MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880101

Total Repeats: 1049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011721	GGAA	2	8	5	12	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011721	CAA	2	6	17	22	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011721	A	6	6	37	42	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011721	CT	3	6	44	49	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011721	AG	3	6	71	76	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011721	TA	3	6	94	99	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011721	TTTG	2	8	185	192	0 %	75 %	25 %	0 %	218203845
8	NC_011721	GAG	2	6	251	256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203845
9	NC_011721	GGA	2	6	284	289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203845
10	NC_011721	GAT	3	9	331	339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203845
11	NC_011721	AAG	2	6	411	416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203845
12	NC_011721	ATA	2	6	485	490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203845
13	NC_011721	TAA	2	6	567	572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203846
14	NC_011721	TGT	2	6	583	588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203846
15	NC_011721	GT	3	6	610	615	0 %	50 %	50 %	0 %	218203846
16	NC_011721	CA	3	6	623	628	50 %	0 %	0 %	50 %	218203846
17	NC_011721	ATA	2	6	672	677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203846
18	NC_011721	AGG	2	6	745	750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203846
19	NC_011721	AAG	2	6	771	776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203846
20	NC_011721	CAGT	2	8	831	838	25 %	25 %	25 %	25 %	218203846
21	NC_011721	CTC	2	6	870	875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203846
22	NC_011721	TTA	2	6	886	891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203846
23	NC_011721	CA	3	6	984	989	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011721	ATTA	2	8	992	999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011721	GT	3	6	1069	1074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011721	T	7	7	1112	1118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011721	AATA	2	8	1135	1142	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011721	AGA	2	6	1188	1193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011721	ATTTT	2	10	1212	1221	20 %	80 %	0 %	0 %	218203847
30	NC_011721	T	9	9	1218	1226	0 %	100 %	0 %	0 %	218203847
31	NC_011721	AAC	2	6	1246	1251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203847
32	NC_011721	A	6	6	1272	1277	100 %	0 %	0 %	0 %	218203847
33	NC_011721	ATT	2	6	1287	1292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203847
34	NC_011721	TC	3	6	1296	1301	0 %	50 %	0 %	50 %	218203847
35	NC_011721	AG	3	6	1351	1356	50 %	0 %	50 %	0 %	218203847
36	NC_011721	TTC	2	6	1378	1383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203847
37	NC_011721	TAA	2	6	1431	1436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203847
38	NC_011721	ATA	2	6	1455	1460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203847
39	NC_011721	GGAT	2	8	1461	1468	25 %	25 %	50 %	0 %	218203847
40	NC_011721	A	6	6	1561	1566	100 %	0 %	0 %	0 %	218203847
41	NC_011721	ACA	2	6	1609	1614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203847
42	NC_011721	TG	3	6	1642	1647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011721	CTC	2	6	1739	1744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203848
44	NC_011721	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	218203848
45	NC_011721	TAA	2	6	1896	1901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203848
46	NC_011721	ATA	2	6	1994	1999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203848
47	NC_011721	TTA	2	6	2018	2023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203848
48	NC_011721	TTGA	2	8	2035	2042	25 %	50 %	25 %	0 %	218203848
49	NC_011721	AG	3	6	2067	2072	50 %	0 %	50 %	0 %	218203848
50	NC_011721	T	6	6	2091	2096	0 %	100 %	0 %	0 %	218203848
51	NC_011721	CAAG	2	8	2111	2118	50 %	0 %	25 %	25 %	218203848
52	NC_011721	ATA	2	6	2225	2230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203848
53	NC_011721	TGAT	2	8	2243	2250	25 %	50 %	25 %	0 %	218203848
54	NC_011721	TTTTA	2	10	2265	2274	20 %	80 %	0 %	0 %	218203848
55	NC_011721	TGA	2	6	2280	2285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203848
56	NC_011721	ATA	2	6	2384	2389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203848
57	NC_011721	TCAA	2	8	2405	2412	50 %	25 %	0 %	25 %	218203848
58	NC_011721	TTA	2	6	2432	2437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203848
59	NC_011721	A	8	8	2456	2463	100 %	0 %	0 %	0 %	218203848
60	NC_011721	TC	3	6	2469	2474	0 %	50 %	0 %	50 %	218203848
61	NC_011721	ATA	2	6	2480	2485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203848
62	NC_011721	AAT	2	6	2679	2684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203848
63	NC_011721	TTA	2	6	2692	2697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203848
