MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 126376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
63001	NC_011729	TCA	2	6	2953565	2953570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63002	NC_011729	TATTG	2	10	2953667	2953676	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63003	NC_011729	GCT	2	6	2953721	2953726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218439622
63004	NC_011729	GTG	2	6	2953728	2953733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218439622
63005	NC_011729	TCC	2	6	2953747	2953752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218439622
63006	NC_011729	GAT	2	6	2953759	2953764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218439622
63007	NC_011729	GGCG	2	8	2953878	2953885	0 %	0 %	75 %	25 %	218439622
63008	NC_011729	CTCCC	2	10	2953926	2953935	0 %	20 %	0 %	80 %	218439622
63009	NC_011729	CGGCAT	2	12	2953936	2953947	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218439622
63010	NC_011729	ATT	2	6	2953979	2953984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218439622
63011	NC_011729	CCT	2	6	2953988	2953993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218439622
63012	NC_011729	CAA	2	6	2954003	2954008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218439622
63013	NC_011729	GATC	2	8	2954011	2954018	25 %	25 %	25 %	25 %	218439622
63014	NC_011729	AAG	2	6	2954085	2954090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218439622
63015	NC_011729	CAAT	2	8	2954095	2954102	50 %	25 %	0 %	25 %	218439622
63016	NC_011729	TAT	2	6	2954182	2954187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218439622
63017	NC_011729	TCC	2	6	2954217	2954222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218439622
63018	NC_011729	TTG	2	6	2954228	2954233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218439622
63019	NC_011729	TGG	2	6	2954250	2954255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218439622
63020	NC_011729	ATTG	2	8	2954276	2954283	25 %	50 %	25 %	0 %	218439622
63021	NC_011729	AGT	2	6	2954293	2954298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218439622
63022	NC_011729	ATG	2	6	2954343	2954348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218439622
63023	NC_011729	CAA	3	9	2954366	2954374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218439622
63024	NC_011729	GTG	2	6	2954375	2954380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218439622
63025	NC_011729	AGAA	2	8	2954449	2954456	75 %	0 %	25 %	0 %	218439622
63026	NC_011729	TAT	2	6	2954568	2954573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218439622
63027	NC_011729	TTA	2	6	2954772	2954777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218439623
63028	NC_011729	AGA	2	6	2954824	2954829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218439623
63029	NC_011729	ATT	2	6	2954842	2954847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218439623
63030	NC_011729	ATC	3	9	2954886	2954894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218439623
63031	NC_011729	GGA	2	6	2954996	2955001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218439623
63032	NC_011729	GAA	2	6	2955005	2955010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218439623
63033	NC_011729	TTA	2	6	2955027	2955032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218439623
63034	NC_011729	CTT	2	6	2955053	2955058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218439623
63035	NC_011729	TAT	2	6	2955081	2955086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218439623
63036	NC_011729	TCAA	2	8	2955108	2955115	50 %	25 %	0 %	25 %	218439623
63037	NC_011729	AAT	2	6	2955116	2955121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218439623
63038	NC_011729	GA	3	6	2955130	2955135	50 %	0 %	50 %	0 %	218439623
63039	NC_011729	TAC	2	6	2955220	2955225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218439623
63040	NC_011729	A	6	6	2955417	2955422	100 %	0 %	0 %	0 %	218439623
63041	NC_011729	AAC	2	6	2955445	2955450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218439623
63042	NC_011729	A	7	7	2955467	2955473	100 %	0 %	0 %	0 %	218439623
63043	NC_011729	A	7	7	2955491	2955497	100 %	0 %	0 %	0 %	218439623
63044	NC_011729	TATC	2	8	2955516	2955523	25 %	50 %	0 %	25 %	218439623
63045	NC_011729	ATT	2	6	2955547	2955552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218439623
63046	NC_011729	ATT	2	6	2955648	2955653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218439623
63047	NC_011729	GGAT	2	8	2955752	2955759	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63048	NC_011729	AAG	2	6	2955807	2955812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63049	NC_011729	A	6	6	2955830	2955835	100 %	0 %	0 %	0 %	218439624
63050	NC_011729	TC	3	6	2955836	2955841	0 %	50 %	0 %	50 %	218439624
63051	NC_011729	TAAT	2	8	2955873	2955880	50 %	50 %	0 %	0 %	218439624
63052	NC_011729	GTT	2	6	2955892	2955897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218439624
63053	NC_011729	GAG	2	6	2955919	2955924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218439624
63054	NC_011729	CA	3	6	2955934	2955939	50 %	0 %	0 %	50 %	218439624
63055	NC_011729	GCG	2	6	2955948	2955953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218439624
63056	NC_011729	GAT	2	6	2955982	2955987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218439624
63057	NC_011729	CAA	2	6	2955991	2955996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218439624
63058	NC_011729	GAG	2	6	2956039	2956044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218439624
63059	NC_011729	TGG	2	6	2956062	2956067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218439624
63060	NC_011729	TAT	2	6	2956107	2956112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63061	NC_011729	AAC	2	6	2956132	2956137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63062	NC_011729	ATG	2	6	2956160	2956165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63063	NC_011729	TGAT	2	8	2956191	2956198	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63064	NC_011729	AAAT	2	8	2956207	2956214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63065	NC_011729	TTTAA	2	10	2956290	2956299	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63066	NC_011729	T	6	6	2956355	2956360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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63069	NC_011729	ATC	2	6	2956413	2956418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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63072	NC_011729	ATTT	2	8	2956473	2956480	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63073	NC_011729	A	6	6	2956508	2956513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63074	NC_011729	A	7	7	2956534	2956540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63075	NC_011729	T	7	7	2956566	2956572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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63091	NC_011729	AAAC	2	8	2957212	2957219	75 %	0 %	0 %	25 %	218439625
63092	NC_011729	T	6	6	2957269	2957274	0 %	100 %	0 %	0 %	218439625
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63107	NC_011729	GTC	2	6	2958066	2958071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218439626
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