MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 44092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011527	AG	3	6	559926	559931	50 %	0 %	50 %	0 %	212212216
12502	NC_011527	CATCGT	2	12	559950	559961	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	212212216
12503	NC_011527	AAGA	2	8	559991	559998	75 %	0 %	25 %	0 %	212212216
12504	NC_011527	ATC	2	6	560032	560037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212212216
12505	NC_011527	T	6	6	560038	560043	0 %	100 %	0 %	0 %	212212216
12506	NC_011527	TCG	2	6	560054	560059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212216
12507	NC_011527	AG	3	6	560102	560107	50 %	0 %	50 %	0 %	212212216
12508	NC_011527	GTT	2	6	560144	560149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212212216
12509	NC_011527	T	6	6	560157	560162	0 %	100 %	0 %	0 %	212212216
12510	NC_011527	TTC	2	6	560170	560175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212212216
12511	NC_011527	TAT	2	6	560211	560216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212216
12512	NC_011527	A	8	8	560217	560224	100 %	0 %	0 %	0 %	212212216
12513	NC_011527	TGG	2	6	560275	560280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212212216
12514	NC_011527	ATC	2	6	560533	560538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212212216
12515	NC_011527	A	6	6	560567	560572	100 %	0 %	0 %	0 %	212212216
12516	NC_011527	TG	3	6	560595	560600	0 %	50 %	50 %	0 %	212212216
12517	NC_011527	A	7	7	560620	560626	100 %	0 %	0 %	0 %	212212216
12518	NC_011527	TA	3	6	560717	560722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_011527	GTTTTT	2	12	560732	560743	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_011527	TTA	2	6	560776	560781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_011527	GA	3	6	560785	560790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_011527	AGG	2	6	560802	560807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_011527	GTTT	2	8	560851	560858	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_011527	CTG	2	6	560870	560875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12525	NC_011527	TAAT	2	8	560880	560887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_011527	GCT	2	6	560904	560909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12527	NC_011527	GCGT	2	8	560974	560981	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12528	NC_011527	ACGA	2	8	560984	560991	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12529	NC_011527	TAA	2	6	560997	561002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_011527	AG	3	6	561145	561150	50 %	0 %	50 %	0 %	212212217
12531	NC_011527	GTTGA	2	10	561209	561218	20 %	40 %	40 %	0 %	212212217
12532	NC_011527	TTA	2	6	561310	561315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212217
12533	NC_011527	CTTG	2	8	561466	561473	0 %	50 %	25 %	25 %	212212217
12534	NC_011527	TCG	2	6	561660	561665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212217
12535	NC_011527	TGAC	2	8	561714	561721	25 %	25 %	25 %	25 %	212212217
12536	NC_011527	GCC	2	6	561746	561751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212212217
12537	NC_011527	ACG	2	6	561788	561793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212217
12538	NC_011527	CCG	2	6	561879	561884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212212217
12539	NC_011527	ATT	2	6	561920	561925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212217
12540	NC_011527	AAG	2	6	561948	561953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212217
12541	NC_011527	A	6	6	561994	561999	100 %	0 %	0 %	0 %	212212217
12542	NC_011527	TGA	2	6	562020	562025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212217
12543	NC_011527	TAAA	2	8	562089	562096	75 %	25 %	0 %	0 %	212212217
12544	NC_011527	AAG	2	6	562110	562115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212217
12545	NC_011527	ACC	2	6	562226	562231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212212217
12546	NC_011527	AAAGAA	2	12	562241	562252	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	212212217
12547	NC_011527	GAT	2	6	562289	562294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212217
12548	NC_011527	CAAA	2	8	562324	562331	75 %	0 %	0 %	25 %	212212217
12549	NC_011527	TG	3	6	562344	562349	0 %	50 %	50 %	0 %	212212217
12550	NC_011527	CGG	2	6	562459	562464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212212218
12551	NC_011527	CGGC	2	8	562545	562552	0 %	0 %	50 %	50 %	212212218
12552	NC_011527	GAA	2	6	562567	562572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212218
12553	NC_011527	ATT	2	6	562587	562592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212218
12554	NC_011527	ATT	2	6	562651	562656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212218
12555	NC_011527	AAGT	2	8	562685	562692	50 %	25 %	25 %	0 %	212212218
12556	NC_011527	GATG	2	8	562716	562723	25 %	25 %	50 %	0 %	212212218
12557	NC_011527	TGA	2	6	562803	562808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212218
12558	NC_011527	CGC	2	6	562813	562818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212212218
12559	NC_011527	ACA	2	6	562827	562832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212212218
12560	NC_011527	GAA	2	6	562833	562838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212218
12561	NC_011527	ATAA	2	8	562847	562854	75 %	25 %	0 %	0 %	212212218
