MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 44092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_011527	TTA	3	9	856987	856995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212469
19003	NC_011527	C	6	6	857070	857075	0 %	0 %	0 %	100 %	212212469
19004	NC_011527	TTA	2	6	857080	857085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212469
19005	NC_011527	GGT	3	9	857090	857098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212212469
19006	NC_011527	CTT	2	6	857115	857120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212212469
19007	NC_011527	A	6	6	857124	857129	100 %	0 %	0 %	0 %	212212469
19008	NC_011527	ACG	2	6	857144	857149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212469
19009	NC_011527	CAGGAA	2	12	857160	857171	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	212212469
19010	NC_011527	TGG	2	6	857215	857220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212212469
19011	NC_011527	CTC	2	6	857299	857304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212212469
19012	NC_011527	TTA	2	6	857366	857371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212469
19013	NC_011527	CTG	2	6	857436	857441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212470
19014	NC_011527	TGG	2	6	857454	857459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212212470
19015	NC_011527	AAG	2	6	857472	857477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212470
19016	NC_011527	AATT	2	8	857532	857539	50 %	50 %	0 %	0 %	212212470
19017	NC_011527	AAT	2	6	857846	857851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212212470
19018	NC_011527	ATT	2	6	857911	857916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212470
19019	NC_011527	GC	3	6	858040	858045	0 %	0 %	50 %	50 %	212212470
19020	NC_011527	TGG	2	6	858079	858084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212212470
19021	NC_011527	AGA	2	6	858175	858180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212470
19022	NC_011527	ACA	2	6	858183	858188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212212470
19023	NC_011527	CTCA	2	8	858194	858201	25 %	25 %	0 %	50 %	212212470
19024	NC_011527	AGG	2	6	858238	858243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212212470
19025	NC_011527	CAC	2	6	858267	858272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212212470
19026	NC_011527	GAA	2	6	858425	858430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212470
19027	NC_011527	AAG	3	9	858474	858482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212470
19028	NC_011527	AGT	2	6	858565	858570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212470
19029	NC_011527	AAG	2	6	858597	858602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212471
19030	NC_011527	T	7	7	858613	858619	0 %	100 %	0 %	0 %	212212471
19031	NC_011527	GAT	2	6	858650	858655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212471
19032	NC_011527	ATT	2	6	858734	858739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212471
19033	NC_011527	TGT	2	6	858769	858774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212212471
19034	NC_011527	GCT	2	6	858782	858787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212471
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19037	NC_011527	CGG	2	6	859143	859148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212212472
19038	NC_011527	TCC	2	6	859236	859241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212212472
19039	NC_011527	AGC	2	6	859260	859265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212472
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19041	NC_011527	CCCG	2	8	859320	859327	0 %	0 %	25 %	75 %	212212472
19042	NC_011527	GTT	2	6	859342	859347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212212472
19043	NC_011527	ATT	2	6	859384	859389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212472
19044	NC_011527	CGC	2	6	859480	859485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19045	NC_011527	GC	3	6	859522	859527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19046	NC_011527	ACG	2	6	859556	859561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19047	NC_011527	T	7	7	859565	859571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19048	NC_011527	TGT	2	6	859627	859632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19049	NC_011527	GC	3	6	859665	859670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19050	NC_011527	GC	3	6	859676	859681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19051	NC_011527	GAG	2	6	859708	859713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19052	NC_011527	T	6	6	859726	859731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19053	NC_011527	TTA	2	6	859736	859741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19054	NC_011527	CAT	2	6	859745	859750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19055	NC_011527	GATGGT	2	12	859766	859777	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
