MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 44092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_011527	ATTCA	2	10	879642	879651	40 %	40 %	0 %	20 %	212212492
19502	NC_011527	AC	4	8	879706	879713	50 %	0 %	0 %	50 %	212212492
19503	NC_011527	TTTAC	2	10	879742	879751	20 %	60 %	0 %	20 %	212212492
19504	NC_011527	GAA	2	6	879763	879768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212492
19505	NC_011527	CCAA	2	8	879824	879831	50 %	0 %	0 %	50 %	212212492
19506	NC_011527	TCA	2	6	879851	879856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212212492
19507	NC_011527	CGC	2	6	879881	879886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212212492
19508	NC_011527	TCG	2	6	879901	879906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212492
19509	NC_011527	TTA	2	6	879928	879933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212492
19510	NC_011527	T	6	6	879984	879989	0 %	100 %	0 %	0 %	212212492
19511	NC_011527	GGGT	2	8	880000	880007	0 %	25 %	75 %	0 %	212212492
19512	NC_011527	CCG	2	6	880025	880030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212212492
19513	NC_011527	CCG	2	6	880033	880038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212212492
19514	NC_011527	CAT	2	6	880067	880072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212212492
19515	NC_011527	GTTGA	2	10	880092	880101	20 %	40 %	40 %	0 %	212212492
19516	NC_011527	T	8	8	880197	880204	0 %	100 %	0 %	0 %	212212492
19517	NC_011527	GCA	2	6	880261	880266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212492
19518	NC_011527	CCA	2	6	880360	880365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212212492
19519	NC_011527	CG	3	6	880377	880382	0 %	0 %	50 %	50 %	212212492
19520	NC_011527	AGCT	2	8	880505	880512	25 %	25 %	25 %	25 %	212212492
19521	NC_011527	T	6	6	880560	880565	0 %	100 %	0 %	0 %	212212492
19522	NC_011527	GGC	2	6	880594	880599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212212492
19523	NC_011527	ATTA	2	8	880623	880630	50 %	50 %	0 %	0 %	212212492
19524	NC_011527	GC	3	6	880646	880651	0 %	0 %	50 %	50 %	212212492
19525	NC_011527	ATA	2	6	880653	880658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212212492
19526	NC_011527	GTT	2	6	880768	880773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212212493
19527	NC_011527	T	6	6	880772	880777	0 %	100 %	0 %	0 %	212212493
19528	NC_011527	GAA	2	6	880822	880827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212493
19529	NC_011527	CAT	2	6	880871	880876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212212493
19530	NC_011527	TGT	2	6	880887	880892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212212493
19531	NC_011527	TAT	2	6	880902	880907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212493
19532	NC_011527	CTT	2	6	880940	880945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212212493
19533	NC_011527	TCT	2	6	881068	881073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212212493
19534	NC_011527	TAT	2	6	881078	881083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212493
19535	NC_011527	TTCCTT	2	12	881129	881140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212212493
19536	NC_011527	ATT	3	9	881227	881235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212493
19537	NC_011527	AGG	2	6	881319	881324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19538	NC_011527	TTC	2	6	881503	881508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212212494
19539	NC_011527	GC	3	6	881551	881556	0 %	0 %	50 %	50 %	212212494
19540	NC_011527	A	6	6	881567	881572	100 %	0 %	0 %	0 %	212212494
19541	NC_011527	CGA	2	6	881776	881781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212494
19542	NC_011527	GGC	2	6	881815	881820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212212494
19543	NC_011527	TA	3	6	881862	881867	50 %	50 %	0 %	0 %	212212494
19544	NC_011527	GCA	2	6	881917	881922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212494
19545	NC_011527	TC	3	6	882062	882067	0 %	50 %	0 %	50 %	212212494
19546	NC_011527	TGTA	2	8	882075	882082	25 %	50 %	25 %	0 %	212212494
19547	NC_011527	TC	3	6	882115	882120	0 %	50 %	0 %	50 %	212212494
19548	NC_011527	GAA	2	6	882161	882166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212494
19549	NC_011527	A	6	6	882308	882313	100 %	0 %	0 %	0 %	212212494
19550	NC_011527	A	6	6	882395	882400	100 %	0 %	0 %	0 %	212212494
19551	NC_011527	GGC	2	6	882406	882411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212212494
19552	NC_011527	GC	3	6	882419	882424	0 %	0 %	50 %	50 %	212212494
19553	NC_011527	TTG	2	6	882432	882437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212212494
19554	NC_011527	ATA	2	6	882456	882461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212212494
19555	NC_011527	A	7	7	882472	882478	100 %	0 %	0 %	0 %	212212494
19556	NC_011527	GAA	2	6	882494	882499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212494
19557	NC_011527	ACC	2	6	882536	882541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212212494
19558	NC_011527	TTG	2	6	882656	882661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212212495
