MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 126376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011729	GGA	2	6	581337	581342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_011729	ATC	2	6	581458	581463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437527
12503	NC_011729	CAT	2	6	581479	581484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437527
12504	NC_011729	ATT	2	6	581534	581539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437527
12505	NC_011729	GAT	2	6	581551	581556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437527
12506	NC_011729	GAA	2	6	581584	581589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437527
12507	NC_011729	CGG	2	6	581606	581611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437527
12508	NC_011729	GAT	2	6	581641	581646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437527
12509	NC_011729	T	6	6	581649	581654	0 %	100 %	0 %	0 %	218437527
12510	NC_011729	GCG	2	6	581695	581700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437527
12511	NC_011729	A	8	8	581717	581724	100 %	0 %	0 %	0 %	218437527
12512	NC_011729	CCCAA	2	10	581755	581764	40 %	0 %	0 %	60 %	218437527
12513	NC_011729	TCG	2	6	581805	581810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437527
12514	NC_011729	T	6	6	581811	581816	0 %	100 %	0 %	0 %	218437527
12515	NC_011729	CTA	2	6	581828	581833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437527
12516	NC_011729	T	6	6	581840	581845	0 %	100 %	0 %	0 %	218437527
12517	NC_011729	GAA	2	6	581911	581916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437527
12518	NC_011729	ATTT	2	8	581933	581940	25 %	75 %	0 %	0 %	218437527
12519	NC_011729	TTG	2	6	581944	581949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437527
12520	NC_011729	ATT	2	6	582154	582159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437527
12521	NC_011729	AAT	2	6	582163	582168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437527
12522	NC_011729	ATT	2	6	582208	582213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437527
12523	NC_011729	ATT	2	6	582259	582264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437527
12524	NC_011729	GAT	2	6	582276	582281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437527
12525	NC_011729	GCC	2	6	582301	582306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218437527
12526	NC_011729	CTGGC	2	10	582521	582530	0 %	20 %	40 %	40 %	218437527
12527	NC_011729	GT	3	6	582632	582637	0 %	50 %	50 %	0 %	218437527
12528	NC_011729	ATT	2	6	582658	582663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437527
12529	NC_011729	G	6	6	582664	582669	0 %	0 %	100 %	0 %	218437527
12530	NC_011729	GGC	2	6	582757	582762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437527
12531	NC_011729	T	6	6	582811	582816	0 %	100 %	0 %	0 %	218437527
12532	NC_011729	CGAAAG	2	12	582839	582850	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	218437527
12533	NC_011729	AGA	2	6	582879	582884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437527
12534	NC_011729	CGA	2	6	582889	582894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437527
12535	NC_011729	ATT	2	6	583056	583061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437527
12536	NC_011729	TCC	2	6	583139	583144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437527
12537	NC_011729	ATTT	2	8	583218	583225	25 %	75 %	0 %	0 %	218437527
12538	NC_011729	GAG	2	6	583253	583258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437527
12539	NC_011729	GAA	2	6	583348	583353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437527
12540	NC_011729	CGT	2	6	583360	583365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437527
12541	NC_011729	ATG	2	6	583367	583372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437527
12542	NC_011729	G	6	6	583447	583452	0 %	0 %	100 %	0 %	218437527
12543	NC_011729	ATTT	2	8	583467	583474	25 %	75 %	0 %	0 %	218437527
12544	NC_011729	AATT	2	8	583679	583686	50 %	50 %	0 %	0 %	218437527
12545	NC_011729	ATT	2	6	583699	583704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437527
12546	NC_011729	TCA	2	6	583821	583826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437527
12547	NC_011729	GAACAA	2	12	583843	583854	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	218437527
12548	NC_011729	AAT	2	6	583876	583881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_011729	ATT	2	6	583965	583970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_011729	T	7	7	583969	583975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_011729	CTT	2	6	583983	583988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12552	NC_011729	ATCA	2	8	583991	583998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12553	NC_011729	ATT	2	6	584006	584011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_011729	CTC	2	6	584026	584031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12555	NC_011729	TCAT	2	8	584034	584041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12556	NC_011729	TAGT	2	8	584102	584109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_011729	AG	3	6	584131	584136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_011729	TAAA	2	8	584144	584151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_011729	A	6	6	584149	584154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_011729	ATTA	2	8	584163	584170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_011729	C	6	6	584209	584214	0 %	0 %	0 %	100 %	218437528
