MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 96488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_011726	TCCC	2	8	1024956	1024963	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21002	NC_011726	GTA	2	6	1025016	1025021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245833
21003	NC_011726	AGA	2	6	1025146	1025151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245833
21004	NC_011726	TCA	2	6	1025161	1025166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245833
21005	NC_011726	TTA	2	6	1025170	1025175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245833
21006	NC_011726	ATCAAA	2	12	1025223	1025234	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218245833
21007	NC_011726	TTAGCG	2	12	1025282	1025293	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218245833
21008	NC_011726	TCA	2	6	1025314	1025319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245833
21009	NC_011726	A	6	6	1025367	1025372	100 %	0 %	0 %	0 %	218245833
21010	NC_011726	AGA	2	6	1025380	1025385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245833
21011	NC_011726	GCAA	2	8	1025477	1025484	50 %	0 %	25 %	25 %	218245834
21012	NC_011726	CAA	2	6	1025490	1025495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245834
21013	NC_011726	A	6	6	1025494	1025499	100 %	0 %	0 %	0 %	218245834
21014	NC_011726	TTG	2	6	1025511	1025516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245834
21015	NC_011726	TTG	2	6	1025542	1025547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245834
21016	NC_011726	TGCTT	2	10	1025576	1025585	0 %	60 %	20 %	20 %	218245834
21017	NC_011726	ATA	2	6	1025608	1025613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245834
21018	NC_011726	AGTT	2	8	1025638	1025645	25 %	50 %	25 %	0 %	218245834
21019	NC_011726	TAA	2	6	1025732	1025737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245834
21020	NC_011726	AAC	2	6	1025905	1025910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245834
21021	NC_011726	CACG	2	8	1025986	1025993	25 %	0 %	25 %	50 %	218245834
21022	NC_011726	G	6	6	1026054	1026059	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21023	NC_011726	ATT	2	6	1026106	1026111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21024	NC_011726	TAT	2	6	1026131	1026136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245835
21025	NC_011726	AGG	2	6	1026155	1026160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245835
21026	NC_011726	AGA	2	6	1026173	1026178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245835
21027	NC_011726	CTT	2	6	1026197	1026202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245835
21028	NC_011726	TAT	2	6	1026280	1026285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245835
21029	NC_011726	AGG	2	6	1026290	1026295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245835
21030	NC_011726	AGC	2	6	1026356	1026361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245835
21031	NC_011726	TTTA	2	8	1026364	1026371	25 %	75 %	0 %	0 %	218245835
21032	NC_011726	TTC	2	6	1026380	1026385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245835
21033	NC_011726	CTG	2	6	1026454	1026459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245835
21034	NC_011726	ATT	2	6	1026505	1026510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245835
21035	NC_011726	A	6	6	1026551	1026556	100 %	0 %	0 %	0 %	218245835
21036	NC_011726	TACC	2	8	1026607	1026614	25 %	25 %	0 %	50 %	218245835
21037	NC_011726	AAG	2	6	1026646	1026651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245835
21038	NC_011726	C	6	6	1026660	1026665	0 %	0 %	0 %	100 %	218245835
21039	NC_011726	CAG	2	6	1026733	1026738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245835
21040	NC_011726	AAG	2	6	1026755	1026760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245835
21041	NC_011726	ATT	2	6	1026927	1026932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245835
21042	NC_011726	ATG	2	6	1026940	1026945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245835
21043	NC_011726	AGA	2	6	1027085	1027090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245835
21044	NC_011726	AAC	2	6	1027199	1027204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245835
21045	NC_011726	A	6	6	1027209	1027214	100 %	0 %	0 %	0 %	218245835
21046	NC_011726	CTA	2	6	1027243	1027248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21047	NC_011726	TAT	2	6	1027266	1027271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21048	NC_011726	AAT	2	6	1027300	1027305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21049	NC_011726	TCT	2	6	1027369	1027374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245836
21050	NC_011726	AGA	2	6	1027427	1027432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245836
21051	NC_011726	TAC	2	6	1027456	1027461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245836
21052	NC_011726	ACA	2	6	1027476	1027481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245836
21053	NC_011726	TTG	2	6	1027644	1027649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245836
21054	NC_011726	TGC	2	6	1027663	1027668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245836
21055	NC_011726	AAAC	2	8	1027726	1027733	75 %	0 %	0 %	25 %	218245836
21056	NC_011726	AACC	2	8	1027782	1027789	50 %	0 %	0 %	50 %	218245836
21057	NC_011726	ATT	2	6	1027796	1027801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245836
