MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 chromosome

Total Repeats: 45441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011528	TTTCT	2	10	53	62	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011528	CCG	2	6	197	202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217689
3	NC_011528	CAA	2	6	203	208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217689
4	NC_011528	CAAA	2	8	247	254	75 %	0 %	0 %	25 %	212217689
5	NC_011528	TAC	2	6	261	266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217689
6	NC_011528	TGGAT	2	10	291	300	20 %	40 %	40 %	0 %	212217689
7	NC_011528	CCT	2	6	356	361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212217689
8	NC_011528	CCAA	2	8	401	408	50 %	0 %	0 %	50 %	212217689
9	NC_011528	AGC	2	6	436	441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217689
10	NC_011528	TCG	2	6	513	518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217689
11	NC_011528	GCC	3	9	545	553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217689
12	NC_011528	TTTA	2	8	596	603	25 %	75 %	0 %	0 %	212217689
13	NC_011528	TGG	2	6	604	609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217689
14	NC_011528	A	6	6	677	682	100 %	0 %	0 %	0 %	212217689
15	NC_011528	TTG	2	6	708	713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217689
16	NC_011528	GTT	2	6	784	789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217689
17	NC_011528	T	6	6	806	811	0 %	100 %	0 %	0 %	212217689
18	NC_011528	GATC	2	8	821	828	25 %	25 %	25 %	25 %	212217689
19	NC_011528	TTC	2	6	839	844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217689
20	NC_011528	AGA	2	6	925	930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217689
21	NC_011528	CTT	2	6	1057	1062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217689
22	NC_011528	TCAA	2	8	1144	1151	50 %	25 %	0 %	25 %	212217689
23	NC_011528	CG	3	6	1300	1305	0 %	0 %	50 %	50 %	212217689
24	NC_011528	ATGGCC	2	12	1316	1327	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	212217689
25	NC_011528	TTGC	2	8	1430	1437	0 %	50 %	25 %	25 %	212217689
26	NC_011528	CGT	2	6	1440	1445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217689
27	NC_011528	AGA	2	6	1456	1461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217689
28	NC_011528	CCCCT	2	10	1513	1522	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
29	NC_011528	G	6	6	1628	1633	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011528	AAATT	2	10	1642	1651	60 %	40 %	0 %	0 %	212217690
31	NC_011528	ATT	2	6	1665	1670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217690
32	NC_011528	CT	3	6	1741	1746	0 %	50 %	0 %	50 %	212217690
33	NC_011528	TCT	2	6	1834	1839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217690
34	NC_011528	A	6	6	1925	1930	100 %	0 %	0 %	0 %	212217690
35	NC_011528	CCG	2	6	1991	1996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217690
36	NC_011528	TAT	2	6	2098	2103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217690
37	NC_011528	CAAA	2	8	2194	2201	75 %	0 %	0 %	25 %	212217690
38	NC_011528	ATC	2	6	2224	2229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217690
39	NC_011528	ATT	2	6	2242	2247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217690
40	NC_011528	GAG	2	6	2266	2271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217690
41	NC_011528	AAT	2	6	2302	2307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217690
42	NC_011528	CTA	2	6	2321	2326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217690
43	NC_011528	AATT	2	8	2348	2355	50 %	50 %	0 %	0 %	212217690
44	NC_011528	GTG	2	6	2396	2401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217690
45	NC_011528	ATCG	2	8	2416	2423	25 %	25 %	25 %	25 %	212217690
46	NC_011528	ATT	2	6	2508	2513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217690
47	NC_011528	CCA	2	6	2525	2530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217690
48	NC_011528	AAG	2	6	2540	2545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217690
49	NC_011528	GAA	3	9	2551	2559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217690
50	NC_011528	AGC	2	6	2677	2682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217690
51	NC_011528	T	9	9	2834	2842	0 %	100 %	0 %	0 %	212217691
52	NC_011528	AATC	2	8	2877	2884	50 %	25 %	0 %	25 %	212217691
53	NC_011528	ATA	2	6	2943	2948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217691
54	NC_011528	TTA	2	6	2967	2972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217691
55	NC_011528	CA	3	6	2986	2991	50 %	0 %	0 %	50 %	212217691
56	NC_011528	CGAT	2	8	3028	3035	25 %	25 %	25 %	25 %	212217691
57	NC_011528	T	6	6	3124	3129	0 %	100 %	0 %	0 %	212217691
58	NC_011528	CCTT	2	8	3188	3195	0 %	50 %	0 %	50 %	212217691
59	NC_011528	T	7	7	3194	3200	0 %	100 %	0 %	0 %	212217691
60	NC_011528	TCA	2	6	3319	3324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217691
61	NC_011528	GTGG	2	8	3420	3427	0 %	25 %	75 %	0 %	212217691
62	NC_011528	AC	3	6	3492	3497	50 %	0 %	0 %	50 %	212217691
63	NC_011528	CAA	2	6	3572	3577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217691
64	NC_011528	TTAC	2	8	3585	3592	25 %	50 %	0 %	25 %	212217691
65	NC_011528	A	6	6	3627	3632	100 %	0 %	0 %	0 %	212217691
66	NC_011528	ATTT	2	8	3647	3654	25 %	75 %	0 %	0 %	212217691
67	NC_011528	CGA	2	6	3658	3663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217691
68	NC_011528	CCG	2	6	3669	3674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217691
69	NC_011528	TGAT	2	8	3702	3709	25 %	50 %	25 %	0 %	212217691
70	NC_011528	CGC	2	6	3814	3819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217691
71	NC_011528	TAGA	2	8	3919	3926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011528	AGA	2	6	3961	3966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011528	AAT	2	6	4016	4021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011528	A	7	7	4032	4038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011528	A	7	7	4078	4084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011528	TGAGCG	2	12	4129	4140	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212217692
