MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 96488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_011726	TG	3	6	1220901	1220906	0 %	50 %	50 %	0 %	218246022
25002	NC_011726	CCT	2	6	1220999	1221004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218246023
25003	NC_011726	AT	3	6	1221032	1221037	50 %	50 %	0 %	0 %	218246023
25004	NC_011726	CAG	2	6	1221064	1221069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218246023
25005	NC_011726	CAT	3	9	1221093	1221101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218246023
25006	NC_011726	AAC	2	6	1221131	1221136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218246023
25007	NC_011726	TGT	2	6	1221311	1221316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218246023
25008	NC_011726	CCCAA	2	10	1221336	1221345	40 %	0 %	0 %	60 %	218246023
25009	NC_011726	GAT	2	6	1221421	1221426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25010	NC_011726	GTC	2	6	1221508	1221513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25011	NC_011726	TTC	2	6	1221540	1221545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25012	NC_011726	CTG	2	6	1221588	1221593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218246024
25013	NC_011726	TTA	2	6	1221598	1221603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218246024
25014	NC_011726	CCCA	2	8	1221604	1221611	25 %	0 %	0 %	75 %	218246024
25015	NC_011726	CGT	2	6	1221653	1221658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218246024
25016	NC_011726	C	6	6	1221702	1221707	0 %	0 %	0 %	100 %	218246024
25017	NC_011726	CAA	2	6	1221713	1221718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218246024
25018	NC_011726	TGC	2	6	1221741	1221746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218246024
25019	NC_011726	A	6	6	1221753	1221758	100 %	0 %	0 %	0 %	218246024
25020	NC_011726	TTC	2	6	1221760	1221765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218246024
25021	NC_011726	ACA	2	6	1221868	1221873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218246024
25022	NC_011726	TAG	2	6	1221888	1221893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218246024
25023	NC_011726	CAGT	2	8	1221970	1221977	25 %	25 %	25 %	25 %	218246024
25024	NC_011726	T	7	7	1221981	1221987	0 %	100 %	0 %	0 %	218246024
25025	NC_011726	CCAA	2	8	1221992	1221999	50 %	0 %	0 %	50 %	218246024
25026	NC_011726	GAC	2	6	1222021	1222026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218246024
25027	NC_011726	GAGC	2	8	1222082	1222089	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25028	NC_011726	GTCG	2	8	1222234	1222241	0 %	25 %	50 %	25 %	218246025
25029	NC_011726	GT	3	6	1222251	1222256	0 %	50 %	50 %	0 %	218246025
25030	NC_011726	CCT	2	6	1222271	1222276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218246025
25031	NC_011726	GTA	2	6	1222337	1222342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218246025
25032	NC_011726	GAT	2	6	1222345	1222350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218246025
25033	NC_011726	AAGGA	2	10	1222389	1222398	60 %	0 %	40 %	0 %	218246025
25034	NC_011726	CAA	2	6	1222421	1222426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218246025
25035	NC_011726	ATT	2	6	1222463	1222468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218246025
25036	NC_011726	AAC	2	6	1222539	1222544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218246025
25037	NC_011726	GCA	2	6	1222559	1222564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218246025
25038	NC_011726	C	6	6	1222593	1222598	0 %	0 %	0 %	100 %	218246025
25039	NC_011726	ATT	2	6	1222760	1222765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218246025
25040	NC_011726	TTA	2	6	1222838	1222843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218246025
25041	NC_011726	CGTC	2	8	1222852	1222859	0 %	25 %	25 %	50 %	218246025
25042	NC_011726	T	6	6	1222888	1222893	0 %	100 %	0 %	0 %	218246025
25043	NC_011726	GCA	2	6	1222961	1222966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218246025
25044	NC_011726	CAA	2	6	1222979	1222984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218246025
25045	NC_011726	A	6	6	1222991	1222996	100 %	0 %	0 %	0 %	218246025
25046	NC_011726	CGTCAT	2	12	1223017	1223028	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218246025
25047	NC_011726	GACG	2	8	1223035	1223042	25 %	0 %	50 %	25 %	218246025
25048	NC_011726	CGA	2	6	1223348	1223353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218246025
25049	NC_011726	ACT	2	6	1223367	1223372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218246025
25050	NC_011726	TCAA	2	8	1223397	1223404	50 %	25 %	0 %	25 %	218246025
25051	NC_011726	CAA	2	6	1223487	1223492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218246025
25052	NC_011726	G	6	6	1223561	1223566	0 %	0 %	100 %	0 %	218246025
25053	NC_011726	ATT	2	6	1223651	1223656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218246025
25054	NC_011726	ATG	2	6	1223687	1223692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218246025
25055	NC_011726	TAT	2	6	1223728	1223733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218246025
25056	NC_011726	TGG	2	6	1223749	1223754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218246025
25057	NC_011726	GTG	2	6	1223870	1223875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218246025
25058	NC_011726	TCC	2	6	1223968	1223973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218246025
25059	NC_011726	CATT	2	8	1224024	1224031	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25060	NC_011726	AGA	2	6	1224051	1224056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25061	NC_011726	TAA	2	6	1224079	1224084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25062	NC_011726	GTA	2	6	1224154	1224159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25063	NC_011726	CTA	2	6	1224295	1224300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218246026
25064	NC_011726	ATTT	2	8	1224370	1224377	25 %	75 %	0 %	0 %	218246026
25065	NC_011726	T	8	8	1224375	1224382	0 %	100 %	0 %	0 %	218246026
