MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 44092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_011527	CCT	2	6	813259	813264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212212437
18002	NC_011527	CAA	2	6	813432	813437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212212437
18003	NC_011527	CTT	2	6	813439	813444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212212437
18004	NC_011527	T	6	6	813515	813520	0 %	100 %	0 %	0 %	212212437
18005	NC_011527	GGT	2	6	813600	813605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18006	NC_011527	ATCA	2	8	813663	813670	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18007	NC_011527	GCAA	2	8	813711	813718	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18008	NC_011527	TG	3	6	813721	813726	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18009	NC_011527	TG	3	6	813732	813737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18010	NC_011527	ATT	2	6	814009	814014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212438
18011	NC_011527	GCGG	2	8	814018	814025	0 %	0 %	75 %	25 %	212212438
18012	NC_011527	GTT	2	6	814055	814060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212212438
18013	NC_011527	TGGCGT	2	12	814140	814151	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	212212438
18014	NC_011527	GGA	2	6	814153	814158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212212438
18015	NC_011527	TGG	2	6	814196	814201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212212438
18016	NC_011527	GAA	2	6	814261	814266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212438
18017	NC_011527	A	6	6	814315	814320	100 %	0 %	0 %	0 %	212212438
18018	NC_011527	ATT	2	6	814361	814366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212438
18019	NC_011527	GGT	2	6	814377	814382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212212438
18020	NC_011527	AAG	2	6	814400	814405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212438
18021	NC_011527	AG	4	8	814425	814432	50 %	0 %	50 %	0 %	212212438
18022	NC_011527	ATT	2	6	814493	814498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212438
18023	NC_011527	TAG	2	6	814499	814504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212438
18024	NC_011527	AGCC	2	8	814518	814525	25 %	0 %	25 %	50 %	212212438
18025	NC_011527	AATG	2	8	814605	814612	50 %	25 %	25 %	0 %	212212438
18026	NC_011527	AAT	2	6	814680	814685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212212438
18027	NC_011527	AAG	2	6	814739	814744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212438
18028	NC_011527	CAA	2	6	814762	814767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212212438
18029	NC_011527	CGG	2	6	814771	814776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212212438
18030	NC_011527	GCCA	2	8	814856	814863	25 %	0 %	25 %	50 %	212212438
18031	NC_011527	CGG	2	6	814872	814877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212212438
18032	NC_011527	CAGC	2	8	814943	814950	25 %	0 %	25 %	50 %	212212438
18033	NC_011527	TGA	2	6	814967	814972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212438
18034	NC_011527	GTC	3	9	814973	814981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212438
18035	NC_011527	A	6	6	814990	814995	100 %	0 %	0 %	0 %	212212438
18036	NC_011527	GCGG	2	8	815000	815007	0 %	0 %	75 %	25 %	212212438
18037	NC_011527	GATG	2	8	815013	815020	25 %	25 %	50 %	0 %	212212438
18038	NC_011527	TGA	2	6	815103	815108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212438
18039	NC_011527	GC	3	6	815140	815145	0 %	0 %	50 %	50 %	212212438
18040	NC_011527	TG	3	6	815173	815178	0 %	50 %	50 %	0 %	212212438
18041	NC_011527	GAT	2	6	815241	815246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212439
18042	NC_011527	A	6	6	815252	815257	100 %	0 %	0 %	0 %	212212439
18043	NC_011527	CGA	2	6	815493	815498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212439
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18045	NC_011527	ATCT	2	8	815590	815597	25 %	50 %	0 %	25 %	212212439
18046	NC_011527	TCG	2	6	815625	815630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212439
18047	NC_011527	AAT	2	6	815708	815713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18048	NC_011527	GTC	2	6	815724	815729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18049	NC_011527	T	7	7	815747	815753	0 %	100 %	0 %	0 %	212212440
18050	NC_011527	GCA	2	6	815809	815814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212440
18051	NC_011527	TGT	2	6	815848	815853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212212440
18052	NC_011527	TCC	2	6	815885	815890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212212440
18053	NC_011527	GAT	2	6	815891	815896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212440
18054	NC_011527	CCAA	2	8	815915	815922	50 %	0 %	0 %	50 %	212212440
18055	NC_011527	CCT	2	6	815948	815953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18056	NC_011527	GTT	2	6	815962	815967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18057	NC_011527	CTT	2	6	815973	815978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18058	NC_011527	AAC	2	6	816005	816010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18059	NC_011527	CTTA	2	8	816019	816026	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18060	NC_011527	TAAA	2	8	816034	816041	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18061	NC_011527	A	7	7	816039	816045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18062	NC_011527	TATT	2	8	816062	816069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18063	NC_011527	GAA	2	6	816075	816080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18064	NC_011527	TTCTAT	2	12	816101	816112	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	212212441
18065	NC_011527	T	7	7	816112	816118	0 %	100 %	0 %	0 %	212212441