19056	NC_011527	CGG	2	6	859893	859898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19057	NC_011527	GTT	2	6	860016	860021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19058	NC_011527	T	6	6	860050	860055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19059	NC_011527	TAA	2	6	860081	860086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19060	NC_011527	TCG	2	6	860109	860114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19061	NC_011527	ATC	2	6	860119	860124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19062	NC_011527	GAT	2	6	860125	860130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19063	NC_011527	T	6	6	860130	860135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19064	NC_011527	CCA	2	6	860186	860191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19065	NC_011527	AGG	2	6	860353	860358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19066	NC_011527	GGT	2	6	860427	860432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19067	NC_011527	GAG	2	6	860448	860453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19068	NC_011527	AG	4	8	860468	860475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19069	NC_011527	T	6	6	860539	860544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19070	NC_011527	AAT	2	6	860568	860573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19071	NC_011527	CAAT	2	8	860579	860586	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19072	NC_011527	TGT	2	6	860648	860653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19073	NC_011527	GC	3	6	860678	860683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19074	NC_011527	TTTTC	2	10	860733	860742	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19075	NC_011527	TAT	2	6	860816	860821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19076	NC_011527	CAC	2	6	860864	860869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19077	NC_011527	CAT	2	6	860908	860913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19078	NC_011527	TAA	2	6	860919	860924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19079	NC_011527	TAA	2	6	860933	860938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19080	NC_011527	GAG	2	6	860950	860955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19081	NC_011527	TGA	2	6	860996	861001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19082	NC_011527	A	7	7	861006	861012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19083	NC_011527	ATC	3	9	861024	861032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19096	NC_011527	GCT	2	6	861620	861625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212474
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19098	NC_011527	CTG	2	6	861769	861774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212474
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19107	NC_011527	CAC	2	6	862047	862052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212212474
19108	NC_011527	GGC	3	9	862073	862081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212212474
19109	NC_011527	CTT	2	6	862164	862169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212212474
19110	NC_011527	CTTG	2	8	862173	862180	0 %	50 %	25 %	25 %	212212474
19111	NC_011527	TTC	2	6	862186	862191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212212474
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19113	NC_011527	T	7	7	862248	862254	0 %	100 %	0 %	0 %	212212474
19114	NC_011527	TAA	2	6	862298	862303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212212474
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19116	NC_011527	GAAGC	2	10	862413	862422	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19117	NC_011527	ATG	2	6	862439	862444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19118	NC_011527	TCGCT	2	10	862458	862467	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19119	NC_011527	GGC	2	6	862500	862505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19120	NC_011527	TTG	2	6	862536	862541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19122	NC_011527	AAT	2	6	862913	862918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212212475
19123	NC_011527	T	6	6	862918	862923	0 %	100 %	0 %	0 %	212212475
19124	NC_011527	GCG	2	6	862950	862955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212212475
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19127	NC_011527	GAA	2	6	863210	863215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212475
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19166	NC_011527	GAA	2	6	865166	865171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19229	NC_011527	GGGC	2	8	868068	868075	0 %	0 %	75 %	25 %	212212481
19230	NC_011527	CCT	2	6	868080	868085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212212481
19231	NC_011527	CAGG	2	8	868123	868130	25 %	0 %	50 %	25 %	212212481
19232	NC_011527	A	6	6	868264	868269	100 %	0 %	0 %	0 %	212212481
19233	NC_011527	AGC	2	6	868363	868368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212481
19234	NC_011527	TCG	3	9	868397	868405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212481
19235	NC_011527	A	7	7	868462	868468	100 %	0 %	0 %	0 %	212212481
19236	NC_011527	TGG	2	6	868487	868492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212212481
19237	NC_011527	GCT	2	6	868514	868519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212481
19238	NC_011527	ATT	2	6	868580	868585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212481
19239	NC_011527	T	6	6	868692	868697	0 %	100 %	0 %	0 %	212212481
19240	NC_011527	T	6	6	868710	868715	0 %	100 %	0 %	0 %	212212481
19241	NC_011527	TC	3	6	868821	868826	0 %	50 %	0 %	50 %	212212482
19242	NC_011527	TATCGT	2	12	868827	868838	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212212482
19243	NC_011527	GAT	2	6	868909	868914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212482
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19498	NC_011527	T	6	6	879527	879532	0 %	100 %	0 %	0 %	212212492
19499	NC_011527	AATA	3	12	879592	879603	75 %	25 %	0 %	0 %	212212492
19500	NC_011527	AATTA	2	10	879609	879618	60 %	40 %	0 %	0 %	212212492

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