MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 44092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011527	GTC	2	6	44345	44350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211716
1002	NC_011527	TTG	2	6	44395	44400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211716
1003	NC_011527	TGG	2	6	44413	44418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211716
1004	NC_011527	ATC	2	6	44421	44426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211716
1005	NC_011527	TGG	2	6	44439	44444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211716
1006	NC_011527	GCG	2	6	44482	44487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211716
1007	NC_011527	GC	3	6	44517	44522	0 %	0 %	50 %	50 %	212211716
1008	NC_011527	GTTT	2	8	44524	44531	0 %	75 %	25 %	0 %	212211716
1009	NC_011527	CAC	2	6	44778	44783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211717
1010	NC_011527	ATT	2	6	44862	44867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211717
1011	NC_011527	TTAT	2	8	44886	44893	25 %	75 %	0 %	0 %	212211717
1012	NC_011527	TA	3	6	44904	44909	50 %	50 %	0 %	0 %	212211717
1013	NC_011527	GCGCG	2	10	44913	44922	0 %	0 %	60 %	40 %	212211717
1014	NC_011527	TGA	2	6	45064	45069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211717
1015	NC_011527	TCG	2	6	45199	45204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211717
1016	NC_011527	T	6	6	45205	45210	0 %	100 %	0 %	0 %	212211717
1017	NC_011527	AAG	2	6	45247	45252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211717
1018	NC_011527	GATT	2	8	45304	45311	25 %	50 %	25 %	0 %	212211717
1019	NC_011527	AATT	2	8	45373	45380	50 %	50 %	0 %	0 %	212211717
1020	NC_011527	TTG	2	6	45396	45401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211717
1021	NC_011527	GTG	2	6	45404	45409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211717
1022	NC_011527	TTA	2	6	45450	45455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211717
1023	NC_011527	ATG	2	6	45483	45488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211717
1024	NC_011527	GCA	2	6	45513	45518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211717
1025	NC_011527	AAG	2	6	45534	45539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_011527	AATT	2	8	45561	45568	50 %	50 %	0 %	0 %	212211718
1027	NC_011527	TTTA	2	8	45604	45611	25 %	75 %	0 %	0 %	212211718
1028	NC_011527	CGC	2	6	45619	45624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211718
1029	NC_011527	GTT	2	6	45815	45820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211718
1030	NC_011527	CGT	2	6	45863	45868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_011527	G	8	8	45878	45885	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_011527	GC	3	6	45889	45894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_011527	ATA	2	6	45959	45964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_011527	TCG	2	6	46018	46023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211719
1035	NC_011527	GCC	2	6	46055	46060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211719
1036	NC_011527	AGC	2	6	46109	46114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211719
1037	NC_011527	GAA	2	6	46119	46124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211719
1038	NC_011527	GC	3	6	46220	46225	0 %	0 %	50 %	50 %	212211719
1039	NC_011527	GAA	2	6	46239	46244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211719
1040	NC_011527	A	6	6	46247	46252	100 %	0 %	0 %	0 %	212211719
1041	NC_011527	ATT	2	6	46334	46339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211719
1042	NC_011527	A	6	6	46375	46380	100 %	0 %	0 %	0 %	212211719
1043	NC_011527	TGA	2	6	46424	46429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211719
1044	NC_011527	AGTG	2	8	46433	46440	25 %	25 %	50 %	0 %	212211719
1045	NC_011527	GCATT	2	10	46451	46460	20 %	40 %	20 %	20 %	212211720
1046	NC_011527	AGC	2	6	46486	46491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211720
1047	NC_011527	ATT	2	6	46559	46564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211720
1048	NC_011527	AAG	2	6	46572	46577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211720
1049	NC_011527	TAT	2	6	46629	46634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211720
1050	NC_011527	CAA	2	6	46665	46670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211720
1051	NC_011527	TTC	2	6	46698	46703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211720
1052	NC_011527	TGA	2	6	46714	46719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211720
1053	NC_011527	A	6	6	46719	46724	100 %	0 %	0 %	0 %	212211720
1054	NC_011527	CAG	2	6	46760	46765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211720
1055	NC_011527	AATA	2	8	46772	46779	75 %	25 %	0 %	0 %	212211720
1056	NC_011527	ACG	2	6	46824	46829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211720
1057	NC_011527	CAA	2	6	46838	46843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211720
1058	NC_011527	TTAAA	2	10	46881	46890	60 %	40 %	0 %	0 %	212211720
1059	NC_011527	CGG	2	6	46915	46920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211720
1060	NC_011527	TTA	2	6	46923	46928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211720
1061	NC_011527	ATGG	2	8	46949	46956	25 %	25 %	50 %	0 %	212211720
1062	NC_011527	TAA	2	6	47003	47008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211720
1063	NC_011527	AGC	2	6	47030	47035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211721
