MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 94970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
88001	NC_011831	GCA	2	6	4340037	4340042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850415
88002	NC_011831	GGA	2	6	4340046	4340051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850415
88003	NC_011831	CGG	2	6	4340091	4340096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850415
88004	NC_011831	GC	3	6	4340114	4340119	0 %	0 %	50 %	50 %	219850415
88005	NC_011831	AACGG	2	10	4340190	4340199	40 %	0 %	40 %	20 %	219850415
88006	NC_011831	CAG	2	6	4340248	4340253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850415
88007	NC_011831	GTA	2	6	4340417	4340422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850415
88008	NC_011831	CTC	2	6	4340426	4340431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850415
88009	NC_011831	CGGT	2	8	4340444	4340451	0 %	25 %	50 %	25 %	219850415
88010	NC_011831	GTTTC	2	10	4340584	4340593	0 %	60 %	20 %	20 %	219850415
88011	NC_011831	CGC	2	6	4340693	4340698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850415
88012	NC_011831	GC	4	8	4340796	4340803	0 %	0 %	50 %	50 %	219850415
88013	NC_011831	GCG	3	9	4340817	4340825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850415
88014	NC_011831	GC	3	6	4340850	4340855	0 %	0 %	50 %	50 %	219850415
88015	NC_011831	AAC	2	6	4340865	4340870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219850415
88016	NC_011831	CAA	2	6	4340897	4340902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219850415
88017	NC_011831	GC	3	6	4340949	4340954	0 %	0 %	50 %	50 %	219850415
88018	NC_011831	CGT	2	6	4340957	4340962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850415
88019	NC_011831	CATCGT	2	12	4341044	4341055	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219850415
88020	NC_011831	AGC	2	6	4341189	4341194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850415
88021	NC_011831	CAC	2	6	4341235	4341240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850415
88022	NC_011831	ATC	2	6	4341257	4341262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850415
88023	NC_011831	CTCG	2	8	4341280	4341287	0 %	25 %	25 %	50 %	219850415
88024	NC_011831	GC	3	6	4341305	4341310	0 %	0 %	50 %	50 %	219850415
88025	NC_011831	GCC	2	6	4341324	4341329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850415
88026	NC_011831	TGA	2	6	4341382	4341387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850415
88027	NC_011831	TCG	2	6	4341390	4341395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850415
88028	NC_011831	CGA	2	6	4341405	4341410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850415
88029	NC_011831	TGC	2	6	4341421	4341426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850415
88030	NC_011831	GC	3	6	4341434	4341439	0 %	0 %	50 %	50 %	219850415
88031	NC_011831	AGA	2	6	4341481	4341486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850415
88032	NC_011831	GGA	2	6	4341517	4341522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850415
88033	NC_011831	ATA	2	6	4341567	4341572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219850415
88034	NC_011831	TTTTA	2	10	4341597	4341606	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88035	NC_011831	ACA	2	6	4341630	4341635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88036	NC_011831	AGTTT	2	10	4341698	4341707	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88037	NC_011831	CAG	2	6	4341745	4341750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88038	NC_011831	CTAA	2	8	4341808	4341815	50 %	25 %	0 %	25 %	219850416
88039	NC_011831	AG	3	6	4341913	4341918	50 %	0 %	50 %	0 %	219850416
88040	NC_011831	TGT	2	6	4341925	4341930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850416
88041	NC_011831	GTC	2	6	4342063	4342068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850416
88042	NC_011831	TCA	2	6	4342092	4342097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850416
88043	NC_011831	GAA	2	6	4342132	4342137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850416
88044	NC_011831	TCG	2	6	4342145	4342150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850416
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88046	NC_011831	GTG	2	6	4342235	4342240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88047	NC_011831	TAC	2	6	4342277	4342282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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88049	NC_011831	ATT	2	6	4342420	4342425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219850417
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88052	NC_011831	TCG	2	6	4342477	4342482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850417
88053	NC_011831	TCC	2	6	4342489	4342494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850417
88054	NC_011831	AGCA	2	8	4342497	4342504	50 %	0 %	25 %	25 %	219850417
88055	NC_011831	CCA	2	6	4342514	4342519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850417
88056	NC_011831	CAG	2	6	4342524	4342529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850417
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88058	NC_011831	CAAC	2	8	4342613	4342620	50 %	0 %	0 %	50 %	219850417
88059	NC_011831	TAA	2	6	4342636	4342641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219850417
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88116	NC_011831	ATG	2	6	4345668	4345673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850417
88117	NC_011831	TGG	2	6	4345686	4345691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850417
88118	NC_011831	ATG	2	6	4345731	4345736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850417
88119	NC_011831	GATC	2	8	4345759	4345766	25 %	25 %	25 %	25 %	219850417
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88121	NC_011831	CGGT	2	8	4345878	4345885	0 %	25 %	50 %	25 %	219850417
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88123	NC_011831	ATG	2	6	4346124	4346129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850417
88124	NC_011831	GTT	2	6	4346171	4346176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850417
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88127	NC_011831	CGT	2	6	4346294	4346299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850417
88128	NC_011831	TTG	2	6	4346330	4346335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850417
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88134	NC_011831	TGG	2	6	4346781	4346786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850417
88135	NC_011831	CGGTA	2	10	4346811	4346820	20 %	20 %	40 %	20 %	219850417
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88145	NC_011831	CGG	2	6	4347095	4347100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850417
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88152	NC_011831	GC	3	6	4347511	4347516	0 %	0 %	50 %	50 %	219850417
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88172	NC_011831	AT	3	6	4348668	4348673	50 %	50 %	0 %	0 %	219850417
88173	NC_011831	TTC	2	6	4348730	4348735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850417
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88219	NC_011831	GGTGTT	2	12	4350834	4350845	0 %	50 %	50 %	0 %	219850418
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88224	NC_011831	AACGG	2	10	4351092	4351101	40 %	0 %	40 %	20 %	219850418
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88230	NC_011831	GT	3	6	4351405	4351410	0 %	50 %	50 %	0 %	219850418
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