MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 44092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_011527	A	6	6	583865	583870	100 %	0 %	0 %	0 %	212212238
13002	NC_011527	GAAAA	2	10	583928	583937	80 %	0 %	20 %	0 %	212212238
13003	NC_011527	T	6	6	584040	584045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_011527	TTG	2	6	584167	584172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212212239
13005	NC_011527	CAG	2	6	584236	584241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212239
13006	NC_011527	AGA	2	6	584346	584351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212239
13007	NC_011527	ATC	2	6	584390	584395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212212239
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13009	NC_011527	TA	3	6	584474	584479	50 %	50 %	0 %	0 %	212212239
13010	NC_011527	ATT	2	6	584487	584492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212239
13011	NC_011527	GGA	2	6	584520	584525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212212239
13012	NC_011527	TTAT	2	8	584526	584533	25 %	75 %	0 %	0 %	212212239
13013	NC_011527	TTA	2	6	584536	584541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212239
13014	NC_011527	A	7	7	584598	584604	100 %	0 %	0 %	0 %	212212239
13015	NC_011527	ACCG	2	8	584634	584641	25 %	0 %	25 %	50 %	212212239
13016	NC_011527	GA	3	6	584651	584656	50 %	0 %	50 %	0 %	212212239
13017	NC_011527	CGC	2	6	584711	584716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212212239
13018	NC_011527	GAA	2	6	584727	584732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212239
13019	NC_011527	GAA	2	6	584745	584750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212239
13020	NC_011527	TTA	2	6	584777	584782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_011527	CAAT	2	8	584789	584796	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13022	NC_011527	ACAA	2	8	584797	584804	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13023	NC_011527	A	6	6	584803	584808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_011527	TAT	2	6	584980	584985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212240
13025	NC_011527	A	6	6	585002	585007	100 %	0 %	0 %	0 %	212212240
13026	NC_011527	CCGCA	2	10	585034	585043	20 %	0 %	20 %	60 %	212212240
13027	NC_011527	CCTA	2	8	585096	585103	25 %	25 %	0 %	50 %	212212240
13028	NC_011527	TTAT	2	8	585130	585137	25 %	75 %	0 %	0 %	212212240
13029	NC_011527	ACG	2	6	585147	585152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212240
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13031	NC_011527	TAT	2	6	585362	585367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212240
13032	NC_011527	CAA	2	6	585393	585398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212212240
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13034	NC_011527	G	6	6	585470	585475	0 %	0 %	100 %	0 %	212212240
13035	NC_011527	AGT	2	6	585479	585484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212240
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13037	NC_011527	TAA	2	6	585529	585534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212212240
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13039	NC_011527	A	6	6	585798	585803	100 %	0 %	0 %	0 %	212212240
13040	NC_011527	TA	3	6	585814	585819	50 %	50 %	0 %	0 %	212212240
13041	NC_011527	GCTG	2	8	585838	585845	0 %	25 %	50 %	25 %	212212240
13042	NC_011527	GAATT	2	10	585907	585916	40 %	40 %	20 %	0 %	212212240
13043	NC_011527	GTG	2	6	585966	585971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212212240
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13045	NC_011527	TAT	2	6	586023	586028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212240
13046	NC_011527	ATT	2	6	586054	586059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212240
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13048	NC_011527	AAG	2	6	586252	586257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212240
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13050	NC_011527	CTG	2	6	586429	586434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212240
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13054	NC_011527	T	6	6	586550	586555	0 %	100 %	0 %	0 %	212212240
13055	NC_011527	GCC	2	6	586596	586601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212212240
13056	NC_011527	GCA	2	6	586670	586675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212240
13057	NC_011527	A	6	6	586705	586710	100 %	0 %	0 %	0 %	212212240
13058	NC_011527	AAAAT	2	10	586714	586723	80 %	20 %	0 %	0 %	212212240
13059	NC_011527	TTCGGG	2	12	586814	586825	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	212212240
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13062	NC_011527	ATT	2	6	586963	586968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212240
13063	NC_011527	GA	3	6	587002	587007	50 %	0 %	50 %	0 %	212212240
13064	NC_011527	GTG	2	6	587013	587018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212212240
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13066	NC_011527	CG	3	6	587079	587084	0 %	0 %	50 %	50 %	212212240
