MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 126376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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123502	NC_011729	AGT	3	9	5805321	5805329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442117
123503	NC_011729	CCG	2	6	5805351	5805356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442117
123504	NC_011729	TCT	2	6	5805422	5805427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442117
123505	NC_011729	TGG	2	6	5805435	5805440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442117
123506	NC_011729	CAG	2	6	5805495	5805500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442117
123507	NC_011729	TTG	2	6	5805506	5805511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442117
123508	NC_011729	G	6	6	5805513	5805518	0 %	0 %	100 %	0 %	218442117
123509	NC_011729	TTTG	2	8	5805519	5805526	0 %	75 %	25 %	0 %	218442117
123510	NC_011729	GATC	2	8	5805576	5805583	25 %	25 %	25 %	25 %	218442117
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123517	NC_011729	ATA	2	6	5806256	5806261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442117
123518	NC_011729	TTC	2	6	5806387	5806392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442117
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123532	NC_011729	ATT	2	6	5807041	5807046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123533	NC_011729	A	6	6	5807130	5807135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123534	NC_011729	A	6	6	5807163	5807168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123535	NC_011729	TAA	2	6	5807181	5807186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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123537	NC_011729	ATGA	2	8	5807286	5807293	50 %	25 %	25 %	0 %	218442118
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123543	NC_011729	TAA	2	6	5807582	5807587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123544	NC_011729	TTA	2	6	5807588	5807593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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123553	NC_011729	CTTC	2	8	5807841	5807848	0 %	50 %	0 %	50 %	218442120
123554	NC_011729	TCCT	2	8	5807913	5807920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123555	NC_011729	T	7	7	5807981	5807987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123556	NC_011729	TAGA	2	8	5808031	5808038	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123557	NC_011729	TCA	2	6	5808070	5808075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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123560	NC_011729	AGG	2	6	5808118	5808123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123561	NC_011729	AGG	2	6	5808132	5808137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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123972	NC_011729	AAC	2	6	5826175	5826180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442136
123973	NC_011729	TTC	2	6	5826220	5826225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442136
123974	NC_011729	TCC	2	6	5826277	5826282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442136
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123976	NC_011729	TGA	2	6	5826338	5826343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442136
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123978	NC_011729	GAT	2	6	5826429	5826434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442136
123979	NC_011729	T	6	6	5826471	5826476	0 %	100 %	0 %	0 %	218442136
123980	NC_011729	GAA	2	6	5826483	5826488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442136
123981	NC_011729	AAT	2	6	5826591	5826596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442136
123982	NC_011729	AGC	2	6	5826616	5826621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442136
123983	NC_011729	TAAA	2	8	5826642	5826649	75 %	25 %	0 %	0 %	218442136
123984	NC_011729	TAA	2	6	5826675	5826680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442136
123985	NC_011729	CTG	2	6	5826682	5826687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442136
123986	NC_011729	AACAA	2	10	5826786	5826795	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123987	NC_011729	TAAAC	2	10	5826827	5826836	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123988	NC_011729	ATCTT	2	10	5826951	5826960	20 %	60 %	0 %	20 %	218442137
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123992	NC_011729	CATA	2	8	5827299	5827306	50 %	25 %	0 %	25 %	218442137
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123994	NC_011729	A	6	6	5827457	5827462	100 %	0 %	0 %	0 %	218442137
123995	NC_011729	GA	3	6	5827527	5827532	50 %	0 %	50 %	0 %	218442137
123996	NC_011729	GCAAC	2	10	5827555	5827564	40 %	0 %	20 %	40 %	218442137
123997	NC_011729	TTG	3	9	5827642	5827650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442137
123998	NC_011729	ATC	2	6	5827672	5827677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442137
123999	NC_011729	GAT	2	6	5827692	5827697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442137
124000	NC_011729	CCAC	2	8	5827741	5827748	25 %	0 %	0 %	75 %	218442137

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