MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 44092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_011527	CA	3	6	446419	446424	50 %	0 %	0 %	50 %	212212113
10003	NC_011527	A	6	6	446428	446433	100 %	0 %	0 %	0 %	212212113
10004	NC_011527	A	6	6	446440	446445	100 %	0 %	0 %	0 %	212212113
10005	NC_011527	ACAGT	2	10	446497	446506	40 %	20 %	20 %	20 %	212212113
10006	NC_011527	CAA	2	6	446551	446556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212212113
10007	NC_011527	TC	3	6	446563	446568	0 %	50 %	0 %	50 %	212212113
10008	NC_011527	G	7	7	446571	446577	0 %	0 %	100 %	0 %	212212113
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10011	NC_011527	CAATAA	2	12	446697	446708	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	212212113
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10013	NC_011527	ACTT	2	8	446780	446787	25 %	50 %	0 %	25 %	212212113
10014	NC_011527	AAG	2	6	446789	446794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212113
10015	NC_011527	AGAA	2	8	446842	446849	75 %	0 %	25 %	0 %	212212113
10016	NC_011527	GCT	2	6	446881	446886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212113
10017	NC_011527	GAC	2	6	446974	446979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212113
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10019	NC_011527	AGGT	2	8	447068	447075	25 %	25 %	50 %	0 %	212212113
10020	NC_011527	TGG	2	6	447081	447086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212212113
10021	NC_011527	TAA	2	6	447202	447207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212212113
10022	NC_011527	CTG	2	6	447217	447222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_011527	ACA	2	6	447276	447281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212212114
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10027	NC_011527	ATGACA	2	12	447368	447379	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212212114
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10030	NC_011527	G	6	6	447441	447446	0 %	0 %	100 %	0 %	212212114
10031	NC_011527	CGGG	2	8	447467	447474	0 %	0 %	75 %	25 %	212212114
10032	NC_011527	T	8	8	447539	447546	0 %	100 %	0 %	0 %	212212114
10033	NC_011527	GGT	2	6	447566	447571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212212114
10034	NC_011527	GA	3	6	447587	447592	50 %	0 %	50 %	0 %	212212114
10035	NC_011527	ATGCGG	2	12	447641	447652	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212212114
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10043	NC_011527	TC	3	6	447987	447992	0 %	50 %	0 %	50 %	212212114
10044	NC_011527	AAAC	2	8	448156	448163	75 %	0 %	0 %	25 %	212212114
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10052	NC_011527	GAG	2	6	448405	448410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212212114
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10059	NC_011527	GTG	2	6	448648	448653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212212114
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10073	NC_011527	GCT	2	6	449334	449339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10110	NC_011527	AAG	2	6	451025	451030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_011527	A	8	8	451031	451038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10115	NC_011527	A	6	6	451155	451160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_011527	TA	3	6	451181	451186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10376	NC_011527	TGC	2	6	463287	463292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212130
10377	NC_011527	CGC	2	6	463304	463309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212212130
10378	NC_011527	ATT	3	9	463366	463374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212130
10379	NC_011527	CAAA	2	8	463514	463521	75 %	0 %	0 %	25 %	212212130
10380	NC_011527	ACG	2	6	463542	463547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212130
10381	NC_011527	TTA	2	6	463550	463555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212130
10382	NC_011527	ATG	2	6	463563	463568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212130
10383	NC_011527	CGC	2	6	463604	463609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212212130
10384	NC_011527	CTAT	2	8	463624	463631	25 %	50 %	0 %	25 %	212212130
10385	NC_011527	AGA	2	6	463728	463733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212130
10386	NC_011527	ACG	2	6	463754	463759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212130
10387	NC_011527	GGC	2	6	463796	463801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212212130
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10390	NC_011527	ATTG	2	8	463918	463925	25 %	50 %	25 %	0 %	212212130
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10394	NC_011527	CCTC	2	8	464169	464176	0 %	25 %	0 %	75 %	212212131
10395	NC_011527	ATT	2	6	464202	464207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212131
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10398	NC_011527	ACA	2	6	464275	464280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212212131
10399	NC_011527	ACT	2	6	464304	464309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212212131
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10403	NC_011527	TGA	2	6	464448	464453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212131
10404	NC_011527	G	6	6	464474	464479	0 %	0 %	100 %	0 %	212212131
10405	NC_011527	AT	3	6	464622	464627	50 %	50 %	0 %	0 %	212212131
10406	NC_011527	T	6	6	464656	464661	0 %	100 %	0 %	0 %	212212131
10407	NC_011527	T	7	7	464667	464673	0 %	100 %	0 %	0 %	212212131
10408	NC_011527	GGA	2	6	464686	464691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212212131
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10412	NC_011527	A	6	6	464799	464804	100 %	0 %	0 %	0 %	212212131
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10419	NC_011527	GCGT	2	8	465062	465069	0 %	25 %	50 %	25 %	212212131
10420	NC_011527	GGA	2	6	465118	465123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212212131
