MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 126376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011729	CAT	2	6	23126	23131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437033
502	NC_011729	AT	3	6	23210	23215	50 %	50 %	0 %	0 %	218437033
503	NC_011729	ATTT	2	8	23258	23265	25 %	75 %	0 %	0 %	218437033
504	NC_011729	T	6	6	23313	23318	0 %	100 %	0 %	0 %	218437033
505	NC_011729	CAA	2	6	23328	23333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437033
506	NC_011729	TAACT	2	10	23339	23348	40 %	40 %	0 %	20 %	218437033
507	NC_011729	ATA	2	6	23362	23367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437033
508	NC_011729	CCG	2	6	23375	23380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218437033
509	NC_011729	T	6	6	23413	23418	0 %	100 %	0 %	0 %	218437033
510	NC_011729	ATGG	2	8	23476	23483	25 %	25 %	50 %	0 %	218437033
511	NC_011729	GTT	2	6	23504	23509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437033
512	NC_011729	T	7	7	23531	23537	0 %	100 %	0 %	0 %	218437033
513	NC_011729	TGC	2	6	23558	23563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437033
514	NC_011729	ATT	2	6	23605	23610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437033
515	NC_011729	TAA	2	6	23648	23653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437033
516	NC_011729	GGA	2	6	23715	23720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437033
517	NC_011729	TTA	2	6	23754	23759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437033
518	NC_011729	AAT	2	6	23777	23782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437033
519	NC_011729	T	7	7	23801	23807	0 %	100 %	0 %	0 %	218437033
520	NC_011729	T	6	6	23892	23897	0 %	100 %	0 %	0 %	218437033
521	NC_011729	TAT	2	6	23988	23993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437033
522	NC_011729	T	6	6	24041	24046	0 %	100 %	0 %	0 %	218437033
523	NC_011729	ATT	2	6	24066	24071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437033
524	NC_011729	AG	3	6	24097	24102	50 %	0 %	50 %	0 %	218437033
525	NC_011729	T	6	6	24132	24137	0 %	100 %	0 %	0 %	218437033
526	NC_011729	CTAT	2	8	24169	24176	25 %	50 %	0 %	25 %	218437033
527	NC_011729	T	6	6	24191	24196	0 %	100 %	0 %	0 %	218437033
528	NC_011729	A	6	6	24260	24265	100 %	0 %	0 %	0 %	218437033
529	NC_011729	T	7	7	24319	24325	0 %	100 %	0 %	0 %	218437033
530	NC_011729	GGA	2	6	24378	24383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437033
531	NC_011729	GCG	2	6	24387	24392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437033
532	NC_011729	CAA	2	6	24402	24407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437033
533	NC_011729	ATT	2	6	24415	24420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437033
534	NC_011729	GAATG	2	10	24442	24451	40 %	20 %	40 %	0 %	218437033
535	NC_011729	CTA	2	6	24478	24483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437033
536	NC_011729	GTA	2	6	24486	24491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437033
537	NC_011729	GCA	2	6	24507	24512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437033
538	NC_011729	ATT	2	6	24592	24597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437033
539	NC_011729	CTC	2	6	24676	24681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437033
540	NC_011729	AAT	2	6	24703	24708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437033
541	NC_011729	ATC	2	6	24736	24741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437034
542	NC_011729	T	7	7	24760	24766	0 %	100 %	0 %	0 %	218437034
543	NC_011729	TTGCC	2	10	24792	24801	0 %	40 %	20 %	40 %	218437034
544	NC_011729	GTT	2	6	24828	24833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437034
545	NC_011729	TAA	2	6	24878	24883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437034
546	NC_011729	GAT	2	6	24894	24899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437034
547	NC_011729	TGT	2	6	24965	24970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437034
548	NC_011729	ATA	2	6	25024	25029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437034
549	NC_011729	CGT	2	6	25104	25109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437034
550	NC_011729	TAA	2	6	25118	25123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437034
551	NC_011729	T	6	6	25163	25168	0 %	100 %	0 %	0 %	218437034
552	NC_011729	CT	3	6	25215	25220	0 %	50 %	0 %	50 %	218437034
553	NC_011729	T	6	6	25231	25236	0 %	100 %	0 %	0 %	218437034
554	NC_011729	CGT	2	6	25239	25244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437034
555	NC_011729	TTGAAA	2	12	25279	25290	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218437034
556	NC_011729	AGA	2	6	25334	25339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437034
557	NC_011729	TCC	2	6	25361	25366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437034
558	NC_011729	TTA	2	6	25425	25430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437034
559	NC_011729	T	6	6	25458	25463	0 %	100 %	0 %	0 %	218437034
560	NC_011729	TAT	2	6	25580	25585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437034
561	NC_011729	T	6	6	25595	25600	0 %	100 %	0 %	0 %	218437034
562	NC_011729	TTAT	2	8	25667	25674	25 %	75 %	0 %	0 %	218437034
563	NC_011729	TGA	2	6	25762	25767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437035
564	NC_011729	A	6	6	25767	25772	100 %	0 %	0 %	0 %	218437035
