MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 126376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_011729	TAAGAG	2	12	510651	510662	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218437468
11003	NC_011729	CCG	2	6	510753	510758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218437468
11004	NC_011729	TCC	2	6	510816	510821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437468
11005	NC_011729	ATT	2	6	510844	510849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437468
11006	NC_011729	CCG	2	6	510894	510899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218437468
11007	NC_011729	TTA	2	6	510932	510937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437468
11008	NC_011729	TCT	2	6	510946	510951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437468
11009	NC_011729	TGA	2	6	511084	511089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437468
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11011	NC_011729	AAG	2	6	511107	511112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437468
11012	NC_011729	TTA	2	6	511178	511183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437468
11013	NC_011729	CTC	2	6	511211	511216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437468
11014	NC_011729	GCC	2	6	511238	511243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218437468
11015	NC_011729	TTC	2	6	511250	511255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437468
11016	NC_011729	GA	3	6	511312	511317	50 %	0 %	50 %	0 %	218437468
11017	NC_011729	TTTA	2	8	511318	511325	25 %	75 %	0 %	0 %	218437468
11018	NC_011729	A	6	6	511325	511330	100 %	0 %	0 %	0 %	218437468
11019	NC_011729	GTC	2	6	511383	511388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437468
11020	NC_011729	ACG	2	6	511416	511421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437468
11021	NC_011729	ATT	2	6	511444	511449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437468
11022	NC_011729	ATGG	2	8	511457	511464	25 %	25 %	50 %	0 %	218437468
11023	NC_011729	ATT	4	12	511484	511495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437468
11024	NC_011729	A	6	6	511625	511630	100 %	0 %	0 %	0 %	218437468
11025	NC_011729	CGG	2	6	511664	511669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437468
11026	NC_011729	GCC	2	6	511715	511720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218437468
11027	NC_011729	GTC	3	9	511731	511739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437468
11028	NC_011729	AAG	2	6	511743	511748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437468
11029	NC_011729	ACC	2	6	511754	511759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218437468
11030	NC_011729	ATG	2	6	511770	511775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437468
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11032	NC_011729	ATG	2	6	511893	511898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437468
11033	NC_011729	CAAG	2	8	511931	511938	50 %	0 %	25 %	25 %	218437468
11034	NC_011729	GAA	2	6	511964	511969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437468
11035	NC_011729	ATT	2	6	512014	512019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437468
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11037	NC_011729	ATT	2	6	512042	512047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437468
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11039	NC_011729	A	6	6	512091	512096	100 %	0 %	0 %	0 %	218437468
11040	NC_011729	AGA	2	6	512161	512166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437468
11041	NC_011729	GTC	2	6	512196	512201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437468
11042	NC_011729	ATT	2	6	512255	512260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437468
11043	NC_011729	ATCG	2	8	512312	512319	25 %	25 %	25 %	25 %	218437468
11044	NC_011729	TTA	2	6	512330	512335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437468
11045	NC_011729	TGAA	2	8	512379	512386	50 %	25 %	25 %	0 %	218437468
11046	NC_011729	GGGT	2	8	512434	512441	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_011729	T	8	8	512452	512459	0 %	100 %	0 %	0 %	218437469
11048	NC_011729	ATTTAA	2	12	512463	512474	50 %	50 %	0 %	0 %	218437469
11049	NC_011729	CAA	2	6	512496	512501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437469
11050	NC_011729	GTTGA	2	10	512550	512559	20 %	40 %	40 %	0 %	218437469
11051	NC_011729	AATA	2	8	512568	512575	75 %	25 %	0 %	0 %	218437469
11052	NC_011729	TC	3	6	512583	512588	0 %	50 %	0 %	50 %	218437469
11053	NC_011729	ATC	2	6	512621	512626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437469
11054	NC_011729	A	7	7	512662	512668	100 %	0 %	0 %	0 %	218437469
11055	NC_011729	AAT	2	6	512702	512707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437469
11056	NC_011729	T	7	7	512726	512732	0 %	100 %	0 %	0 %	218437469
11057	NC_011729	CTA	2	6	512814	512819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437469
11058	NC_011729	T	6	6	512820	512825	0 %	100 %	0 %	0 %	218437469
11059	NC_011729	GGGT	2	8	512847	512854	0 %	25 %	75 %	0 %	218437469
11060	NC_011729	TAA	2	6	512886	512891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437469
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11062	NC_011729	TTG	2	6	513157	513162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437469
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11076	NC_011729	TAAA	2	8	513931	513938	75 %	25 %	0 %	0 %	218437469
11077	NC_011729	GCT	2	6	513991	513996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437469
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11079	NC_011729	CA	3	6	514090	514095	50 %	0 %	0 %	50 %	218437469
11080	NC_011729	CGA	2	6	514097	514102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437469
11081	NC_011729	GTT	2	6	514136	514141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437469
11082	NC_011729	CCCT	2	8	514147	514154	0 %	25 %	0 %	75 %	218437469
11083	NC_011729	CAT	2	6	514212	514217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11084	NC_011729	TCA	2	6	514236	514241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11088	NC_011729	GAA	2	6	514575	514580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437470
11089	NC_011729	ATT	2	6	514616	514621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437470
11090	NC_011729	TCGAGT	2	12	514640	514651	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218437470
11091	NC_011729	TTAG	2	8	514656	514663	25 %	50 %	25 %	0 %	218437470
11092	NC_011729	CGT	2	6	514674	514679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437470
11093	NC_011729	ATTA	2	8	514845	514852	50 %	50 %	0 %	0 %	218437471
11094	NC_011729	CAA	2	6	514865	514870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437471
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11099	NC_011729	CAGA	2	8	514991	514998	50 %	0 %	25 %	25 %	218437471
11100	NC_011729	CAA	2	6	515003	515008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437471
11101	NC_011729	TAA	3	9	515021	515029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437471
11102	NC_011729	CAACC	2	10	515055	515064	40 %	0 %	0 %	60 %	218437471
11103	NC_011729	CCT	2	6	515077	515082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437471
11104	NC_011729	GGA	2	6	515135	515140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437471
11105	NC_011729	GCTA	2	8	515247	515254	25 %	25 %	25 %	25 %	218437471
11106	NC_011729	AAT	2	6	515343	515348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437471
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11108	NC_011729	GA	3	6	515456	515461	50 %	0 %	50 %	0 %	218437471
11109	NC_011729	ATC	2	6	515496	515501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437471
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11113	NC_011729	C	6	6	515614	515619	0 %	0 %	0 %	100 %	218437471
11114	NC_011729	CTTT	2	8	515636	515643	0 %	75 %	0 %	25 %	218437471
11115	NC_011729	TCT	2	6	515662	515667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437471
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11119	NC_011729	TTAA	2	8	515869	515876	50 %	50 %	0 %	0 %	218437471
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11121	NC_011729	ATA	2	6	515918	515923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11494	NC_011729	GGTTTG	2	12	534475	534486	0 %	50 %	50 %	0 %	218437485
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11496	NC_011729	A	6	6	534569	534574	100 %	0 %	0 %	0 %	218437485
11497	NC_011729	A	6	6	534580	534585	100 %	0 %	0 %	0 %	218437485
11498	NC_011729	TAT	2	6	534650	534655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437485
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