25066	NC_011726	ATA	2	6	1224398	1224403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218246026
25067	NC_011726	CAT	2	6	1224454	1224459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218246026
25068	NC_011726	CTTCT	2	10	1224475	1224484	0 %	60 %	0 %	40 %	218246026
25069	NC_011726	TGG	2	6	1224554	1224559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218246026
25070	NC_011726	AAAT	2	8	1224646	1224653	75 %	25 %	0 %	0 %	218246026
25071	NC_011726	AGTT	2	8	1224673	1224680	25 %	50 %	25 %	0 %	218246026
25072	NC_011726	TCT	2	6	1224711	1224716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218246026
25073	NC_011726	T	9	9	1224841	1224849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25074	NC_011726	TGA	2	6	1224911	1224916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25075	NC_011726	TAG	2	6	1224934	1224939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25076	NC_011726	GGA	2	6	1225115	1225120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218246027
25077	NC_011726	CGT	2	6	1225228	1225233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218246027
25078	NC_011726	AGTG	2	8	1225240	1225247	25 %	25 %	50 %	0 %	218246027
25079	NC_011726	TCAG	2	8	1225282	1225289	25 %	25 %	25 %	25 %	218246027
25080	NC_011726	TGC	2	6	1225350	1225355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218246027
25081	NC_011726	AATACG	2	12	1225397	1225408	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218246027
25082	NC_011726	TAG	2	6	1225410	1225415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218246027
25083	NC_011726	AGTG	2	8	1225442	1225449	25 %	25 %	50 %	0 %	218246027
25084	NC_011726	T	6	6	1225486	1225491	0 %	100 %	0 %	0 %	218246027
25085	NC_011726	TAG	2	6	1225512	1225517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218246027
25086	NC_011726	A	9	9	1225586	1225594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25087	NC_011726	A	6	6	1225598	1225603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25088	NC_011726	AAC	2	6	1225634	1225639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218246028
25089	NC_011726	AGC	2	6	1225682	1225687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218246028
25090	NC_011726	CTT	2	6	1225773	1225778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218246028
25091	NC_011726	ATT	2	6	1225848	1225853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218246028
25092	NC_011726	ATCAA	2	10	1225861	1225870	60 %	20 %	0 %	20 %	218246028
25093	NC_011726	AT	3	6	1225882	1225887	50 %	50 %	0 %	0 %	218246028
25094	NC_011726	GTA	2	6	1225948	1225953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218246028
25095	NC_011726	GTGG	2	8	1226029	1226036	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25096	NC_011726	CTT	2	6	1226060	1226065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25097	NC_011726	CAT	2	6	1226171	1226176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218246029
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25099	NC_011726	CAT	3	9	1226300	1226308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218246029
25100	NC_011726	GTT	2	6	1226340	1226345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218246030
25101	NC_011726	AAC	2	6	1226358	1226363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218246030
25102	NC_011726	TGGCAG	2	12	1226429	1226440	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	218246030
25103	NC_011726	CTG	2	6	1226466	1226471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218246030
25104	NC_011726	CCT	2	6	1226511	1226516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25105	NC_011726	AGA	2	6	1226526	1226531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25106	NC_011726	TA	3	6	1226582	1226587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25107	NC_011726	CAT	2	6	1226715	1226720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25108	NC_011726	A	6	6	1226791	1226796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25109	NC_011726	ATG	2	6	1226868	1226873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25110	NC_011726	AAC	2	6	1226939	1226944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218246031
25111	NC_011726	GAT	2	6	1226983	1226988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218246031
25112	NC_011726	ACCC	2	8	1227017	1227024	25 %	0 %	0 %	75 %	218246031
25113	NC_011726	TCC	2	6	1227072	1227077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218246031
25114	NC_011726	CGA	2	6	1227189	1227194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218246031
25115	NC_011726	TAC	2	6	1227226	1227231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218246031
25116	NC_011726	GCC	2	6	1227339	1227344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218246031
25117	NC_011726	TTG	2	6	1227413	1227418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218246031
25118	NC_011726	GGT	2	6	1227422	1227427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218246031
25119	NC_011726	ATC	2	6	1227515	1227520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218246031
25120	NC_011726	GCC	3	9	1227522	1227530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218246031
25121	NC_011726	TGGAA	2	10	1227566	1227575	40 %	20 %	40 %	0 %	218246031
25122	NC_011726	CT	3	6	1227608	1227613	0 %	50 %	0 %	50 %	218246031
25123	NC_011726	TTC	2	6	1227656	1227661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218246031
25124	NC_011726	GGT	2	6	1227743	1227748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218246031
25125	NC_011726	CAT	2	6	1227754	1227759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218246031
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25129	NC_011726	GGGCA	2	10	1227824	1227833	20 %	0 %	60 %	20 %	218246031
25130	NC_011726	AGG	2	6	1227937	1227942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218246031
25131	NC_011726	TTTGA	2	10	1228058	1228067	20 %	60 %	20 %	0 %	218246031
25132	NC_011726	GA	3	6	1228066	1228071	50 %	0 %	50 %	0 %	218246031
25133	NC_011726	TTAATA	2	12	1228102	1228113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25134	NC_011726	G	7	7	1228275	1228281	0 %	0 %	100 %	0 %	218246032