565	NC_011729	A	6	6	25788	25793	100 %	0 %	0 %	0 %	218437035
566	NC_011729	G	6	6	25814	25819	0 %	0 %	100 %	0 %	218437035
567	NC_011729	ATT	2	6	25823	25828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437035
568	NC_011729	T	6	6	25827	25832	0 %	100 %	0 %	0 %	218437035
569	NC_011729	TCA	2	6	25834	25839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437035
570	NC_011729	CTC	2	6	25885	25890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437035
571	NC_011729	AGC	2	6	25913	25918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437035
572	NC_011729	GGGTT	2	10	25949	25958	0 %	40 %	60 %	0 %	218437035
573	NC_011729	TAA	2	6	26090	26095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437035
574	NC_011729	AGG	2	6	26099	26104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437035
575	NC_011729	AGC	2	6	26114	26119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437035
576	NC_011729	GT	3	6	26128	26133	0 %	50 %	50 %	0 %	218437035
577	NC_011729	GCA	3	9	26154	26162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437035
578	NC_011729	TTA	2	6	26166	26171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437035
579	NC_011729	TCA	2	6	26186	26191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437035
580	NC_011729	A	6	6	26318	26323	100 %	0 %	0 %	0 %	218437035
581	NC_011729	GT	3	6	26479	26484	0 %	50 %	50 %	0 %	218437035
582	NC_011729	ATT	2	6	26564	26569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437035
583	NC_011729	TAT	2	6	26594	26599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437035
584	NC_011729	CT	3	6	26614	26619	0 %	50 %	0 %	50 %	218437035
585	NC_011729	TTA	2	6	26626	26631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437035
586	NC_011729	ATG	2	6	26733	26738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_011729	ATT	2	6	26772	26777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437036
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591	NC_011729	ATC	2	6	26936	26941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437036
592	NC_011729	CAT	2	6	26943	26948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437036
593	NC_011729	A	6	6	27083	27088	100 %	0 %	0 %	0 %	218437036
594	NC_011729	TAA	2	6	27172	27177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437036
595	NC_011729	AGG	2	6	27256	27261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437036
596	NC_011729	GTT	2	6	27297	27302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437036
597	NC_011729	GAT	2	6	27330	27335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437036
598	NC_011729	GTTT	2	8	27383	27390	0 %	75 %	25 %	0 %	218437036
599	NC_011729	GGT	2	6	27472	27477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437036
600	NC_011729	TGA	2	6	27482	27487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437036
601	NC_011729	TGT	2	6	27506	27511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437036
602	NC_011729	A	6	6	27524	27529	100 %	0 %	0 %	0 %	218437036
603	NC_011729	GAC	2	6	27609	27614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437036
604	NC_011729	AACCA	2	10	27617	27626	60 %	0 %	0 %	40 %	218437036
605	NC_011729	TGT	2	6	27656	27661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437036
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608	NC_011729	ATA	2	6	27764	27769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437036
609	NC_011729	TAA	2	6	27805	27810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437036
610	NC_011729	ATG	2	6	27928	27933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437036
611	NC_011729	TTC	2	6	27940	27945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437036
612	NC_011729	TTG	2	6	27955	27960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437036
613	NC_011729	TTG	2	6	27979	27984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437036
614	NC_011729	AATG	2	8	28035	28042	50 %	25 %	25 %	0 %	218437036
615	NC_011729	TAA	2	6	28115	28120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437036
616	NC_011729	ACC	2	6	28144	28149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218437036
617	NC_011729	TAA	2	6	28177	28182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437036
618	NC_011729	AAT	2	6	28197	28202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437036
619	NC_011729	TC	3	6	28208	28213	0 %	50 %	0 %	50 %	218437036
620	NC_011729	AAT	2	6	28282	28287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437036
621	NC_011729	CTT	2	6	28296	28301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437036
622	NC_011729	ATT	2	6	28411	28416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437036
623	NC_011729	GAAT	2	8	28470	28477	50 %	25 %	25 %	0 %	218437036
624	NC_011729	CAT	2	6	28554	28559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437036
625	NC_011729	ACA	2	6	28562	28567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437036
626	NC_011729	TA	3	6	28629	28634	50 %	50 %	0 %	0 %	218437036
627	NC_011729	AAT	3	9	28654	28662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437036
628	NC_011729	CTT	2	6	28722	28727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437036
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630	NC_011729	T	6	6	28783	28788	0 %	100 %	0 %	0 %	218437036
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