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13074	NC_011527	GTA	2	6	587374	587379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212240
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13079	NC_011527	GAAT	2	8	587521	587528	50 %	25 %	25 %	0 %	212212240
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13090	NC_011527	GAC	2	6	588040	588045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212241
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13095	NC_011527	TGA	2	6	588304	588309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212241
13096	NC_011527	TGA	2	6	588325	588330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212241
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13098	NC_011527	ACAA	2	8	588371	588378	75 %	0 %	0 %	25 %	212212241
13099	NC_011527	TGG	2	6	588490	588495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212212241
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13103	NC_011527	GGGA	2	8	588605	588612	25 %	0 %	75 %	0 %	212212241
13104	NC_011527	TGCT	2	8	588687	588694	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13105	NC_011527	GTC	2	6	588720	588725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212242
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13107	NC_011527	CTT	2	6	588994	588999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212212242
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13110	NC_011527	TGA	2	6	589213	589218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212242
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13112	NC_011527	GAA	2	6	589262	589267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212242
13113	NC_011527	TAAT	2	8	589291	589298	50 %	50 %	0 %	0 %	212212242
13114	NC_011527	CCT	2	6	589348	589353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13115	NC_011527	GTT	2	6	589361	589366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13118	NC_011527	CGGGT	2	10	589517	589526	0 %	20 %	60 %	20 %	212212243
13119	NC_011527	CTG	2	6	589586	589591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212243
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13121	NC_011527	ACTA	2	8	589865	589872	50 %	25 %	0 %	25 %	212212243
13122	NC_011527	AGA	2	6	589912	589917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212243
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13375	NC_011527	ATT	2	6	600561	600566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212252
13376	NC_011527	CGAT	2	8	600590	600597	25 %	25 %	25 %	25 %	212212252
13377	NC_011527	CAA	3	9	600628	600636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212212252
13378	NC_011527	TTG	2	6	600641	600646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212212252
13379	NC_011527	TGT	2	6	600662	600667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212212252
13380	NC_011527	AATTA	2	10	600699	600708	60 %	40 %	0 %	0 %	212212252
13381	NC_011527	A	6	6	600776	600781	100 %	0 %	0 %	0 %	212212252
13382	NC_011527	AT	3	6	600930	600935	50 %	50 %	0 %	0 %	212212252
13383	NC_011527	ATTG	2	8	600942	600949	25 %	50 %	25 %	0 %	212212252
13384	NC_011527	ATA	2	6	600992	600997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212212252
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13387	NC_011527	GAT	2	6	601174	601179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212252
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13396	NC_011527	A	6	6	601714	601719	100 %	0 %	0 %	0 %	212212252
13397	NC_011527	AGCA	2	8	601730	601737	50 %	0 %	25 %	25 %	212212252
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13399	NC_011527	A	6	6	601788	601793	100 %	0 %	0 %	0 %	212212252
13400	NC_011527	GGC	2	6	601848	601853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212212252
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13405	NC_011527	GTT	2	6	602030	602035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212212252
13406	NC_011527	TA	3	6	602068	602073	50 %	50 %	0 %	0 %	212212252
13407	NC_011527	TCA	3	9	602097	602105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212212252
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13410	NC_011527	TCGATA	2	12	602198	602209	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212212252
13411	NC_011527	TCG	2	6	602210	602215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212252
13412	NC_011527	TGA	2	6	602262	602267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212252
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13415	NC_011527	CAA	2	6	602435	602440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13495	NC_011527	TCGC	2	8	605790	605797	0 %	25 %	25 %	50 %	212212257
13496	NC_011527	CAC	2	6	605833	605838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212212257
13497	NC_011527	CAA	2	6	605864	605869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212212257
13498	NC_011527	TTG	2	6	605945	605950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212212257
13499	NC_011527	TGC	2	6	606060	606065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212257
13500	NC_011527	CTC	2	6	606124	606129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212212257

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