	6	28383	28388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846973
563	NC_011831	TCT	2	6	28425	28430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219846973
564	NC_011831	TGA	2	6	28504	28509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846973
565	NC_011831	TCG	2	6	28568	28573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846973
566	NC_011831	GAT	2	6	28587	28592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846973
567	NC_011831	TAG	2	6	28599	28604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846973
568	NC_011831	ATA	2	6	28607	28612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219846973
569	NC_011831	GC	3	6	28663	28668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
570	NC_011831	GCA	2	6	28747	28752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846974
571	NC_011831	TTTAG	2	10	28767	28776	20 %	60 %	20 %	0 %	219846974
572	NC_011831	ATA	2	6	28803	28808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219846974
573	NC_011831	CGG	2	6	28813	28818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846974
574	NC_011831	GGT	2	6	28858	28863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846974
575	NC_011831	GATC	2	8	28876	28883	25 %	25 %	25 %	25 %	219846974
576	NC_011831	GCCAG	2	10	28906	28915	20 %	0 %	40 %	40 %	219846974
577	NC_011831	CGA	2	6	28918	28923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846974
578	NC_011831	TTG	2	6	28998	29003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219846974
579	NC_011831	TTC	2	6	29027	29032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219846974
580	NC_011831	AGC	2	6	29063	29068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846974
581	NC_011831	CGT	2	6	29110	29115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846974
582	NC_011831	GAGC	2	8	29155	29162	25 %	0 %	50 %	25 %	219846974
583	NC_011831	GC	3	6	29180	29185	0 %	0 %	50 %	50 %	219846974
584	NC_011831	ACGA	2	8	29207	29214	50 %	0 %	25 %	25 %	219846974
585	NC_011831	GTC	2	6	29223	29228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846974
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588	NC_011831	GCA	2	6	29472	29477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846974
589	NC_011831	TTG	2	6	29527	29532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_011831	TCT	2	6	29565	29570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_011831	A	6	6	29598	29603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_011831	CT	3	6	29632	29637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
593	NC_011831	TGC	2	6	29667	29672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_011831	AGC	2	6	29718	29723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_011831	TGC	3	9	29727	29735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_011831	CATG	2	8	29775	29782	25 %	25 %	25 %	25 %	219846975
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599	NC_011831	CCA	2	6	29904	29909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846975
600	NC_011831	GTGG	2	8	29999	30006	0 %	25 %	75 %	0 %	219846975
601	NC_011831	CGG	2	6	30162	30167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846975
602	NC_011831	GCC	2	6	30203	30208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846975
603	NC_011831	GT	3	6	30240	30245	0 %	50 %	50 %	0 %	219846975
604	NC_011831	CG	3	6	30255	30260	0 %	0 %	50 %	50 %	219846975
605	NC_011831	GCC	2	6	30281	30286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846975
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610	NC_011831	GCCG	2	8	30637	30644	0 %	0 %	50 %	50 %	219846975
611	NC_011831	GGA	2	6	30660	30665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219846975
612	NC_011831	CCG	2	6	30684	30689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846975
613	NC_011831	TGC	2	6	30781	30786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846975
614	NC_011831	GGTT	2	8	30787	30794	0 %	50 %	50 %	0 %	219846975
615	NC_011831	CTG	2	6	30970	30975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_011831	GAG	2	6	30979	30984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011831	ATC	2	6	31009	31014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846976
618	NC_011831	GTC	2	6	31059	31064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846976
619	NC_011831	CAG	2	6	31105	31110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846976
620	NC_011831	CCGATC	2	12	31133	31144	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219846976
621	NC_011831	ATC	2	6	31228	31233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846976
622	NC_011831	CCAA	2	8	31243	31250	50 %	0 %	0 %	50 %	219846976
623	NC_011831	GTC	2	6	31264	31269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846976
624	NC_011831	GT	3	6	31286	31291	0 %	50 %	50 %	0 %	219846976
625	NC_011831	GTG	2	6	31355	31360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846976
626	NC_011831	TGA	3	9	31440	31448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846976
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629	NC_011831	GAA	2	6	31566	31571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219846976
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