64	NC_011721	CTG	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011721	TGA	2	6	2800	2805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011721	TAA	2	6	2868	2873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011721	A	7	7	3076	3082	100 %	0 %	0 %	0 %	218203849
68	NC_011721	TAT	2	6	3083	3088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203849
69	NC_011721	TCA	2	6	3092	3097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203849
70	NC_011721	TCT	2	6	3269	3274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203849
71	NC_011721	GAA	2	6	3402	3407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203849
72	NC_011721	GAT	2	6	3417	3422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203849
73	NC_011721	CCA	2	6	3424	3429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203849
74	NC_011721	ATT	2	6	3434	3439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203849
75	NC_011721	GCC	2	6	3459	3464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218203849
76	NC_011721	TAT	2	6	3487	3492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203849
77	NC_011721	TGA	2	6	3611	3616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203849
78	NC_011721	CAA	2	6	3669	3674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203849
79	NC_011721	CAAC	2	8	3686	3693	50 %	0 %	0 %	50 %	218203849
80	NC_011721	GAG	2	6	3706	3711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203849
81	NC_011721	CGC	2	6	3808	3813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218203849
82	NC_011721	AAG	2	6	3934	3939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203849
83	NC_011721	CAA	2	6	4155	4160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203849
84	NC_011721	GAA	2	6	4209	4214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203849
85	NC_011721	TTA	2	6	4245	4250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203849
86	NC_011721	TTTG	2	8	4280	4287	0 %	75 %	25 %	0 %	218203849
87	NC_011721	TGG	2	6	4309	4314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218203849
88	NC_011721	A	7	7	4366	4372	100 %	0 %	0 %	0 %	218203849
89	NC_011721	AAC	2	6	4378	4383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203849
90	NC_011721	TCC	2	6	4475	4480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203849
91	NC_011721	CTT	2	6	4498	4503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203849
92	NC_011721	GCTAC	2	10	4506	4515	20 %	20 %	20 %	40 %	218203849
93	NC_011721	TTG	2	6	4632	4637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203849
94	NC_011721	AGA	2	6	4649	4654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203849
95	NC_011721	AAC	2	6	4655	4660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203849
96	NC_011721	AGA	2	6	4751	4756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203849
97	NC_011721	AGA	2	6	4759	4764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203849
98	NC_011721	C	6	6	4773	4778	0 %	0 %	0 %	100 %	218203849
99	NC_011721	C	6	6	4781	4786	0 %	0 %	0 %	100 %	218203849
100	NC_011721	C	6	6	4789	4794	0 %	0 %	0 %	100 %	218203849
101	NC_011721	C	7	7	4797	4803	0 %	0 %	0 %	100 %	218203849
102	NC_011721	C	7	7	4813	4819	0 %	0 %	0 %	100 %	218203849
103	NC_011721	ACAGT	2	10	4838	4847	40 %	20 %	20 %	20 %	218203849
104	NC_011721	CAT	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203849
105	NC_011721	C	6	6	4926	4931	0 %	0 %	0 %	100 %	218203849
106	NC_011721	AAC	2	6	4990	4995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203849
107	NC_011721	AAC	2	6	5016	5021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203849
108	NC_011721	G	6	6	5079	5084	0 %	0 %	100 %	0 %	218203849
109	NC_011721	TAT	2	6	5153	5158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203849
110	NC_011721	ACC	2	6	5163	5168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203849
111	NC_011721	ATTG	2	8	5201	5208	25 %	50 %	25 %	0 %	218203849
112	NC_011721	T	6	6	5265	5270	0 %	100 %	0 %	0 %	218203849
113	NC_011721	AAG	2	6	5284	5289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011721	TTC	2	6	5310	5315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011721	T	6	6	5374	5379	0 %	100 %	0 %	0 %	218203850
116	NC_011721	T	6	6	5384	5389	0 %	100 %	0 %	0 %	218203850
117	NC_011721	GCA	2	6	5450	5455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203850
118	NC_011721	TGTC	2	8	5457	5464	0 %	50 %	25 %	25 %	218203850
119	NC_011721	CT	3	6	5503	5508	0 %	50 %	0 %	50 %	218203850
120	NC_011721	A	6	6	5533	5538	100 %	0 %	0 %	0 %	218203850
121	NC_011721	A	7	7	5598	5604	100 %	0 %	0 %	0 %	218203850
122	NC_011721	GCA	2	6	5620	5625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203850
123	NC_011721	GTCT	2	8	5626	5633	0 %	50 %	25 %	25 %	218203850
124	NC_011721	TAT	2	6	5744	5749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203850
125	NC_011721	ACG	2	6	5768	5773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203850
126	NC_011721	A	6	6	5823	5828	100 %	0 %	0 %	0 %	218203850
127	NC_011721	CCT	2	6	5882	5887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203850
