MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 126376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
124501	NC_011729	TGT	2	6	5852173	5852178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442163
124502	NC_011729	TCT	2	6	5852191	5852196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442163
124503	NC_011729	TCT	2	6	5852302	5852307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442163
124504	NC_011729	TTC	2	6	5852346	5852351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442163
124505	NC_011729	GAAC	2	8	5852365	5852372	50 %	0 %	25 %	25 %	218442163
124506	NC_011729	GCG	2	6	5852389	5852394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442163
124507	NC_011729	T	9	9	5852403	5852411	0 %	100 %	0 %	0 %	218442163
124508	NC_011729	GCA	2	6	5852431	5852436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442163
124509	NC_011729	CG	3	6	5852439	5852444	0 %	0 %	50 %	50 %	218442163
124510	NC_011729	AGG	2	6	5852445	5852450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442163
124511	NC_011729	TG	3	6	5852467	5852472	0 %	50 %	50 %	0 %	218442163
124512	NC_011729	AAG	2	6	5852501	5852506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442163
124513	NC_011729	A	6	6	5852520	5852525	100 %	0 %	0 %	0 %	218442163
124514	NC_011729	A	6	6	5852535	5852540	100 %	0 %	0 %	0 %	218442163
124515	NC_011729	GA	3	6	5852630	5852635	50 %	0 %	50 %	0 %	218442163
124516	NC_011729	TTGA	2	8	5852676	5852683	25 %	50 %	25 %	0 %	218442163
124517	NC_011729	AAC	2	6	5852691	5852696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442163
124518	NC_011729	TGT	2	6	5852773	5852778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442163
124519	NC_011729	AGGAAT	2	12	5852796	5852807	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218442163
124520	NC_011729	GTA	2	6	5852843	5852848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442163
124521	NC_011729	TTG	2	6	5852971	5852976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442163
124522	NC_011729	CAT	2	6	5853021	5853026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442163
124523	NC_011729	ATC	2	6	5853031	5853036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442163
124524	NC_011729	TTA	2	6	5853173	5853178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442163
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124526	NC_011729	A	6	6	5853305	5853310	100 %	0 %	0 %	0 %	218442163
124527	NC_011729	TAT	2	6	5853311	5853316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442163
124528	NC_011729	TAA	2	6	5853324	5853329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442163
124529	NC_011729	AT	3	6	5853339	5853344	50 %	50 %	0 %	0 %	218442163
124530	NC_011729	CTA	2	6	5853350	5853355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442163
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124532	NC_011729	TTG	2	6	5853390	5853395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442163
124533	NC_011729	GAA	2	6	5853407	5853412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442163
124534	NC_011729	TCC	2	6	5853453	5853458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442163
124535	NC_011729	ACC	2	6	5853479	5853484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442163
124536	NC_011729	A	6	6	5853498	5853503	100 %	0 %	0 %	0 %	218442163
124537	NC_011729	AAT	2	6	5853520	5853525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442163
124538	NC_011729	GTA	2	6	5853616	5853621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124539	NC_011729	GTA	2	6	5853664	5853669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124540	NC_011729	GTA	2	6	5853719	5853724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124541	NC_011729	GTA	2	6	5853767	5853772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124542	NC_011729	GTA	2	6	5853813	5853818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124543	NC_011729	TA	3	6	5853874	5853879	50 %	50 %	0 %	0 %	218442164
124544	NC_011729	TCT	2	6	5853924	5853929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442164
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124549	NC_011729	ATC	2	6	5854313	5854318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442164
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124552	NC_011729	A	6	6	5854505	5854510	100 %	0 %	0 %	0 %	218442164
124553	NC_011729	CCT	2	6	5854635	5854640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442164
124554	NC_011729	TAA	2	6	5854666	5854671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442164
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124557	NC_011729	AATC	2	8	5854903	5854910	50 %	25 %	0 %	25 %	218442164
124558	NC_011729	AATC	2	8	5854924	5854931	50 %	25 %	0 %	25 %	218442164
124559	NC_011729	A	6	6	5854978	5854983	100 %	0 %	0 %	0 %	218442164
124560	NC_011729	ATG	2	6	5855018	5855023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442164
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124562	NC_011729	TCA	2	6	5855121	5855126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442164
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124566	NC_011729	TCA	3	9	5855446	5855454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442165
124567	NC_011729	ATC	2	6	5855515	5855520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442166
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124574	NC_011729	T	7	7	5855823	5855829	0 %	100 %	0 %	0 %	218442166
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124588	NC_011729	AG	3	6	5856898	5856903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124589	NC_011729	TC	3	6	5856937	5856942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124590	NC_011729	TTA	2	6	5856955	5856960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124591	NC_011729	CT	3	6	5856983	5856988	0 %	50 %	0 %	50 %	218442167
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124600	NC_011729	TTC	2	6	5857271	5857276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442167
124601	NC_011729	TGC	2	6	5857290	5857295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442167
124602	NC_011729	AAT	2	6	5857298	5857303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442167
124603	NC_011729	TCT	2	6	5857311	5857316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442167
124604	NC_011729	T	6	6	5857331	5857336	0 %	100 %	0 %	0 %	218442167
124605	NC_011729	GCA	2	6	5857386	5857391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442167
124606	NC_011729	AGAGA	2	10	5857407	5857416	60 %	0 %	40 %	0 %	218442167
124607	NC_011729	ATT	2	6	5857481	5857486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442167
124608	NC_011729	AG	3	6	5857592	5857597	50 %	0 %	50 %	0 %	218442167
124609	NC_011729	TTAG	2	8	5857617	5857624	25 %	50 %	25 %	0 %	218442167
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124612	NC_011729	TGA	2	6	5857665	5857670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442167
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124614	NC_011729	CTTG	2	8	5857720	5857727	0 %	50 %	25 %	25 %	218442167
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