MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 96488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_011726	CAA	2	6	685914	685919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245529
14002	NC_011726	AGG	2	6	685930	685935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245529
14003	NC_011726	A	8	8	685963	685970	100 %	0 %	0 %	0 %	218245529
14004	NC_011726	ACCA	2	8	685980	685987	50 %	0 %	0 %	50 %	218245529
14005	NC_011726	TCT	2	6	686000	686005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245529
14006	NC_011726	ATT	2	6	686042	686047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245529
14007	NC_011726	AGC	2	6	686100	686105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14008	NC_011726	GGC	2	6	686109	686114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_011726	AT	3	6	686117	686122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_011726	GAT	2	6	686133	686138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_011726	AGTATT	2	12	686227	686238	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218245530
14012	NC_011726	ATT	2	6	686408	686413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245530
14013	NC_011726	TCTCG	2	10	686423	686432	0 %	40 %	20 %	40 %	218245530
14014	NC_011726	GGA	2	6	686486	686491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245530
14015	NC_011726	CAA	2	6	686495	686500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245530
14016	NC_011726	C	6	6	686504	686509	0 %	0 %	0 %	100 %	218245530
14017	NC_011726	TGAAT	2	10	686512	686521	40 %	40 %	20 %	0 %	218245530
14018	NC_011726	AAC	2	6	686532	686537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245530
14019	NC_011726	AAC	2	6	686566	686571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245530
14020	NC_011726	ATTT	2	8	686625	686632	25 %	75 %	0 %	0 %	218245530
14021	NC_011726	AAC	2	6	686667	686672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245530
14022	NC_011726	CAA	2	6	686690	686695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245530
14023	NC_011726	ATG	2	6	686718	686723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245530
14024	NC_011726	GAA	2	6	686795	686800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245530
14025	NC_011726	ACA	2	6	686802	686807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245530
14026	NC_011726	ATA	2	6	686814	686819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245530
14027	NC_011726	CGA	2	6	686827	686832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245530
14028	NC_011726	TCA	2	6	686845	686850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245530
14029	NC_011726	GTCC	2	8	686858	686865	0 %	25 %	25 %	50 %	218245530
14030	NC_011726	ATT	2	6	686873	686878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245530
14031	NC_011726	TGA	2	6	686910	686915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245530
14032	NC_011726	CTG	2	6	686985	686990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245530
14033	NC_011726	AAT	2	6	687080	687085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245530
14034	NC_011726	GT	3	6	687105	687110	0 %	50 %	50 %	0 %	218245530
14035	NC_011726	AGG	2	6	687133	687138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245530
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14037	NC_011726	AAC	2	6	687256	687261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245530
14038	NC_011726	TTA	2	6	687270	687275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245530
14039	NC_011726	GGA	2	6	687286	687291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245530
14040	NC_011726	TGA	2	6	687408	687413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245530
14041	NC_011726	ATTTT	2	10	687441	687450	20 %	80 %	0 %	0 %	218245530
14042	NC_011726	CAA	2	6	687474	687479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245530
14043	NC_011726	TCC	2	6	687568	687573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245530
14044	NC_011726	GGGT	2	8	687647	687654	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_011726	ATT	2	6	687658	687663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245531
14046	NC_011726	TTC	2	6	687670	687675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245531
14047	NC_011726	T	7	7	687689	687695	0 %	100 %	0 %	0 %	218245531
14048	NC_011726	CAAAC	2	10	687771	687780	60 %	0 %	0 %	40 %	218245531
14049	NC_011726	TTGGG	2	10	687852	687861	0 %	40 %	60 %	0 %	218245531
14050	NC_011726	GCA	2	6	687895	687900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245531
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14053	NC_011726	AGG	2	6	687959	687964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245531
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14056	NC_011726	ATT	2	6	688187	688192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245531
14057	NC_011726	TAG	2	6	688275	688280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245531
14058	NC_011726	TTA	2	6	688295	688300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_011726	AG	3	6	688303	688308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_011726	CTA	2	6	688315	688320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14062	NC_011726	TCA	2	6	688343	688348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245532
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14066	NC_011726	GTA	2	6	688493	688498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245532
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14072	NC_011726	T	6	6	688697	688702	0 %	100 %	0 %	0 %	218245533
14073	NC_011726	ATT	2	6	688707	688712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245533
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14077	NC_011726	AAAT	2	8	688761	688768	75 %	25 %	0 %	0 %	218245533
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14093	NC_011726	C	6	6	689487	689492	0 %	0 %	0 %	100 %	218245534
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14095	NC_011726	ACCAA	2	10	689585	689594	60 %	0 %	0 %	40 %	218245534
14096	NC_011726	G	8	8	689655	689662	0 %	0 %	100 %	0 %	218245534
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14103	NC_011726	C	6	6	690016	690021	0 %	0 %	0 %	100 %	218245534
14104	NC_011726	TCC	2	6	690033	690038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245534
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14112	NC_011726	GA	3	6	690569	690574	50 %	0 %	50 %	0 %	218245534
14113	NC_011726	AAC	2	6	690586	690591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245534
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14116	NC_011726	CTT	2	6	690967	690972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245534
14117	NC_011726	TTC	2	6	691001	691006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245534
14118	NC_011726	CAACG	2	10	691016	691025	40 %	0 %	20 %	40 %	218245534
14119	NC_011726	GAA	2	6	691031	691036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245534
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14121	NC_011726	TAC	2	6	691255	691260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245534
14122	NC_011726	AAT	2	6	691343	691348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245534
14123	NC_011726	CTT	2	6	691550	691555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14125	NC_011726	GTT	2	6	691589	691594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14126	NC_011726	GAC	2	6	691633	691638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245535
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14134	NC_011726	A	6	6	692135	692140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14135	NC_011726	A	6	6	692146	692151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14136	NC_011726	T	6	6	692157	692162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14137	NC_011726	CT	3	6	692173	692178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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14141	NC_011726	TACT	2	8	692575	692582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14142	NC_011726	TCAAA	2	10	692625	692634	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14143	NC_011726	TTG	2	6	692674	692679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14144	NC_011726	TTC	2	6	692695	692700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14145	NC_011726	TTC	2	6	692707	692712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14146	NC_011726	TAA	2	6	692824	692829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14155	NC_011726	CAA	2	6	693256	693261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14156	NC_011726	TAT	2	6	693321	693326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14157	NC_011726	T	6	6	693358	693363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14231	NC_011726	GCAAG	2	10	697163	697172	40 %	0 %	40 %	20 %	218245540
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14234	NC_011726	TCTTT	2	10	697298	697307	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14235	NC_011726	T	6	6	697368	697373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14236	NC_011726	ACTC	2	8	697376	697383	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14237	NC_011726	ATCT	2	8	697404	697411	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14238	NC_011726	GTAA	2	8	697554	697561	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14239	NC_011726	AGC	2	6	697597	697602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245541
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14241	NC_011726	G	6	6	697720	697725	0 %	0 %	100 %	0 %	218245541
14242	NC_011726	ATCCC	2	10	697740	697749	20 %	20 %	0 %	60 %	218245541
14243	NC_011726	T	6	6	697756	697761	0 %	100 %	0 %	0 %	218245541
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14245	NC_011726	AAT	2	6	697834	697839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245541
14246	NC_011726	TTG	2	6	697907	697912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245541
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14355	NC_011726	CATACC	2	12	702984	702995	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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14491	NC_011726	CT	3	6	709805	709810	0 %	50 %	0 %	50 %	218245553
14492	NC_011726	ATCG	2	8	709820	709827	25 %	25 %	25 %	25 %	218245553
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