128	NC_011721	A	7	7	6036	6042	100 %	0 %	0 %	0 %	218203850
129	NC_011721	AGC	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203850
130	NC_011721	CTGT	2	8	6093	6100	0 %	50 %	25 %	25 %	218203850
131	NC_011721	CAGGA	2	10	6115	6124	40 %	0 %	40 %	20 %	218203850
132	NC_011721	ATT	2	6	6183	6188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203850
133	NC_011721	AAG	4	12	6193	6204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203850
134	NC_011721	TTA	2	6	6243	6248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203850
135	NC_011721	TTAA	2	8	6255	6262	50 %	50 %	0 %	0 %	218203850
136	NC_011721	TAT	2	6	6297	6302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203850
137	NC_011721	CAA	2	6	6333	6338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203850
138	NC_011721	ATT	2	6	6433	6438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203850
139	NC_011721	TAA	2	6	6458	6463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203850
140	NC_011721	CTG	2	6	6549	6554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203851
141	NC_011721	TCTA	2	8	6591	6598	25 %	50 %	0 %	25 %	218203851
142	NC_011721	TGGC	2	8	6625	6632	0 %	25 %	50 %	25 %	218203851
143	NC_011721	TCA	2	6	6654	6659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203851
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166	NC_011721	ATC	2	6	8063	8068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_011721	GAAAG	2	10	8112	8121	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_011721	TCCA	2	8	8632	8639	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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256	NC_011721	TTAA	2	8	11609	11616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_011721	ACT	2	6	11617	11622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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274	NC_011721	CTA	2	6	12264	12269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203857
275	NC_011721	A	6	6	12290	12295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_011721	CTAA	2	8	12466	12473	50 %	25 %	0 %	25 %	218203858
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279	NC_011721	GCT	2	6	12574	12579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203858
280	NC_011721	GAT	2	6	12582	12587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203858
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407	NC_011721	ACAAA	2	10	19554	19563	80 %	0 %	0 %	20 %	218203868
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410	NC_011721	GTT	2	6	19745	19750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203868
411	NC_011721	ATTG	2	8	19764	19771	25 %	50 %	25 %	0 %	218203868
412	NC_011721	AGG	2	6	19924	19929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203869
413	NC_011721	TTA	2	6	19962	19967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203869
414	NC_011721	ATC	2	6	20026	20031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203869
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418	NC_011721	GATA	2	8	20151	20158	50 %	25 %	25 %	0 %	218203869
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423	NC_011721	ATC	2	6	20363	20368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203869
424	NC_011721	ACT	2	6	20380	20385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203869
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428	NC_011721	ATC	2	6	20565	20570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203870
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430	NC_011721	CTT	2	6	20597	20602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203870
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436	NC_011721	TA	3	6	20826	20831	50 %	50 %	0 %	0 %	218203870
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447	NC_011721	ACAAA	2	10	21316	21325	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
448	NC_011721	AAT	2	6	21344	21349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_011721	A	6	6	21386	21391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_011721	A	6	6	21398	21403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_011721	TTG	2	6	21405	21410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
452	NC_011721	ATCT	2	8	21488	21495	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
453	NC_011721	CTG	2	6	21548	21553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
454	NC_011721	ATTT	2	8	21598	21605	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_011721	CAA	2	6	21769	21774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
460	NC_011721	TAT	2	6	21796	21801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_011721	ATT	2	6	21827	21832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_011721	ATTT	2	8	21876	21883	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_011721	AGA	2	6	21923	21928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
464	NC_011721	GAA	2	6	22039	22044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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