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10422	NC_011527	TATC	2	8	465213	465220	25 %	50 %	0 %	25 %	212212131
10423	NC_011527	CTCC	2	8	465223	465230	0 %	25 %	0 %	75 %	212212131
10424	NC_011527	GAT	2	6	465331	465336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212131
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10431	NC_011527	TGA	2	6	465597	465602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212131
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10434	NC_011527	A	6	6	465826	465831	100 %	0 %	0 %	0 %	212212132
10435	NC_011527	CGA	2	6	465867	465872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212132
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10437	NC_011527	TGC	2	6	466024	466029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212132
10438	NC_011527	TCAA	2	8	466083	466090	50 %	25 %	0 %	25 %	212212132
10439	NC_011527	GTGGGT	2	12	466102	466113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212212132
10440	NC_011527	ATC	2	6	466115	466120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212212132
10441	NC_011527	T	6	6	466133	466138	0 %	100 %	0 %	0 %	212212132
10442	NC_011527	TAG	2	6	466218	466223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212132
10443	NC_011527	TCG	2	6	466260	466265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212132
10444	NC_011527	TCC	2	6	466285	466290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212212132
10445	NC_011527	TTA	2	6	466338	466343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212132
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10447	NC_011527	GC	3	6	466427	466432	0 %	0 %	50 %	50 %	212212132
10448	NC_011527	GAT	2	6	466442	466447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212132
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10450	NC_011527	GCGT	2	8	466497	466504	0 %	25 %	50 %	25 %	212212132
10451	NC_011527	A	6	6	466512	466517	100 %	0 %	0 %	0 %	212212132
10452	NC_011527	ATC	2	6	466535	466540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212212132
10453	NC_011527	AGT	2	6	466591	466596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212132
10454	NC_011527	CGG	2	6	466621	466626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212212132
10455	NC_011527	ATAA	2	8	466631	466638	75 %	25 %	0 %	0 %	212212132
10456	NC_011527	TTTA	2	8	466649	466656	25 %	75 %	0 %	0 %	212212132
10457	NC_011527	ATT	2	6	466697	466702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212132
10458	NC_011527	TCG	2	6	466749	466754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212132
10459	NC_011527	CGT	2	6	466780	466785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212132
10460	NC_011527	TAT	2	6	466786	466791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212132
10461	NC_011527	TCG	2	6	466929	466934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212132
10462	NC_011527	ATT	2	6	467012	467017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212132
10463	NC_011527	A	8	8	467091	467098	100 %	0 %	0 %	0 %	212212132
10464	NC_011527	A	6	6	467171	467176	100 %	0 %	0 %	0 %	212212132
10465	NC_011527	GC	3	6	467310	467315	0 %	0 %	50 %	50 %	212212132
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10469	NC_011527	GCA	2	6	467584	467589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212132
10470	NC_011527	TGG	2	6	467610	467615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212212132
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10472	NC_011527	AGC	2	6	467644	467649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212132
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10474	NC_011527	CAAA	2	8	467782	467789	75 %	0 %	0 %	25 %	212212132
10475	NC_011527	TTTA	2	8	467804	467811	25 %	75 %	0 %	0 %	212212132
10476	NC_011527	TTA	2	6	467867	467872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212132
10477	NC_011527	TCA	2	6	467906	467911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212212132
10478	NC_011527	TGT	2	6	467917	467922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212212132
10479	NC_011527	T	6	6	467945	467950	0 %	100 %	0 %	0 %	212212132
10480	NC_011527	ATT	2	6	468073	468078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212133
10481	NC_011527	CGAT	2	8	468105	468112	25 %	25 %	25 %	25 %	212212133
10482	NC_011527	ATC	2	6	468133	468138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212212133
10483	NC_011527	GCAGC	2	10	468462	468471	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10484	NC_011527	CGCTG	2	10	468508	468517	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10485	NC_011527	TC	4	8	468536	468543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10486	NC_011527	CTA	2	6	468564	468569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212212134
10487	NC_011527	CAA	2	6	468576	468581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212212134
10488	NC_011527	A	7	7	468580	468586	100 %	0 %	0 %	0 %	212212134
10489	NC_011527	ATTC	2	8	468617	468624	25 %	50 %	0 %	25 %	212212134
10490	NC_011527	TCGAT	2	10	468733	468742	20 %	40 %	20 %	20 %	212212134
10491	NC_011527	GCC	2	6	468888	468893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212212134
10492	NC_011527	GTG	2	6	468912	468917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212212134
10493	NC_011527	TGC	2	6	468920	468925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212134
10494	NC_011527	TAAA	2	8	469000	469007	75 %	25 %	0 %	0 %	212212134
10495	NC_011527	ATG	2	6	469078	469083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212134
10496	NC_011527	AAG	2	6	469102	469107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212134
10497	NC_011527	CCG	2	6	469155	469160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212212134
10498	NC_011527	ATT	2	6	469303	469308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212134
10499	NC_011527	GCCA	2	8	469342	469349	25 %	0 %	25 %	50 %	212212134
10500	NC_011527	AGA	2	6	469352	469357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212212134

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