MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 94970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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90002	NC_011831	CGG	2	6	4443133	4443138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850491
90003	NC_011831	ACC	2	6	4443152	4443157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850491
90004	NC_011831	GTC	2	6	4443176	4443181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850491
90005	NC_011831	TGG	2	6	4443388	4443393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850491
90006	NC_011831	CCT	2	6	4443442	4443447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90007	NC_011831	ATT	2	6	4443505	4443510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90008	NC_011831	TTC	2	6	4443601	4443606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850492
90009	NC_011831	CGGTGC	2	12	4443745	4443756	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219850492
90010	NC_011831	CAG	2	6	4443855	4443860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850492
90011	NC_011831	GCG	2	6	4443999	4444004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850492
90012	NC_011831	CGC	2	6	4444035	4444040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850492
90013	NC_011831	GT	3	6	4444044	4444049	0 %	50 %	50 %	0 %	219850492
90014	NC_011831	CTT	2	6	4444066	4444071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850492
90015	NC_011831	GCC	2	6	4444148	4444153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850492
90016	NC_011831	TGG	2	6	4444222	4444227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850492
90017	NC_011831	TGC	2	6	4444228	4444233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850492
90018	NC_011831	CAA	2	6	4444254	4444259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219850492
90019	NC_011831	CAG	2	6	4444273	4444278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850492
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90021	NC_011831	GGA	2	6	4444478	4444483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850493
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90024	NC_011831	CG	3	6	4444691	4444696	0 %	0 %	50 %	50 %	219850493
90025	NC_011831	TCGG	2	8	4444740	4444747	0 %	25 %	50 %	25 %	219850493
90026	NC_011831	CAG	3	9	4444812	4444820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850493
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90032	NC_011831	ATC	2	6	4445037	4445042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850493
90033	NC_011831	TG	3	6	4445095	4445100	0 %	50 %	50 %	0 %	219850493
90034	NC_011831	AGT	2	6	4445116	4445121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850493
90035	NC_011831	GCA	2	6	4445173	4445178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850493
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90040	NC_011831	ATT	2	6	4445371	4445376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90041	NC_011831	AAG	2	6	4445417	4445422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90042	NC_011831	GTA	2	6	4445462	4445467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850494
90043	NC_011831	CGA	2	6	4445485	4445490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850494
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90045	NC_011831	TAG	2	6	4445503	4445508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850494
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90049	NC_011831	CGT	2	6	4445805	4445810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850494
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90052	NC_011831	TCCC	2	8	4445906	4445913	0 %	25 %	0 %	75 %	219850494
90053	NC_011831	TGC	3	9	4445924	4445932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850494
90054	NC_011831	CGA	2	6	4445942	4445947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850494
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90056	NC_011831	CATC	2	8	4446020	4446027	25 %	25 %	0 %	50 %	219850494
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90082	NC_011831	ACTG	2	8	4447025	4447032	25 %	25 %	25 %	25 %	219850495
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90088	NC_011831	ACC	2	6	4447337	4447342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850495
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90099	NC_011831	TCG	2	6	4447841	4447846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850496
90100	NC_011831	AGT	2	6	4447856	4447861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850496
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90106	NC_011831	GATC	2	8	4448118	4448125	25 %	25 %	25 %	25 %	219850496
90107	NC_011831	GAT	2	6	4448205	4448210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90108	NC_011831	GTA	2	6	4448245	4448250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850497
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90113	NC_011831	TGA	2	6	4448626	4448631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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90115	NC_011831	TGCG	2	8	4448733	4448740	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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90117	NC_011831	GAAT	2	8	4448840	4448847	50 %	25 %	25 %	0 %	219850498
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90466	NC_011831	GCT	2	6	4465668	4465673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850510
90467	NC_011831	ATT	2	6	4465675	4465680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219850510
90468	NC_011831	TGG	3	9	4465691	4465699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850510
90469	NC_011831	GCT	2	6	4465701	4465706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850510
90470	NC_011831	GGC	2	6	4465748	4465753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850510
90471	NC_011831	GGC	2	6	4465833	4465838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850510
90472	NC_011831	GGT	2	6	4465854	4465859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850510
90473	NC_011831	CTG	2	6	4465882	4465887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850510
90474	NC_011831	GCGCG	2	10	4465936	4465945	0 %	0 %	60 %	40 %	219850510
90475	NC_011831	TGC	2	6	4465991	4465996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850510
90476	NC_011831	GCC	2	6	4466013	4466018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850510
90477	NC_011831	TGG	2	6	4466078	4466083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850510
90478	NC_011831	GGGCC	2	10	4466093	4466102	0 %	0 %	60 %	40 %	219850510
90479	NC_011831	AGG	2	6	4466126	4466131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850510
90480	NC_011831	TGC	2	6	4466137	4466142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90481	NC_011831	C	6	6	4466153	4466158	0 %	0 %	0 %	100 %	219850511
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90483	NC_011831	CGCT	2	8	4466171	4466178	0 %	25 %	25 %	50 %	219850511
90484	NC_011831	CAACGC	2	12	4466180	4466191	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	219850511
90485	NC_011831	GCA	2	6	4466202	4466207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850511
90486	NC_011831	CCG	2	6	4466237	4466242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850511
90487	NC_011831	GCA	2	6	4466253	4466258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850511
90488	NC_011831	AAC	2	6	4466304	4466309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219850511
90489	NC_011831	AGCG	2	8	4466317	4466324	25 %	0 %	50 %	25 %	219850511
90490	NC_011831	AGG	2	6	4466353	4466358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850511
90491	NC_011831	GTTG	2	8	4466378	4466385	0 %	50 %	50 %	0 %	219850511
90492	NC_011831	TAG	2	6	4466411	4466416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850511
90493	NC_011831	CAG	2	6	4466432	4466437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850511
90494	NC_011831	AAG	2	6	4466457	4466462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850511
90495	NC_011831	GCA	2	6	4466481	4466486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850511
90496	NC_011831	GTC	2	6	4466540	4466545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850511
90497	NC_011831	CCA	2	6	4466603	4466608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850511
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90499	NC_011831	TGG	2	6	4466662	4466667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850511
90500	NC_011831	CAT	2	6	4466846	4466851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850511

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