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18068	NC_011527	ATT	2	6	816314	816319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212441
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18070	NC_011527	GAG	2	6	816409	816414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212212441
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18072	NC_011527	CCCA	2	8	816457	816464	25 %	0 %	0 %	75 %	212212441
18073	NC_011527	TTG	2	6	816491	816496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212212441
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18075	NC_011527	GCG	2	6	816694	816699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18076	NC_011527	T	8	8	816712	816719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18077	NC_011527	GAA	2	6	816752	816757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18078	NC_011527	TAA	2	6	816797	816802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18079	NC_011527	ATA	2	6	816805	816810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18080	NC_011527	A	6	6	816851	816856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18081	NC_011527	CTA	2	6	816862	816867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18082	NC_011527	CAT	2	6	816895	816900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18083	NC_011527	A	6	6	816936	816941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18084	NC_011527	ATCT	2	8	816944	816951	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18085	NC_011527	TAGA	2	8	816964	816971	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18086	NC_011527	ATTA	2	8	816998	817005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18087	NC_011527	TAAA	2	8	817055	817062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18088	NC_011527	GT	3	6	817111	817116	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18089	NC_011527	CAA	2	6	817122	817127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18090	NC_011527	TAAT	2	8	817141	817148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18091	NC_011527	A	7	7	817238	817244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18092	NC_011527	T	6	6	817294	817299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18093	NC_011527	AGC	2	6	817340	817345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18094	NC_011527	CTC	2	6	817412	817417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18095	NC_011527	AACTA	2	10	817451	817460	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18096	NC_011527	TA	3	6	817459	817464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18097	NC_011527	GATA	2	8	817506	817513	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18098	NC_011527	AGA	2	6	817604	817609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18099	NC_011527	GTTA	2	8	817613	817620	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18100	NC_011527	T	8	8	817652	817659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18101	NC_011527	AAT	2	6	817729	817734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18102	NC_011527	A	6	6	817762	817767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18103	NC_011527	TTC	2	6	817781	817786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18104	NC_011527	AAGTT	2	10	817789	817798	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18105	NC_011527	AT	3	6	817842	817847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18106	NC_011527	A	6	6	817850	817855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18107	NC_011527	ATA	2	6	817925	817930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18108	NC_011527	CTT	2	6	817948	817953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18109	NC_011527	TCG	2	6	818028	818033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18110	NC_011527	TAAT	2	8	818093	818100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18111	NC_011527	AGA	2	6	818122	818127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18112	NC_011527	GTT	2	6	818181	818186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18113	NC_011527	TAATT	2	10	818272	818281	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18114	NC_011527	ATT	2	6	818303	818308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18115	NC_011527	GC	3	6	818343	818348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18116	NC_011527	ATT	2	6	818461	818466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18117	NC_011527	AAT	2	6	818493	818498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18118	NC_011527	AGC	2	6	818557	818562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18119	NC_011527	T	6	6	818597	818602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18120	NC_011527	TC	3	6	818610	818615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18121	NC_011527	CAA	2	6	818619	818624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18122	NC_011527	AT	3	6	818649	818654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18123	NC_011527	TGA	2	6	818716	818721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18124	NC_011527	ATT	2	6	818744	818749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18125	NC_011527	GAT	2	6	818759	818764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18126	NC_011527	GTA	2	6	818783	818788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18127	NC_011527	AAT	2	6	818798	818803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18129	NC_011527	A	9	9	818906	818914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18254	NC_011527	AACT	2	8	824497	824504	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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18375	NC_011527	AAT	2	6	829671	829676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18376	NC_011527	ATA	2	6	829705	829710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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