MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 126376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011729	AGCA	2	8	254803	254810	50 %	0 %	25 %	25 %	218437241
5502	NC_011729	ATA	2	6	254825	254830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437241
5503	NC_011729	TCAT	2	8	254842	254849	25 %	50 %	0 %	25 %	218437241
5504	NC_011729	GTC	2	6	254887	254892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_011729	A	6	6	254967	254972	100 %	0 %	0 %	0 %	218437242
5506	NC_011729	TTA	2	6	254992	254997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437242
5507	NC_011729	A	7	7	255130	255136	100 %	0 %	0 %	0 %	218437242
5508	NC_011729	AAAC	2	8	255236	255243	75 %	0 %	0 %	25 %	218437242
5509	NC_011729	AAG	3	9	255269	255277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437242
5510	NC_011729	ACA	2	6	255402	255407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437242
5511	NC_011729	ATT	2	6	255458	255463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437242
5512	NC_011729	AGG	2	6	255510	255515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437242
5513	NC_011729	AGG	2	6	255522	255527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437242
5514	NC_011729	AAGA	2	8	255587	255594	75 %	0 %	25 %	0 %	218437242
5515	NC_011729	ACC	2	6	255667	255672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218437242
5516	NC_011729	TTG	2	6	255711	255716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437242
5517	NC_011729	GAA	2	6	255736	255741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437242
5518	NC_011729	ACA	2	6	255882	255887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437242
5519	NC_011729	ATG	2	6	255950	255955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437242
5520	NC_011729	CAG	2	6	256040	256045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437242
5521	NC_011729	ATT	2	6	256102	256107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437242
5522	NC_011729	GATCG	2	10	256153	256162	20 %	20 %	40 %	20 %	218437242
5523	NC_011729	GAT	2	6	256216	256221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437242
5524	NC_011729	ATTG	2	8	256415	256422	25 %	50 %	25 %	0 %	218437243
5525	NC_011729	TAT	2	6	256493	256498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437243
5526	NC_011729	CGAC	2	8	256513	256520	25 %	0 %	25 %	50 %	218437243
5527	NC_011729	TCC	2	6	256530	256535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437243
5528	NC_011729	TTG	2	6	256563	256568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437243
5529	NC_011729	AG	3	6	256569	256574	50 %	0 %	50 %	0 %	218437243
5530	NC_011729	CTC	2	6	256616	256621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437243
5531	NC_011729	ATT	2	6	256650	256655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437243
5532	NC_011729	TTTA	2	8	256671	256678	25 %	75 %	0 %	0 %	218437243
5533	NC_011729	AGC	2	6	256755	256760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437243
5534	NC_011729	ATC	2	6	256782	256787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437243
5535	NC_011729	TTG	2	6	256803	256808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437243
5536	NC_011729	CAT	2	6	256877	256882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437243
5537	NC_011729	GA	3	6	256935	256940	50 %	0 %	50 %	0 %	218437243
5538	NC_011729	TTC	2	6	256950	256955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437243
5539	NC_011729	GAT	2	6	257033	257038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437243
5540	NC_011729	ATC	2	6	257070	257075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437243
5541	NC_011729	TGA	2	6	257083	257088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437243
5542	NC_011729	AGCATT	2	12	257103	257114	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218437243
5543	NC_011729	TCCA	2	8	257227	257234	25 %	25 %	0 %	50 %	218437243
5544	NC_011729	T	6	6	257267	257272	0 %	100 %	0 %	0 %	218437243
5545	NC_011729	AAG	2	6	257290	257295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437243
5546	NC_011729	GCC	2	6	257446	257451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218437243
5547	NC_011729	T	6	6	257457	257462	0 %	100 %	0 %	0 %	218437243
5548	NC_011729	CAT	2	6	257465	257470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437243
5549	NC_011729	CCCA	2	8	257560	257567	25 %	0 %	0 %	75 %	218437243
5550	NC_011729	TTG	2	6	257577	257582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437243
5551	NC_011729	CCAT	2	8	257610	257617	25 %	25 %	0 %	50 %	218437243
5552	NC_011729	AGTTG	2	10	257716	257725	20 %	40 %	40 %	0 %	218437243
5553	NC_011729	T	7	7	257874	257880	0 %	100 %	0 %	0 %	218437243
5554	NC_011729	TTA	2	6	257916	257921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_011729	ATA	2	6	257926	257931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_011729	TAA	2	6	257945	257950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_011729	CTT	2	6	257964	257969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_011729	T	6	6	257992	257997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_011729	TTTG	2	8	258000	258007	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_011729	ATT	2	6	258039	258044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_011729	AAT	3	9	258046	258054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_011729	TTTTA	2	10	258059	258068	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_011729	ACTG	2	8	258103	258110	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5564	NC_011729	T	6	6	258113	258118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_011729	ATCA	2	8	258233	258240	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5566	NC_011729	GAA	2	6	258281	258286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_011729	CAA	2	6	258302	258307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_011729	TATAT	2	10	258312	258321	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_011729	CAA	2	6	258322	258327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_011729	TAA	2	6	258362	258367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437244