77	NC_011528	CAC	2	6	4141	4146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217692
78	NC_011528	TTC	2	6	4157	4162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217692
79	NC_011528	CGA	2	6	4229	4234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217692
80	NC_011528	CAC	2	6	4248	4253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217692
81	NC_011528	CGA	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217692
82	NC_011528	AGA	2	6	4391	4396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217692
83	NC_011528	GCC	2	6	4407	4412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217692
84	NC_011528	TTA	2	6	4417	4422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217692
85	NC_011528	CGG	2	6	4475	4480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217692
86	NC_011528	GTG	2	6	4503	4508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217692
87	NC_011528	AGA	2	6	4520	4525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217692
88	NC_011528	GCTT	2	8	4715	4722	0 %	50 %	25 %	25 %	212217692
89	NC_011528	A	7	7	4830	4836	100 %	0 %	0 %	0 %	212217692
90	NC_011528	CCAT	2	8	4840	4847	25 %	25 %	0 %	50 %	212217692
91	NC_011528	T	6	6	4933	4938	0 %	100 %	0 %	0 %	212217692
92	NC_011528	AAT	2	6	4947	4952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217692
93	NC_011528	CGG	2	6	4967	4972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217692
94	NC_011528	CACT	2	8	4973	4980	25 %	25 %	0 %	50 %	212217692
95	NC_011528	AGT	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217692
96	NC_011528	CTTG	2	8	5216	5223	0 %	50 %	25 %	25 %	212217692
97	NC_011528	TGC	2	6	5267	5272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217692
98	NC_011528	ACG	2	6	5312	5317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217692
99	NC_011528	TGG	2	6	5401	5406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217692
100	NC_011528	TCT	2	6	5523	5528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217692
101	NC_011528	AGA	2	6	5576	5581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217692
102	NC_011528	ATC	2	6	5605	5610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217692
103	NC_011528	CCGACG	2	12	5626	5637	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	212217692
104	NC_011528	CA	3	6	5647	5652	50 %	0 %	0 %	50 %	212217692
105	NC_011528	TCT	2	6	5674	5679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217692
106	NC_011528	TA	3	6	5737	5742	50 %	50 %	0 %	0 %	212217692
107	NC_011528	A	7	7	5748	5754	100 %	0 %	0 %	0 %	212217692
108	NC_011528	GTT	2	6	5798	5803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217692
109	NC_011528	GCG	2	6	5886	5891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217692
110	NC_011528	TA	3	6	5946	5951	50 %	50 %	0 %	0 %	212217692
111	NC_011528	GCT	2	6	5960	5965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217692
112	NC_011528	TGAG	2	8	5995	6002	25 %	25 %	50 %	0 %	212217692
113	NC_011528	GAA	2	6	6003	6008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217692
114	NC_011528	GGA	2	6	6035	6040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217692
115	NC_011528	A	6	6	6093	6098	100 %	0 %	0 %	0 %	212217692
116	NC_011528	ATT	2	6	6135	6140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217692
117	NC_011528	TTG	2	6	6208	6213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217692
118	NC_011528	TA	3	6	6217	6222	50 %	50 %	0 %	0 %	212217692
119	NC_011528	A	6	6	6330	6335	100 %	0 %	0 %	0 %	212217692
120	NC_011528	TAT	2	6	6424	6429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217692
121	NC_011528	ACC	2	6	6471	6476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217692
122	NC_011528	CGC	2	6	6501	6506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217692
123	NC_011528	TCC	2	6	6558	6563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_011528	A	10	10	6756	6765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011528	TG	3	6	6825	6830	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011528	TGA	2	6	6835	6840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011528	GTAT	2	8	6883	6890	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011528	GTG	2	6	6920	6925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011528	GGA	2	6	6938	6943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011528	GCA	2	6	7003	7008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011528	AAC	2	6	7116	7121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011528	GTT	2	6	7198	7203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011528	GTG	2	6	7230	7235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011528	AGCG	2	8	7270	7277	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011528	TTGT	2	8	7318	7325	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011528	TTG	2	6	7334	7339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011528	GAG	2	6	7367	7372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011528	GGGT	2	8	7431	7438	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011528	TCA	2	6	7480	7485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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141	NC_011528	AGG	2	6	7554	7559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011528	TGT	2	6	7560	7565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011528	A	6	6	7642	7647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011528	GAAT	2	8	7698	7705	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011528	TG	3	6	7712	7717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_011528	ATCTC	2	10	12728	12737	20 %	40 %	0 %	40 %	212217698
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402	NC_011528	CTCAA	2	10	19557	19566	40 %	20 %	0 %	40 %	212217707
403	NC_011528	A	7	7	19571	19577	100 %	0 %	0 %	0 %	212217707
404	NC_011528	A	7	7	19579	19585	100 %	0 %	0 %	0 %	212217707
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495	NC_011528	TAA	2	6	23356	23361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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