1064	NC_011527	ATT	2	6	47049	47054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211721
1065	NC_011527	GGAA	2	8	47099	47106	50 %	0 %	50 %	0 %	212211721
1066	NC_011527	ATGTT	2	10	47155	47164	20 %	60 %	20 %	0 %	212211721
1067	NC_011527	AGA	2	6	47264	47269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211721
1068	NC_011527	AGT	2	6	47336	47341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211721
1069	NC_011527	TCA	2	6	47425	47430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211721
1070	NC_011527	ACCG	2	8	47456	47463	25 %	0 %	25 %	50 %	212211721
1071	NC_011527	AATC	2	8	47470	47477	50 %	25 %	0 %	25 %	212211721
1072	NC_011527	AATT	2	8	47512	47519	50 %	50 %	0 %	0 %	212211721
1073	NC_011527	CGAT	2	8	47554	47561	25 %	25 %	25 %	25 %	212211721
1074	NC_011527	ATC	2	6	47565	47570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211721
1075	NC_011527	AC	3	6	47579	47584	50 %	0 %	0 %	50 %	212211721
1076	NC_011527	TCG	2	6	47625	47630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211721
1077	NC_011527	AGA	2	6	47654	47659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211721
1078	NC_011527	TTG	2	6	47683	47688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211721
1079	NC_011527	GCT	2	6	47712	47717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211721
1080	NC_011527	TC	3	6	47838	47843	0 %	50 %	0 %	50 %	212211721
1081	NC_011527	T	6	6	47887	47892	0 %	100 %	0 %	0 %	212211721
1082	NC_011527	TAT	2	6	48002	48007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211721
1083	NC_011527	CAAC	2	8	48043	48050	50 %	0 %	0 %	50 %	212211721
1084	NC_011527	ATTT	2	8	48091	48098	25 %	75 %	0 %	0 %	212211721
1085	NC_011527	TGTC	2	8	48133	48140	0 %	50 %	25 %	25 %	212211721
1086	NC_011527	GGGT	2	8	48145	48152	0 %	25 %	75 %	0 %	212211721
1087	NC_011527	ATT	2	6	48171	48176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211721
1088	NC_011527	A	6	6	48177	48182	100 %	0 %	0 %	0 %	212211721
1089	NC_011527	ATT	2	6	48354	48359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211721
1090	NC_011527	A	6	6	48402	48407	100 %	0 %	0 %	0 %	212211721
1091	NC_011527	TTA	2	6	48429	48434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211721
1092	NC_011527	CTTC	2	8	48437	48444	0 %	50 %	0 %	50 %	212211721
1093	NC_011527	TAA	2	6	48476	48481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211721
1094	NC_011527	ATT	2	6	48490	48495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211721
1095	NC_011527	A	6	6	48499	48504	100 %	0 %	0 %	0 %	212211721
1096	NC_011527	A	6	6	48511	48516	100 %	0 %	0 %	0 %	212211721
1097	NC_011527	GC	3	6	48605	48610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_011527	GC	3	6	48614	48619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_011527	TTC	2	6	48625	48630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_011527	GAT	2	6	48641	48646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_011527	ACGA	2	8	48679	48686	50 %	0 %	25 %	25 %	212211722
1102	NC_011527	A	6	6	48711	48716	100 %	0 %	0 %	0 %	212211722
1103	NC_011527	CGC	2	6	48739	48744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211722
1104	NC_011527	GCC	2	6	48827	48832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211722
1105	NC_011527	CAA	2	6	48863	48868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211722
1106	NC_011527	ATC	2	6	48896	48901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211722
1107	NC_011527	TAC	2	6	48904	48909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211722
1108	NC_011527	GCG	2	6	48924	48929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211722
1109	NC_011527	ATTT	2	8	48942	48949	25 %	75 %	0 %	0 %	212211722
1110	NC_011527	A	6	6	48971	48976	100 %	0 %	0 %	0 %	212211722
1111	NC_011527	ATA	2	6	48987	48992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211722
1112	NC_011527	CCG	2	6	49039	49044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211722
1113	NC_011527	CAA	2	6	49148	49153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211722
1114	NC_011527	GAA	3	9	49244	49252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211722
1115	NC_011527	TGA	2	6	49288	49293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211722
1116	NC_011527	TTA	2	6	49304	49309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211722
1117	NC_011527	TGG	2	6	49392	49397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211722
1118	NC_011527	TAA	2	6	49456	49461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211722
1119	NC_011527	GC	3	6	49463	49468	0 %	0 %	50 %	50 %	212211722
1120	NC_011527	CA	3	6	49480	49485	50 %	0 %	0 %	50 %	212211722
1121	NC_011527	GCG	3	9	49511	49519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211722
1122	NC_011527	GAGT	2	8	49523	49530	25 %	25 %	50 %	0 %	212211722
1123	NC_011527	ATAA	2	8	49532	49539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_011527	ACA	2	6	49633	49638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211723
1125	NC_011527	CGTTGA	2	12	49677	49688	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212211723
1126	NC_011527	AAT	2	6	49741	49746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211723
1127	NC_011527	GCA	2	6	49805	49810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211723
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1129	NC_011527	CGAT	2	8	49916	49923	25 %	25 %	25 %	25 %	212211723
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