12562	NC_011729	AGA	2	6	584285	584290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437528
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12564	NC_011729	GAT	2	6	584393	584398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437528
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12567	NC_011729	CTG	2	6	584518	584523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437528
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12569	NC_011729	CTG	2	6	584539	584544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437528
12570	NC_011729	C	7	7	584586	584592	0 %	0 %	0 %	100 %	218437528
12571	NC_011729	TCC	3	9	584633	584641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437528
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12573	NC_011729	GAT	2	6	584691	584696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437528
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12575	NC_011729	AAT	2	6	584884	584889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12576	NC_011729	TTG	2	6	584896	584901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12577	NC_011729	ATT	2	6	584909	584914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437529
12578	NC_011729	A	8	8	584922	584929	100 %	0 %	0 %	0 %	218437529
12579	NC_011729	AAT	2	6	585095	585100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437529
12580	NC_011729	ACTG	2	8	585121	585128	25 %	25 %	25 %	25 %	218437529
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12585	NC_011729	ACC	3	9	585279	585287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218437530
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12587	NC_011729	AG	3	6	585311	585316	50 %	0 %	50 %	0 %	218437530
12588	NC_011729	AGA	2	6	585323	585328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437530
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12591	NC_011729	A	7	7	585759	585765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_011729	T	7	7	585771	585777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_011729	TTAA	2	8	585799	585806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_011729	TTGA	2	8	585810	585817	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_011729	T	9	9	585848	585856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_011729	ATT	2	6	585861	585866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12597	NC_011729	TGA	2	6	585921	585926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_011729	GTC	2	6	585937	585942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12599	NC_011729	TAGT	2	8	586017	586024	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12600	NC_011729	ATT	2	6	586051	586056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_011729	TGAA	2	8	586095	586102	50 %	25 %	25 %	0 %	218437531
12602	NC_011729	GCA	2	6	586105	586110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437531
12603	NC_011729	TAAA	2	8	586197	586204	75 %	25 %	0 %	0 %	218437531
12604	NC_011729	ATTT	2	8	586234	586241	25 %	75 %	0 %	0 %	218437531
12605	NC_011729	AATA	2	8	586247	586254	75 %	25 %	0 %	0 %	218437531
12606	NC_011729	ATC	2	6	586290	586295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437531
12607	NC_011729	GCA	2	6	586339	586344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437531
12608	NC_011729	TTA	2	6	586347	586352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437531
12609	NC_011729	A	6	6	586352	586357	100 %	0 %	0 %	0 %	218437531
12610	NC_011729	AAAT	2	8	586408	586415	75 %	25 %	0 %	0 %	218437531
12611	NC_011729	A	6	6	586539	586544	100 %	0 %	0 %	0 %	218437531
12612	NC_011729	TTAT	2	8	586560	586567	25 %	75 %	0 %	0 %	218437531
12613	NC_011729	ACT	2	6	586670	586675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437531
12614	NC_011729	TGA	2	6	586687	586692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437531
12615	NC_011729	TGA	2	6	586720	586725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437531
12616	NC_011729	ATTT	2	8	586734	586741	25 %	75 %	0 %	0 %	218437531
12617	NC_011729	CTT	2	6	586849	586854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12618	NC_011729	ATACTG	2	12	586917	586928	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12619	NC_011729	CA	3	6	587080	587085	50 %	0 %	0 %	50 %	218437532
12620	NC_011729	TAT	2	6	587099	587104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437532
12621	NC_011729	TAA	2	6	587154	587159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437532
12622	NC_011729	TTC	2	6	587172	587177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437532
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12999	NC_011729	AGA	2	6	603984	603989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437549
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