25135	NC_011726	TTG	2	6	1228284	1228289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218246032
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25137	NC_011726	TAC	2	6	1228487	1228492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218246032
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25141	NC_011726	CTG	2	6	1228628	1228633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218246032
25142	NC_011726	CCT	2	6	1228654	1228659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218246032
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25145	NC_011726	TTG	2	6	1228788	1228793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218246032
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25148	NC_011726	GCT	2	6	1228912	1228917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218246032
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25152	NC_011726	CTG	2	6	1229291	1229296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218246032
25153	NC_011726	CTAG	2	8	1229332	1229339	25 %	25 %	25 %	25 %	218246033
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25163	NC_011726	CTTT	2	8	1229738	1229745	0 %	75 %	0 %	25 %	218246033
25164	NC_011726	TAC	2	6	1229899	1229904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25165	NC_011726	AATT	2	8	1229911	1229918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25166	NC_011726	CGG	2	6	1229964	1229969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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25177	NC_011726	AAT	2	6	1230832	1230837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25178	NC_011726	ATT	2	6	1230843	1230848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218246035
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25182	NC_011726	TAAT	2	8	1231002	1231009	50 %	50 %	0 %	0 %	218246035
25183	NC_011726	TAAT	2	8	1231056	1231063	50 %	50 %	0 %	0 %	218246035
25184	NC_011726	TCA	2	6	1231085	1231090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218246035
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25204	NC_011726	AG	3	6	1232228	1232233	50 %	0 %	50 %	0 %	218246036
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25206	NC_011726	AGC	2	6	1232329	1232334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218246036
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25211	NC_011726	CTT	2	6	1232608	1232613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25212	NC_011726	ACTA	2	8	1232679	1232686	50 %	25 %	0 %	25 %	218246037
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25215	NC_011726	CTT	2	6	1232756	1232761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218246037
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25219	NC_011726	CAT	2	6	1233050	1233055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218246037
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25221	NC_011726	ATC	2	6	1233093	1233098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218246037
25222	NC_011726	GTTGA	2	10	1233156	1233165	20 %	40 %	40 %	0 %	218246037
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25224	NC_011726	TGAT	2	8	1233259	1233266	25 %	50 %	25 %	0 %	218246037
25225	NC_011726	TTTC	2	8	1233310	1233317	0 %	75 %	0 %	25 %	218246037
25226	NC_011726	A	6	6	1233361	1233366	100 %	0 %	0 %	0 %	218246037
25227	NC_011726	T	6	6	1233453	1233458	0 %	100 %	0 %	0 %	218246037
25228	NC_011726	CG	3	6	1233495	1233500	0 %	0 %	50 %	50 %	218246037
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25230	NC_011726	TAA	2	6	1233516	1233521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218246037
25231	NC_011726	TGA	2	6	1233535	1233540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218246037
25232	NC_011726	GAC	2	6	1233551	1233556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218246037
25233	NC_011726	CTC	2	6	1233611	1233616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218246037
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25235	NC_011726	CG	3	6	1233810	1233815	0 %	0 %	50 %	50 %	218246037
25236	NC_011726	GTA	2	6	1233829	1233834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218246037
25237	NC_011726	TCT	2	6	1233865	1233870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218246037
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25351	NC_011726	CGGTGG	2	12	1239627	1239638	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	218246043
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25356	NC_011726	TGA	2	6	1239938	1239943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25473	NC_011726	TC	3	6	1245059	1245064	0 %	50 %	0 %	50 %	218246048
25474	NC_011726	CAA	2	6	1245077	1245082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218246048
25475	NC_011726	CTG	2	6	1245104	1245109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218246048
25476	NC_011726	TTA	2	6	1245157	1245162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25477	NC_011726	TAAT	2	8	1245192	1245199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25478	NC_011726	ATT	2	6	1245241	1245246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218246049
25479	NC_011726	CTGA	2	8	1245255	1245262	25 %	25 %	25 %	25 %	218246049
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25482	NC_011726	CTT	2	6	1245426	1245431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218246049
25483	NC_011726	ATC	2	6	1245451	1245456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218246049
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25485	NC_011726	GA	3	6	1245560	1245565	50 %	0 %	50 %	0 %	218246049
25486	NC_011726	AATTAA	2	12	1245715	1245726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218246049
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25497	NC_011726	T	6	6	1246296	1246301	0 %	100 %	0 %	0 %	218246049
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25499	NC_011726	GTTT	2	8	1246420	1246427	0 %	75 %	25 %	0 %	218246049
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