MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 plasmid pQpRS_K_Q154

Total Repeats: 858

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011526	AAGT	2	8	23400	23407	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
502	NC_011526	T	7	7	23419	23425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_011526	AAAT	2	8	23430	23437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_011526	TAGCT	2	10	23442	23451	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
505	NC_011526	TAA	2	6	23477	23482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_011526	GA	3	6	23485	23490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_011526	A	6	6	23499	23504	100 %	0 %	0 %	0 %	212208429
508	NC_011526	AT	3	6	23525	23530	50 %	50 %	0 %	0 %	212208429
509	NC_011526	ACC	2	6	23544	23549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212208429
510	NC_011526	CGT	2	6	23566	23571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212208429
511	NC_011526	GAA	2	6	23583	23588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208429
512	NC_011526	AAG	2	6	23605	23610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208429
513	NC_011526	T	7	7	23617	23623	0 %	100 %	0 %	0 %	212208429
514	NC_011526	GAA	2	6	23643	23648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208429
515	NC_011526	AT	3	6	23694	23699	50 %	50 %	0 %	0 %	212208429
516	NC_011526	A	6	6	23731	23736	100 %	0 %	0 %	0 %	212208429
517	NC_011526	AG	3	6	23776	23781	50 %	0 %	50 %	0 %	212208429
518	NC_011526	GT	3	6	23796	23801	0 %	50 %	50 %	0 %	212208429
519	NC_011526	CTT	2	6	23959	23964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208429
520	NC_011526	A	7	7	24033	24039	100 %	0 %	0 %	0 %	212208429
521	NC_011526	TTAC	2	8	24041	24048	25 %	50 %	0 %	25 %	212208429
522	NC_011526	CT	3	6	24126	24131	0 %	50 %	0 %	50 %	212208429
523	NC_011526	TTA	2	6	24140	24145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208429
524	NC_011526	AAG	2	6	24153	24158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208429
525	NC_011526	AGAT	2	8	24205	24212	50 %	25 %	25 %	0 %	212208429
526	NC_011526	T	6	6	24224	24229	0 %	100 %	0 %	0 %	212208429
527	NC_011526	ATC	2	6	24232	24237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208429
528	NC_011526	A	6	6	24277	24282	100 %	0 %	0 %	0 %	212208429
529	NC_011526	AGAAAA	2	12	24308	24319	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	212208429
530	NC_011526	GCC	2	6	24329	24334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212208429
531	NC_011526	TTA	2	6	24335	24340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208429
532	NC_011526	TC	3	6	24451	24456	0 %	50 %	0 %	50 %	212208429
533	NC_011526	T	6	6	24457	24462	0 %	100 %	0 %	0 %	212208429
534	NC_011526	A	6	6	24500	24505	100 %	0 %	0 %	0 %	212208429
535	NC_011526	AG	3	6	24638	24643	50 %	0 %	50 %	0 %	212208429
536	NC_011526	AT	3	6	24653	24658	50 %	50 %	0 %	0 %	212208429
537	NC_011526	ATA	2	6	24714	24719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208429
538	NC_011526	AGG	2	6	24808	24813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212208429
539	NC_011526	ATC	2	6	24892	24897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208429
540	NC_011526	ATC	2	6	24935	24940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208429
541	NC_011526	CCG	2	6	24994	24999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212208430
542	NC_011526	GAA	2	6	25104	25109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208430
543	NC_011526	AAT	2	6	25110	25115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208430
544	NC_011526	A	6	6	25116	25121	100 %	0 %	0 %	0 %	212208430
545	NC_011526	ATCTT	2	10	25137	25146	20 %	60 %	0 %	20 %	212208430
546	NC_011526	CCA	2	6	25150	25155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212208430
547	NC_011526	TGG	2	6	25180	25185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212208430
548	NC_011526	A	6	6	25294	25299	100 %	0 %	0 %	0 %	212208431
549	NC_011526	ATC	2	6	25327	25332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208431
550	NC_011526	CCA	2	6	25401	25406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212208431
551	NC_011526	T	6	6	25557	25562	0 %	100 %	0 %	0 %	212208431
552	NC_011526	CAT	2	6	25578	25583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208431
553	NC_011526	ATA	2	6	25597	25602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_011526	CTT	2	6	25686	25691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_011526	CCA	2	6	25698	25703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_011526	CA	3	6	25702	25707	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
557	NC_011526	AGAT	2	8	25745	25752	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
558	NC_011526	T	7	7	25752	25758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_011526	T	6	6	25771	25776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_011526	A	7	7	25777	25783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_011526	TTAA	2	8	25815	25822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_011526	AT	3	6	25878	25883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_011526	TA	3	6	25910	25915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_011526	A	7	7	25973	25979	100 %	0 %	0 %	0 %	212208432
565	NC_011526	CCA	2	6	26007	26012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212208432
566	NC_011526	A	7	7	26040	26046	100 %	0 %	0 %	0 %	212208432
567	NC_011526	CTT	2	6	26084	26089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208432
