MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 96488

< Previous12...2627282930313233343536...192193Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_011726	ATAA	2	8	733074	733081	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_011726	TAA	2	6	733109	733114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_011726	GTCAAT	2	12	733117	733128	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218245575
15004	NC_011726	AGA	2	6	733159	733164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245575
15005	NC_011726	AT	3	6	733201	733206	50 %	50 %	0 %	0 %	218245575
15006	NC_011726	ATT	2	6	733217	733222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245575
15007	NC_011726	ACA	2	6	733243	733248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245575
15008	NC_011726	TGG	2	6	733342	733347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245575
15009	NC_011726	ATT	2	6	733355	733360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245575
15010	NC_011726	TGG	2	6	733408	733413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245575
15011	NC_011726	ATT	2	6	733415	733420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245575
15012	NC_011726	T	6	6	733425	733430	0 %	100 %	0 %	0 %	218245575
15013	NC_011726	CAAA	2	8	733478	733485	75 %	0 %	0 %	25 %	218245575
15014	NC_011726	GATC	2	8	733540	733547	25 %	25 %	25 %	25 %	218245575
15015	NC_011726	AGA	2	6	733549	733554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245575
15016	NC_011726	TTTA	2	8	733569	733576	25 %	75 %	0 %	0 %	218245575
15017	NC_011726	ATG	3	9	733599	733607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245575
15018	NC_011726	GTC	2	6	733647	733652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245575
15019	NC_011726	TATT	2	8	733676	733683	25 %	75 %	0 %	0 %	218245575
15020	NC_011726	TG	3	6	733837	733842	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_011726	CGA	2	6	733901	733906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245576
15022	NC_011726	AGGAAA	2	12	733907	733918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245576
15023	NC_011726	CGG	2	6	733942	733947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218245576
15024	NC_011726	TGG	2	6	733951	733956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245576
15025	NC_011726	TAT	2	6	734063	734068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245576
15026	NC_011726	GAA	2	6	734214	734219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245576
15027	NC_011726	ACCT	2	8	734264	734271	25 %	25 %	0 %	50 %	218245576
15028	NC_011726	GTT	2	6	734304	734309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245576
15029	NC_011726	TCA	2	6	734419	734424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245576
15030	NC_011726	TGG	2	6	734464	734469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245576
15031	NC_011726	ATG	2	6	734488	734493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245576
15032	NC_011726	CCT	2	6	734578	734583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245576
15033	NC_011726	GAG	2	6	734599	734604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245576
15034	NC_011726	ATCG	2	8	734637	734644	25 %	25 %	25 %	25 %	218245576
15035	NC_011726	GGGA	2	8	734683	734690	25 %	0 %	75 %	0 %	218245576
15036	NC_011726	ATT	2	6	734726	734731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245576
15037	NC_011726	CGT	2	6	734775	734780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245576
15038	NC_011726	TGGT	2	8	734783	734790	0 %	50 %	50 %	0 %	218245576
15039	NC_011726	TG	3	6	734892	734897	0 %	50 %	50 %	0 %	218245576
15040	NC_011726	CCA	2	6	735001	735006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218245576
15041	NC_011726	GAT	2	6	735024	735029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245576
15042	NC_011726	ATT	2	6	735126	735131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245576
15043	NC_011726	TTAAT	2	10	735213	735222	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_011726	CAA	2	6	735259	735264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245577
15045	NC_011726	GGGA	2	8	735299	735306	25 %	0 %	75 %	0 %	218245577
15046	NC_011726	AAG	2	6	735371	735376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245577
15047	NC_011726	A	6	6	735391	735396	100 %	0 %	0 %	0 %	218245577
15048	NC_011726	GCT	2	6	735397	735402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245577
15049	NC_011726	ATCT	2	8	735437	735444	25 %	50 %	0 %	25 %	218245577
15050	NC_011726	TCT	2	6	735515	735520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245577
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15052	NC_011726	TGGG	2	8	735711	735718	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_011726	TAA	2	6	735729	735734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_011726	A	7	7	735754	735760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15055	NC_011726	CCA	2	6	735800	735805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15056	NC_011726	AAG	2	6	735891	735896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15057	NC_011726	TGA	2	6	735910	735915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_011726	A	6	6	735937	735942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_011726	AAC	2	6	735984	735989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15060	NC_011726	T	6	6	736085	736090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_011726	A	6	6	736091	736096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15062	NC_011726	AGT	2	6	736100	736105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15077	NC_011726	T	7	7	736658	736664	0 %	100 %	0 %	0 %	218245578
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15088	NC_011726	AT	4	8	737172	737179	50 %	50 %	0 %	0 %	218245579
15089	NC_011726	AAT	2	6	737187	737192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245579
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15107	NC_011726	TTGCT	2	10	738186	738195	0 %	60 %	20 %	20 %	218245580
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15123	NC_011726	TAA	2	6	739154	739159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245581
15124	NC_011726	CCG	2	6	739189	739194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218245581
15125	NC_011726	TAA	2	6	739250	739255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245581
15126	NC_011726	GAT	2	6	739277	739282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245581
15127	NC_011726	CAT	2	6	739312	739317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245581
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15129	NC_011726	TAA	2	6	739356	739361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245581
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15131	NC_011726	GTA	2	6	739480	739485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15132	NC_011726	AAG	2	6	739505	739510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15133	NC_011726	CTT	2	6	739521	739526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15134	NC_011726	TCA	2	6	739538	739543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15142	NC_011726	AATT	2	8	740106	740113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15143	NC_011726	CGA	2	6	740184	740189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15144	NC_011726	GCC	2	6	740233	740238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15145	NC_011726	ACT	2	6	740249	740254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245583
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15155	NC_011726	TGAT	2	8	741053	741060	25 %	50 %	25 %	0 %	218245585
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15163	NC_011726	TCCCCC	2	12	741637	741648	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
15164	NC_011726	C	7	7	741644	741650	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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15244	NC_011726	AGC	2	6	746165	746170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245589
15245	NC_011726	TCA	2	6	746173	746178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245589
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15248	NC_011726	GAA	2	6	746331	746336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245589
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15360	NC_011726	TGG	2	6	751828	751833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245594
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15362	NC_011726	GACA	2	8	751946	751953	50 %	0 %	25 %	25 %	218245594
15363	NC_011726	AAT	2	6	752049	752054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245595
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