21058	NC_011726	CTT	2	6	1027924	1027929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245836
21059	NC_011726	TAA	2	6	1027934	1027939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245836
21060	NC_011726	ACAG	2	8	1027947	1027954	50 %	0 %	25 %	25 %	218245836
21061	NC_011726	TCC	2	6	1027955	1027960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245836
21062	NC_011726	AGT	2	6	1028001	1028006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245836
21063	NC_011726	AT	3	6	1028172	1028177	50 %	50 %	0 %	0 %	218245836
21064	NC_011726	ATTG	2	8	1028210	1028217	25 %	50 %	25 %	0 %	218245836
21065	NC_011726	ATC	2	6	1028273	1028278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245836
21066	NC_011726	TTGAC	2	10	1028295	1028304	20 %	40 %	20 %	20 %	218245836
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21068	NC_011726	GTG	3	9	1028424	1028432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245836
21069	NC_011726	TTAA	2	8	1028457	1028464	50 %	50 %	0 %	0 %	218245836
21070	NC_011726	CT	3	6	1028501	1028506	0 %	50 %	0 %	50 %	218245836
21071	NC_011726	TTGA	2	8	1028516	1028523	25 %	50 %	25 %	0 %	218245836
21072	NC_011726	GCA	2	6	1028613	1028618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245836
21073	NC_011726	TA	3	6	1028638	1028643	50 %	50 %	0 %	0 %	218245836
21074	NC_011726	AAG	2	6	1028653	1028658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245836
21075	NC_011726	TG	3	6	1028683	1028688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21076	NC_011726	TTA	2	6	1028703	1028708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21077	NC_011726	TA	3	6	1028750	1028755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21078	NC_011726	TAT	2	6	1028813	1028818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21079	NC_011726	T	6	6	1028824	1028829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21081	NC_011726	T	6	6	1028843	1028848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21082	NC_011726	AATT	2	8	1028853	1028860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21083	NC_011726	TTG	2	6	1028880	1028885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21084	NC_011726	AGA	2	6	1028961	1028966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21085	NC_011726	ATT	2	6	1029003	1029008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21089	NC_011726	ACG	2	6	1029232	1029237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245837
21090	NC_011726	TTA	2	6	1029254	1029259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245837
21091	NC_011726	TGC	2	6	1029267	1029272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245837
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21099	NC_011726	CGATT	2	10	1029598	1029607	20 %	40 %	20 %	20 %	218245837
21100	NC_011726	GAAA	2	8	1029695	1029702	75 %	0 %	25 %	0 %	218245837
21101	NC_011726	TTG	2	6	1029717	1029722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245837
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21103	NC_011726	GGA	2	6	1029763	1029768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245837
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21105	NC_011726	GA	3	6	1029862	1029867	50 %	0 %	50 %	0 %	218245837
21106	NC_011726	GAT	2	6	1029950	1029955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245837
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21108	NC_011726	GGT	2	6	1030209	1030214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245837
21109	NC_011726	TCAAC	2	10	1030306	1030315	40 %	20 %	0 %	40 %	218245837
21110	NC_011726	TTGAT	2	10	1030326	1030335	20 %	60 %	20 %	0 %	218245837
21111	NC_011726	ATG	2	6	1030416	1030421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245837
21112	NC_011726	AAAT	2	8	1030555	1030562	75 %	25 %	0 %	0 %	218245837
21113	NC_011726	GGT	2	6	1030621	1030626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245837
21114	NC_011726	TGAG	2	8	1030700	1030707	25 %	25 %	50 %	0 %	218245838
21115	NC_011726	AAC	2	6	1030721	1030726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245838
21116	NC_011726	CTGT	2	8	1030774	1030781	0 %	50 %	25 %	25 %	218245838
21117	NC_011726	C	6	6	1030848	1030853	0 %	0 %	0 %	100 %	218245838
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21119	NC_011726	TGG	2	6	1031090	1031095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245838
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21237	NC_011726	A	6	6	1035903	1035908	100 %	0 %	0 %	0 %	218245844
21238	NC_011726	CTT	2	6	1035923	1035928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245844
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21346	NC_011726	GCA	2	6	1041298	1041303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21348	NC_011726	TTTA	2	8	1041329	1041336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21350	NC_011726	ATT	2	6	1041403	1041408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21351	NC_011726	ATT	2	6	1041410	1041415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245848
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21354	NC_011726	TGA	2	6	1041598	1041603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245848
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21463	NC_011726	AGTT	2	8	1047099	1047106	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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21468	NC_011726	CT	3	6	1047403	1047408	0 %	50 %	0 %	50 %	218245853
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