12562	NC_011527	GCG	2	6	562870	562875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212212219
12563	NC_011527	CAT	2	6	563023	563028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212212219
12564	NC_011527	TGA	2	6	563037	563042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212219
12565	NC_011527	AGG	2	6	563130	563135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212212219
12566	NC_011527	AGT	2	6	563146	563151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212219
12567	NC_011527	A	6	6	563291	563296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_011527	TCT	2	6	563432	563437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212212220
12569	NC_011527	ACA	3	9	563555	563563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212212220
12570	NC_011527	AAT	2	6	563599	563604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212212220
12571	NC_011527	AAGC	2	8	563661	563668	50 %	0 %	25 %	25 %	212212220
12572	NC_011527	TTC	2	6	563833	563838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212212220
12573	NC_011527	CTGA	2	8	563848	563855	25 %	25 %	25 %	25 %	212212220
12574	NC_011527	AGCG	2	8	563871	563878	25 %	0 %	50 %	25 %	212212220
12575	NC_011527	ATG	2	6	563936	563941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212220
12576	NC_011527	TCG	2	6	563959	563964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212220
12577	NC_011527	TAT	2	6	564046	564051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212220
12578	NC_011527	TAT	2	6	564078	564083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212220
12579	NC_011527	AATTA	2	10	564095	564104	60 %	40 %	0 %	0 %	212212220
12580	NC_011527	TGG	2	6	564147	564152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12581	NC_011527	T	6	6	564185	564190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12582	NC_011527	TC	3	6	564215	564220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12583	NC_011527	ATT	2	6	564242	564247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212221
12584	NC_011527	ATT	2	6	564252	564257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212221
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12586	NC_011527	GAA	2	6	564280	564285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212221
12587	NC_011527	TGC	2	6	564310	564315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212221
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12589	NC_011527	AATA	2	8	564388	564395	75 %	25 %	0 %	0 %	212212221
12590	NC_011527	CCG	2	6	564398	564403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212212221
12591	NC_011527	A	6	6	564498	564503	100 %	0 %	0 %	0 %	212212221
12592	NC_011527	T	7	7	564539	564545	0 %	100 %	0 %	0 %	212212221
12593	NC_011527	AATGA	2	10	564641	564650	60 %	20 %	20 %	0 %	212212221
12594	NC_011527	GATTT	2	10	564677	564686	20 %	60 %	20 %	0 %	212212221
12595	NC_011527	TTA	2	6	564728	564733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212221
12596	NC_011527	A	7	7	564743	564749	100 %	0 %	0 %	0 %	212212221
12597	NC_011527	T	6	6	564757	564762	0 %	100 %	0 %	0 %	212212221
12598	NC_011527	CTC	2	6	564786	564791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212212221
12599	NC_011527	A	6	6	564870	564875	100 %	0 %	0 %	0 %	212212221
12600	NC_011527	CGAG	2	8	564881	564888	25 %	0 %	50 %	25 %	212212221
12601	NC_011527	A	7	7	564958	564964	100 %	0 %	0 %	0 %	212212221
12602	NC_011527	GAT	2	6	564992	564997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212221
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12604	NC_011527	AGA	2	6	565042	565047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212221
12605	NC_011527	GATC	2	8	565117	565124	25 %	25 %	25 %	25 %	212212221
12606	NC_011527	CA	3	6	565125	565130	50 %	0 %	0 %	50 %	212212221
12607	NC_011527	A	6	6	565151	565156	100 %	0 %	0 %	0 %	212212221
12608	NC_011527	ATC	2	6	565217	565222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12610	NC_011527	ATTTTT	2	12	565314	565325	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	212212222
12611	NC_011527	T	7	7	565321	565327	0 %	100 %	0 %	0 %	212212222
12612	NC_011527	TTA	2	6	565336	565341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212222
12613	NC_011527	CTT	2	6	565375	565380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212212222
12614	NC_011527	ATC	2	6	565555	565560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212212222
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12617	NC_011527	T	7	7	565654	565660	0 %	100 %	0 %	0 %	212212222
12618	NC_011527	ATGG	2	8	565799	565806	25 %	25 %	50 %	0 %	212212222
12619	NC_011527	CAA	2	6	565830	565835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212212222
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12622	NC_011527	CCT	2	6	566141	566146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212212223
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12624	NC_011527	AGC	2	6	566179	566184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212223
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12747	NC_011527	CTAAA	2	10	572128	572137	60 %	20 %	0 %	20 %	212212227
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12999	NC_011527	A	6	6	583820	583825	100 %	0 %	0 %	0 %	212212238
13000	NC_011527	CAC	2	6	583844	583849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212212238

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