5571	NC_011729	CAT	2	6	258380	258385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437244
5572	NC_011729	CT	3	6	258397	258402	0 %	50 %	0 %	50 %	218437244
5573	NC_011729	TGG	2	6	258440	258445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437244
5574	NC_011729	AGA	2	6	258456	258461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437244
5575	NC_011729	CAA	2	6	258486	258491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437244
5576	NC_011729	TAA	2	6	258554	258559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437244
5577	NC_011729	ATT	2	6	258564	258569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437244
5578	NC_011729	CTA	2	6	258602	258607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437244
5579	NC_011729	TGT	2	6	258610	258615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437244
5580	NC_011729	CCT	2	6	258616	258621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437244
5581	NC_011729	CTT	3	9	258704	258712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437244
5582	NC_011729	ACC	2	6	258729	258734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218437244
5583	NC_011729	TCA	2	6	258745	258750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437244
5584	NC_011729	AAT	2	6	258751	258756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437244
5585	NC_011729	AATAGC	2	12	258846	258857	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218437244
5586	NC_011729	TCT	2	6	258949	258954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437244
5587	NC_011729	CAT	2	6	258962	258967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437244
5588	NC_011729	GTC	2	6	259026	259031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437244
5589	NC_011729	ATT	2	6	259119	259124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437244
5590	NC_011729	TGA	2	6	259168	259173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437244
5591	NC_011729	T	6	6	259242	259247	0 %	100 %	0 %	0 %	218437244
5592	NC_011729	TCA	2	6	259258	259263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437244
5593	NC_011729	CTTTA	2	10	259347	259356	20 %	60 %	0 %	20 %	218437244
5594	NC_011729	ACT	2	6	259414	259419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437244
5595	NC_011729	TTG	2	6	259544	259549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437244
5596	NC_011729	AAC	2	6	259590	259595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437244
5597	NC_011729	TACC	2	8	259643	259650	25 %	25 %	0 %	50 %	218437244
5598	NC_011729	TTG	2	6	259659	259664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437244
5599	NC_011729	GTTCT	2	10	259722	259731	0 %	60 %	20 %	20 %	218437244
5600	NC_011729	GAA	2	6	259771	259776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437244
5601	NC_011729	CTC	2	6	259850	259855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437244
5602	NC_011729	CAT	2	6	259895	259900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437244
5603	NC_011729	ATC	2	6	260109	260114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437244
5604	NC_011729	AAT	2	6	260222	260227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437244
5605	NC_011729	GAATA	2	10	260258	260267	60 %	20 %	20 %	0 %	218437244
5606	NC_011729	AAT	2	6	260338	260343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437244
5607	NC_011729	TAAATT	2	12	260411	260422	50 %	50 %	0 %	0 %	218437244
5608	NC_011729	TAC	2	6	260424	260429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437244
5609	NC_011729	TGT	2	6	260558	260563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437244
5610	NC_011729	ATA	2	6	260577	260582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437244
5611	NC_011729	CAG	2	6	260615	260620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437244
5612	NC_011729	CCT	2	6	260623	260628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437244
5613	NC_011729	TAA	2	6	260639	260644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437244
5614	NC_011729	CAA	2	6	260666	260671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437244
5615	NC_011729	GGAG	2	8	260679	260686	25 %	0 %	75 %	0 %	218437244
5616	NC_011729	TAA	2	6	260757	260762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437244
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5618	NC_011729	GTTTT	2	10	260818	260827	0 %	80 %	20 %	0 %	218437244
5619	NC_011729	TTA	2	6	260938	260943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437244
5620	NC_011729	A	6	6	260961	260966	100 %	0 %	0 %	0 %	218437244
5621	NC_011729	GGTT	2	8	261032	261039	0 %	50 %	50 %	0 %	218437244
5622	NC_011729	TAT	2	6	261113	261118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437244
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