19559	NC_011527	TTTATT	2	12	882670	882681	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	212212495
19560	NC_011527	TGCG	2	8	882689	882696	0 %	25 %	50 %	25 %	212212495
19561	NC_011527	GC	3	6	882770	882775	0 %	0 %	50 %	50 %	212212495
19562	NC_011527	CTT	2	6	882779	882784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212212495
19563	NC_011527	TTA	2	6	882797	882802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212495
19564	NC_011527	CCA	2	6	882857	882862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212212495
19565	NC_011527	TAG	2	6	883041	883046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212495
19566	NC_011527	GTT	2	6	883090	883095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212212495
19567	NC_011527	CCGA	2	8	883210	883217	25 %	0 %	25 %	50 %	212212495
19568	NC_011527	TAA	3	9	883236	883244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212212495
19569	NC_011527	CGG	2	6	883256	883261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212212495
19570	NC_011527	TTA	2	6	883280	883285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212495
19571	NC_011527	TA	3	6	883291	883296	50 %	50 %	0 %	0 %	212212495
19572	NC_011527	ACAA	2	8	883319	883326	75 %	0 %	0 %	25 %	212212495
19573	NC_011527	TCA	2	6	883343	883348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212212495
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19576	NC_011527	CTT	2	6	883547	883552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212212495
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19579	NC_011527	TGT	2	6	883683	883688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212212495
19580	NC_011527	TTA	2	6	883697	883702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212495
19581	NC_011527	GTTT	2	8	883726	883733	0 %	75 %	25 %	0 %	212212495
19582	NC_011527	GTG	2	6	883804	883809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212212495
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19584	NC_011527	TAT	2	6	883911	883916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212495
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19588	NC_011527	TCGT	2	8	884121	884128	0 %	50 %	25 %	25 %	212212495
19589	NC_011527	GTT	2	6	884222	884227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212212495
19590	NC_011527	T	6	6	884231	884236	0 %	100 %	0 %	0 %	212212495
19591	NC_011527	ACC	2	6	884245	884250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212212495
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19593	NC_011527	GC	3	6	884279	884284	0 %	0 %	50 %	50 %	212212495
19594	NC_011527	GCAAGC	2	12	884292	884303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212495
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19602	NC_011527	GGA	2	6	884646	884651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212212495
19603	NC_011527	AAG	2	6	884658	884663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212495
19604	NC_011527	ATCG	2	8	884725	884732	25 %	25 %	25 %	25 %	212212495
19605	NC_011527	GAT	2	6	884823	884828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212495
19606	NC_011527	ATT	2	6	884865	884870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212495
19607	NC_011527	CAG	2	6	884912	884917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212495
19608	NC_011527	AATT	2	8	884924	884931	50 %	50 %	0 %	0 %	212212495
19609	NC_011527	AGC	2	6	884966	884971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212495
19610	NC_011527	CAA	2	6	884992	884997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212212495
19611	NC_011527	GTG	2	6	885157	885162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212212495
19612	NC_011527	T	6	6	885166	885171	0 %	100 %	0 %	0 %	212212495
19613	NC_011527	ATT	4	12	885178	885189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212495
19614	NC_011527	GGC	2	6	885201	885206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212212495
19615	NC_011527	T	7	7	885278	885284	0 %	100 %	0 %	0 %	212212495
19616	NC_011527	GATTG	2	10	885321	885330	20 %	40 %	40 %	0 %	212212495
19617	NC_011527	ATTA	2	8	885345	885352	50 %	50 %	0 %	0 %	212212495
19618	NC_011527	TGG	2	6	885371	885376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212212495
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19620	NC_011527	AAG	3	9	885395	885403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212495
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19992	NC_011527	TATGG	2	10	902230	902239	20 %	40 %	40 %	0 %	212212511
19993	NC_011527	G	6	6	902243	902248	0 %	0 %	100 %	0 %	212212511
19994	NC_011527	TTA	2	6	902339	902344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212512
19995	NC_011527	ATT	2	6	902360	902365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212512
19996	NC_011527	CTT	3	9	902375	902383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212212512
19997	NC_011527	GCA	2	6	902391	902396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212512
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20000	NC_011527	ATC	2	6	902519	902524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212212512

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