568	NC_011526	CAG	2	6	26138	26143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212208432
569	NC_011526	TGA	2	6	26154	26159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208432
570	NC_011526	TG	3	6	26181	26186	0 %	50 %	50 %	0 %	212208432
571	NC_011526	A	6	6	26198	26203	100 %	0 %	0 %	0 %	212208432
572	NC_011526	TGAGTC	2	12	26212	26223	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212208432
573	NC_011526	A	6	6	26241	26246	100 %	0 %	0 %	0 %	212208432
574	NC_011526	TGA	2	6	26314	26319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_011526	TTG	2	6	26571	26576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212208433
576	NC_011526	CAT	2	6	26595	26600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208433
577	NC_011526	CTTTT	2	10	26663	26672	0 %	80 %	0 %	20 %	212208433
578	NC_011526	T	8	8	26669	26676	0 %	100 %	0 %	0 %	212208433
579	NC_011526	TCA	2	6	26682	26687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208433
580	NC_011526	TAA	2	6	26715	26720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208434
581	NC_011526	CCT	2	6	26777	26782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212208434
582	NC_011526	A	7	7	26832	26838	100 %	0 %	0 %	0 %	212208434
583	NC_011526	TCT	2	6	26845	26850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208434
584	NC_011526	ATT	2	6	26863	26868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208434
585	NC_011526	T	6	6	26913	26918	0 %	100 %	0 %	0 %	212208434
586	NC_011526	TCA	2	6	26957	26962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208434
587	NC_011526	CCT	2	6	27160	27165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212208435
588	NC_011526	GTG	2	6	27248	27253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212208435
589	NC_011526	T	6	6	27310	27315	0 %	100 %	0 %	0 %	212208435
590	NC_011526	GCT	2	6	27361	27366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212208435
591	NC_011526	GCC	2	6	27403	27408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212208435
592	NC_011526	CTTG	2	8	27412	27419	0 %	50 %	25 %	25 %	212208435
593	NC_011526	CCG	2	6	27448	27453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212208435
594	NC_011526	ATC	2	6	27458	27463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208435
595	NC_011526	CTT	2	6	27625	27630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208435
596	NC_011526	T	6	6	27649	27654	0 %	100 %	0 %	0 %	212208436
597	NC_011526	TAAG	2	8	27694	27701	50 %	25 %	25 %	0 %	212208436
598	NC_011526	T	6	6	27801	27806	0 %	100 %	0 %	0 %	212208436
599	NC_011526	TTA	2	6	27908	27913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208436
600	NC_011526	AGC	2	6	27934	27939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212208436
601	NC_011526	ATC	2	6	27940	27945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208436
602	NC_011526	TTTAGA	2	12	27964	27975	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	212208436
603	NC_011526	AAG	2	6	28066	28071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208436
604	NC_011526	TGC	2	6	28080	28085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212208436
605	NC_011526	ACC	2	6	28129	28134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212208436
606	NC_011526	TCC	2	6	28158	28163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212208436
607	NC_011526	TGGAT	2	10	28180	28189	20 %	40 %	40 %	0 %	212208436
608	NC_011526	AAT	2	6	28190	28195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208436
609	NC_011526	ATCC	2	8	28248	28255	25 %	25 %	0 %	50 %	212208436
610	NC_011526	TGGC	2	8	28289	28296	0 %	25 %	50 %	25 %	212208436
611	NC_011526	AAT	2	6	28305	28310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208436
612	NC_011526	TGGCAT	2	12	28323	28334	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212208436
613	NC_011526	T	6	6	28340	28345	0 %	100 %	0 %	0 %	212208436
614	NC_011526	GCT	2	6	28362	28367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212208436
615	NC_011526	TC	3	6	28370	28375	0 %	50 %	0 %	50 %	212208436
616	NC_011526	T	7	7	28407	28413	0 %	100 %	0 %	0 %	212208436
617	NC_011526	GAT	2	6	28429	28434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208436
618	NC_011526	TG	3	6	28481	28486	0 %	50 %	50 %	0 %	212208436
619	NC_011526	GGTT	2	8	28631	28638	0 %	50 %	50 %	0 %	212208436
620	NC_011526	GT	3	6	28685	28690	0 %	50 %	50 %	0 %	212208436
621	NC_011526	GTGA	2	8	28705	28712	25 %	25 %	50 %	0 %	212208436
622	NC_011526	CTTT	2	8	28742	28749	0 %	75 %	0 %	25 %	212208436
623	NC_011526	AGT	2	6	28792	28797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208436
624	NC_011526	TTTG	2	8	28860	28867	0 %	75 %	25 %	0 %	212208436
625	NC_011526	TCT	2	6	28874	28879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208436
626	NC_011526	GTTT	2	8	28903	28910	0 %	75 %	25 %	0 %	212208436
627	NC_011526	ATT	2	6	28930	28935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208436
628	NC_011526	AGT	2	6	29014	29019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208436
629	NC_011526	TCG	2	6	29100	29105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212208436
630	NC_011526	TTC	2	6	29131	29136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208436
631	NC_011526	AAT	2	6	29151	29156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208436
632	NC_011526	T	6	6	29166	29171	0 %	100 %	0 %	0 %	212208436
633	NC_011526	TTC	2	6	29212	29217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208436
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